Doublet Group distance statistics: 51087

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 4, 5, 1, 5, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.027 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.013, 0.036, 0.059, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.036 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.014, 0.046, 0.078, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.046 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.024, 0.149, 0.273, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.149 std_dev=0.124
C2'	A	0, 0.025, 0.179, 0.332, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.179 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.076, 0.249, 0.422, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.249 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.155, 0.371, 0.587, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.371 std_dev=0.216
O2'	A	0, 0.041, 0.258, 0.475, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.258 std_dev=0.217
C3'	A	0, 0.072, 0.293, 0.513, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.293 std_dev=0.220
C2	B	0, 0.197, 0.427, 0.657, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.427 std_dev=0.230
C6	B	0, 0.182, 0.414, 0.645, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.414 std_dev=0.232
C2'	B	0, 0.160, 0.393, 0.626, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.393 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.217, 0.461, 0.705, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.461 std_dev=0.244
C1'	B	0, 0.176, 0.423, 0.671, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.423 std_dev=0.247
C5	B	0, 0.204, 0.469, 0.733, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.469 std_dev=0.264
C4	B	0, 0.191, 0.460, 0.729, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.460 std_dev=0.269
O5'	A	0, 0.113, 0.386, 0.660, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.386 std_dev=0.273
O2	B	0, 0.269, 0.543, 0.818, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.543 std_dev=0.274
C3'	B	0, 0.179, 0.454, 0.728, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.454 std_dev=0.275
O2'	B	0, 0.228, 0.505, 0.782, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.505 std_dev=0.277
P	A	0, 0.146, 0.427, 0.708, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.427 std_dev=0.281
O3'	B	0, 0.197, 0.485, 0.774, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.485 std_dev=0.289
O4'	B	0, 0.223, 0.532, 0.840, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.532 std_dev=0.309
O3'	A	0, 0.151, 0.466, 0.782, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.466 std_dev=0.315
OP1	A	0, 0.171, 0.493, 0.816, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.493 std_dev=0.323
C4'	B	0, 0.239, 0.572, 0.905, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.572 std_dev=0.333
N4	B	0, 0.222, 0.561, 0.900, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.561 std_dev=0.339
C5'	A	0, 0.071, 0.436, 0.801, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.436 std_dev=0.365
OP2	A	0, 0.143, 0.539, 0.936, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.539 std_dev=0.397
C5'	B	0, 0.277, 0.692, 1.107, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.692 std_dev=0.415
O5'	B	0, 0.236, 0.790, 1.344, 2.136 max_d=2.136 avg_d=0.790 std_dev=0.554
P	B	0, 0.307, 0.996, 1.685, 2.440 max_d=2.440 avg_d=0.996 std_dev=0.689
