Doublet Group distance statistics: 51082

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 4, 1, 8, 15, 11, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.013, 0.030, 0.046, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.017, 0.034, 0.052, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.015, 0.034, 0.054, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.034 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.006, 0.029, 0.052, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.029 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.016, 0.040, 0.065, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.040 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.016, 0.043, 0.071, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.043 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.017, 0.049, 0.081, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.049 std_dev=0.032
O6	A	0, 0.012, 0.048, 0.084, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.048 std_dev=0.036
N7	A	0, 0.015, 0.066, 0.117, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.066 std_dev=0.051
C8	A	0, 0.023, 0.084, 0.145, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.084 std_dev=0.061
O4'	A	0, 0.033, 0.121, 0.209, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.121 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.102, 0.208, 0.313, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.208 std_dev=0.106
N1	B	0, 0.224, 0.351, 0.478, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.351 std_dev=0.127
C4'	A	0, 0.033, 0.186, 0.338, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.186 std_dev=0.152
O2'	A	0, 0.161, 0.328, 0.494, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.328 std_dev=0.166
C3'	A	0, 0.147, 0.314, 0.481, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.314 std_dev=0.167
C6	B	0, 0.574, 0.787, 1.001, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.787 std_dev=0.214
C5'	A	0, 0.147, 0.416, 0.686, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.416 std_dev=0.270
O3'	A	0, 0.221, 0.499, 0.776, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.499 std_dev=0.277
C2	B	0, 0.548, 0.842, 1.136, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.842 std_dev=0.294
C5	B	0, 0.863, 1.159, 1.455, 1.713 max_d=1.713 avg_d=1.159 std_dev=0.296
C2'	B	0, 0.402, 0.711, 1.019, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.711 std_dev=0.308
C4	B	0, 1.080, 1.398, 1.716, 1.921 max_d=1.921 avg_d=1.398 std_dev=0.318
C3'	B	0, 0.715, 1.036, 1.357, 1.611 max_d=1.611 avg_d=1.036 std_dev=0.321
C1'	B	0, 0.382, 0.706, 1.030, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.706 std_dev=0.324
O3'	B	0, 0.771, 1.099, 1.428, 1.620 max_d=1.620 avg_d=1.099 std_dev=0.329
O2'	B	0, 0.494, 0.843, 1.191, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.843 std_dev=0.348
P	A	0, 0.785, 1.135, 1.486, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.135 std_dev=0.350
N3	B	0, 0.990, 1.350, 1.710, 1.764 max_d=1.764 avg_d=1.350 std_dev=0.360
OP2	A	0, 1.047, 1.415, 1.783, 2.278 max_d=2.278 avg_d=1.415 std_dev=0.368
O2	B	0, 0.842, 1.219, 1.597, 1.820 max_d=1.820 avg_d=1.219 std_dev=0.378
O5'	A	0, 0.505, 0.885, 1.264, 2.427 max_d=2.427 avg_d=0.885 std_dev=0.379
O4'	B	0, 0.797, 1.214, 1.630, 2.065 max_d=2.065 avg_d=1.214 std_dev=0.417
N4	B	0, 1.614, 2.036, 2.457, 2.701 max_d=2.701 avg_d=2.036 std_dev=0.421
C4'	B	0, 0.930, 1.352, 1.774, 2.209 max_d=2.209 avg_d=1.352 std_dev=0.422
OP1	A	0, 0.957, 1.401, 1.844, 3.013 max_d=3.013 avg_d=1.401 std_dev=0.444
