Doublet Group distance statistics: 51075

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.000, 0.060, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.060 std_dev=0.060
C8	B	0, 0.000, 0.317, 0.635, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.317 std_dev=0.317
N7	B	0, 0.000, 0.357, 0.713, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.357 std_dev=0.357
N9	B	0, 0.000, 0.384, 0.769, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.384 std_dev=0.384
C1'	B	0, 0.000, 0.388, 0.775, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.388 std_dev=0.388
C5	B	0, 0.000, 0.439, 0.877, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.439 std_dev=0.439
C4	B	0, 0.000, 0.468, 0.936, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.468 std_dev=0.468
N6	B	0, 0.000, 0.500, 1.001, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.500 std_dev=0.500
C6	B	0, 0.000, 0.507, 1.014, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.507 std_dev=0.507
N3	B	0, 0.000, 0.567, 1.134, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.567 std_dev=0.567
N1	B	0, 0.000, 0.596, 1.192, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.596 std_dev=0.596
C2	B	0, 0.000, 0.623, 1.245, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.623 std_dev=0.623
C2'	A	0, 0.000, 0.996, 1.992, 1.992 max_d=1.992 avg_d=0.996 std_dev=0.996
O4'	A	0, 0.000, 1.052, 2.104, 2.104 max_d=2.104 avg_d=1.052 std_dev=1.052
C2'	B	0, 0.000, 1.075, 2.150, 2.150 max_d=2.150 avg_d=1.075 std_dev=1.075
O4'	B	0, 0.000, 1.220, 2.441, 2.441 max_d=2.441 avg_d=1.220 std_dev=1.220
O2'	A	0, 0.000, 1.388, 2.775, 2.775 max_d=2.775 avg_d=1.388 std_dev=1.388
C3'	A	0, 0.000, 1.397, 2.794, 2.794 max_d=2.794 avg_d=1.397 std_dev=1.397
O2'	B	0, 0.000, 1.430, 2.860, 2.860 max_d=2.860 avg_d=1.430 std_dev=1.430
C3'	B	0, 0.000, 1.461, 2.921, 2.921 max_d=2.921 avg_d=1.461 std_dev=1.461
O3'	A	0, 0.000, 1.527, 3.055, 3.055 max_d=3.055 avg_d=1.527 std_dev=1.527
C4'	A	0, 0.000, 1.581, 3.162, 3.162 max_d=3.162 avg_d=1.581 std_dev=1.581
O3'	B	0, 0.000, 1.640, 3.280, 3.280 max_d=3.280 avg_d=1.640 std_dev=1.640
C4'	B	0, 0.000, 1.683, 3.365, 3.365 max_d=3.365 avg_d=1.683 std_dev=1.683
O5'	B	0, 0.000, 2.155, 4.310, 4.310 max_d=4.310 avg_d=2.155 std_dev=2.155
O5'	A	0, 0.000, 2.374, 4.748, 4.748 max_d=4.748 avg_d=2.374 std_dev=2.374
C5'	A	0, 0.000, 2.391, 4.783, 4.783 max_d=4.783 avg_d=2.391 std_dev=2.391
C5'	B	0, 0.000, 2.452, 4.905, 4.905 max_d=4.905 avg_d=2.452 std_dev=2.452
P	B	0, 0.000, 2.718, 5.437, 5.437 max_d=5.437 avg_d=2.718 std_dev=2.718
OP2	B	0, 0.000, 2.833, 5.665, 5.665 max_d=5.665 avg_d=2.833 std_dev=2.833
P	A	0, 0.000, 2.909, 5.817, 5.817 max_d=5.817 avg_d=2.909 std_dev=2.909
OP2	A	0, 0.000, 3.031, 6.062, 6.062 max_d=6.062 avg_d=3.031 std_dev=3.031
