Doublet Group distance statistics: 51089

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.003, 0.021, 0.039, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.004, 0.023, 0.041, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.023 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.008, 0.030, 0.051, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.006, 0.030, 0.054, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.030 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.008, 0.036, 0.064, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.036 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.029, 0.207, 0.385, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.207 std_dev=0.178
C2'	A	0, 0.022, 0.233, 0.443, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.233 std_dev=0.211
O2'	A	0, 0.028, 0.275, 0.521, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.275 std_dev=0.246
C6	B	0, 0.196, 0.459, 0.722, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.459 std_dev=0.263
C4'	A	0, 0.062, 0.327, 0.593, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.327 std_dev=0.265
C3'	A	0, 0.058, 0.376, 0.695, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.376 std_dev=0.319
C5	B	0, 0.202, 0.560, 0.919, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.560 std_dev=0.359
N1	B	0, 0.175, 0.576, 0.978, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.576 std_dev=0.402
C5'	A	0, 0.100, 0.558, 1.016, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.558 std_dev=0.458
O3'	A	0, 0.085, 0.563, 1.040, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.563 std_dev=0.477
C4	B	0, 0.235, 0.732, 1.229, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.732 std_dev=0.497
C2'	B	0, 0.153, 0.651, 1.149, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.651 std_dev=0.498
C1'	B	0, 0.157, 0.673, 1.190, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.673 std_dev=0.516
C2	B	0, 0.209, 0.748, 1.287, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.748 std_dev=0.539
N3	B	0, 0.243, 0.800, 1.357, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.800 std_dev=0.557
C3'	B	0, 0.088, 0.662, 1.236, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.662 std_dev=0.574
O4'	B	0, 0.155, 0.749, 1.343, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.749 std_dev=0.594
O5'	A	0, 0.003, 0.627, 1.251, 2.323 max_d=2.323 avg_d=0.627 std_dev=0.624
O2'	B	0, 0.186, 0.821, 1.455, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.821 std_dev=0.634
O3'	B	0, 0.082, 0.719, 1.356, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.719 std_dev=0.637
N4	B	0, 0.287, 0.943, 1.600, 1.959 max_d=1.959 avg_d=0.943 std_dev=0.657
C4'	B	0, 0.133, 0.802, 1.472, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.802 std_dev=0.670
O2	B	0, 0.241, 0.948, 1.656, 2.045 max_d=2.045 avg_d=0.948 std_dev=0.707
P	A	0, 0.041, 0.765, 1.490, 2.339 max_d=2.339 avg_d=0.765 std_dev=0.724
O5'	B	0, 0.158, 0.913, 1.667, 2.395 max_d=2.395 avg_d=0.913 std_dev=0.754
C5'	B	0, 0.156, 0.970, 1.784, 2.176 max_d=2.176 avg_d=0.970 std_dev=0.814
OP2	A	0, 0.025, 0.846, 1.667, 2.724 max_d=2.724 avg_d=0.846 std_dev=0.821
OP1	A	0, 0.059, 0.895, 1.732, 2.742 max_d=2.742 avg_d=0.895 std_dev=0.836
P	B	0, 0.187, 1.111, 2.035, 2.646 max_d=2.646 avg_d=1.111 std_dev=0.924
OP1	B	0, 0.248, 1.265, 2.281, 2.916 max_d=2.916 avg_d=1.265 std_dev=1.016
OP2	B	0, 0.148, 1.200, 2.253, 3.493 max_d=3.493 avg_d=1.200 std_dev=1.053

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.14	0.01	0.15	0.08	0.11