O5'	B	0, 1.242, 1.738, 2.235, 2.676 max_d=2.676 avg_d=1.738 std_dev=0.496
C5'	B	0, 1.133, 1.638, 2.142, 2.666 max_d=2.666 avg_d=1.638 std_dev=0.505
P	B	0, 1.456, 2.028, 2.600, 3.082 max_d=3.082 avg_d=2.028 std_dev=0.572
OP2	B	0, 1.265, 2.017, 2.769, 4.883 max_d=4.883 avg_d=2.017 std_dev=0.752
OP1	B	0, 1.677, 2.429, 3.181, 4.331 max_d=4.331 avg_d=2.429 std_dev=0.752

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.10	0.02	0.10	0.23	0.10
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.05	0.22	0.01	0.19	0.26	0.18
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.05	0.08	0.09	0.08	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.11	0.09	0.14	0.22	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.12	0.12	0.11	0.10	0.08	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.15	0.15	0.19	0.21	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.23	0.01	0.19	0.24	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.04	0.06	0.04	0.09	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.09	0.10	0.21	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02	0.29	0.01	0.25	0.27	0.23
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.14	0.16	0.11	0.08	0.07	0.17	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.18	0.13	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.03	0.31	0.00	0.27	0.31	0.26
C8	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.09	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.30	0.03	0.22	0.22	0.19
N1	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.27	0.01	0.24	0.28	0.22
N2	0.04	0.00	0.09	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.14	0.07	0.21	0.02	0.18	0.25	0.18
N3	0.03	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.05	0.20	0.01	0.17	0.24	0.15
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.03	0.33	0.03	0.27	0.28	0.25
N9	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.21	0.02	0.17	0.22	0.14
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.11	0.14	0.11	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.06	0.09	0.14	0.23	0.07
O3'	0.02	0.12	0.03	0.01	0.09	0.02	0.13	0.03	0.15	0.13	0.14	0.14	0.10	0.16	0.07	0.06	0.00	0.02	0.15	0.19	0.26	0.23	0.14
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.07	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.03	0.09	0.27	0.13
O5'	0.10	0.22	0.11	0.15	0.23	0.02	0.29	0.01	0.31	0.30	0.27	0.21	0.20	0.33	0.21	0.06	0.15	0.09	0.00	0.34	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.19	0.03	0.34	0.00	0.32	0.36	0.30
OP1	0.10	0.19	0.14	0.19	0.19	0.10	0.25	0.13	0.27	0.22	0.24	0.18	0.17	0.27	0.17	0.14	0.26	0.09	0.02	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.26	0.22	0.21	0.24	0.21	0.27	0.18	0.31	0.22	0.28	0.25	0.24	0.28	0.22	0.23	0.23	0.27	0.01	0.36	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.18	0.07	0.09	0.17	0.05	0.23	0.02	0.26	0.19	0.22	0.18	0.15	0.25	0.14	0.07	0.14	0.13	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.23	0.13	0.17	0.11	0.17	0.17	0.24	0.16	0.09	0.21	0.15	0.40	0.20	0.15	0.14	0.23	0.36	0.43	0.30
C2	0.19	0.27	0.18	0.18	0.19	0.19	0.18	0.23	0.18	0.19	0.30	0.19	0.35	0.20	0.16	0.20	0.23	0.40	0.55	0.28
C2'	0.12	0.23	0.12	0.12	0.11	0.13	0.17	0.22	0.16	0.09	0.21	0.14	0.40	0.20	0.10	0.12	0.26	0.41	0.49	0.34
C3'	0.14	0.24	0.16	0.10	0.12	0.11	0.16	0.19	0.15	0.11	0.22	0.15	0.40	0.26	0.10	0.11	0.27	0.43	0.45	0.32
C4	0.17	0.28	0.18	0.16	0.12	0.19	0.14	0.24	0.15	0.16	0.29	0.15	0.38	0.21	0.15	0.19	0.23	0.36	0.51	0.29
C4'	0.16	0.24	0.16	0.12	0.15	0.11	0.17	0.19	0.17	0.14	0.22	0.17	0.39	0.27	0.13	0.11	0.23	0.36	0.36	0.26
C5	0.21	0.29	0.22	0.20	0.17	0.23	0.14	0.28	0.17	0.20	0.29	0.20	0.35	0.24	0.19	0.24	0.26	0.36	0.55	0.32
