Doublet Group distance statistics: 51095

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 3, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.007
O6	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.001, 0.012, 0.025, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.012 std_dev=0.013
N1	A	0, -0.001, 0.013, 0.027, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.009, 0.026, 0.044, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, -0.003, 0.015, 0.033, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.015 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.001, 0.017, 0.034, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.017 std_dev=0.018
C8	A	0, -0.001, 0.022, 0.045, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.022 std_dev=0.023
N3	B	0, 0.158, 0.321, 0.484, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.321 std_dev=0.163
C2	B	0, 0.161, 0.325, 0.488, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.325 std_dev=0.164
C4	B	0, 0.152, 0.349, 0.545, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.349 std_dev=0.196
N1	B	0, 0.143, 0.357, 0.572, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.357 std_dev=0.215
N4	B	0, 0.176, 0.404, 0.632, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.404 std_dev=0.228
O2	B	0, 0.159, 0.388, 0.616, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.388 std_dev=0.229
C1'	B	0, 0.129, 0.407, 0.685, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.407 std_dev=0.278
C5	B	0, 0.112, 0.408, 0.705, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.408 std_dev=0.297
C6	B	0, 0.101, 0.408, 0.714, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.408 std_dev=0.307
O4'	A	0, -0.114, 0.205, 0.523, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.205 std_dev=0.319
C2'	B	0, 0.091, 0.419, 0.746, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.419 std_dev=0.327
O4'	B	0, 0.132, 0.462, 0.792, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.462 std_dev=0.330
C2'	A	0, -0.119, 0.212, 0.542, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.212 std_dev=0.331
C3'	B	0, 0.081, 0.425, 0.769, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.425 std_dev=0.344
O2'	B	0, 0.113, 0.498, 0.883, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.498 std_dev=0.385
C4'	B	0, 0.096, 0.484, 0.872, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.484 std_dev=0.388
O3'	B	0, 0.079, 0.472, 0.865, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.472 std_dev=0.393
P	B	0, 0.067, 0.505, 0.943, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.505 std_dev=0.438
C5'	B	0, 0.116, 0.563, 1.011, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.563 std_dev=0.447
O5'	B	0, 0.132, 0.593, 1.054, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.593 std_dev=0.461
C4'	A	0, -0.138, 0.398, 0.934, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.398 std_dev=0.536
C3'	A	0, -0.152, 0.432, 1.015, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.432 std_dev=0.583
C5'	A	0, -0.138, 0.475, 1.088, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.475 std_dev=0.613
O2'	A	0, -0.216, 0.486, 1.187, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.486 std_dev=0.702
O3'	A	0, -0.208, 0.677, 1.562, 2.724 max_d=2.724 avg_d=0.677 std_dev=0.885
O5'	A	0, -0.351, 0.597, 1.546, 3.306 max_d=3.306 avg_d=0.597 std_dev=0.948
OP2	B	0, -0.111, 1.190, 2.491, 3.776 max_d=3.776 avg_d=1.190 std_dev=1.301
OP1	B	0, -0.084, 1.253, 2.591, 3.422 max_d=3.422 avg_d=1.253 std_dev=1.338
P	A	0, -0.664, 0.816, 2.295, 5.204 max_d=5.204 avg_d=0.816 std_dev=1.479
OP1	A	0, -0.899, 0.941, 2.780, 6.414 max_d=6.414 avg_d=0.941 std_dev=1.839
