Doublet Group distance statistics: 51074

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C5	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.000, 0.041, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.000, 0.045, 0.090, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.045
N7	A	0, 0.000, 0.047, 0.093, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.047 std_dev=0.047
O6	A	0, 0.000, 0.049, 0.099, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.049 std_dev=0.049
O4'	A	0, 0.000, 0.066, 0.132, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.066 std_dev=0.066
C4'	A	0, 0.000, 0.085, 0.171, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.085 std_dev=0.085
O2'	A	0, 0.000, 0.093, 0.186, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.093 std_dev=0.093
C2'	B	0, 0.000, 0.094, 0.187, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.094 std_dev=0.094
O2'	B	0, 0.000, 0.096, 0.191, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.096 std_dev=0.096
C3'	A	0, 0.000, 0.099, 0.198, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.099 std_dev=0.099
C8	B	0, 0.000, 0.105, 0.210, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.105 std_dev=0.105
O3'	A	0, 0.000, 0.108, 0.215, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.108 std_dev=0.108
C5'	A	0, 0.000, 0.122, 0.244, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.122 std_dev=0.122
C1'	B	0, 0.000, 0.134, 0.268, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.134 std_dev=0.134
N9	B	0, 0.000, 0.140, 0.281, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.140 std_dev=0.140
O5'	A	0, 0.000, 0.144, 0.287, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.144 std_dev=0.144
C3'	B	0, 0.000, 0.146, 0.293, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.146 std_dev=0.146
O4'	B	0, 0.000, 0.162, 0.325, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.162 std_dev=0.162
N7	B	0, 0.000, 0.163, 0.325, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.163 std_dev=0.163
C4'	B	0, 0.000, 0.169, 0.337, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.169 std_dev=0.169
O5'	B	0, 0.000, 0.173, 0.345, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.173 std_dev=0.173
OP2	B	0, 0.000, 0.175, 0.351, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.175 std_dev=0.175
C4	B	0, 0.000, 0.188, 0.375, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.188 std_dev=0.188
C5'	B	0, 0.000, 0.188, 0.376, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.188 std_dev=0.188
P	A	0, 0.000, 0.196, 0.393, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.196 std_dev=0.196
C5	B	0, 0.000, 0.201, 0.402, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.201 std_dev=0.201
O3'	B	0, 0.000, 0.208, 0.415, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.208 std_dev=0.208
P	B	0, 0.000, 0.217, 0.434, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.217 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.000, 0.241, 0.483, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.241 std_dev=0.241
C6	B	0, 0.000, 0.255, 0.511, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.255 std_dev=0.255
N6	B	0, 0.000, 0.288, 0.576, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.288 std_dev=0.288
C2	B	0, 0.000, 0.297, 0.594, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.297 std_dev=0.297
OP2	A	0, 0.000, 0.300, 0.600, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.300 std_dev=0.300
OP1	B	0, 0.000, 0.305, 0.610, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.305 std_dev=0.305
N1	B	0, 0.000, 0.307, 0.614, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.307 std_dev=0.307
OP1	A	0, 0.000, 0.331, 0.662, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.331 std_dev=0.331

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.12	0.01	0.01
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.16	0.08	0.05
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.14	0.02	0.02
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.05	0.03
C4	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.16	0.08	0.05
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.14	0.10	0.05
C5'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.06	0.03	0.00	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.13	0.09	0.04
C8	0.03	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04	0.12	0.09	0.04
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.01	0.15	0.08	0.04
N2	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.02	0.17	0.07	0.05
N3	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	0.17	0.07	0.06
N7	0.03	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.03	0.12	0.11	0.05
N9	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.15	0.07	0.05
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.02	0.02
O3'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.03	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.07	0.07	0.03	0.02
O5'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.05	0.06	0.03	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00