C5'	0.24	0.29	0.27	0.15	0.20	0.14	0.19	0.16	0.19	0.21	0.26	0.20	0.41	0.37	0.16	0.17	0.22	0.36	0.28	0.21
C6	0.23	0.28	0.23	0.22	0.21	0.25	0.17	0.29	0.20	0.22	0.30	0.24	0.33	0.24	0.21	0.26	0.28	0.40	0.60	0.33
C8	0.19	0.26	0.21	0.17	0.15	0.22	0.18	0.29	0.18	0.15	0.24	0.19	0.36	0.25	0.15	0.22	0.28	0.36	0.50	0.34
N1	0.21	0.28	0.21	0.20	0.21	0.22	0.19	0.26	0.20	0.21	0.30	0.22	0.33	0.22	0.19	0.23	0.26	0.41	0.59	0.31
N2	0.19	0.26	0.18	0.18	0.21	0.19	0.21	0.22	0.19	0.19	0.29	0.23	0.33	0.19	0.16	0.19	0.23	0.41	0.56	0.28
N3	0.17	0.27	0.16	0.16	0.14	0.18	0.16	0.22	0.16	0.16	0.29	0.16	0.37	0.19	0.15	0.17	0.22	0.37	0.51	0.27
N7	0.23	0.27	0.24	0.21	0.18	0.25	0.16	0.31	0.18	0.19	0.26	0.22	0.34	0.26	0.21	0.26	0.29	0.35	0.55	0.35
N9	0.16	0.26	0.17	0.15	0.11	0.18	0.16	0.25	0.15	0.12	0.25	0.15	0.39	0.21	0.13	0.17	0.24	0.35	0.47	0.31
O2'	0.13	0.21	0.14	0.16	0.12	0.15	0.19	0.22	0.17	0.11	0.19	0.15	0.38	0.21	0.15	0.14	0.23	0.38	0.46	0.31
O3'	0.15	0.22	0.17	0.12	0.11	0.13	0.16	0.19	0.15	0.11	0.20	0.15	0.37	0.28	0.13	0.12	0.28	0.45	0.45	0.33
O4'	0.12	0.24	0.12	0.17	0.16	0.15	0.19	0.23	0.17	0.12	0.23	0.18	0.41	0.21	0.18	0.11	0.23	0.35	0.38	0.28
O5'	0.24	0.35	0.27	0.10	0.31	0.08	0.29	0.10	0.27	0.26	0.35	0.32	0.42	0.32	0.01	0.15	0.25	0.45	0.30	0.27
O6	0.26	0.28	0.26	0.26	0.24	0.29	0.20	0.32	0.24	0.25	0.30	0.28	0.32	0.26	0.26	0.30	0.32	0.43	0.65	0.37
OP1	0.11	0.21	0.15	0.03	0.19	0.10	0.17	0.20	0.14	0.12	0.22	0.22	0.28	0.24	0.02	0.08	0.16	0.46	0.39	0.25
OP2	0.08	0.22	0.08	0.09	0.24	0.20	0.23	0.33	0.19	0.14	0.26	0.27	0.27	0.10	0.02	0.17	0.33	0.51	0.27	0.27
P	0.07	0.20	0.12	0.02	0.20	0.07	0.18	0.17	0.15	0.12	0.22	0.22	0.26	0.18	0.00	0.03	0.18	0.44	0.27	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.24	0.14	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.10	0.03	0.15	0.37	0.34	0.17
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.05	0.12	0.00	0.02	0.01	0.09	0.26	0.17	0.14
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.06	0.10	0.11	0.12	0.01	0.01	0.01	0.13	0.31	0.19	0.18
C4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.02	0.22	0.45	0.53	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.07	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.23	0.44	0.54	0.26
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.06	0.08	0.11	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.15	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.20	0.37	0.42	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.14	0.33	0.30	0.16
N3	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.19	0.42	0.44	0.22
N4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.02	0.24	0.47	0.60	0.28
O2	0.02	0.00	0.12	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.15	0.04	0.12	0.34	0.27	0.14
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.04	0.03	0.10	0.00	0.04	0.04	0.05	0.27	0.16	0.12
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.11	0.01	0.13	0.02	0.11	0.06	0.11	0.13	0.15	0.04	0.00	0.01	0.12	0.45	0.28	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.05	0.19	0.10	0.08
O5'	0.07	0.15	0.09	0.13	0.22	0.01	0.23	0.01	0.20	0.14	0.19	0.24	0.12	0.05	0.12	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.24	0.37	0.26	0.31	0.45	0.15	0.44	0.15	0.37	0.33	0.42	0.47	0.34	0.27	0.45	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.34	0.17	0.19	0.53	0.12	0.54	0.18	0.42	0.30	0.44	0.60	0.27	0.16	0.28	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.17	0.14	0.18	0.25	0.05	0.26	0.02	0.21	0.16	0.22	0.28	0.14	0.12	0.25	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00