Doublet Group distance statistics: 51085

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 1, 0, 3, 2, 4, 9, 1, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.010, 0.029, 0.047, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.029 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.013, 0.034, 0.056, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.034 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.008, 0.039, 0.070, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.039 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.013, 0.048, 0.083, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.048 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.032, 0.129, 0.227, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.129 std_dev=0.097
C2'	A	0, 0.043, 0.159, 0.276, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.159 std_dev=0.116
O2'	A	0, 0.079, 0.220, 0.362, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.220 std_dev=0.142
C4'	A	0, 0.071, 0.246, 0.421, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.246 std_dev=0.175
C3'	A	0, 0.090, 0.268, 0.447, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.268 std_dev=0.178
O3'	A	0, 0.188, 0.412, 0.637, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.412 std_dev=0.224
C5	B	0, 0.577, 0.858, 1.139, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.858 std_dev=0.281
C6	B	0, 0.469, 0.771, 1.074, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.771 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.422, 0.725, 1.028, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.725 std_dev=0.303
C2	B	0, 0.525, 0.832, 1.139, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.832 std_dev=0.307
N1	B	0, 0.441, 0.750, 1.060, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.750 std_dev=0.310
O2'	B	0, 0.546, 0.861, 1.177, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.861 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.588, 0.904, 1.219, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.904 std_dev=0.316
O2	B	0, 0.573, 0.898, 1.224, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.898 std_dev=0.325
C5'	A	0, 0.077, 0.405, 0.732, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.405 std_dev=0.327
N3	B	0, 0.556, 0.892, 1.229, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.892 std_dev=0.337
C1'	B	0, 0.393, 0.734, 1.076, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.734 std_dev=0.342
C3'	B	0, 0.275, 0.634, 0.993, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.634 std_dev=0.359
O5'	A	0, 0.062, 0.431, 0.801, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.431 std_dev=0.370
P	A	0, 0.158, 0.531, 0.904, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.531 std_dev=0.373
O3'	B	0, 0.216, 0.600, 0.984, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.600 std_dev=0.384
N4	B	0, 0.624, 1.009, 1.393, 1.520 max_d=1.520 avg_d=1.009 std_dev=0.384
OP1	A	0, 0.196, 0.604, 1.012, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.604 std_dev=0.408
OP2	A	0, 0.155, 0.567, 0.979, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.567 std_dev=0.412
O4'	B	0, 0.326, 0.739, 1.152, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.739 std_dev=0.413
O5'	B	0, 0.497, 0.917, 1.337, 2.036 max_d=2.036 avg_d=0.917 std_dev=0.420
C4'	B	0, 0.272, 0.723, 1.174, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.723 std_dev=0.451
C5'	B	0, 0.353, 0.868, 1.382, 2.090 max_d=2.090 avg_d=0.868 std_dev=0.515
