Doublet Group distance statistics: 51084

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 5, 0, 3, 3, 4, 3, 8, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.031, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.016 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.010, 0.030, 0.051, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.013, 0.034, 0.055, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.034 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.014, 0.037, 0.060, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.037 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.016, 0.045, 0.074, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.045 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.020, 0.053, 0.086, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.053 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.015, 0.061, 0.106, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.061 std_dev=0.046
C8	A	0, 0.017, 0.071, 0.126, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.071 std_dev=0.055
C2'	A	0, 0.068, 0.213, 0.357, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.213 std_dev=0.145
O4'	A	0, 0.024, 0.171, 0.317, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.171 std_dev=0.146
N1	B	0, 0.225, 0.421, 0.616, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.421 std_dev=0.196
C6	B	0, 0.183, 0.408, 0.633, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.408 std_dev=0.225
C4'	A	0, 0.071, 0.297, 0.524, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.297 std_dev=0.227
C3'	A	0, 0.026, 0.285, 0.544, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.285 std_dev=0.259
O2'	A	0, 0.039, 0.333, 0.626, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.333 std_dev=0.294
C5'	A	0, 0.184, 0.522, 0.861, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.522 std_dev=0.338
C2	B	0, 0.328, 0.674, 1.020, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.674 std_dev=0.346
C1'	B	0, 0.218, 0.570, 0.922, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.570 std_dev=0.352
O5'	A	0, 0.185, 0.537, 0.889, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.537 std_dev=0.352
C5	B	0, 0.199, 0.560, 0.920, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.560 std_dev=0.360
O4'	B	0, 0.254, 0.653, 1.053, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.653 std_dev=0.400
C2'	B	0, 0.226, 0.626, 1.026, 1.987 max_d=1.987 avg_d=0.626 std_dev=0.400
C3'	B	0, 0.283, 0.689, 1.095, 2.026 max_d=2.026 avg_d=0.689 std_dev=0.406
C4	B	0, 0.287, 0.704, 1.121, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.704 std_dev=0.417
N3	B	0, 0.348, 0.779, 1.210, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.779 std_dev=0.431
O3'	A	0, -0.007, 0.432, 0.871, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.432 std_dev=0.439
P	A	0, 0.357, 0.799, 1.242, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.799 std_dev=0.443
C4'	B	0, 0.312, 0.791, 1.270, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.791 std_dev=0.479
OP2	A	0, 0.422, 0.915, 1.408, 2.091 max_d=2.091 avg_d=0.915 std_dev=0.493
O5'	B	0, 0.305, 0.811, 1.316, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.811 std_dev=0.505
O2	B	0, 0.437, 0.951, 1.465, 2.099 max_d=2.099 avg_d=0.951 std_dev=0.514
O3'	B	0, 0.385, 0.909, 1.432, 2.420 max_d=2.420 avg_d=0.909 std_dev=0.524
C5'	B	0, 0.351, 0.893, 1.435, 2.233 max_d=2.233 avg_d=0.893 std_dev=0.542
O2'	B	0, 0.359, 0.904, 1.450, 2.514 max_d=2.514 avg_d=0.904 std_dev=0.545
N4	B	0, 0.380, 0.978, 1.577, 2.150 max_d=2.150 avg_d=0.978 std_dev=0.599
OP1	A	0, 0.408, 1.007, 1.606, 2.215 max_d=2.215 avg_d=1.007 std_dev=0.599
P	B	0, 0.518, 1.175, 1.833, 2.665 max_d=2.665 avg_d=1.175 std_dev=0.657
