Doublet Group distance statistics: 51086

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 3, 10, 3, 3, 4, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.024, 0.037, 0.051, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.019, 0.036, 0.053, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.023, 0.042, 0.061, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.042 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.009, 0.030, 0.052, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.030 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.041, 0.070, 0.099, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.070 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.033, 0.064, 0.096, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.064 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.033, 0.070, 0.108, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.070 std_dev=0.038
N1	B	0, 0.231, 0.416, 0.600, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.416 std_dev=0.184
C1'	B	0, 0.354, 0.560, 0.766, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.560 std_dev=0.206
C2'	B	0, 0.311, 0.525, 0.738, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.525 std_dev=0.214
C2	B	0, 0.191, 0.415, 0.638, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.415 std_dev=0.223
C3'	B	0, 0.508, 0.752, 0.997, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.752 std_dev=0.245
O2	B	0, 0.301, 0.560, 0.819, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.560 std_dev=0.259
C6	B	0, 0.402, 0.663, 0.924, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.663 std_dev=0.261
N3	B	0, 0.343, 0.626, 0.908, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.626 std_dev=0.283
O4'	B	0, 0.595, 0.886, 1.178, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.886 std_dev=0.291
C5	B	0, 0.490, 0.799, 1.109, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.799 std_dev=0.309
O4'	A	0, 0.097, 0.408, 0.719, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.408 std_dev=0.311
C4	B	0, 0.408, 0.741, 1.074, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.741 std_dev=0.333
O3'	B	0, 0.553, 0.888, 1.222, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.888 std_dev=0.334
O2'	B	0, 0.535, 0.879, 1.222, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.879 std_dev=0.344
C2'	A	0, 0.044, 0.395, 0.746, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.395 std_dev=0.351
C4'	B	0, 0.652, 1.033, 1.414, 1.591 max_d=1.591 avg_d=1.033 std_dev=0.381
N4	B	0, 0.569, 1.015, 1.461, 2.056 max_d=2.056 avg_d=1.015 std_dev=0.446
OP2	A	0, 0.606, 1.097, 1.588, 1.713 max_d=1.713 avg_d=1.097 std_dev=0.491
C5'	B	0, 0.891, 1.384, 1.877, 2.067 max_d=2.067 avg_d=1.384 std_dev=0.493
O5'	A	0, 0.461, 0.956, 1.450, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.956 std_dev=0.495
P	A	0, 0.505, 1.008, 1.510, 1.685 max_d=1.685 avg_d=1.008 std_dev=0.502
C4'	A	0, 0.219, 0.781, 1.343, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.781 std_dev=0.562
O5'	B	0, 0.893, 1.506, 2.119, 3.077 max_d=3.077 avg_d=1.506 std_dev=0.613
C5'	A	0, 0.413, 1.044, 1.675, 2.034 max_d=2.034 avg_d=1.044 std_dev=0.631
OP1	A	0, 0.658, 1.292, 1.926, 2.188 max_d=2.188 avg_d=1.292 std_dev=0.634
C3'	A	0, 0.151, 0.796, 1.441, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.796 std_dev=0.645
O2'	A	0, -0.020, 0.676, 1.371, 1.821 max_d=1.821 avg_d=0.676 std_dev=0.695
P	B	0, 1.092, 1.934, 2.775, 3.682 max_d=3.682 avg_d=1.934 std_dev=0.842
OP1	B	0, 1.433, 2.478, 3.523, 4.579 max_d=4.579 avg_d=2.478 std_dev=1.045
O3'	A	0, 0.207, 1.265, 2.323, 2.876 max_d=2.876 avg_d=1.265 std_dev=1.058