OP2	A	0, -0.975, 1.080, 3.136, 7.198 max_d=7.198 avg_d=1.080 std_dev=2.056

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.25	0.00	0.23	0.02	0.12	0.51	0.30
C2	0.04	0.00	0.16	0.05	0.01	0.17	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.42	0.21	0.30	0.01	0.12	0.85	0.43
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.02	0.19	0.06	0.11	0.12	0.20	0.15	0.07	0.01	0.00	0.09	0.02	0.29	0.04	0.32	0.44	0.33
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.13	0.01	0.22	0.01	0.20	0.32	0.11	0.08	0.05	0.32	0.17	0.01	0.01	0.01	0.06	0.25	0.20	0.15	0.11
C4	0.02	0.01	0.08	0.13	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.26	0.11	0.41	0.00	0.22	0.95	0.56
C4'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.21	0.11	0.23	0.16	0.17	0.07	0.25	0.06	0.00	0.01	0.08	0.25	0.10	0.07
C5	0.02	0.00	0.02	0.22	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.22	0.06	0.57	0.01	0.46	1.26	0.79
C5'	0.07	0.18	0.19	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.09	0.18	0.13	0.24	0.18	0.17	0.05	0.08	0.16	0.02	0.01	0.12	0.10	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.20	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.24	0.10	0.57	0.00	0.44	1.32	0.80
C8	0.01	0.01	0.11	0.32	0.01	0.21	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.36	0.24	0.10	0.66	0.01	0.62	1.25	0.85
N1	0.04	0.00	0.12	0.11	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.33	0.17	0.43	0.01	0.22	1.10	0.61
N2	0.04	0.00	0.20	0.08	0.01	0.23	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.51	0.25	0.22	0.01	0.24	0.72	0.31
N3	0.04	0.01	0.15	0.05	0.00	0.16	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.41	0.21	0.26	0.01	0.14	0.74	0.37
N7	0.02	0.00	0.07	0.32	0.01	0.17	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.36	0.25	0.05	0.71	0.01	0.71	1.46	0.97
N9	0.00	0.01	0.01	0.17	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.18	0.01	0.43	0.01	0.28	0.89	0.56
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.15	0.25	0.25	0.08	0.24	0.36	0.18	0.26	0.17	0.36	0.18	0.00	0.17	0.18	0.20	0.28	0.24	0.44	0.25
O3'	0.25	0.42	0.09	0.01	0.26	0.06	0.22	0.16	0.24	0.24	0.33	0.51	0.41	0.25	0.18	0.17	0.00	0.17	0.06	0.23	0.30	0.15	0.13
O4'	0.00	0.21	0.02	0.01	0.11	0.00	0.06	0.02	0.10	0.10	0.17	0.25	0.21	0.05	0.01	0.18	0.17	0.00	0.24	0.07	0.06	0.44	0.27
O5'	0.23	0.30	0.29	0.06	0.41	0.01	0.57	0.01	0.57	0.66	0.43	0.22	0.26	0.71	0.43	0.20	0.06	0.24	0.00	0.66	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.25	0.00	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.23	0.07	0.66	0.00	0.60	1.51	0.93
OP1	0.12	0.12	0.32	0.20	0.22	0.25	0.46	0.10	0.44	0.62	0.22	0.24	0.14	0.71	0.28	0.24	0.30	0.06	0.01	0.60	0.00	0.01	0.00
OP2	0.51	0.85	0.44	0.15	0.95	0.10	1.26	0.03	1.32	1.25	1.10	0.72	0.74	1.46	0.89	0.44	0.15	0.44	0.01	1.51	0.01	0.00	0.00
P	0.30	0.43	0.33	0.11	0.56	0.07	0.79	0.01	0.80	0.85	0.61	0.31	0.37	0.97	0.56	0.25	0.13	0.27	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.09	0.22	0.26	0.17	0.24	0.27	0.29	0.29	0.18	0.13	0.19	0.18	0.24	0.28	0.20	0.35	0.35	0.63	0.26
C2	0.15	0.13	0.17	0.20	0.12	0.21	0.22	0.26	0.20	0.14	0.10	0.12	0.19	0.17	0.19	0.20	0.29	0.52	1.05	0.13
C2'	0.14	0.16	0.18	0.25	0.18	0.25	0.25	0.35	0.22	0.14	0.16	0.21	0.28	0.25	0.29	0.18	0.19	0.24	0.69	0.16
C3'	0.09	0.24	0.12	0.27	0.18	0.24	0.26	0.33	0.27	0.10	0.27	0.22	0.45	0.14	0.35	0.14	0.51	0.43	0.39	0.44
C4	0.15	0.11	0.17	0.20	0.13	0.22	0.26	0.28	0.25	0.14	0.08	0.15	0.20	0.18	0.19	0.20	0.31	0.34	0.90	0.16
C4'	0.08	0.35	0.17	0.36	0.26	0.30	0.15	0.37	0.15	0.09	0.41	0.32	0.55	0.15	0.49	0.16	0.45	0.46	0.40	0.40
C5	0.16	0.13	0.19	0.21	0.11	0.25	0.25	0.31	0.22	0.13	0.10	0.16	0.22	0.20	0.19	0.23	0.31	0.25	0.99	0.15
