Doublet Group distance statistics: 51081

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 4, 11, 16, 9, 6, 5, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.016, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.016, 0.032, 0.047, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.033 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.024, 0.044, 0.064, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.044 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.024, 0.047, 0.070, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.047 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.019, 0.042, 0.065, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.042 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.024, 0.051, 0.078, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.051 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.031, 0.065, 0.099, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.065 std_dev=0.034
C2	B	0, 0.244, 0.383, 0.522, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.383 std_dev=0.139
O4'	A	0, 0.120, 0.265, 0.411, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.265 std_dev=0.145
C2'	A	0, 0.158, 0.315, 0.471, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.315 std_dev=0.156
N3	B	0, 0.260, 0.424, 0.587, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.424 std_dev=0.164
O2	B	0, 0.295, 0.480, 0.665, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.480 std_dev=0.185
C4	B	0, 0.269, 0.462, 0.655, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.462 std_dev=0.193
O2'	A	0, 0.186, 0.384, 0.582, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.384 std_dev=0.198
N1	B	0, 0.217, 0.423, 0.630, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.423 std_dev=0.206
C5	B	0, 0.299, 0.514, 0.729, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.514 std_dev=0.215
C6	B	0, 0.275, 0.505, 0.735, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.505 std_dev=0.230
C4'	A	0, 0.232, 0.471, 0.710, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.471 std_dev=0.239
C2'	B	0, 0.272, 0.516, 0.761, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.516 std_dev=0.244
C3'	A	0, 0.254, 0.499, 0.744, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.499 std_dev=0.245
C1'	B	0, 0.286, 0.533, 0.780, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.533 std_dev=0.247
C3'	B	0, 0.258, 0.521, 0.783, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.521 std_dev=0.262
N4	B	0, 0.246, 0.537, 0.827, 1.900 max_d=1.900 avg_d=0.537 std_dev=0.291
O4'	B	0, 0.331, 0.635, 0.938, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.635 std_dev=0.303
C4'	B	0, 0.360, 0.669, 0.979, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.669 std_dev=0.310
O3'	B	0, 0.261, 0.574, 0.887, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.574 std_dev=0.313
O2'	B	0, 0.352, 0.672, 0.992, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.672 std_dev=0.320
P	A	0, 0.213, 0.540, 0.868, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.540 std_dev=0.327
OP1	A	0, 0.291, 0.626, 0.962, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.626 std_dev=0.336
O3'	A	0, 0.427, 0.783, 1.140, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.783 std_dev=0.357
O5'	A	0, 0.130, 0.504, 0.879, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.504 std_dev=0.375
C5'	A	0, 0.344, 0.729, 1.115, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.729 std_dev=0.385
C5'	B	0, 0.389, 0.781, 1.172, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.781 std_dev=0.391