C2	0.01	0.00	0.17	0.18	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.24	0.06	0.32	0.01	0.30	0.28	0.28
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.08	0.12	0.20	0.17	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.15	0.06	0.18	0.06	0.11
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.13	0.12	0.16	0.22	0.17	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.19	0.13	0.23	0.09	0.15
C4	0.01	0.00	0.09	0.11	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.04	0.34	0.01	0.32	0.26	0.29
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.17	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.44	0.01	0.41	0.37	0.39
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.09	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.09	0.15	0.24	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.16	0.04	0.46	0.00	0.44	0.42	0.41
C8	0.00	0.01	0.08	0.12	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.14	0.03	0.45	0.01	0.39	0.29	0.37
N1	0.01	0.00	0.12	0.16	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.20	0.05	0.40	0.00	0.38	0.36	0.35
N2	0.02	0.01	0.20	0.22	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.29	0.07	0.28	0.01	0.27	0.25	0.25
N3	0.01	0.00	0.17	0.17	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.21	0.05	0.28	0.00	0.26	0.22	0.24
N7	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.14	0.02	0.50	0.01	0.47	0.41	0.44
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.32	0.01	0.28	0.19	0.25
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.07	0.03	0.03	0.02	0.06	0.05	0.10	0.19	0.14	0.04	0.01	0.00	0.06	0.03	0.05	0.05	0.10	0.09	0.04
O3'	0.02	0.24	0.01	0.01	0.12	0.02	0.12	0.03	0.16	0.14	0.20	0.29	0.21	0.14	0.05	0.06	0.00	0.02	0.15	0.17	0.24	0.14	0.15
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.03	0.14	0.15	0.10
O5'	0.14	0.32	0.15	0.19	0.34	0.01	0.44	0.01	0.46	0.45	0.40	0.28	0.28	0.50	0.32	0.05	0.15	0.09	0.00	0.50	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.17	0.03	0.50	0.00	0.50	0.48	0.46
OP1	0.15	0.30	0.18	0.23	0.32	0.09	0.41	0.15	0.44	0.39	0.38	0.27	0.26	0.47	0.28	0.10	0.24	0.14	0.01	0.50	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.28	0.06	0.09	0.26	0.17	0.37	0.24	0.42	0.29	0.36	0.25	0.22	0.41	0.19	0.09	0.14	0.15	0.01	0.48	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.28	0.11	0.15	0.29	0.02	0.39	0.01	0.41	0.37	0.35	0.25	0.24	0.44	0.25	0.04	0.15	0.10	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.25	0.25	0.22	0.21	0.25	0.21	0.34	0.24	0.24	0.25	0.22	0.29	0.31	0.16	0.27	0.46	0.48	0.68	0.59
C2	0.15	0.22	0.19	0.18	0.18	0.17	0.10	0.32	0.10	0.14	0.27	0.28	0.28	0.24	0.22	0.12	0.44	0.63	0.76	0.64
C2'	0.22	0.29	0.20	0.16	0.24	0.18	0.20	0.29	0.21	0.23	0.30	0.24	0.35	0.26	0.12	0.21	0.41	0.41	0.67	0.54
C3'	0.11	0.25	0.11	0.12	0.17	0.13	0.11	0.23	0.09	0.13	0.27	0.19	0.36	0.19	0.16	0.12	0.32	0.29	0.58	0.42
C4	0.16	0.13	0.21	0.22	0.13	0.23	0.10	0.37	0.12	0.12	0.16	0.25	0.17	0.25	0.24	0.19	0.47	0.61	0.76	0.66
C4'	0.10	0.29	0.11	0.11	0.23	0.10	0.15	0.20	0.11	0.14	0.32	0.26	0.40	0.21	0.09	0.11	0.33	0.26	0.54	0.41
C5	0.14	0.16	0.21	0.26	0.27	0.28	0.17	0.44	0.11	0.11	0.25	0.40	0.18	0.23	0.31	0.21	0.52	0.70	0.82	0.72
C5'	0.14	0.33	0.15	0.13	0.26	0.12	0.21	0.15	0.17	0.19	0.34	0.28	0.45	0.24	0.17	0.13	0.27	0.14	0.48	0.32
C6	0.13	0.22	0.20	0.26	0.34	0.26	0.20	0.44	0.12	0.13	0.33	0.51	0.23	0.21	0.31	0.19	0.51	0.74	0.84	0.73
C8	0.24	0.15	0.28	0.32	0.15	0.35	0.14	0.48	0.16	0.17	0.15	0.25	0.21	0.29	0.33	0.31	0.54	0.61	0.76	0.69