OP1	A	0, 0.000, 3.136, 6.273, 6.273 max_d=6.273 avg_d=3.136 std_dev=3.136
OP1	B	0, 0.000, 3.280, 6.559, 6.559 max_d=6.559 avg_d=3.280 std_dev=3.280

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.00	0.00	0.01	0.29	0.00	0.14	0.01	0.36	0.19	0.17
C2	0.04	0.00	0.32	0.18	0.01	0.26	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.16	0.44	0.14	0.00	0.16	0.14	0.01
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.17	0.00	0.09	0.17	0.15	0.17	0.26	0.38	0.31	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.35	0.12	0.74	0.54	0.53
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.23	0.00	0.32	0.01	0.33	0.30	0.27	0.12	0.14	0.36	0.21	0.00	0.00	0.01	0.05	0.37	0.41	0.03	0.14
C4	0.02	0.01	0.17	0.23	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.22	0.01	0.00	0.08	0.14	0.08
C4'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.02	0.33	0.14	0.39	0.26	0.28	0.10	0.23	0.01	0.00	0.00	0.08	0.17	0.02	0.05
C5	0.01	0.00	0.09	0.32	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.07	0.08	0.18	0.00	0.16	0.36	0.31
C5'	0.06	0.32	0.17	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.02	0.39	0.18	0.47	0.32	0.35	0.07	0.05	0.19	0.01	0.00	0.11	0.02	0.00	0.00
C6	0.02	0.00	0.15	0.33	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.07	0.17	0.15	0.00	0.20	0.44	0.33
C8	0.01	0.01	0.17	0.30	0.00	0.33	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.47	0.11	0.25	0.34	0.00	0.19	0.26	0.37
N1	0.03	0.00	0.26	0.27	0.00	0.14	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.03	0.33	0.00	0.00	0.03	0.31	0.16
N2	0.05	0.00	0.38	0.12	0.01	0.39	0.00	0.47	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.39	0.24	0.54	0.24	0.01	0.27	0.08	0.12
N3	0.04	0.01	0.31	0.14	0.00	0.26	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.21	0.43	0.18	0.00	0.24	0.03	0.09
N7	0.00	0.00	0.08	0.36	0.00	0.28	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.16	0.14	0.38	0.01	0.33	0.47	0.50
N9	0.00	0.01	0.01	0.21	0.01	0.10	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.07	0.01	0.04	0.00	0.10	0.04	0.07
O2'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.01	0.23	0.19	0.05	0.11	0.47	0.09	0.39	0.26	0.42	0.18	0.00	0.07	0.18	0.27	0.19	0.75	0.66	0.53
O3'	0.29	0.16	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.19	0.07	0.11	0.03	0.24	0.21	0.16	0.07	0.07	0.00	0.20	0.27	0.14	0.03	0.25	0.15
O4'	0.00	0.44	0.01	0.01	0.22	0.00	0.08	0.01	0.17	0.25	0.33	0.54	0.43	0.14	0.01	0.18	0.20	0.00	0.06	0.11	0.12	0.05	0.01
O5'	0.14	0.14	0.35	0.05	0.01	0.00	0.18	0.00	0.15	0.34	0.00	0.24	0.18	0.38	0.04	0.27	0.27	0.06	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00
O6	0.01	0.00	0.12	0.37	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.14	0.11	0.25	0.00	0.35	0.59	0.47