OP2	B	0, 0.342, 1.069, 1.796, 2.552 max_d=2.552 avg_d=1.069 std_dev=0.727
OP1	B	0, 0.386, 1.132, 1.878, 2.510 max_d=2.510 avg_d=1.132 std_dev=0.746

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.06	0.25	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.16	0.04	0.20	0.01	0.14	0.30	0.16
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.06	0.08	0.09	0.14	0.12	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.06	0.18	0.15	0.08
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.08	0.12	0.11	0.17	0.13	0.11	0.05	0.01	0.01	0.01	0.22	0.08	0.25	0.15	0.15
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.19	0.01	0.12	0.28	0.15
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.03	0.06	0.04	0.00	0.02	0.07	0.11	0.22	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.24	0.01	0.17	0.30	0.19
C5'	0.02	0.13	0.03	0.03	0.11	0.01	0.13	0.00	0.15	0.11	0.15	0.13	0.11	0.13	0.08	0.05	0.05	0.01	0.01	0.16	0.10	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.25	0.00	0.20	0.32	0.22
C8	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.22	0.02	0.14	0.27	0.16
N1	0.03	0.00	0.09	0.11	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.23	0.01	0.17	0.31	0.20
N2	0.04	0.00	0.14	0.17	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.21	0.05	0.19	0.01	0.13	0.30	0.16
N3	0.03	0.00	0.12	0.13	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.04	0.17	0.01	0.11	0.28	0.14
N7	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.26	0.02	0.19	0.29	0.21
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.16	0.01	0.10	0.26	0.12
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.07	0.06	0.06	0.05	0.08	0.05	0.11	0.16	0.12	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.08	0.08	0.20	0.18	0.07
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.08	0.04	0.09	0.05	0.10	0.14	0.13	0.21	0.15	0.14	0.05	0.05	0.00	0.03	0.20	0.11	0.34	0.22	0.22
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.03	0.00	0.08	0.03	0.07	0.30	0.14
O5'	0.07	0.20	0.15	0.22	0.19	0.02	0.24	0.01	0.25	0.22	0.23	0.19	0.17	0.26	0.16	0.08	0.20	0.08	0.00	0.27	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.03	0.27	0.00	0.23	0.33	0.24
OP1	0.06	0.14	0.18	0.25	0.12	0.11	0.17	0.10	0.20	0.14	0.17	0.13	0.11	0.19	0.10	0.20	0.34	0.07	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.30	0.15	0.15	0.28	0.22	0.30	0.24	0.32	0.27	0.31	0.30	0.28	0.29	0.26	0.18	0.22	0.30	0.02	0.33	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.16	0.08	0.15	0.15	0.03	0.19	0.02	0.22	0.16	0.20	0.16	0.14	0.21	0.12	0.07	0.22	0.14	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.27	0.18	0.16	0.24	0.17	0.22	0.19	0.18	0.19	0.26	0.27	0.37	0.26	0.16	0.17	0.43	0.45	0.47	0.44
C2	0.22	0.28	0.18	0.20	0.38	0.22	0.40	0.31	0.32	0.27	0.31	0.45	0.31	0.23	0.17	0.24	0.65	0.72	0.82	0.74
C2'	0.15	0.26	0.14	0.11	0.23	0.11	0.22	0.13	0.18	0.17	0.27	0.28	0.37	0.24	0.13	0.13	0.50	0.57	0.56	0.53
C3'	0.17	0.19	0.17	0.16	0.20	0.15	0.26	0.16	0.24	0.17	0.20	0.23	0.28	0.24	0.19	0.16	0.56	0.66	0.60	0.59
C4	0.21	0.26	0.18	0.20	0.30	0.21	0.32	0.28	0.28	0.24	0.26	0.32	0.30	0.23	0.17	0.22	0.61	0.65	0.71	0.66
C4'	0.15	0.16	0.14	0.11	0.17	0.12	0.20	0.11	0.18	0.14	0.17	0.20	0.24	0.24	0.15	0.13	0.40	0.46	0.39	0.40
C5	0.22	0.23	0.21	0.24	0.26	0.27	0.34	0.35	0.30	0.24	0.21	0.27	0.26	0.23	0.21	0.26	0.68	0.74	0.80	0.74
C5'	0.26	0.18	0.26	0.19	0.18	0.21	0.23	0.16	0.26	0.22	0.17	0.18	0.22	0.35	0.22	0.24	0.44	0.51	0.38	0.44
