Doublet Group distance statistics: 51080

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 6, 7, 15, 20, 17, 22, 20, 4, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.024, 0.033, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.024 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.017, 0.027, 0.037, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.027 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.019, 0.031, 0.044, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.017, 0.031, 0.045, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.031 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.022, 0.037, 0.052, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.037 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.023, 0.045, 0.067, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.045 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.026, 0.051, 0.076, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.051 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.041, 0.066, 0.091, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.066 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.020, 0.054, 0.087, 0.202 max_d=0.202 avg_d=0.054 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.330, 0.468, 0.607, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.468 std_dev=0.138
C2'	A	0, 0.380, 0.536, 0.692, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.536 std_dev=0.156
N3	B	0, 0.346, 0.513, 0.679, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.513 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.318, 0.520, 0.722, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.520 std_dev=0.202
C4'	A	0, 0.573, 0.777, 0.981, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.777 std_dev=0.204
C2	B	0, 0.495, 0.705, 0.915, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.705 std_dev=0.210
O2'	A	0, 0.388, 0.618, 0.848, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.618 std_dev=0.230
N1	B	0, 0.579, 0.813, 1.047, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.813 std_dev=0.234
C3'	A	0, 0.612, 0.861, 1.110, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.861 std_dev=0.249
OP2	A	0, 0.356, 0.607, 0.857, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.607 std_dev=0.251
C2'	B	0, 0.786, 1.037, 1.289, 1.612 max_d=1.612 avg_d=1.037 std_dev=0.252
C5	B	0, 0.526, 0.783, 1.040, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.783 std_dev=0.257
P	A	0, 0.397, 0.664, 0.930, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.664 std_dev=0.266
C6	B	0, 0.577, 0.846, 1.116, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.846 std_dev=0.269
O2	B	0, 0.659, 0.940, 1.222, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.940 std_dev=0.281
N4	B	0, 0.288, 0.570, 0.852, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.570 std_dev=0.282
O5'	A	0, 0.533, 0.821, 1.109, 1.881 max_d=1.881 avg_d=0.821 std_dev=0.288
C3'	B	0, 0.527, 0.818, 1.108, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.818 std_dev=0.290
C1'	B	0, 0.846, 1.138, 1.430, 1.724 max_d=1.724 avg_d=1.138 std_dev=0.292
O3'	B	0, 0.566, 0.884, 1.203, 1.843 max_d=1.843 avg_d=0.884 std_dev=0.319
OP1	A	0, 0.704, 1.030, 1.357, 1.853 max_d=1.853 avg_d=1.030 std_dev=0.326
C5'	A	0, 0.869, 1.199, 1.530, 2.668 max_d=2.668 avg_d=1.199 std_dev=0.330
O2'	B	0, 1.115, 1.459, 1.802, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.459 std_dev=0.343
C4'	B	0, 0.890, 1.258, 1.625, 2.353 max_d=2.353 avg_d=1.258 std_dev=0.367
O4'	B	0, 0.976, 1.346, 1.716, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.346 std_dev=0.370
O3'	A	0, 0.973, 1.386, 1.798, 3.312 max_d=3.312 avg_d=1.386 std_dev=0.412
