Doublet Group distance statistics: 51093

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 3, 1, 1, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.015, 0.028, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.015, 0.031, 0.046, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.019, 0.037, 0.055, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.037 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.020, 0.039, 0.058, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.039 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.021, 0.045, 0.068, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.026, 0.051, 0.076, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.051 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.092, 0.247, 0.402, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.247 std_dev=0.155
O4'	A	0, 0.088, 0.248, 0.409, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.248 std_dev=0.161
O2'	A	0, 0.265, 0.431, 0.597, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.431 std_dev=0.166
C4'	A	0, 0.226, 0.460, 0.694, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.460 std_dev=0.234
C3'	A	0, 0.209, 0.450, 0.691, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.450 std_dev=0.241
N1	B	0, 0.370, 0.623, 0.875, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.623 std_dev=0.253
C6	B	0, 0.254, 0.511, 0.769, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.511 std_dev=0.257
O3'	A	0, 0.330, 0.651, 0.973, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.651 std_dev=0.321
C5	B	0, 0.491, 0.846, 1.200, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.846 std_dev=0.354
C1'	B	0, 0.482, 0.883, 1.284, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.883 std_dev=0.401
C2'	B	0, 0.477, 0.886, 1.295, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.886 std_dev=0.409
C5'	A	0, 0.375, 0.786, 1.198, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.786 std_dev=0.411
C2	B	0, 0.528, 0.948, 1.369, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.948 std_dev=0.420
O5'	A	0, 0.263, 0.700, 1.137, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.700 std_dev=0.437
C4	B	0, 0.633, 1.118, 1.602, 1.758 max_d=1.758 avg_d=1.118 std_dev=0.485
N3	B	0, 0.627, 1.139, 1.652, 1.788 max_d=1.788 avg_d=1.139 std_dev=0.513
C3'	B	0, 0.397, 0.931, 1.465, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.931 std_dev=0.534
O4'	B	0, 0.405, 0.982, 1.558, 2.050 max_d=2.050 avg_d=0.982 std_dev=0.577
O2	B	0, 0.649, 1.273, 1.898, 2.120 max_d=2.120 avg_d=1.273 std_dev=0.625
O2'	B	0, 0.671, 1.301, 1.931, 2.272 max_d=2.272 avg_d=1.301 std_dev=0.630
P	A	0, 0.297, 0.990, 1.683, 2.272 max_d=2.272 avg_d=0.990 std_dev=0.693
O3'	B	0, 0.464, 1.159, 1.854, 2.378 max_d=2.378 avg_d=1.159 std_dev=0.695
C4'	B	0, 0.421, 1.137, 1.854, 2.515 max_d=2.515 avg_d=1.137 std_dev=0.717
N4	B	0, 0.826, 1.561, 2.295, 2.680 max_d=2.680 avg_d=1.561 std_dev=0.734
OP2	A	0, 0.302, 1.039, 1.777, 2.413 max_d=2.413 avg_d=1.039 std_dev=0.738
O5'	B	0, 0.332, 1.106, 1.880, 2.623 max_d=2.623 avg_d=1.106 std_dev=0.774
C5'	B	0, 0.385, 1.255, 2.125, 2.950 max_d=2.950 avg_d=1.255 std_dev=0.870
OP1	A	0, 0.333, 1.257, 2.180, 2.917 max_d=2.917 avg_d=1.257 std_dev=0.924
P	B	0, 0.466, 1.502, 2.539, 3.474 max_d=3.474 avg_d=1.502 std_dev=1.037
OP2	B	0, 0.544, 1.661, 2.778, 3.449 max_d=3.449 avg_d=1.661 std_dev=1.117
OP1	B	0, 0.546, 1.685, 2.824, 3.890 max_d=3.890 avg_d=1.685 std_dev=1.139

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.11	0.02	0.12	0.16	0.16
