Doublet Group distance statistics: 51083

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 6, 6, 9, 6, 3, 9, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.024, 0.034, 0.044, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.034 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.014, 0.025, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.024, 0.034, 0.044, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.034 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.023, 0.036, 0.048, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.036 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.024, 0.037, 0.051, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.037 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.028, 0.042, 0.057, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.042 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.033, 0.053, 0.073, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.053 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.034, 0.058, 0.083, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.058 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.049, 0.077, 0.104, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.077 std_dev=0.028
O6	A	0, 0.025, 0.053, 0.080, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.053 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.054, 0.087, 0.120, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.087 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.220, 0.342, 0.465, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.342 std_dev=0.123
C2'	A	0, 0.333, 0.478, 0.622, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.478 std_dev=0.145
C2	B	0, 0.489, 0.680, 0.871, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.680 std_dev=0.191
C2'	B	0, 0.573, 0.774, 0.975, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.774 std_dev=0.201
O5'	A	0, 0.470, 0.678, 0.885, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.678 std_dev=0.208
C3'	B	0, 0.392, 0.608, 0.825, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.608 std_dev=0.217
N1	B	0, 0.466, 0.688, 0.910, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.688 std_dev=0.222
O2	B	0, 0.575, 0.797, 1.019, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.797 std_dev=0.222
C1'	B	0, 0.542, 0.774, 1.006, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.774 std_dev=0.232
N3	B	0, 0.407, 0.642, 0.877, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.642 std_dev=0.235
OP2	A	0, 0.550, 0.789, 1.028, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.789 std_dev=0.239
C4'	A	0, 0.561, 0.803, 1.044, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.803 std_dev=0.242
N4	B	0, 0.547, 0.797, 1.048, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.797 std_dev=0.251
C5'	A	0, 0.489, 0.742, 0.995, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.742 std_dev=0.253
C4	B	0, 0.397, 0.654, 0.911, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.654 std_dev=0.257
O2'	B	0, 0.722, 0.981, 1.240, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.981 std_dev=0.259
P	A	0, 0.458, 0.718, 0.978, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.718 std_dev=0.260
C6	B	0, 0.381, 0.649, 0.916, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.649 std_dev=0.267
C5	B	0, 0.379, 0.656, 0.933, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.656 std_dev=0.277
O3'	B	0, 0.402, 0.684, 0.966, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.684 std_dev=0.282
C4'	B	0, 0.385, 0.680, 0.975, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.680 std_dev=0.295
O4'	B	0, 0.443, 0.756, 1.069, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.756 std_dev=0.313
OP1	A	0, 0.538, 0.852, 1.166, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.852 std_dev=0.314
C3'	A	0, 0.884, 1.264, 1.643, 1.741 max_d=1.741 avg_d=1.264 std_dev=0.380
