Doublet Group distance statistics: 51088

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 3, 2, 2, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.013, 0.026, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.012, 0.034, 0.057, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.034 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.019, 0.045, 0.071, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.045 std_dev=0.026
N1	B	0, 0.137, 0.315, 0.493, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.315 std_dev=0.178
C2	B	0, 0.190, 0.376, 0.562, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.376 std_dev=0.186
C6	B	0, 0.126, 0.314, 0.502, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.314 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.181, 0.377, 0.573, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.377 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.138, 0.337, 0.537, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.337 std_dev=0.200
O4'	A	0, -0.047, 0.160, 0.368, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.160 std_dev=0.208
C5	B	0, 0.120, 0.329, 0.539, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.329 std_dev=0.209
C1'	B	0, 0.164, 0.384, 0.603, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.384 std_dev=0.220
C2'	A	0, -0.025, 0.203, 0.431, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.203 std_dev=0.228
O2	B	0, 0.231, 0.489, 0.747, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.489 std_dev=0.258
N4	B	0, 0.135, 0.403, 0.671, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.403 std_dev=0.268
O4'	B	0, 0.143, 0.415, 0.686, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.415 std_dev=0.272
C4'	A	0, -0.037, 0.236, 0.510, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.236 std_dev=0.274
C2'	B	0, 0.118, 0.414, 0.711, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.414 std_dev=0.296
C4'	B	0, 0.152, 0.474, 0.796, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.474 std_dev=0.322
C3'	A	0, -0.052, 0.275, 0.603, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.275 std_dev=0.328
C3'	B	0, 0.119, 0.475, 0.831, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.475 std_dev=0.356
C5'	A	0, -0.021, 0.348, 0.717, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.348 std_dev=0.369
C5'	B	0, 0.166, 0.551, 0.936, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.551 std_dev=0.385
O5'	B	0, 0.160, 0.553, 0.947, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.553 std_dev=0.394
O2'	B	0, 0.069, 0.526, 0.982, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.526 std_dev=0.456
O2'	A	0, -0.039, 0.429, 0.896, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.429 std_dev=0.467
O3'	A	0, -0.163, 0.398, 0.959, 2.643 max_d=2.643 avg_d=0.398 std_dev=0.561
O3'	B	0, 0.034, 0.603, 1.173, 2.117 max_d=2.117 avg_d=0.603 std_dev=0.570
P	B	0, 0.105, 0.678, 1.252, 2.262 max_d=2.262 avg_d=0.678 std_dev=0.574
O5'	A	0, -0.179, 0.528, 1.235, 2.537 max_d=2.537 avg_d=0.528 std_dev=0.707
OP2	B	0, 0.006, 0.717, 1.427, 3.133 max_d=3.133 avg_d=0.717 std_dev=0.711
OP1	B	0, -0.202, 0.922, 2.047, 5.024 max_d=5.024 avg_d=0.922 std_dev=1.124
OP1	A	0, -0.247, 0.969, 2.186, 4.226 max_d=4.226 avg_d=0.969 std_dev=1.217
P	A	0, -0.517, 0.816, 2.149, 4.642 max_d=4.642 avg_d=0.816 std_dev=1.333
OP2	A	0, -0.662, 1.235, 3.132, 6.529 max_d=6.529 avg_d=1.235 std_dev=1.897

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.17	0.00	0.30	0.01	0.27	0.47	0.32
C2	0.02	0.00	0.10	0.05	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.22	0.15	0.36	0.01	0.44	0.71	0.52