P	B	0, 0.675, 1.190, 1.706, 2.189 max_d=2.189 avg_d=1.190 std_dev=0.515
OP2	B	0, 0.755, 1.387, 2.019, 3.279 max_d=3.279 avg_d=1.387 std_dev=0.632
OP1	B	0, 0.826, 1.472, 2.119, 2.852 max_d=2.852 avg_d=1.472 std_dev=0.646

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.10	0.01	0.10	0.16	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.14	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.15	0.03	0.26	0.01	0.24	0.25	0.22
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.06	0.10	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.05	0.20	0.08	0.11
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.13	0.10	0.14	0.16	0.13	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.22	0.14	0.27	0.07	0.17
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.11	0.02	0.26	0.01	0.21	0.22	0.19
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.09	0.09	0.08	0.07	0.10	0.06	0.05	0.03	0.00	0.02	0.11	0.10	0.18	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.10	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.32	0.01	0.26	0.27	0.25
C5'	0.04	0.16	0.02	0.02	0.15	0.01	0.20	0.00	0.21	0.17	0.19	0.15	0.14	0.21	0.12	0.05	0.04	0.01	0.01	0.23	0.13	0.25	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.02	0.34	0.00	0.30	0.31	0.29
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.28	0.01	0.20	0.19	0.19
N1	0.02	0.00	0.06	0.14	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.02	0.31	0.01	0.28	0.30	0.26
N2	0.03	0.01	0.10	0.16	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.25	0.01	0.24	0.25	0.21
N3	0.02	0.00	0.08	0.13	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.23	0.01	0.21	0.21	0.18
N7	0.01	0.00	0.04	0.11	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.33	0.01	0.26	0.26	0.26
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.22	0.01	0.17	0.17	0.14
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.03	0.07	0.11	0.09	0.03	0.02	0.00	0.04	0.06	0.07	0.05	0.15	0.11	0.05
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.11	0.03	0.13	0.04	0.15	0.11	0.16	0.18	0.13	0.14	0.07	0.04	0.00	0.03	0.17	0.17	0.31	0.11	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.23	0.10
O5'	0.10	0.26	0.16	0.22	0.26	0.02	0.32	0.01	0.34	0.28	0.31	0.25	0.23	0.33	0.22	0.07	0.17	0.04	0.00	0.36	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.17	0.02	0.36	0.00	0.33	0.35	0.32
OP1	0.10	0.24	0.20	0.27	0.21	0.10	0.26	0.13	0.30	0.20	0.28	0.24	0.21	0.26	0.17	0.15	0.31	0.05	0.02	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.25	0.08	0.07	0.22	0.18	0.27	0.25	0.31	0.19	0.30	0.25	0.21	0.26	0.17	0.11	0.11	0.23	0.01	0.35	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.22	0.11	0.17	0.19	0.03	0.25	0.01	0.29	0.19	0.26	0.21	0.18	0.26	0.14	0.05	0.19	0.10	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.20	0.20	0.14	0.25	0.16	0.24	0.16	0.23	0.21	0.24	0.28	0.19	0.34	0.12	0.21	0.27	0.33	0.33	0.27
C2	0.19	0.16	0.16	0.16	0.25	0.15	0.25	0.23	0.20	0.17	0.17	0.33	0.22	0.30	0.18	0.16	0.35	0.45	0.62	0.41
C2'	0.20	0.18	0.17	0.10	0.23	0.11	0.21	0.12	0.19	0.18	0.22	0.27	0.19	0.32	0.12	0.16	0.27	0.37	0.34	0.27
C3'	0.14	0.16	0.14	0.13	0.20	0.11	0.19	0.15	0.17	0.14	0.20	0.24	0.18	0.27	0.18	0.11	0.27	0.41	0.31	0.28
C4	0.18	0.15	0.16	0.16	0.24	0.15	0.24	0.22	0.20	0.16	0.18	0.29	0.16	0.28	0.17	0.15	0.33	0.40	0.52	0.36
C4'	0.17	0.19	0.15	0.09	0.20	0.11	0.20	0.09	0.19	0.16	0.21	0.22	0.22	0.28	0.10	0.14	0.24	0.35	0.25	0.25
C5	0.17	0.15	0.16	0.20	0.20	0.20	0.23	0.29	0.20	0.16	0.14	0.24	0.20	0.24	0.22	0.17	0.38	0.47	0.61	0.43