C2	0.03	0.00	0.14	0.19	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.23	0.03	0.26	0.01	0.30	0.39	0.29
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.03	0.02	0.03	0.05	0.10	0.10	0.18	0.14	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.04	0.14	0.14	0.09
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.13	0.00	0.14	0.02	0.15	0.17	0.17	0.22	0.17	0.16	0.09	0.01	0.00	0.01	0.13	0.16	0.22	0.21	0.15
C4	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.14	0.02	0.23	0.01	0.25	0.32	0.26
C4'	0.01	0.08	0.03	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.10	0.08	0.09	0.07	0.11	0.05	0.09	0.02	0.00	0.02	0.10	0.06	0.03	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.27	0.02	0.32	0.39	0.31
C5'	0.04	0.13	0.03	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.18	0.19	0.16	0.12	0.11	0.21	0.11	0.09	0.02	0.02	0.01	0.21	0.07	0.03	0.03
C6	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.29	0.01	0.36	0.45	0.35
C8	0.01	0.01	0.10	0.17	0.01	0.10	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.19	0.04	0.22	0.03	0.23	0.24	0.23
N1	0.02	0.00	0.10	0.17	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.02	0.28	0.01	0.35	0.44	0.34
N2	0.03	0.00	0.18	0.22	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.29	0.04	0.25	0.02	0.30	0.40	0.29
N3	0.02	0.00	0.14	0.17	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.21	0.03	0.23	0.02	0.25	0.33	0.26
N7	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.11	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.20	0.03	0.27	0.04	0.31	0.35	0.31
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.18	0.02	0.19	0.24	0.21
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.08	0.09	0.06	0.09	0.09	0.06	0.14	0.21	0.16	0.05	0.03	0.00	0.05	0.07	0.08	0.08	0.14	0.09	0.06
O3'	0.02	0.23	0.02	0.00	0.14	0.02	0.16	0.02	0.19	0.19	0.21	0.29	0.21	0.20	0.09	0.05	0.00	0.02	0.18	0.20	0.36	0.34	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.13	0.02	0.19	0.24	0.24
O5'	0.11	0.26	0.09	0.13	0.23	0.02	0.27	0.01	0.29	0.22	0.28	0.25	0.23	0.27	0.18	0.08	0.18	0.13	0.00	0.30	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.16	0.01	0.10	0.02	0.21	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.08	0.20	0.02	0.30	0.00	0.40	0.48	0.38
OP1	0.12	0.30	0.14	0.22	0.25	0.06	0.32	0.07	0.36	0.23	0.35	0.30	0.25	0.31	0.19	0.14	0.36	0.19	0.02	0.40	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.39	0.14	0.21	0.32	0.03	0.39	0.03	0.45	0.24	0.44	0.40	0.33	0.35	0.24	0.09	0.34	0.24	0.02	0.48	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.29	0.09	0.15	0.26	0.05	0.31	0.03	0.35	0.23	0.34	0.29	0.26	0.31	0.21	0.06	0.26	0.24	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.27	0.35	0.31	0.32	0.34	0.25	0.30	0.24	0.22	0.36	0.40	0.31	0.52	0.34	0.31	0.28	0.43	0.49	0.33
C2	0.33	0.23	0.33	0.26	0.29	0.26	0.30	0.30	0.23	0.23	0.19	0.44	0.36	0.51	0.28	0.27	0.43	0.62	0.72	0.56
C2'	0.22	0.24	0.23	0.16	0.30	0.20	0.21	0.17	0.17	0.16	0.33	0.38	0.29	0.42	0.19	0.21	0.23	0.45	0.64	0.40
C3'	0.11	0.27	0.11	0.06	0.27	0.05	0.17	0.08	0.12	0.13	0.33	0.33	0.35	0.23	0.05	0.08	0.22	0.46	0.71	0.44
C4	0.29	0.18	0.32	0.27	0.30	0.27	0.28	0.29	0.24	0.21	0.23	0.39	0.22	0.45	0.28	0.26	0.38	0.53	0.59	0.46
C4'	0.12	0.30	0.11	0.11	0.25	0.14	0.13	0.14	0.11	0.13	0.35	0.30	0.42	0.22	0.18	0.12	0.16	0.38	0.56	0.31
C5	0.23	0.15	0.26	0.28	0.23	0.28	0.27	0.37	0.24	0.19	0.15	0.29	0.20	0.35	0.28	0.25	0.48	0.62	0.67	0.57
C5'	0.28	0.43	0.26	0.13	0.30	0.14	0.19	0.09	0.19	0.28	0.42	0.31	0.55	0.28	0.07	0.22	0.16	0.36	0.56	0.31