OP2	A	0, 0.207, 0.602, 0.996, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.602 std_dev=0.394
O5'	B	0, 0.311, 0.768, 1.224, 2.549 max_d=2.549 avg_d=0.768 std_dev=0.456
P	B	0, 0.487, 0.982, 1.477, 2.483 max_d=2.483 avg_d=0.982 std_dev=0.495
OP1	B	0, 0.705, 1.274, 1.843, 2.989 max_d=2.989 avg_d=1.274 std_dev=0.569
OP2	B	0, 0.357, 1.071, 1.786, 3.199 max_d=3.199 avg_d=1.071 std_dev=0.714

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.14	0.02	0.12	0.23	0.10
C2	0.04	0.00	0.12	0.14	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.17	0.05	0.27	0.01	0.22	0.25	0.19
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.14	0.11	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.06	0.20	0.20	0.11
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.12	0.11	0.13	0.15	0.12	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.21	0.14	0.26	0.19	0.16
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.28	0.01	0.22	0.24	0.19
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.08	0.06	0.09	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.09	0.10	0.22	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.34	0.01	0.27	0.26	0.25
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.16	0.16	0.13	0.09	0.08	0.18	0.09	0.06	0.05	0.01	0.01	0.19	0.15	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.17	0.03	0.35	0.00	0.29	0.28	0.27
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.34	0.03	0.24	0.23	0.22
N1	0.03	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.18	0.04	0.31	0.01	0.26	0.27	0.24
N2	0.05	0.01	0.14	0.15	0.01	0.08	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.20	0.06	0.24	0.02	0.21	0.25	0.18
N3	0.04	0.01	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.15	0.05	0.24	0.01	0.20	0.24	0.17
N7	0.01	0.02	0.05	0.11	0.01	0.09	0.00	0.18	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.04	0.38	0.03	0.29	0.27	0.28
N9	0.00	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.26	0.02	0.19	0.23	0.16
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.04	0.13	0.18	0.14	0.04	0.03	0.00	0.06	0.05	0.07	0.08	0.14	0.20	0.07
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.11	0.03	0.14	0.05	0.17	0.13	0.18	0.20	0.15	0.15	0.07	0.06	0.00	0.02	0.19	0.19	0.32	0.24	0.20
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.12	0.04	0.10	0.29	0.14
O5'	0.14	0.27	0.17	0.21	0.28	0.02	0.34	0.01	0.35	0.34	0.31	0.24	0.24	0.38	0.26	0.07	0.19	0.12	0.00	0.38	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.19	0.04	0.38	0.00	0.32	0.32	0.31
OP1	0.12	0.22	0.20	0.26	0.22	0.10	0.27	0.15	0.29	0.24	0.26	0.21	0.20	0.29	0.19	0.14	0.32	0.10	0.02	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.25	0.20	0.19	0.24	0.22	0.26	0.23	0.28	0.23	0.27	0.25	0.24	0.27	0.23	0.20	0.24	0.29	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.19	0.11	0.16	0.19	0.05	0.25	0.02	0.27	0.22	0.24	0.18	0.17	0.28	0.16	0.07	0.20	0.14	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.15	0.17	0.15	0.23	0.15	0.24	0.22	0.21	0.15	0.21	0.27	0.20	0.26	0.14	0.14	0.23	0.33	0.38	0.25
C2	0.15	0.15	0.17	0.14	0.22	0.16	0.27	0.27	0.21	0.15	0.16	0.31	0.21	0.22	0.14	0.14	0.40	0.53	0.63	0.42
C2'	0.15	0.16	0.15	0.11	0.23	0.11	0.24	0.21	0.21	0.14	0.22	0.28	0.22	0.26	0.12	0.11	0.23	0.34	0.41	0.27
C3'	0.16	0.15	0.19	0.14	0.22	0.14	0.24	0.24	0.23	0.15	0.20	0.26	0.19	0.31	0.16	0.13	0.21	0.34	0.36	0.25
C4	0.15	0.13	0.18	0.14	0.20	0.15	0.25	0.26	0.21	0.14	0.15	0.25	0.19	0.23	0.14	0.13	0.36	0.47	0.54	0.38
C4'	0.18	0.18	0.18	0.14	0.22	0.14	0.22	0.22	0.21	0.17	0.22	0.24	0.22	0.32	0.15	0.14	0.15	0.24	0.31	0.18
C5	0.18	0.16	0.21	0.19	0.17	0.21	0.25	0.31	0.24	0.18	0.17	0.19	0.20	0.23	0.19	0.19	0.43	0.53	0.61	0.45