C5'	0.16	0.19	0.17	0.12	0.19	0.15	0.20	0.12	0.18	0.16	0.20	0.21	0.26	0.27	0.17	0.15	0.22	0.35	0.24	0.23
C6	0.18	0.18	0.17	0.22	0.19	0.22	0.25	0.33	0.21	0.17	0.16	0.24	0.24	0.24	0.24	0.18	0.42	0.54	0.72	0.50
C8	0.17	0.16	0.17	0.19	0.19	0.18	0.21	0.24	0.19	0.17	0.17	0.21	0.19	0.23	0.20	0.17	0.31	0.38	0.43	0.33
N1	0.18	0.17	0.16	0.19	0.22	0.18	0.25	0.29	0.20	0.16	0.15	0.29	0.24	0.27	0.21	0.16	0.39	0.51	0.71	0.48
N2	0.21	0.17	0.17	0.15	0.26	0.14	0.26	0.22	0.20	0.17	0.18	0.35	0.23	0.33	0.16	0.18	0.34	0.44	0.63	0.41
N3	0.21	0.16	0.17	0.14	0.26	0.14	0.25	0.20	0.20	0.18	0.20	0.33	0.19	0.32	0.16	0.17	0.32	0.39	0.53	0.36
N7	0.19	0.18	0.19	0.24	0.17	0.24	0.21	0.32	0.20	0.18	0.15	0.19	0.21	0.23	0.25	0.21	0.38	0.46	0.56	0.42
N9	0.19	0.16	0.16	0.14	0.23	0.14	0.23	0.18	0.20	0.18	0.20	0.27	0.15	0.28	0.15	0.16	0.29	0.35	0.41	0.31
O2'	0.26	0.22	0.21	0.12	0.25	0.17	0.23	0.14	0.22	0.22	0.25	0.29	0.24	0.37	0.09	0.24	0.26	0.34	0.29	0.26
O3'	0.15	0.16	0.14	0.13	0.21	0.11	0.19	0.15	0.17	0.14	0.20	0.24	0.19	0.27	0.18	0.11	0.29	0.46	0.31	0.30
O4'	0.21	0.20	0.20	0.15	0.23	0.17	0.23	0.16	0.23	0.19	0.24	0.25	0.22	0.32	0.14	0.19	0.27	0.34	0.29	0.27
O5'	0.10	0.19	0.13	0.05	0.23	0.04	0.20	0.07	0.15	0.13	0.24	0.27	0.22	0.25	0.01	0.07	0.23	0.39	0.21	0.23
O6	0.20	0.22	0.18	0.26	0.19	0.27	0.26	0.39	0.24	0.20	0.21	0.21	0.27	0.23	0.28	0.22	0.47	0.62	0.82	0.57
OP1	0.03	0.12	0.05	0.02	0.15	0.06	0.17	0.10	0.14	0.07	0.14	0.19	0.18	0.10	0.02	0.04	0.17	0.44	0.33	0.23
OP2	0.10	0.14	0.14	0.05	0.22	0.10	0.24	0.20	0.20	0.14	0.18	0.24	0.13	0.16	0.02	0.08	0.24	0.47	0.24	0.26
P	0.04	0.11	0.07	0.01	0.16	0.04	0.16	0.10	0.14	0.07	0.14	0.19	0.14	0.12	0.00	0.02	0.19	0.41	0.22	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.09	0.14	0.15	0.07
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.04	0.19	0.26	0.31	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.05	0.12	0.00	0.02	0.01	0.12	0.19	0.12	0.11
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.09	0.06	0.09	0.10	0.11	0.02	0.01	0.01	0.17	0.25	0.13	0.16
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.27	0.37	0.47	0.26
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.16	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.28	0.36	0.46	0.27
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.13	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.10	0.23	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.04	0.24	0.28	0.34	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.18	0.23	0.26	0.14
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.23	0.33	0.40	0.21
N4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.29	0.41	0.54	0.29
O2	0.02	0.01	0.12	0.11	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.06	0.15	0.23	0.26	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.02	0.06	0.06	0.11	0.00	0.04	0.05	0.05	0.15	0.13	0.06
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.10	0.06	0.11	0.13	0.14	0.04	0.00	0.02	0.16	0.34	0.25	0.20
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.06	0.05	0.02	0.00	0.07	0.10	0.19	0.08
O5'	0.09	0.19	0.12	0.17	0.27	0.02	0.28	0.01	0.24	0.18	0.23	0.29	0.15	0.05	0.16	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.26	0.19	0.25	0.37	0.10	0.36	0.10	0.28	0.23	0.33	0.41	0.23	0.15	0.34	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.31	0.12	0.13	0.47	0.16	0.46	0.23	0.34	0.26	0.40	0.54	0.26	0.13	0.25	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.16	0.11	0.16	0.26	0.02	0.27	0.01	0.20	0.14	0.21	0.29	0.13	0.06	0.20	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00