C6	0.22	0.20	0.25	0.28	0.18	0.29	0.28	0.42	0.23	0.18	0.16	0.26	0.30	0.34	0.29	0.24	0.57	0.74	0.81	0.69
C8	0.23	0.22	0.27	0.29	0.23	0.29	0.23	0.32	0.23	0.21	0.25	0.25	0.25	0.31	0.28	0.27	0.36	0.46	0.49	0.39
N1	0.28	0.24	0.29	0.26	0.22	0.26	0.29	0.36	0.23	0.21	0.18	0.36	0.38	0.42	0.28	0.23	0.52	0.71	0.81	0.65
N2	0.37	0.26	0.36	0.26	0.29	0.28	0.30	0.28	0.23	0.25	0.20	0.47	0.41	0.55	0.29	0.30	0.42	0.63	0.73	0.56
N3	0.35	0.21	0.35	0.27	0.32	0.29	0.29	0.28	0.24	0.24	0.24	0.46	0.29	0.53	0.29	0.30	0.37	0.54	0.62	0.47
N7	0.23	0.14	0.25	0.32	0.18	0.34	0.23	0.42	0.24	0.19	0.13	0.20	0.16	0.28	0.31	0.30	0.49	0.59	0.59	0.53
N9	0.27	0.22	0.32	0.28	0.29	0.28	0.25	0.28	0.24	0.21	0.29	0.36	0.23	0.43	0.29	0.27	0.32	0.46	0.51	0.38
O2'	0.32	0.28	0.31	0.24	0.34	0.31	0.24	0.25	0.22	0.23	0.37	0.43	0.34	0.52	0.26	0.32	0.21	0.42	0.61	0.35
O3'	0.13	0.26	0.12	0.11	0.27	0.09	0.18	0.12	0.14	0.14	0.33	0.34	0.33	0.23	0.09	0.11	0.27	0.52	0.83	0.53
O4'	0.21	0.29	0.28	0.32	0.27	0.33	0.19	0.32	0.20	0.16	0.36	0.33	0.39	0.41	0.40	0.26	0.29	0.44	0.47	0.33
O5'	0.18	0.32	0.18	0.09	0.21	0.07	0.14	0.06	0.14	0.19	0.31	0.22	0.42	0.20	0.01	0.13	0.17	0.41	0.61	0.37
O6	0.20	0.22	0.22	0.31	0.11	0.35	0.26	0.52	0.24	0.16	0.23	0.16	0.31	0.28	0.33	0.27	0.67	0.84	0.93	0.80
OP1	0.07	0.16	0.11	0.02	0.12	0.06	0.19	0.15	0.18	0.07	0.16	0.14	0.27	0.20	0.02	0.04	0.26	0.49	0.68	0.42
OP2	0.11	0.16	0.10	0.07	0.24	0.10	0.31	0.16	0.30	0.18	0.20	0.26	0.17	0.10	0.02	0.10	0.25	0.49	0.71	0.46
P	0.05	0.15	0.08	0.02	0.13	0.04	0.17	0.10	0.18	0.08	0.16	0.15	0.23	0.14	0.01	0.02	0.20	0.44	0.64	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.08	0.08	0.31	0.14
C2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.09	0.05	0.13	0.16	0.45	0.25
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.07	0.03	0.16	0.01	0.03	0.01	0.04	0.21	0.29	0.13
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.10	0.04	0.07	0.05	0.12	0.02	0.01	0.01	0.07	0.25	0.32	0.18
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.18	0.30	0.57	0.31
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.20	0.18	0.06
C5	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.06	0.18	0.31	0.59	0.32
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.13	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.17	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.07	0.15	0.22	0.50	0.27
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.12	0.14	0.43	0.23
N3	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.04	0.16	0.23	0.52	0.29
N4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.19	0.36	0.60	0.34
O2	0.04	0.00	0.16	0.12	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.15	0.09	0.11	0.12	0.42	0.22
O2'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.05	0.05	0.06	0.05	0.07	0.03	0.09	0.06	0.17	0.00	0.08	0.06	0.05	0.26	0.34	0.16
O3'	0.03	0.09	0.03	0.01	0.06	0.01	0.11	0.04	0.12	0.03	0.09	0.07	0.15	0.08	0.00	0.02	0.13	0.36	0.47	0.27
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.09	0.06	0.02	0.00	0.12	0.06	0.31	0.17
O5'	0.08	0.13	0.04	0.07	0.18	0.01	0.18	0.01	0.15	0.12	0.16	0.19	0.11	0.05	0.13	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.16	0.21	0.25	0.30	0.20	0.31	0.17	0.22	0.14	0.23	0.36	0.12	0.26	0.36	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.45	0.29	0.32	0.57	0.18	0.59	0.08	0.50	0.43	0.52	0.60	0.42	0.34	0.47	0.31	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.25	0.13	0.18	0.31	0.06	0.32	0.02	0.27	0.23	0.29	0.34	0.22	0.16	0.27	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00