O6	0.04	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.07	0.10	0.00	0.10	0.08	0.02
OP1	0.12	0.16	0.14	0.08	0.16	0.06	0.14	0.07	0.13	0.12	0.15	0.17	0.17	0.12	0.15	0.14	0.06	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.08	0.02	0.05	0.08	0.05	0.10	0.02	0.09	0.09	0.08	0.07	0.07	0.11	0.07	0.02	0.07	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.11	0.05	0.08	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.02	0.04	0.10	0.05	0.04	0.04	0.04	0.13	0.09	0.07	0.04	0.01	0.06
C2	0.09	0.19	0.06	0.07	0.12	0.08	0.11	0.08	0.15	0.03	0.18	0.16	0.13	0.05	0.09	0.06	0.10	0.08	0.08	0.07	0.04	0.07
C2'	0.07	0.11	0.04	0.07	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.03	0.06	0.10	0.03	0.04	0.03	0.04	0.12	0.08	0.05	0.02	0.01	0.03
C3'	0.09	0.07	0.06	0.10	0.03	0.10	0.02	0.10	0.02	0.02	0.02	0.09	0.07	0.04	0.04	0.06	0.15	0.10	0.07	0.04	0.01	0.06
C4	0.07	0.15	0.04	0.06	0.07	0.06	0.04	0.07	0.06	0.01	0.10	0.13	0.03	0.02	0.05	0.04	0.09	0.07	0.05	0.03	0.01	0.05
C4'	0.10	0.05	0.07	0.11	0.03	0.12	0.02	0.11	0.03	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03	0.05	0.06	0.16	0.12	0.09	0.05	0.02	0.07
C5	0.06	0.11	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03	0.05	0.05	0.01	0.08	0.11	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.03
C5'	0.11	0.04	0.09	0.13	0.04	0.13	0.00	0.12	0.01	0.02	0.00	0.07	0.04	0.01	0.06	0.07	0.17	0.13	0.09	0.06	0.03	0.08
C6	0.07	0.14	0.05	0.05	0.10	0.05	0.08	0.05	0.09	0.02	0.11	0.13	0.08	0.03	0.08	0.07	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.03
C8	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.00	0.01	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02
N1	0.09	0.17	0.06	0.06	0.13	0.07	0.12	0.08	0.14	0.05	0.15	0.16	0.12	0.07	0.10	0.08	0.09	0.07	0.07	0.06	0.03	0.07
N2	0.10	0.20	0.07	0.08	0.13	0.09	0.13	0.10	0.17	0.05	0.20	0.17	0.17	0.07	0.10	0.07	0.10	0.09	0.09	0.09	0.06	0.09
N3	0.08	0.18	0.05	0.06	0.10	0.07	0.07	0.08	0.11	0.01	0.16	0.15	0.08	0.01	0.07	0.05	0.10	0.08	0.07	0.06	0.03	0.06
N7	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01
N9	0.07	0.11	0.04	0.06	0.05	0.07	0.00	0.07	0.01	0.02	0.06	0.11	0.02	0.03	0.04	0.03	0.10	0.08	0.06	0.03	0.01	0.05
O2'	0.05	0.11	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.04	0.01	0.05	0.06	0.09	0.05	0.07	0.01	0.02	0.09	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01
O3'	0.08	0.06	0.06	0.09	0.02	0.09	0.04	0.09	0.04	0.03	0.00	0.07	0.09	0.06	0.03	0.05	0.14	0.09	0.07	0.04	0.01	0.05
O4'	0.11	0.05	0.08	0.12	0.03	0.12	0.02	0.12	0.04	0.00	0.02	0.08	0.07	0.03	0.05	0.06	0.17	0.12	0.10	0.07	0.04	0.09
O5'	0.12	0.01	0.10	0.14	0.04	0.15	0.00	0.14	0.02	0.04	0.02	0.05	0.04	0.01	0.07	0.07	0.19	0.15	0.11	0.08	0.05	0.10
O6	0.07	0.13	0.06	0.05	0.10	0.04	0.09	0.04	0.09	0.04	0.10	0.12	0.08	0.05	0.09	0.09	0.07	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02
OP1	0.00	0.10	0.03	0.04	0.09	0.05	0.13	0.03	0.14	0.10	0.13	0.06	0.16	0.13	0.06	0.05	0.11	0.03	0.03	0.07	0.12	0.06
OP2	0.05	0.09	0.10	0.05	0.10	0.02	0.11	0.04	0.10	0.10	0.10	0.08	0.11	0.12	0.09	0.15	0.00	0.01	0.08	0.13	0.16	0.11
P	0.03	0.05	0.01	0.04	0.04	0.06	0.07	0.04	0.07	0.05	0.07	0.02	0.09	0.07	0.02	0.04	0.09	0.06	0.00	0.05	0.08	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03
C2	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.07	0.07	0.06	0.09
C2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02
C3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03
C4	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.08	0.08	0.07	0.10
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00
C5	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.09	0.11	0.10	0.12
C5'	0.02	0.05	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.09	0.05	0.05	0.08	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
C6	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.09	0.11	0.09	0.12
C8	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.11	0.13	0.10	0.13
N1	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.08	0.07	0.09
N3	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.06	0.06	0.06	0.08
N6	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.10	0.13	0.11	0.13
N7	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.11	0.14	0.12	0.14
N9	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.08	0.07	0.09
O2'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03
O3'	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.05	0.04
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01
O5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.07	0.06	0.10	0.11	0.08	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.07	0.00	0.05	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.08	0.06	0.13	0.14	0.08	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.01	0.06	0.00	0.04	0.07	0.02	0.10	0.00	0.09	0.10	0.07	0.06	0.11	0.12	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.09	0.02	0.03	0.10	0.00	0.12	0.00	0.12	0.13	0.09	0.08	0.13	0.14	0.09	0.03	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00