O2'	A	0, 1.057, 1.441, 1.825, 1.793 max_d=1.793 avg_d=1.441 std_dev=0.384
C5'	B	0, 0.333, 0.760, 1.188, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.760 std_dev=0.427
O5'	B	0, 0.359, 0.931, 1.502, 2.239 max_d=2.239 avg_d=0.931 std_dev=0.571
P	B	0, 0.427, 1.119, 1.811, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.119 std_dev=0.692
O3'	A	0, 1.724, 2.476, 3.229, 3.133 max_d=3.133 avg_d=2.476 std_dev=0.753
OP2	B	0, 0.576, 1.624, 2.672, 3.740 max_d=3.740 avg_d=1.624 std_dev=1.048
OP1	B	0, 0.684, 1.888, 3.092, 3.900 max_d=3.900 avg_d=1.888 std_dev=1.204

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.18	0.00	0.12	0.03	0.11	0.18	0.12
C2	0.03	0.00	0.14	0.11	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.10	0.16	0.02	0.17	0.26	0.18
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.14	0.07	0.10	0.11	0.18	0.14	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.30	0.07	0.33	0.38	0.32
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.13	0.00	0.19	0.02	0.19	0.22	0.15	0.10	0.09	0.23	0.14	0.02	0.01	0.01	0.09	0.21	0.14	0.13	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.03	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.10	0.05	0.16	0.03	0.17	0.24	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.07	0.14	0.04	0.07	0.05	0.13	0.06	0.19	0.02	0.00	0.01	0.09	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.19	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.07	0.03	0.21	0.03	0.23	0.30	0.23
C5'	0.05	0.10	0.14	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.13	0.16	0.11	0.10	0.09	0.18	0.09	0.06	0.14	0.02	0.01	0.16	0.09	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.19	0.02	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.23	0.09	0.04	0.21	0.01	0.26	0.33	0.25
C8	0.01	0.01	0.10	0.22	0.01	0.14	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.15	0.08	0.21	0.03	0.21	0.24	0.21
N1	0.03	0.01	0.11	0.15	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.14	0.07	0.19	0.01	0.22	0.30	0.22
N2	0.04	0.01	0.18	0.10	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.27	0.12	0.15	0.02	0.15	0.25	0.17
N3	0.03	0.01	0.14	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.22	0.10	0.14	0.02	0.15	0.23	0.15
N7	0.01	0.01	0.08	0.23	0.01	0.13	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.15	0.06	0.24	0.04	0.27	0.31	0.27
N9	0.01	0.01	0.02	0.14	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.06	0.01	0.14	0.03	0.15	0.20	0.15
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.13	0.19	0.22	0.06	0.23	0.24	0.17	0.15	0.11	0.27	0.13	0.00	0.05	0.14	0.22	0.27	0.27	0.42	0.27
O3'	0.18	0.21	0.02	0.01	0.10	0.02	0.07	0.14	0.09	0.15	0.14	0.27	0.22	0.15	0.06	0.05	0.00	0.13	0.18	0.11	0.29	0.25	0.22
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.07	0.12	0.10	0.06	0.01	0.14	0.13	0.00	0.08	0.04	0.10	0.10	0.09
O5'	0.12	0.16	0.30	0.09	0.16	0.01	0.21	0.01	0.21	0.21	0.19	0.15	0.14	0.24	0.14	0.22	0.18	0.08	0.00	0.24	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.07	0.21	0.03	0.09	0.03	0.16	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.27	0.11	0.04	0.24	0.00	0.30	0.36	0.29
OP1	0.11	0.17	0.33	0.14	0.17	0.07	0.23	0.09	0.26	0.21	0.22	0.15	0.15	0.27	0.15	0.27	0.29	0.10	0.02	0.30	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.26	0.38	0.13	0.24	0.04	0.30	0.03	0.33	0.24	0.30	0.25	0.23	0.31	0.20	0.42	0.25	0.10	0.02	0.36	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.18	0.32	0.10	0.17	0.02	0.23	0.01	0.25	0.21	0.22	0.17	0.15	0.27	0.15	0.27	0.22	0.09	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.27	0.26	0.12	0.23	0.12	0.22	0.23	0.17	0.18	0.26	0.30	0.41	0.41	0.14	0.14	0.57	0.69	0.65	0.59
C2	0.24	0.26	0.27	0.18	0.21	0.18	0.25	0.25	0.22	0.22	0.21	0.29	0.35	0.34	0.17	0.19	0.77	1.07	1.07	0.83
C2'	0.16	0.23	0.16	0.23	0.22	0.24	0.24	0.43	0.21	0.14	0.25	0.27	0.37	0.30	0.26	0.16	0.58	0.76	0.74	0.65
C3'	0.17	0.24	0.18	0.10	0.22	0.09	0.20	0.20	0.17	0.16	0.26	0.27	0.33	0.30	0.11	0.10	0.51	0.65	0.52	0.54