C5'	B	0, 1.018, 1.440, 1.863, 2.729 max_d=2.729 avg_d=1.440 std_dev=0.422
O5'	B	0, 0.998, 1.567, 2.136, 3.691 max_d=3.691 avg_d=1.567 std_dev=0.569
P	B	0, 1.932, 2.618, 3.305, 4.858 max_d=4.858 avg_d=2.618 std_dev=0.686
OP1	B	0, 2.366, 3.226, 4.085, 5.693 max_d=5.693 avg_d=3.226 std_dev=0.860
OP2	B	0, 2.015, 2.937, 3.860, 7.274 max_d=7.274 avg_d=2.937 std_dev=0.923

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.12	0.03	0.12	0.18	0.11
C2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.18	0.05	0.17	0.02	0.16	0.24	0.16
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.07	0.07	0.06	0.09	0.13	0.11	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.15	0.07	0.20	0.19	0.15
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.16	0.16	0.14	0.14	0.11	0.18	0.10	0.02	0.01	0.01	0.13	0.18	0.20	0.15	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.18	0.02	0.16	0.23	0.16
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06	0.07	0.05	0.11	0.05	0.10	0.03	0.00	0.02	0.10	0.10	0.11	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.03	0.21	0.02	0.20	0.26	0.20
C5'	0.04	0.10	0.07	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.15	0.13	0.10	0.08	0.18	0.09	0.06	0.08	0.02	0.01	0.18	0.12	0.13	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.16	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.15	0.04	0.22	0.01	0.22	0.28	0.21
C8	0.02	0.02	0.06	0.16	0.01	0.10	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.15	0.05	0.21	0.04	0.18	0.23	0.18
N1	0.04	0.01	0.09	0.14	0.02	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.16	0.04	0.20	0.02	0.19	0.26	0.19
N2	0.06	0.01	0.13	0.14	0.02	0.07	0.02	0.10	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.23	0.07	0.16	0.03	0.16	0.24	0.15
N3	0.04	0.01	0.11	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.17	0.05	0.16	0.02	0.15	0.22	0.15
N7	0.01	0.02	0.05	0.18	0.01	0.11	0.00	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.17	0.04	0.24	0.04	0.22	0.27	0.22
N9	0.01	0.02	0.02	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.17	0.03	0.15	0.21	0.14
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.10	0.10	0.10	0.06	0.12	0.08	0.14	0.18	0.14	0.10	0.06	0.00	0.06	0.08	0.10	0.12	0.17	0.18	0.11
O3'	0.09	0.18	0.03	0.01	0.11	0.03	0.14	0.08	0.15	0.15	0.16	0.23	0.17	0.17	0.08	0.06	0.00	0.07	0.18	0.18	0.29	0.24	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04	0.01	0.08	0.07	0.00	0.11	0.05	0.10	0.19	0.12
O5'	0.12	0.17	0.15	0.13	0.18	0.02	0.21	0.01	0.22	0.21	0.20	0.16	0.16	0.24	0.17	0.10	0.18	0.11	0.00	0.24	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.07	0.18	0.02	0.10	0.02	0.18	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.12	0.18	0.05	0.24	0.00	0.25	0.31	0.24
OP1	0.12	0.16	0.20	0.20	0.16	0.10	0.20	0.12	0.22	0.18	0.19	0.16	0.15	0.22	0.15	0.17	0.29	0.10	0.02	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.24	0.19	0.15	0.23	0.11	0.26	0.13	0.28	0.23	0.26	0.24	0.22	0.27	0.21	0.18	0.24	0.19	0.02	0.31	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.16	0.15	0.12	0.16	0.04	0.20	0.02	0.21	0.18	0.19	0.15	0.15	0.22	0.14	0.11	0.20	0.12	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.20	0.20	0.20	0.18	0.19	0.20	0.29	0.19	0.17	0.19	0.21	0.30	0.29	0.18	0.18	0.45	0.55	0.61	0.46
C2	0.19	0.20	0.19	0.17	0.23	0.21	0.28	0.32	0.25	0.20	0.20	0.27	0.24	0.24	0.15	0.21	0.54	0.71	0.81	0.58
C2'	0.16	0.20	0.16	0.16	0.18	0.15	0.20	0.28	0.17	0.15	0.20	0.21	0.30	0.28	0.16	0.14	0.45	0.57	0.64	0.48
C3'	0.13	0.17	0.15	0.13	0.17	0.13	0.20	0.26	0.18	0.12	0.18	0.20	0.27	0.28	0.13	0.10	0.41	0.55	0.58	0.45
C4	0.18	0.19	0.20	0.17	0.16	0.20	0.23	0.32	0.21	0.17	0.17	0.20	0.26	0.26	0.15	0.19	0.53	0.65	0.75	0.55
C4'	0.15	0.19	0.15	0.15	0.18	0.13	0.18	0.23	0.17	0.14	0.20	0.21	0.28	0.28	0.16	0.12	0.35	0.47	0.48	0.37