OP2	B	0, 0.699, 1.607, 2.514, 3.197 max_d=3.197 avg_d=1.607 std_dev=0.908
OP1	B	0, 0.745, 1.702, 2.659, 3.717 max_d=3.717 avg_d=1.702 std_dev=0.957

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.11	0.03	0.12	0.26	0.15
C2	0.04	0.00	0.14	0.17	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.19	0.07	0.25	0.01	0.19	0.30	0.20
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.06	0.09	0.08	0.12	0.16	0.14	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.21	0.09	0.22	0.22	0.15
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.14	0.00	0.16	0.03	0.18	0.15	0.18	0.18	0.15	0.17	0.11	0.02	0.01	0.02	0.22	0.19	0.30	0.18	0.16
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.25	0.02	0.19	0.28	0.19
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.07	0.06	0.05	0.12	0.06	0.12	0.01	0.00	0.02	0.11	0.11	0.22	0.08
C5	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.03	0.32	0.02	0.26	0.33	0.26
C5'	0.03	0.11	0.06	0.03	0.12	0.01	0.18	0.00	0.19	0.20	0.15	0.09	0.09	0.22	0.11	0.07	0.09	0.01	0.01	0.22	0.14	0.22	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.18	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.17	0.17	0.04	0.33	0.01	0.29	0.36	0.28
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.12	0.01	0.20	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.14	0.06	0.32	0.03	0.24	0.28	0.23
N1	0.04	0.01	0.12	0.18	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.18	0.05	0.29	0.01	0.25	0.34	0.24
N2	0.05	0.01	0.16	0.18	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.23	0.08	0.22	0.02	0.18	0.29	0.18
N3	0.04	0.01	0.14	0.15	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.07	0.21	0.01	0.16	0.27	0.17
N7	0.01	0.01	0.07	0.17	0.01	0.12	0.01	0.22	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.16	0.05	0.36	0.03	0.30	0.35	0.29
N9	0.01	0.02	0.03	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.02	0.23	0.03	0.17	0.26	0.17
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.11	0.12	0.15	0.07	0.17	0.13	0.16	0.15	0.11	0.15	0.09	0.00	0.04	0.08	0.11	0.19	0.17	0.23	0.11
O3'	0.10	0.19	0.02	0.01	0.12	0.01	0.14	0.09	0.17	0.14	0.18	0.23	0.18	0.16	0.08	0.04	0.00	0.06	0.22	0.18	0.43	0.28	0.25
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.08	0.07	0.05	0.02	0.08	0.06	0.00	0.08	0.05	0.16	0.33	0.23
O5'	0.11	0.25	0.21	0.22	0.25	0.02	0.32	0.01	0.33	0.32	0.29	0.22	0.21	0.36	0.23	0.11	0.22	0.08	0.00	0.36	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.09	0.19	0.02	0.11	0.02	0.22	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.19	0.18	0.05	0.36	0.00	0.34	0.41	0.33
OP1	0.12	0.19	0.22	0.30	0.19	0.11	0.26	0.14	0.29	0.24	0.25	0.18	0.16	0.30	0.17	0.17	0.43	0.16	0.02	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.30	0.22	0.18	0.28	0.22	0.33	0.22	0.36	0.28	0.34	0.29	0.27	0.35	0.26	0.23	0.28	0.33	0.02	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.20	0.15	0.16	0.19	0.08	0.26	0.02	0.28	0.23	0.24	0.18	0.17	0.29	0.17	0.11	0.25	0.23	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.30	0.26	0.28	0.26	0.26	0.18	0.27	0.20	0.14	0.37	0.34	0.47	0.40	0.35	0.22	0.29	0.56	0.45	0.39
C2	0.25	0.25	0.28	0.24	0.33	0.23	0.26	0.28	0.21	0.21	0.31	0.47	0.32	0.38	0.27	0.22	0.38	0.76	0.61	0.51
C2'	0.17	0.28	0.19	0.21	0.22	0.20	0.18	0.24	0.19	0.12	0.34	0.31	0.46	0.34	0.27	0.16	0.31	0.63	0.55	0.46
C3'	0.13	0.35	0.12	0.14	0.25	0.12	0.21	0.20	0.19	0.15	0.38	0.31	0.53	0.24	0.18	0.11	0.29	0.55	0.49	0.41
C4	0.21	0.22	0.26	0.22	0.25	0.21	0.21	0.26	0.19	0.16	0.30	0.36	0.33	0.35	0.26	0.19	0.34	0.68	0.53	0.46
C4'	0.17	0.41	0.14	0.12	0.28	0.12	0.19	0.16	0.17	0.19	0.43	0.32	0.61	0.26	0.21	0.12	0.21	0.47	0.41	0.32
C5	0.18	0.19	0.22	0.20	0.20	0.19	0.21	0.28	0.18	0.15	0.22	0.29	0.27	0.30	0.24	0.16	0.38	0.76	0.59	0.52
C5'	0.33	0.49	0.34	0.19	0.31	0.20	0.22	0.16	0.22	0.31	0.46	0.32	0.69	0.43	0.17	0.26	0.17	0.45	0.39	0.27