N1	0.13	0.25	0.19	0.22	0.29	0.21	0.14	0.38	0.10	0.14	0.33	0.45	0.28	0.22	0.27	0.13	0.47	0.70	0.80	0.69
N2	0.17	0.25	0.19	0.15	0.16	0.14	0.10	0.28	0.10	0.15	0.28	0.22	0.33	0.26	0.19	0.11	0.41	0.61	0.74	0.61
N3	0.17	0.17	0.20	0.18	0.09	0.18	0.11	0.32	0.13	0.14	0.17	0.18	0.23	0.27	0.20	0.15	0.44	0.59	0.74	0.62
N7	0.19	0.15	0.25	0.32	0.26	0.36	0.20	0.52	0.14	0.13	0.21	0.37	0.17	0.26	0.36	0.29	0.57	0.71	0.83	0.75
N9	0.21	0.13	0.24	0.24	0.09	0.27	0.13	0.39	0.17	0.16	0.11	0.18	0.18	0.28	0.24	0.25	0.49	0.56	0.73	0.64
O2'	0.31	0.41	0.27	0.19	0.37	0.22	0.31	0.29	0.31	0.34	0.44	0.38	0.47	0.33	0.10	0.29	0.43	0.41	0.67	0.55
O3'	0.10	0.30	0.07	0.13	0.21	0.13	0.12	0.23	0.10	0.15	0.32	0.22	0.42	0.12	0.17	0.12	0.30	0.23	0.55	0.39
O4'	0.18	0.25	0.22	0.19	0.23	0.20	0.15	0.28	0.14	0.15	0.29	0.27	0.33	0.29	0.15	0.20	0.40	0.39	0.59	0.50
O5'	0.08	0.19	0.11	0.07	0.24	0.08	0.27	0.13	0.21	0.10	0.22	0.29	0.28	0.17	0.02	0.07	0.11	0.19	0.21	0.13
O6	0.14	0.24	0.20	0.28	0.39	0.30	0.26	0.48	0.15	0.16	0.36	0.57	0.24	0.21	0.35	0.22	0.53	0.80	0.86	0.77
OP1	0.05	0.17	0.08	0.01	0.22	0.04	0.29	0.12	0.24	0.08	0.19	0.27	0.31	0.16	0.01	0.02	0.17	0.33	0.17	0.20
OP2	0.13	0.22	0.09	0.08	0.41	0.12	0.48	0.19	0.41	0.24	0.30	0.46	0.18	0.05	0.02	0.14	0.18	0.25	0.16	0.13
P	0.02	0.15	0.05	0.01	0.26	0.05	0.32	0.10	0.26	0.11	0.20	0.30	0.23	0.09	0.00	0.04	0.10	0.21	0.12	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.12	0.08	0.10
C2	0.01	0.00	0.10	0.13	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.14	0.02	0.13	0.15	0.16	0.14
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.09	0.03	0.08	0.07	0.19	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.12	0.09
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.12	0.00	0.15	0.02	0.15	0.07	0.13	0.14	0.18	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.11	0.08
C4	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.16	0.01	0.14	0.16	0.19	0.17
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03
C5	0.00	0.00	0.09	0.15	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.20	0.03	0.13	0.15	0.18	0.16
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.05	0.04	0.06	0.06	0.07	0.05	0.02	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.00	0.00	0.09	0.15	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.17	0.04	0.12	0.13	0.13	0.14
N1	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.11	0.13	0.12	0.13
N3	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.16	0.01	0.14	0.16	0.19	0.16
N4	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.19	0.02	0.14	0.16	0.21	0.18
O2	0.01	0.00	0.19	0.18	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.23	0.04	0.13	0.16	0.16	0.14
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.05	0.06	0.05	0.06	0.02	0.05	0.04	0.15	0.00	0.04	0.04	0.03	0.07	0.07	0.05
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.16	0.02	0.20	0.02	0.17	0.07	0.16	0.19	0.23	0.04	0.00	0.02	0.09	0.13	0.12	0.08
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.00	0.09	0.13	0.07	0.09
O5'	0.08	0.13	0.07	0.07	0.14	0.02	0.13	0.01	0.12	0.11	0.14	0.14	0.13	0.03	0.09	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.15	0.07	0.08	0.16	0.06	0.15	0.07	0.13	0.13	0.16	0.16	0.16	0.07	0.13	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.16	0.12	0.11	0.19	0.02	0.18	0.02	0.13	0.12	0.19	0.21	0.16	0.07	0.12	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.14	0.09	0.08	0.17	0.03	0.16	0.01	0.14	0.13	0.16	0.18	0.14	0.05	0.08	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00