OP1	0.36	0.16	0.74	0.41	0.08	0.17	0.16	0.02	0.20	0.19	0.03	0.27	0.24	0.33	0.10	0.75	0.03	0.12	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00
OP2	0.19	0.14	0.54	0.03	0.14	0.02	0.36	0.00	0.44	0.26	0.31	0.08	0.03	0.47	0.04	0.66	0.25	0.05	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.01	0.53	0.14	0.08	0.05	0.31	0.00	0.33	0.37	0.16	0.12	0.09	0.50	0.07	0.53	0.15	0.01	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.31	0.51	0.80	0.16	0.42	0.21	0.53	0.29	0.08	0.35	0.20	0.30	0.15	0.06	0.04	0.65	0.03	0.48	1.00	0.11	0.56
C2	0.20	0.11	0.10	0.56	0.11	0.26	0.03	0.34	0.03	0.07	0.02	0.15	0.13	0.01	0.13	0.42	0.44	0.09	0.43	0.63	0.23	0.26
C2'	0.53	0.10	0.02	0.33	0.14	0.01	0.02	0.21	0.20	0.21	0.26	0.13	0.31	0.05	0.30	0.56	0.18	0.48	0.10	0.67	0.16	0.22
C3'	0.10	0.01	0.58	0.92	0.07	0.51	0.18	0.77	0.21	0.16	0.13	0.05	0.28	0.23	0.05	0.07	0.83	0.06	0.65	1.34	0.47	0.82
C4	0.16	0.10	0.20	0.66	0.01	0.36	0.10	0.48	0.20	0.01	0.20	0.00	0.25	0.08	0.06	0.39	0.51	0.02	0.50	0.80	0.05	0.42
C4'	0.11	0.19	0.92	1.18	0.02	0.68	0.04	0.81	0.05	0.16	0.16	0.10	0.05	0.12	0.11	0.59	1.17	0.06	0.74	1.48	0.51	0.92
C5	0.16	0.04	0.04	0.60	0.02	0.40	0.07	0.53	0.15	0.03	0.12	0.03	0.20	0.05	0.08	0.56	0.46	0.08	0.57	0.77	0.04	0.44
C5'	0.07	0.53	0.98	1.26	0.16	0.71	0.13	0.85	0.27	0.11	0.45	0.39	0.25	0.03	0.02	0.77	1.36	0.01	0.78	1.61	0.63	1.01
C6	0.18	0.09	0.08	0.50	0.11	0.34	0.05	0.46	0.00	0.09	0.03	0.13	0.08	0.03	0.14	0.63	0.39	0.07	0.55	0.63	0.15	0.34
C8	0.08	0.25	0.25	0.77	0.16	0.53	0.21	0.68	0.27	0.07	0.29	0.17	0.27	0.15	0.05	0.44	0.59	0.14	0.61	0.99	0.17	0.62
N1	0.20	0.15	0.02	0.51	0.14	0.27	0.08	0.37	0.05	0.10	0.09	0.17	0.05	0.05	0.15	0.54	0.40	0.02	0.47	0.58	0.24	0.26
N2	0.21	0.17	0.11	0.54	0.14	0.21	0.07	0.28	0.03	0.08	0.09	0.19	0.07	0.03	0.15	0.39	0.43	0.14	0.39	0.57	0.30	0.20
N3	0.17	0.02	0.21	0.63	0.04	0.29	0.05	0.39	0.14	0.03	0.13	0.06	0.23	0.05	0.09	0.33	0.49	0.10	0.44	0.73	0.15	0.33
N7	0.12	0.13	0.03	0.65	0.07	0.52	0.15	0.68	0.20	0.02	0.19	0.07	0.22	0.11	0.02	0.64	0.49	0.20	0.65	0.89	0.11	0.57
N9	0.11	0.24	0.33	0.75	0.12	0.43	0.18	0.55	0.28	0.05	0.31	0.13	0.29	0.13	0.01	0.28	0.58	0.01	0.52	0.93	0.07	0.53
O2'	0.59	0.32	0.12	0.13	0.11	0.14	0.01	0.04	0.25	0.36	0.42	0.03	0.32	0.17	0.37	0.72	0.01	0.54	0.11	0.46	0.36	0.04
O3'	0.08	0.14	0.61	1.02	0.03	0.64	0.03	0.91	0.01	0.08	0.07	0.13	0.05	0.10	0.01	0.13	1.02	0.01	0.79	1.57	0.63	1.00
O4'	0.22	0.00	0.96	1.18	0.14	0.70	0.09	0.74	0.00	0.18	0.05	0.11	0.04	0.13	0.19	0.58	1.10	0.16	0.72	1.33	0.37	0.83
O5'	0.25	0.63	0.57	1.01	0.34	0.50	0.20	0.77	0.28	0.01	0.47	0.62	0.19	0.02	0.19	0.25	1.06	0.21	0.66	1.45	0.53	0.87
O6	0.18	0.12	0.21	0.41	0.14	0.35	0.11	0.47	0.08	0.12	0.09	0.14	0.02	0.09	0.15	0.73	0.33	0.14	0.59	0.57	0.15	0.32
OP1	0.12	0.55	0.57	0.95	0.22	0.68	0.08	1.08	0.19	0.15	0.40	0.50	0.10	0.12	0.06	0.37	1.09	0.03	0.93	1.98	1.12	1.35