C5'	0.09	0.46	0.08	0.35	0.30	0.29	0.16	0.41	0.13	0.17	0.48	0.34	0.70	0.14	0.54	0.11	0.47	0.47	0.45	0.45
C6	0.17	0.15	0.20	0.22	0.11	0.27	0.21	0.32	0.19	0.14	0.12	0.17	0.21	0.19	0.20	0.26	0.32	0.34	1.14	0.15
C8	0.15	0.13	0.20	0.20	0.14	0.23	0.28	0.31	0.27	0.13	0.11	0.16	0.26	0.24	0.18	0.20	0.34	0.27	0.72	0.23
N1	0.16	0.14	0.17	0.20	0.09	0.24	0.20	0.29	0.19	0.14	0.12	0.11	0.19	0.17	0.18	0.23	0.30	0.48	1.14	0.14
N2	0.15	0.15	0.18	0.20	0.15	0.20	0.22	0.24	0.19	0.15	0.13	0.16	0.20	0.18	0.20	0.19	0.27	0.60	1.07	0.13
N3	0.16	0.11	0.18	0.21	0.15	0.21	0.25	0.26	0.23	0.15	0.09	0.16	0.18	0.18	0.21	0.19	0.29	0.46	0.93	0.16
N7	0.18	0.16	0.23	0.23	0.14	0.27	0.26	0.33	0.23	0.13	0.12	0.18	0.26	0.25	0.21	0.25	0.32	0.20	0.87	0.19
N9	0.15	0.10	0.18	0.21	0.15	0.22	0.27	0.28	0.28	0.15	0.09	0.16	0.21	0.20	0.20	0.19	0.33	0.29	0.74	0.21
O2'	0.19	0.17	0.19	0.16	0.24	0.15	0.28	0.31	0.27	0.21	0.18	0.24	0.14	0.32	0.17	0.12	0.21	0.23	0.81	0.18
O3'	0.09	0.42	0.11	0.27	0.44	0.24	0.33	0.32	0.26	0.20	0.53	0.53	0.56	0.12	0.44	0.10	0.47	0.35	0.27	0.38
O4'	0.17	0.25	0.26	0.38	0.23	0.33	0.16	0.36	0.19	0.09	0.34	0.29	0.40	0.27	0.46	0.22	0.42	0.48	0.48	0.36
O5'	0.35	0.19	0.39	0.77	0.29	0.70	0.55	0.90	0.60	0.35	0.18	0.27	0.41	0.10	0.84	0.53	1.05	0.99	1.07	1.06
O6	0.20	0.16	0.22	0.25	0.14	0.31	0.17	0.37	0.17	0.16	0.15	0.23	0.21	0.22	0.23	0.29	0.36	0.31	1.23	0.21
OP1	0.29	0.33	0.43	1.05	0.12	1.06	0.34	1.39	0.46	0.16	0.39	0.20	0.70	0.13	1.38	0.67	1.40	1.56	1.56	1.47
OP2	0.87	0.50	0.81	1.40	0.88	1.45	1.27	1.87	1.32	0.92	0.53	0.85	0.24	0.26	1.33	1.24	2.10	2.09	2.32	2.19
P	0.57	0.17	0.62	1.20	0.40	1.17	0.76	1.46	0.84	0.53	0.14	0.36	0.33	0.19	1.36	0.89	1.57	1.57	1.69	1.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.65	0.34	0.12
C2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.10	0.02	0.13	0.93	0.58	0.19
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.07	0.05	0.18	0.00	0.01	0.00	0.16	0.37	0.24	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.12	0.02	0.14	0.03	0.07	0.04	0.18	0.01	0.00	0.01	0.23	0.16	0.17	0.12
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01	0.20	1.14	0.72	0.26
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.01	0.00	0.00	0.17	0.22	0.04
C5	0.01	0.00	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.23	1.15	0.70	0.28
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.06	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.01	0.13	0.33	0.01
C6	0.00	0.01	0.09	0.14	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.21	1.03	0.58	0.24
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.13	0.89	0.51	0.18
N3	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.16	1.06	0.67	0.23
N4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01	0.22	1.19	0.78	0.28
O2	0.03	0.00	0.18	0.18	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.21	0.03	0.09	0.83	0.53	0.15
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.09	0.07	0.15	0.00	0.03	0.03	0.08	0.32	0.20	0.10
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.01	0.13	0.03	0.14	0.02	0.07	0.04	0.21	0.03	0.00	0.01	0.21	0.20	0.25	0.10
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.08	0.59	0.27	0.09
O5'	0.06	0.13	0.16	0.23	0.20	0.00	0.23	0.01	0.21	0.13	0.16	0.22	0.09	0.08	0.21	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.65	0.93	0.37	0.16	1.14	0.17	1.15	0.13	1.03	0.89	1.06	1.19	0.83	0.32	0.20	0.59	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.34	0.58	0.24	0.17	0.72	0.22	0.70	0.33	0.58	0.51	0.67	0.78	0.53	0.20	0.25	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.19	0.12	0.12	0.26	0.04	0.28	0.01	0.24	0.18	0.23	0.28	0.15	0.10	0.10	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00