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.16	0.04	0.08	0.07	0.13	0.10	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.56	0.03	0.51	0.76	0.54
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.16	0.02	0.15	0.23	0.10	0.04	0.03	0.23	0.12	0.01	0.01	0.01	0.28	0.18	0.19	0.31	0.16
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.12	0.08	0.45	0.01	0.51	0.88	0.64
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.15	0.08	0.12	0.08	0.14	0.06	0.15	0.02	0.00	0.02	0.10	0.09	0.09	0.08
C5	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.09	0.04	0.57	0.00	0.70	1.20	0.87
C5'	0.08	0.20	0.16	0.02	0.19	0.01	0.23	0.00	0.25	0.23	0.23	0.20	0.18	0.26	0.16	0.07	0.12	0.02	0.01	0.27	0.10	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.15	0.01	0.08	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.09	0.07	0.55	0.00	0.72	1.20	0.87
C8	0.01	0.01	0.08	0.23	0.00	0.15	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.18	0.07	0.66	0.01	0.73	1.30	0.94
N1	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.14	0.12	0.46	0.01	0.59	0.96	0.71
N2	0.03	0.00	0.13	0.04	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.29	0.18	0.30	0.01	0.36	0.55	0.39
N3	0.02	0.01	0.10	0.03	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.23	0.15	0.33	0.01	0.38	0.62	0.44
N7	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.14	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.17	0.04	0.68	0.01	0.84	1.46	1.05
N9	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.08	0.01	0.48	0.01	0.50	0.87	0.63
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.14	0.15	0.17	0.07	0.18	0.22	0.18	0.26	0.20	0.23	0.11	0.00	0.04	0.12	0.51	0.20	0.49	0.78	0.49
O3'	0.17	0.22	0.02	0.01	0.12	0.02	0.09	0.12	0.09	0.18	0.14	0.29	0.23	0.17	0.08	0.04	0.00	0.14	0.13	0.10	0.19	0.15	0.16
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.02	0.07	0.07	0.12	0.18	0.15	0.04	0.01	0.12	0.14	0.00	0.06	0.05	0.09	0.16	0.09
O5'	0.30	0.36	0.56	0.28	0.45	0.02	0.57	0.01	0.55	0.66	0.46	0.30	0.33	0.68	0.48	0.51	0.13	0.06	0.00	0.60	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.18	0.01	0.10	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.10	0.05	0.60	0.00	0.83	1.37	0.99
OP1	0.27	0.44	0.51	0.19	0.51	0.09	0.70	0.10	0.72	0.73	0.59	0.36	0.38	0.84	0.50	0.49	0.19	0.09	0.02	0.83	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.71	0.76	0.31	0.88	0.09	1.20	0.06	1.20	1.30	0.96	0.55	0.62	1.46	0.87	0.78	0.15	0.16	0.01	1.37	0.01	0.00	0.00
P	0.32	0.52	0.54	0.16	0.64	0.08	0.87	0.01	0.87	0.94	0.71	0.39	0.44	1.05	0.63	0.49	0.16	0.09	0.01	0.99	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.21	0.12	0.11	0.10	0.11	0.19	0.13	0.20	0.12	0.18	0.11	0.38	0.19	0.10	0.12	0.18	0.31	0.40	0.24
C2	0.16	0.18	0.15	0.19	0.15	0.18	0.22	0.20	0.21	0.17	0.17	0.14	0.23	0.16	0.23	0.17	0.21	0.42	0.42	0.23
C2'	0.10	0.19	0.12	0.23	0.09	0.21	0.20	0.29	0.21	0.09	0.17	0.11	0.35	0.11	0.24	0.15	0.38	0.55	0.58	0.44
C3'	0.12	0.15	0.15	0.25	0.13	0.20	0.28	0.27	0.29	0.12	0.13	0.14	0.34	0.12	0.27	0.15	0.38	0.50	0.42	0.42
C4	0.16	0.21	0.18	0.19	0.09	0.17	0.19	0.16	0.18	0.13	0.17	0.10	0.33	0.20	0.25	0.16	0.15	0.26	0.43	0.17
C4'	0.16	0.19	0.21	0.31	0.16	0.25	0.27	0.30	0.29	0.17	0.17	0.16	0.36	0.15	0.35	0.19	0.39	0.47	0.43	0.42
C5	0.17	0.21	0.23	0.28	0.10	0.23	0.17	0.22	0.13	0.13	0.17	0.15	0.31	0.24	0.39	0.20	0.17	0.23	0.50	0.18
C5'	0.34	0.27	0.40	0.55	0.33	0.46	0.46	0.54	0.48	0.35	0.26	0.33	0.33	0.27	0.61	0.39	0.65	0.71	0.67	0.67
C6	0.17	0.18	0.23	0.31	0.11	0.26	0.14	0.27	0.13	0.14	0.17	0.17	0.25	0.22	0.41	0.21	0.25	0.32	0.53	0.23