OP2	B	0, 1.326, 2.451, 3.576, 4.439 max_d=4.439 avg_d=2.451 std_dev=1.125

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.30	0.00	0.16	0.02	0.16	0.23	0.15
C2	0.03	0.00	0.24	0.21	0.01	0.04	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.17	0.33	0.13	0.17	0.02	0.15	0.22	0.14
C2'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.19	0.11	0.14	0.18	0.29	0.23	0.10	0.04	0.01	0.04	0.02	0.44	0.09	0.48	0.53	0.46
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.24	0.01	0.33	0.02	0.34	0.35	0.28	0.19	0.17	0.39	0.23	0.02	0.01	0.02	0.17	0.37	0.23	0.14	0.13
C4	0.02	0.01	0.12	0.24	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.19	0.07	0.17	0.01	0.15	0.20	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.11	0.21	0.05	0.08	0.05	0.20	0.09	0.30	0.03	0.01	0.02	0.14	0.09	0.14	0.03
C5	0.01	0.02	0.07	0.33	0.01	0.13	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.34	0.16	0.04	0.24	0.01	0.22	0.25	0.20
C5'	0.06	0.08	0.19	0.02	0.08	0.01	0.15	0.00	0.15	0.20	0.11	0.10	0.08	0.22	0.08	0.11	0.22	0.01	0.01	0.19	0.09	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.34	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.34	0.18	0.06	0.26	0.01	0.25	0.30	0.24
C8	0.02	0.02	0.14	0.35	0.01	0.21	0.00	0.20	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.36	0.22	0.10	0.24	0.02	0.19	0.18	0.16
N1	0.02	0.01	0.18	0.28	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.25	0.23	0.10	0.21	0.01	0.20	0.27	0.19
N2	0.04	0.01	0.29	0.19	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.44	0.16	0.15	0.02	0.14	0.22	0.12
N3	0.03	0.00	0.23	0.17	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.35	0.13	0.14	0.01	0.13	0.20	0.11
N7	0.01	0.02	0.10	0.39	0.01	0.20	0.01	0.22	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.41	0.25	0.07	0.29	0.02	0.26	0.26	0.25
N9	0.01	0.01	0.04	0.23	0.00	0.09	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.22	0.11	0.01	0.14	0.02	0.13	0.18	0.10
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.22	0.30	0.34	0.11	0.34	0.36	0.25	0.16	0.13	0.41	0.22	0.00	0.06	0.21	0.29	0.41	0.34	0.58	0.36
O3'	0.30	0.33	0.04	0.01	0.19	0.03	0.16	0.22	0.18	0.22	0.23	0.44	0.35	0.25	0.11	0.06	0.00	0.20	0.29	0.21	0.44	0.37	0.34
O4'	0.00	0.13	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.10	0.10	0.16	0.13	0.07	0.01	0.21	0.20	0.00	0.09	0.05	0.08	0.19	0.11
O5'	0.16	0.17	0.44	0.17	0.17	0.02	0.24	0.01	0.26	0.24	0.21	0.15	0.14	0.29	0.14	0.29	0.29	0.09	0.00	0.30	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.09	0.37	0.01	0.14	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.41	0.21	0.05	0.30	0.00	0.30	0.35	0.29
OP1	0.16	0.15	0.48	0.23	0.15	0.09	0.22	0.09	0.25	0.19	0.20	0.14	0.13	0.26	0.13	0.34	0.44	0.08	0.02	0.30	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.22	0.53	0.14	0.20	0.14	0.25	0.16	0.30	0.18	0.27	0.22	0.20	0.26	0.18	0.58	0.37	0.19	0.02	0.35	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.14	0.46	0.13	0.13	0.03	0.20	0.02	0.24	0.16	0.19	0.12	0.11	0.25	0.10	0.36	0.34	0.11	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.23	0.14	0.15	0.21	0.13	0.22	0.17	0.22	0.15	0.29	0.25	0.37	0.22	0.16	0.13	0.48	0.54	0.57	0.46
C2	0.15	0.14	0.14	0.09	0.25	0.11	0.27	0.17	0.23	0.16	0.19	0.34	0.20	0.23	0.08	0.14	0.51	0.74	0.77	0.53
C2'	0.22	0.20	0.26	0.33	0.19	0.31	0.26	0.36	0.30	0.18	0.26	0.24	0.33	0.30	0.37	0.26	0.68	0.80	0.85	0.70
C3'	0.12	0.25	0.12	0.14	0.25	0.12	0.20	0.19	0.16	0.13	0.31	0.31	0.35	0.26	0.17	0.10	0.51	0.55	0.54	0.47
C4	0.14	0.15	0.13	0.09	0.20	0.10	0.25	0.15	0.24	0.13	0.22	0.25	0.25	0.21	0.08	0.12	0.51	0.63	0.68	0.50
C4'	0.21	0.26	0.20	0.14	0.21	0.15	0.19	0.16	0.20	0.19	0.28	0.23	0.37	0.31	0.16	0.17	0.44	0.51	0.47	0.40