OP2	0.66	0.64	0.13	0.36	0.45	0.15	0.18	0.75	0.20	0.06	0.40	0.74	0.04	0.03	0.38	0.46	0.26	0.50	0.58	1.35	0.65	0.83
P	0.18	0.56	0.55	1.00	0.24	0.62	0.06	0.99	0.16	0.16	0.38	0.55	0.05	0.15	0.07	0.30	1.11	0.11	0.85	1.72	0.89	1.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.22	0.00	0.08	0.45	0.17	0.21
C2	0.01	0.00	0.48	0.48	0.00	0.01	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.30	0.29	0.30	0.01	0.31	0.54	0.06
C2'	0.00	0.48	0.00	0.00	0.24	0.00	0.09	0.21	0.19	0.27	0.36	0.48	0.11	0.15	0.01	0.00	0.02	0.00	0.27	0.23	0.51	0.07
C3'	0.00	0.48	0.00	0.00	0.33	0.00	0.31	0.01	0.39	0.05	0.47	0.42	0.38	0.17	0.15	0.02	0.01	0.00	0.30	0.23	0.36	0.07
C4	0.01	0.00	0.24	0.33	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.16	0.07	0.28	0.49	0.02
C4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.06	0.07	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01	0.50	0.07	0.20
C5	0.01	0.00	0.09	0.31	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.16	0.05	0.12	0.19	0.59	0.08
C5'	0.12	0.17	0.21	0.01	0.15	0.01	0.12	0.00	0.12	0.10	0.14	0.18	0.09	0.08	0.14	0.01	0.16	0.02	0.00	0.35	0.26	0.01
C6	0.01	0.00	0.19	0.39	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.25	0.12	0.11	0.18	0.64	0.12
C8	0.00	0.00	0.27	0.05	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.37	0.06	0.19	0.18	0.17	0.47	0.00
N1	0.02	0.00	0.36	0.47	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.31	0.23	0.06	0.24	0.62	0.11
N3	0.01	0.00	0.48	0.42	0.00	0.03	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.21	0.31	0.00	0.34	0.47	0.01
N6	0.01	0.01	0.11	0.38	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.26	0.07	0.14	0.12	0.69	0.16
N7	0.00	0.00	0.15	0.17	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.06	0.11	0.19	0.12	0.58	0.08
N9	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.03	0.00	0.10	0.29	0.39	0.05
O2'	0.02	0.30	0.00	0.02	0.06	0.21	0.12	0.01	0.05	0.37	0.14	0.33	0.14	0.33	0.12	0.00	0.07	0.17	0.04	0.59	0.15	0.30
O3'	0.22	0.29	0.02	0.01	0.13	0.01	0.16	0.16	0.25	0.06	0.31	0.21	0.26	0.06	0.03	0.07	0.00	0.20	0.18	0.56	0.07	0.17
O4'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.16	0.00	0.05	0.02	0.12	0.19	0.23	0.31	0.07	0.11	0.00	0.17	0.20	0.00	0.30	0.61	0.12	0.42
O5'	0.08	0.01	0.27	0.30	0.07	0.01	0.12	0.00	0.11	0.18	0.06	0.00	0.14	0.19	0.10	0.04	0.18	0.30	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.45	0.31	0.23	0.23	0.28	0.50	0.19	0.35	0.18	0.17	0.24	0.34	0.12	0.12	0.29	0.59	0.56	0.61	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.54	0.51	0.36	0.49	0.07	0.59	0.26	0.64	0.47	0.62	0.47	0.69	0.58	0.39	0.15	0.07	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.21	0.06	0.07	0.07	0.02	0.20	0.08	0.01	0.12	0.00	0.11	0.01	0.16	0.08	0.05	0.30	0.17	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00