C8	0.17	0.22	0.24	0.23	0.10	0.20	0.19	0.19	0.15	0.11	0.17	0.14	0.37	0.31	0.36	0.18	0.20	0.34	0.51	0.27
N1	0.16	0.17	0.18	0.25	0.11	0.22	0.18	0.25	0.17	0.15	0.15	0.11	0.21	0.17	0.33	0.18	0.25	0.42	0.48	0.26
N2	0.17	0.17	0.14	0.17	0.21	0.17	0.24	0.21	0.22	0.18	0.18	0.22	0.19	0.17	0.19	0.18	0.23	0.52	0.41	0.27
N3	0.17	0.20	0.15	0.16	0.14	0.16	0.21	0.16	0.21	0.17	0.19	0.13	0.29	0.17	0.19	0.17	0.16	0.34	0.39	0.19
N7	0.19	0.22	0.27	0.32	0.13	0.26	0.19	0.24	0.12	0.12	0.17	0.18	0.33	0.31	0.47	0.22	0.19	0.27	0.55	0.23
N9	0.15	0.22	0.18	0.15	0.08	0.15	0.19	0.14	0.18	0.11	0.17	0.10	0.37	0.23	0.21	0.15	0.16	0.27	0.44	0.21
O2'	0.13	0.28	0.09	0.15	0.18	0.13	0.17	0.24	0.18	0.14	0.30	0.21	0.43	0.19	0.18	0.10	0.34	0.57	0.63	0.44
O3'	0.16	0.29	0.18	0.26	0.15	0.21	0.21	0.27	0.24	0.16	0.28	0.14	0.49	0.17	0.30	0.17	0.37	0.48	0.40	0.40
O4'	0.10	0.17	0.10	0.14	0.15	0.12	0.23	0.14	0.23	0.11	0.16	0.17	0.33	0.17	0.14	0.11	0.21	0.29	0.33	0.24
O5'	0.19	0.19	0.27	0.56	0.37	0.36	0.55	0.54	0.51	0.27	0.21	0.40	0.37	0.33	0.66	0.22	0.77	0.91	0.91	0.84
O6	0.19	0.18	0.26	0.37	0.15	0.31	0.11	0.34	0.10	0.15	0.18	0.24	0.23	0.25	0.49	0.24	0.31	0.35	0.59	0.29
OP1	0.53	0.37	0.60	0.98	0.60	0.87	0.82	1.13	0.81	0.56	0.40	0.62	0.36	0.54	1.17	0.66	1.33	1.59	1.48	1.45
OP2	0.29	0.30	0.39	1.05	0.72	0.77	1.01	1.20	0.94	0.50	0.40	0.78	0.45	0.30	1.14	0.49	1.60	1.88	1.92	1.78
P	0.45	0.26	0.59	1.14	0.63	0.93	0.90	1.22	0.89	0.55	0.34	0.65	0.21	0.24	1.34	0.65	1.46	1.66	1.61	1.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.35	0.14	0.09
C2	0.02	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.10	0.04	0.11	0.60	0.20	0.22
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.03	0.08	0.05	0.19	0.00	0.03	0.01	0.04	0.18	0.11	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.17	0.08	0.10	0.15	0.14	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.08	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.13	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.17	0.02	0.18	0.69	0.28	0.29
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.09	0.05	0.06	0.03	0.00	0.01	0.11	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.18	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.23	0.04	0.19	0.60	0.30	0.26
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.15	0.01	0.16	0.00	0.13	0.08	0.12	0.17	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.17	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.20	0.05	0.15	0.50	0.25	0.19
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.09	0.50	0.19	0.17
N3	0.02	0.00	0.08	0.10	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.15	0.69	0.24	0.27
N4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.20	0.02	0.21	0.73	0.31	0.33
O2	0.04	0.00	0.19	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.18	0.07	0.09	0.59	0.18	0.20
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.03	0.11	0.05	0.24	0.00	0.07	0.06	0.06	0.18	0.06	0.08
O3'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.17	0.03	0.23	0.03	0.20	0.08	0.12	0.20	0.18	0.07	0.00	0.02	0.14	0.27	0.21	0.18
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.07	0.06	0.02	0.00	0.08	0.32	0.13	0.09
O5'	0.04	0.11	0.04	0.08	0.18	0.01	0.19	0.01	0.15	0.09	0.15	0.21	0.09	0.06	0.14	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.35	0.60	0.18	0.12	0.69	0.11	0.60	0.07	0.50	0.50	0.69	0.73	0.59	0.18	0.27	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.20	0.11	0.08	0.28	0.05	0.30	0.15	0.25	0.19	0.24	0.31	0.18	0.06	0.21	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.22	0.07	0.08	0.29	0.02	0.26	0.01	0.19	0.17	0.27	0.33	0.20	0.08	0.18	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00