C5	0.20	0.19	0.22	0.19	0.13	0.22	0.22	0.34	0.22	0.18	0.17	0.16	0.24	0.26	0.17	0.22	0.55	0.68	0.80	0.59
C5'	0.19	0.23	0.20	0.14	0.21	0.13	0.21	0.21	0.20	0.19	0.23	0.22	0.30	0.33	0.15	0.14	0.31	0.46	0.42	0.32
C6	0.21	0.19	0.23	0.20	0.16	0.24	0.26	0.36	0.25	0.20	0.18	0.17	0.22	0.25	0.18	0.24	0.56	0.73	0.86	0.61
C8	0.20	0.20	0.24	0.18	0.13	0.21	0.17	0.33	0.18	0.16	0.18	0.17	0.28	0.29	0.17	0.19	0.51	0.60	0.68	0.52
N1	0.20	0.19	0.20	0.18	0.20	0.22	0.28	0.34	0.25	0.20	0.19	0.22	0.22	0.24	0.16	0.23	0.55	0.74	0.85	0.61
N2	0.20	0.21	0.19	0.18	0.26	0.21	0.29	0.32	0.26	0.21	0.22	0.31	0.25	0.24	0.15	0.21	0.53	0.73	0.81	0.58
N3	0.19	0.20	0.19	0.18	0.22	0.20	0.26	0.31	0.23	0.20	0.20	0.26	0.26	0.25	0.16	0.20	0.52	0.67	0.76	0.55
N7	0.22	0.21	0.26	0.21	0.14	0.24	0.19	0.36	0.21	0.19	0.19	0.18	0.26	0.29	0.20	0.23	0.55	0.65	0.77	0.57
N9	0.18	0.18	0.20	0.18	0.15	0.19	0.20	0.31	0.19	0.16	0.17	0.19	0.28	0.28	0.16	0.17	0.50	0.60	0.68	0.51
O2'	0.22	0.25	0.20	0.18	0.23	0.17	0.23	0.27	0.21	0.21	0.25	0.26	0.35	0.32	0.18	0.18	0.43	0.56	0.62	0.46
O3'	0.15	0.22	0.15	0.15	0.20	0.13	0.20	0.27	0.18	0.15	0.24	0.24	0.33	0.28	0.17	0.11	0.40	0.58	0.58	0.45
O4'	0.17	0.18	0.18	0.21	0.19	0.19	0.19	0.27	0.18	0.15	0.20	0.22	0.27	0.29	0.22	0.16	0.40	0.49	0.52	0.40
O5'	0.21	0.23	0.25	0.08	0.23	0.07	0.25	0.16	0.25	0.21	0.23	0.24	0.29	0.32	0.02	0.12	0.37	0.51	0.45	0.37
O6	0.24	0.20	0.25	0.23	0.18	0.27	0.26	0.38	0.27	0.23	0.20	0.19	0.23	0.26	0.22	0.28	0.57	0.75	0.90	0.63
OP1	0.08	0.14	0.14	0.03	0.15	0.10	0.18	0.22	0.16	0.09	0.15	0.18	0.22	0.21	0.02	0.06	0.26	0.64	0.46	0.36
OP2	0.10	0.19	0.09	0.09	0.25	0.22	0.27	0.38	0.23	0.16	0.23	0.28	0.23	0.10	0.02	0.18	0.46	0.72	0.60	0.53
P	0.06	0.13	0.12	0.02	0.16	0.09	0.19	0.21	0.17	0.09	0.15	0.19	0.20	0.17	0.01	0.05	0.31	0.57	0.43	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.14	0.34	0.28	0.15
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.03	0.30	0.51	0.47	0.28
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.08	0.02	0.06	0.05	0.15	0.01	0.03	0.01	0.19	0.24	0.20	0.13
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.01	0.11	0.03	0.12	0.05	0.10	0.09	0.17	0.02	0.01	0.02	0.25	0.28	0.20	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.10	0.03	0.44	0.68	0.68	0.45
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.14	0.23	0.06
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.04	0.47	0.70	0.68	0.46
C5'	0.03	0.12	0.03	0.03	0.17	0.01	0.18	0.00	0.15	0.10	0.15	0.19	0.12	0.05	0.05	0.02	0.01	0.15	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.04	0.41	0.61	0.51	0.37
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.29	0.49	0.41	0.26
N3	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.38	0.60	0.59	0.37
N4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.04	0.47	0.74	0.77	0.50
O2	0.05	0.01	0.15	0.17	0.02	0.08	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.19	0.05	0.23	0.44	0.40	0.22
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.08	0.07	0.14	0.00	0.05	0.04	0.07	0.19	0.20	0.10
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.10	0.02	0.13	0.05	0.13	0.05	0.11	0.12	0.19	0.05	0.00	0.02	0.21	0.40	0.26	0.22
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.00	0.10	0.33	0.30	0.17
O5'	0.14	0.30	0.19	0.25	0.44	0.02	0.47	0.01	0.41	0.29	0.38	0.47	0.23	0.07	0.21	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.34	0.51	0.24	0.28	0.68	0.14	0.70	0.15	0.61	0.49	0.60	0.74	0.44	0.19	0.40	0.33	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.47	0.20	0.20	0.68	0.23	0.68	0.30	0.51	0.41	0.59	0.77	0.40	0.20	0.26	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.28	0.13	0.18	0.45	0.06	0.46	0.02	0.37	0.26	0.37	0.50	0.22	0.10	0.22	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00