C6	0.19	0.20	0.22	0.22	0.21	0.21	0.23	0.32	0.19	0.17	0.21	0.31	0.27	0.29	0.25	0.18	0.43	0.85	0.67	0.58
C8	0.17	0.21	0.22	0.19	0.19	0.17	0.23	0.23	0.23	0.13	0.24	0.24	0.34	0.30	0.23	0.14	0.31	0.62	0.50	0.44
N1	0.22	0.23	0.25	0.22	0.28	0.22	0.26	0.30	0.21	0.20	0.25	0.41	0.29	0.34	0.25	0.20	0.42	0.83	0.67	0.56
N2	0.27	0.26	0.30	0.26	0.36	0.25	0.29	0.29	0.23	0.23	0.33	0.52	0.33	0.41	0.28	0.25	0.38	0.77	0.62	0.51
N3	0.25	0.25	0.29	0.25	0.32	0.24	0.23	0.27	0.20	0.19	0.34	0.45	0.34	0.40	0.28	0.22	0.35	0.69	0.54	0.46
N7	0.16	0.18	0.21	0.20	0.19	0.19	0.24	0.28	0.21	0.13	0.21	0.25	0.27	0.27	0.24	0.15	0.37	0.72	0.56	0.50
N9	0.20	0.24	0.25	0.23	0.22	0.21	0.19	0.24	0.19	0.13	0.31	0.30	0.38	0.35	0.27	0.18	0.31	0.61	0.48	0.42
O2'	0.24	0.31	0.25	0.25	0.26	0.26	0.20	0.26	0.21	0.17	0.37	0.35	0.48	0.41	0.32	0.24	0.30	0.61	0.55	0.44
O3'	0.15	0.35	0.14	0.15	0.24	0.13	0.20	0.21	0.19	0.16	0.37	0.29	0.55	0.25	0.19	0.13	0.30	0.56	0.53	0.43
O4'	0.14	0.39	0.16	0.25	0.29	0.22	0.19	0.26	0.18	0.15	0.43	0.34	0.59	0.30	0.37	0.15	0.27	0.50	0.41	0.35
O5'	0.25	0.44	0.28	0.13	0.35	0.09	0.31	0.12	0.27	0.28	0.44	0.39	0.58	0.33	0.02	0.17	0.19	0.48	0.44	0.31
O6	0.17	0.20	0.21	0.23	0.18	0.24	0.22	0.37	0.19	0.16	0.21	0.25	0.26	0.26	0.27	0.19	0.47	0.93	0.74	0.64
OP1	0.05	0.20	0.10	0.05	0.19	0.15	0.29	0.27	0.27	0.09	0.21	0.23	0.35	0.15	0.02	0.10	0.31	0.74	0.61	0.47
OP2	0.13	0.20	0.16	0.08	0.27	0.17	0.37	0.31	0.35	0.18	0.23	0.31	0.28	0.17	0.02	0.15	0.30	0.58	0.58	0.44
P	0.06	0.21	0.11	0.01	0.19	0.08	0.27	0.17	0.25	0.10	0.21	0.23	0.34	0.15	0.01	0.04	0.19	0.53	0.48	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.10	0.24	0.21	0.12
C2	0.02	0.00	0.12	0.12	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.14	0.04	0.20	0.46	0.39	0.24
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.12	0.03	0.10	0.07	0.23	0.00	0.02	0.01	0.08	0.23	0.18	0.11
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.10	0.00	0.14	0.02	0.16	0.05	0.11	0.11	0.20	0.02	0.01	0.01	0.08	0.27	0.20	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02	0.22	0.61	0.54	0.30
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.05	0.06	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.15	0.13	0.03
C5	0.01	0.01	0.10	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.18	0.04	0.22	0.59	0.53	0.28
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.13	0.09	0.12	0.15	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.17	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.16	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.18	0.05	0.20	0.47	0.41	0.23
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.17	0.39	0.34	0.20
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.04	0.22	0.56	0.48	0.28
N4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.15	0.03	0.23	0.68	0.59	0.32
O2	0.04	0.00	0.23	0.20	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.21	0.25	0.07	0.20	0.41	0.35	0.22
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.06	0.05	0.08	0.04	0.08	0.02	0.09	0.07	0.21	0.00	0.05	0.04	0.05	0.21	0.15	0.08
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.13	0.02	0.18	0.04	0.18	0.05	0.14	0.15	0.25	0.05	0.00	0.02	0.11	0.42	0.31	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.03	0.07	0.04	0.02	0.00	0.10	0.22	0.20	0.15
O5'	0.10	0.20	0.08	0.08	0.22	0.02	0.22	0.01	0.20	0.17	0.22	0.23	0.20	0.05	0.11	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.24	0.46	0.23	0.27	0.61	0.15	0.59	0.17	0.47	0.39	0.56	0.68	0.41	0.21	0.42	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.39	0.18	0.20	0.54	0.13	0.53	0.22	0.41	0.34	0.48	0.59	0.35	0.15	0.31	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.24	0.11	0.14	0.30	0.03	0.28	0.01	0.23	0.20	0.28	0.32	0.22	0.08	0.21	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00