C5	0.14	0.16	0.15	0.13	0.13	0.14	0.24	0.20	0.24	0.13	0.19	0.17	0.25	0.20	0.14	0.14	0.55	0.69	0.76	0.56
C5'	0.30	0.32	0.30	0.20	0.22	0.22	0.20	0.20	0.22	0.25	0.30	0.23	0.42	0.40	0.19	0.26	0.45	0.62	0.48	0.43
C6	0.15	0.16	0.16	0.16	0.14	0.17	0.24	0.25	0.23	0.15	0.18	0.17	0.23	0.20	0.17	0.16	0.57	0.80	0.86	0.61
C8	0.16	0.21	0.18	0.12	0.14	0.13	0.23	0.17	0.26	0.14	0.22	0.16	0.34	0.23	0.13	0.14	0.56	0.58	0.66	0.54
N1	0.15	0.15	0.14	0.12	0.20	0.14	0.26	0.21	0.23	0.15	0.17	0.27	0.21	0.20	0.12	0.15	0.54	0.81	0.85	0.58
N2	0.17	0.16	0.16	0.10	0.27	0.12	0.29	0.16	0.24	0.17	0.20	0.37	0.20	0.26	0.09	0.15	0.50	0.77	0.78	0.53
N3	0.15	0.15	0.14	0.10	0.25	0.10	0.26	0.14	0.23	0.15	0.23	0.32	0.21	0.23	0.10	0.13	0.49	0.65	0.69	0.49
N7	0.17	0.19	0.19	0.17	0.12	0.17	0.24	0.21	0.26	0.14	0.20	0.15	0.29	0.23	0.20	0.15	0.58	0.65	0.74	0.57
N9	0.14	0.19	0.13	0.10	0.18	0.11	0.23	0.15	0.24	0.13	0.25	0.22	0.32	0.21	0.10	0.12	0.51	0.56	0.62	0.49
O2'	0.15	0.25	0.12	0.22	0.25	0.18	0.37	0.30	0.34	0.17	0.27	0.29	0.47	0.23	0.23	0.15	0.67	0.85	0.99	0.76
O3'	0.21	0.28	0.19	0.18	0.21	0.17	0.18	0.26	0.18	0.19	0.29	0.24	0.38	0.33	0.27	0.14	0.51	0.57	0.56	0.49
O4'	0.16	0.24	0.14	0.17	0.23	0.14	0.23	0.17	0.23	0.17	0.28	0.25	0.35	0.21	0.20	0.13	0.42	0.44	0.44	0.39
O5'	0.21	0.34	0.24	0.08	0.28	0.07	0.21	0.11	0.18	0.22	0.36	0.31	0.44	0.33	0.02	0.13	0.47	0.65	0.53	0.47
O6	0.17	0.19	0.19	0.22	0.15	0.23	0.23	0.32	0.22	0.17	0.22	0.18	0.24	0.21	0.24	0.19	0.60	0.89	0.96	0.67
OP1	0.08	0.22	0.12	0.02	0.19	0.07	0.14	0.18	0.11	0.10	0.25	0.22	0.32	0.19	0.02	0.04	0.38	0.87	0.56	0.46
OP2	0.07	0.21	0.12	0.07	0.21	0.17	0.19	0.31	0.18	0.11	0.25	0.25	0.28	0.15	0.02	0.14	0.64	0.91	0.71	0.66
P	0.06	0.22	0.12	0.01	0.19	0.07	0.14	0.17	0.12	0.10	0.24	0.22	0.30	0.18	0.01	0.03	0.45	0.77	0.53	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.11	0.43	0.20	0.17
C2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.28	0.73	0.47	0.36
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.09	0.06	0.17	0.00	0.01	0.01	0.19	0.25	0.18	0.15
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.09	0.06	0.14	0.12	0.18	0.02	0.01	0.01	0.28	0.34	0.20	0.22
C4	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.41	0.97	0.70	0.51
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.12	0.18	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.04	0.43	0.96	0.68	0.50
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.14	0.08	0.12	0.17	0.07	0.04	0.05	0.01	0.01	0.18	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.04	0.37	0.80	0.50	0.40
N1	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.26	0.66	0.39	0.31
N3	0.02	0.00	0.09	0.14	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.03	0.36	0.87	0.60	0.45
N4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.14	0.03	0.45	1.05	0.79	0.57
O2	0.03	0.01	0.17	0.18	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.20	0.04	0.22	0.63	0.40	0.31
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.08	0.06	0.13	0.00	0.03	0.04	0.08	0.17	0.12	0.05
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.12	0.02	0.11	0.05	0.10	0.06	0.16	0.14	0.20	0.03	0.00	0.01	0.28	0.57	0.32	0.30
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.11	0.42	0.22	0.20
O5'	0.11	0.28	0.19	0.28	0.41	0.02	0.43	0.01	0.37	0.26	0.36	0.45	0.22	0.08	0.28	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.43	0.73	0.25	0.34	0.97	0.12	0.96	0.18	0.80	0.66	0.87	1.05	0.63	0.17	0.57	0.42	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.47	0.18	0.20	0.70	0.18	0.68	0.33	0.50	0.39	0.60	0.79	0.40	0.12	0.32	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.36	0.15	0.22	0.51	0.04	0.50	0.01	0.40	0.31	0.45	0.57	0.31	0.05	0.30	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00