C5'	0.26	0.23	0.30	0.19	0.22	0.22	0.23	0.27	0.25	0.23	0.23	0.24	0.27	0.43	0.18	0.23	0.18	0.27	0.32	0.20
C6	0.19	0.18	0.21	0.21	0.20	0.24	0.27	0.35	0.25	0.19	0.19	0.21	0.21	0.22	0.21	0.22	0.48	0.60	0.70	0.51
C8	0.19	0.15	0.23	0.18	0.14	0.19	0.21	0.28	0.22	0.16	0.15	0.16	0.20	0.26	0.18	0.17	0.34	0.41	0.44	0.34
N1	0.17	0.17	0.19	0.17	0.20	0.20	0.27	0.31	0.23	0.17	0.18	0.25	0.21	0.22	0.17	0.18	0.45	0.59	0.69	0.49
N2	0.16	0.16	0.17	0.13	0.23	0.15	0.27	0.26	0.21	0.15	0.17	0.33	0.22	0.23	0.13	0.14	0.39	0.54	0.64	0.42
N3	0.15	0.14	0.17	0.13	0.24	0.14	0.27	0.24	0.21	0.14	0.17	0.32	0.20	0.23	0.13	0.13	0.35	0.47	0.56	0.37
N7	0.22	0.18	0.25	0.23	0.15	0.25	0.24	0.34	0.26	0.20	0.17	0.16	0.21	0.26	0.23	0.23	0.43	0.50	0.55	0.44
N9	0.15	0.12	0.19	0.14	0.19	0.14	0.23	0.24	0.21	0.14	0.15	0.23	0.18	0.25	0.14	0.13	0.30	0.40	0.45	0.31
O2'	0.20	0.23	0.17	0.16	0.27	0.17	0.25	0.23	0.22	0.19	0.27	0.31	0.28	0.27	0.17	0.17	0.20	0.30	0.38	0.24
O3'	0.17	0.16	0.20	0.16	0.22	0.17	0.24	0.26	0.23	0.15	0.21	0.26	0.23	0.33	0.19	0.14	0.21	0.37	0.37	0.26
O4'	0.15	0.17	0.16	0.16	0.22	0.15	0.22	0.22	0.21	0.15	0.22	0.25	0.19	0.27	0.18	0.13	0.19	0.27	0.32	0.21
O5'	0.20	0.20	0.24	0.08	0.26	0.07	0.30	0.16	0.29	0.21	0.23	0.28	0.24	0.32	0.02	0.11	0.18	0.34	0.27	0.21
O6	0.23	0.21	0.23	0.24	0.22	0.29	0.28	0.40	0.28	0.22	0.22	0.24	0.23	0.23	0.25	0.27	0.53	0.66	0.77	0.58
OP1	0.06	0.12	0.11	0.02	0.14	0.10	0.18	0.19	0.17	0.08	0.13	0.16	0.20	0.17	0.02	0.06	0.21	0.43	0.33	0.22
OP2	0.12	0.20	0.14	0.08	0.21	0.21	0.24	0.35	0.22	0.16	0.20	0.22	0.25	0.14	0.02	0.17	0.26	0.45	0.30	0.27
P	0.06	0.11	0.12	0.02	0.14	0.09	0.20	0.19	0.19	0.09	0.12	0.16	0.18	0.16	0.01	0.05	0.17	0.37	0.24	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.28	0.24	0.11
C2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.19	0.39	0.37	0.17
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.08	0.03	0.08	0.06	0.16	0.00	0.02	0.01	0.11	0.18	0.18	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.02	0.12	0.04	0.09	0.07	0.16	0.02	0.01	0.02	0.14	0.21	0.15	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.08	0.03	0.25	0.48	0.50	0.24
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.11	0.17	0.04
C5	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.04	0.27	0.50	0.50	0.25
C5'	0.04	0.12	0.02	0.02	0.18	0.01	0.20	0.00	0.17	0.11	0.15	0.20	0.10	0.05	0.05	0.02	0.01	0.12	0.23	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.24	0.44	0.39	0.20
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.19	0.37	0.33	0.15
N3	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.03	0.22	0.44	0.45	0.21
N4	0.03	0.01	0.06	0.07	0.00	0.08	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.09	0.04	0.26	0.51	0.56	0.26
O2	0.04	0.01	0.16	0.16	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.20	0.04	0.17	0.35	0.34	0.15
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.04	0.10	0.08	0.16	0.00	0.04	0.05	0.05	0.16	0.15	0.06
O3'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.08	0.02	0.13	0.05	0.13	0.04	0.10	0.09	0.20	0.04	0.00	0.01	0.16	0.33	0.20	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.00	0.13	0.28	0.25	0.15
O5'	0.12	0.19	0.11	0.14	0.25	0.02	0.27	0.01	0.24	0.19	0.22	0.26	0.17	0.05	0.16	0.13	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.28	0.39	0.18	0.21	0.48	0.11	0.50	0.12	0.44	0.37	0.44	0.51	0.35	0.16	0.33	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.37	0.18	0.15	0.50	0.17	0.50	0.23	0.39	0.33	0.45	0.56	0.34	0.15	0.20	0.25	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.17	0.08	0.12	0.24	0.04	0.25	0.02	0.20	0.15	0.21	0.26	0.15	0.06	0.16	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00