C4	0.22	0.24	0.27	0.15	0.16	0.15	0.20	0.25	0.17	0.18	0.20	0.24	0.35	0.35	0.15	0.15	0.72	0.91	0.93	0.76
C4'	0.16	0.27	0.15	0.09	0.30	0.09	0.26	0.17	0.21	0.18	0.32	0.35	0.35	0.30	0.12	0.11	0.43	0.54	0.42	0.45
C5	0.23	0.27	0.29	0.20	0.13	0.19	0.16	0.28	0.16	0.20	0.24	0.17	0.35	0.34	0.20	0.18	0.80	0.99	1.03	0.84
C5'	0.21	0.33	0.20	0.15	0.34	0.14	0.30	0.20	0.26	0.25	0.36	0.37	0.39	0.27	0.13	0.17	0.36	0.53	0.36	0.38
C6	0.25	0.28	0.30	0.23	0.16	0.23	0.19	0.31	0.21	0.23	0.27	0.14	0.35	0.33	0.23	0.22	0.85	1.12	1.19	0.93
C8	0.23	0.28	0.31	0.18	0.19	0.17	0.20	0.29	0.16	0.20	0.25	0.23	0.38	0.37	0.18	0.18	0.69	0.79	0.76	0.70
N1	0.25	0.28	0.28	0.21	0.19	0.21	0.24	0.29	0.23	0.23	0.25	0.19	0.35	0.33	0.20	0.21	0.82	1.15	1.18	0.90
N2	0.25	0.26	0.26	0.18	0.25	0.19	0.28	0.25	0.24	0.23	0.23	0.34	0.35	0.35	0.17	0.21	0.76	1.11	1.09	0.84
N3	0.23	0.23	0.26	0.15	0.20	0.16	0.24	0.24	0.20	0.19	0.19	0.31	0.34	0.36	0.15	0.17	0.71	0.96	0.96	0.76
N7	0.24	0.29	0.32	0.23	0.18	0.21	0.17	0.31	0.15	0.22	0.26	0.21	0.36	0.35	0.24	0.21	0.79	0.92	0.94	0.82
N9	0.22	0.25	0.27	0.13	0.19	0.12	0.20	0.25	0.16	0.17	0.23	0.26	0.38	0.37	0.13	0.13	0.65	0.79	0.77	0.67
O2'	0.25	0.32	0.26	0.14	0.24	0.15	0.26	0.39	0.20	0.19	0.30	0.32	0.53	0.48	0.18	0.13	0.55	0.76	0.79	0.65
O3'	0.16	0.27	0.17	0.12	0.34	0.12	0.28	0.18	0.21	0.17	0.35	0.42	0.34	0.31	0.16	0.12	0.49	0.65	0.50	0.52
O4'	0.20	0.25	0.23	0.13	0.30	0.13	0.26	0.17	0.20	0.16	0.30	0.37	0.35	0.40	0.18	0.14	0.49	0.57	0.48	0.49
O5'	0.18	0.28	0.21	0.07	0.28	0.07	0.26	0.18	0.23	0.21	0.30	0.30	0.34	0.28	0.02	0.11	0.49	0.64	0.42	0.50
O6	0.27	0.30	0.32	0.28	0.22	0.28	0.21	0.36	0.24	0.26	0.31	0.23	0.35	0.33	0.28	0.27	0.90	1.20	1.30	1.00
OP1	0.08	0.18	0.13	0.03	0.19	0.08	0.20	0.19	0.17	0.11	0.20	0.22	0.26	0.19	0.03	0.05	0.30	0.71	0.50	0.32
OP2	0.08	0.12	0.09	0.08	0.21	0.20	0.26	0.35	0.24	0.13	0.16	0.23	0.15	0.10	0.02	0.16	0.57	0.79	0.50	0.56
P	0.05	0.15	0.11	0.02	0.18	0.09	0.21	0.20	0.18	0.10	0.18	0.21	0.21	0.16	0.01	0.04	0.41	0.66	0.40	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.17	0.53	0.19	0.19
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.04	0.40	0.86	0.52	0.42
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.05	0.13	0.00	0.03	0.01	0.26	0.37	0.15	0.25
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.03	0.12	0.05	0.09	0.10	0.12	0.02	0.01	0.01	0.34	0.38	0.15	0.29
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.60	1.16	0.81	0.65
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.14	0.24	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.03	0.63	1.18	0.79	0.68
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.14	0.01	0.15	0.00	0.13	0.07	0.10	0.15	0.05	0.04	0.05	0.01	0.01	0.16	0.43	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.55	1.00	0.57	0.54
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.39	0.81	0.43	0.39
N3	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.50	1.03	0.69	0.55
N4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.13	0.03	0.64	1.26	0.93	0.73
O2	0.03	0.00	0.13	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.14	0.05	0.30	0.74	0.43	0.33
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.06	0.05	0.13	0.00	0.06	0.03	0.07	0.23	0.11	0.10
O3'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.11	0.02	0.14	0.05	0.13	0.06	0.11	0.13	0.14	0.06	0.00	0.02	0.25	0.51	0.26	0.26
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.08	0.48	0.23	0.14
O5'	0.17	0.40	0.26	0.34	0.60	0.02	0.63	0.01	0.55	0.39	0.50	0.64	0.30	0.07	0.25	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.53	0.86	0.37	0.38	1.16	0.14	1.18	0.16	1.00	0.81	1.03	1.26	0.74	0.23	0.51	0.48	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.52	0.15	0.15	0.81	0.24	0.79	0.43	0.57	0.43	0.69	0.93	0.43	0.11	0.26	0.23	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.42	0.25	0.29	0.65	0.04	0.68	0.01	0.54	0.39	0.55	0.73	0.33	0.10	0.26	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00