C6	0.23	0.23	0.21	0.25	0.30	0.29	0.38	0.40	0.33	0.25	0.22	0.32	0.25	0.22	0.23	0.29	0.72	0.83	0.90	0.83
C8	0.21	0.22	0.22	0.22	0.16	0.23	0.22	0.28	0.20	0.19	0.17	0.18	0.29	0.25	0.19	0.23	0.57	0.59	0.58	0.58
N1	0.23	0.26	0.19	0.23	0.36	0.27	0.41	0.37	0.34	0.27	0.28	0.42	0.28	0.22	0.20	0.27	0.70	0.80	0.89	0.81
N2	0.23	0.29	0.18	0.19	0.41	0.22	0.41	0.30	0.33	0.27	0.34	0.50	0.32	0.23	0.16	0.24	0.65	0.73	0.84	0.74
N3	0.21	0.28	0.17	0.18	0.35	0.20	0.35	0.26	0.29	0.25	0.31	0.41	0.32	0.23	0.16	0.21	0.60	0.65	0.73	0.66
N7	0.23	0.20	0.23	0.26	0.18	0.29	0.27	0.36	0.26	0.21	0.16	0.20	0.25	0.24	0.23	0.27	0.67	0.72	0.73	0.71
N9	0.19	0.25	0.18	0.18	0.23	0.19	0.25	0.24	0.22	0.20	0.23	0.25	0.32	0.24	0.16	0.19	0.54	0.56	0.59	0.56
O2'	0.19	0.31	0.16	0.11	0.27	0.13	0.22	0.13	0.18	0.20	0.32	0.32	0.43	0.25	0.11	0.16	0.40	0.48	0.48	0.43
O3'	0.16	0.19	0.17	0.17	0.20	0.17	0.26	0.17	0.24	0.16	0.20	0.24	0.30	0.25	0.22	0.16	0.55	0.70	0.63	0.61
O4'	0.15	0.18	0.16	0.17	0.17	0.15	0.18	0.17	0.15	0.14	0.18	0.21	0.27	0.25	0.19	0.14	0.37	0.37	0.36	0.36
O5'	0.14	0.15	0.16	0.07	0.20	0.06	0.28	0.06	0.25	0.15	0.15	0.23	0.23	0.26	0.02	0.10	0.37	0.48	0.42	0.42
O6	0.24	0.20	0.22	0.28	0.25	0.34	0.37	0.45	0.33	0.24	0.20	0.28	0.22	0.23	0.26	0.32	0.77	0.91	0.98	0.90
OP1	0.09	0.10	0.12	0.02	0.09	0.03	0.17	0.12	0.15	0.06	0.08	0.11	0.19	0.22	0.01	0.04	0.21	0.41	0.32	0.30
OP2	0.09	0.19	0.12	0.06	0.19	0.10	0.26	0.20	0.24	0.15	0.19	0.20	0.25	0.15	0.01	0.10	0.58	0.74	0.56	0.63
P	0.05	0.08	0.09	0.01	0.10	0.03	0.19	0.09	0.17	0.05	0.07	0.11	0.17	0.17	0.01	0.02	0.34	0.48	0.34	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.16	0.17	0.15	0.16
C2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.35	0.34	0.39	0.37
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.07	0.07	0.11	0.01	0.02	0.01	0.19	0.25	0.10	0.17
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.02	0.10	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03	0.00	0.01	0.24	0.31	0.11	0.21
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.02	0.52	0.55	0.61	0.58
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.12	0.17	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.03	0.56	0.58	0.61	0.60
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.07	0.12	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.14	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.49	0.47	0.44	0.48
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.35	0.33	0.32	0.34
N3	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.44	0.45	0.51	0.48
N4	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.02	0.56	0.63	0.70	0.64
O2	0.02	0.01	0.11	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.11	0.04	0.26	0.25	0.31	0.29
O2'	0.01	0.10	0.01	0.03	0.07	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.10	0.08	0.14	0.00	0.07	0.03	0.06	0.20	0.07	0.07
O3'	0.02	0.06	0.02	0.00	0.07	0.02	0.12	0.04	0.11	0.04	0.06	0.08	0.11	0.07	0.00	0.02	0.14	0.34	0.19	0.20
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.06	0.10	0.19	0.12
O5'	0.16	0.35	0.19	0.24	0.52	0.01	0.56	0.01	0.49	0.35	0.44	0.56	0.26	0.06	0.14	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.34	0.25	0.31	0.55	0.12	0.58	0.14	0.47	0.33	0.45	0.63	0.25	0.20	0.34	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.39	0.10	0.11	0.61	0.17	0.61	0.28	0.44	0.32	0.51	0.70	0.31	0.07	0.19	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.37	0.17	0.21	0.58	0.01	0.60	0.01	0.48	0.34	0.48	0.64	0.29	0.07	0.20	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00