Doublet Group distance statistics: 51096

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 3, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.017, 0.040, 0.063, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.040 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.014, 0.040, 0.067, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.040 std_dev=0.027
C5	A	0, 0.015, 0.042, 0.068, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.042 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.026, 0.060, 0.095, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.060 std_dev=0.035
O6	A	0, 0.022, 0.059, 0.095, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.059 std_dev=0.036
N7	A	0, 0.044, 0.106, 0.168, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.106 std_dev=0.062
C8	A	0, 0.052, 0.122, 0.193, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.122 std_dev=0.070
O4'	A	0, -0.025, 0.159, 0.343, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.159 std_dev=0.184
C2'	A	0, 0.086, 0.281, 0.475, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.281 std_dev=0.194
O2	B	0, 0.289, 0.514, 0.739, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.514 std_dev=0.225
C2	B	0, 0.195, 0.422, 0.649, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.422 std_dev=0.227
C4	B	0, 0.229, 0.461, 0.693, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.461 std_dev=0.232
C5	B	0, 0.234, 0.468, 0.703, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.468 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.223, 0.459, 0.695, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.459 std_dev=0.236
O2'	A	0, 0.180, 0.423, 0.667, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.423 std_dev=0.243
C2'	B	0, 0.196, 0.445, 0.694, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.445 std_dev=0.249
N1	B	0, 0.123, 0.375, 0.627, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.375 std_dev=0.252
C1'	B	0, 0.201, 0.468, 0.736, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.468 std_dev=0.268
C6	B	0, 0.140, 0.415, 0.690, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.415 std_dev=0.275
N4	B	0, 0.277, 0.569, 0.860, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.569 std_dev=0.291
C4'	A	0, 0.036, 0.337, 0.637, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.337 std_dev=0.300
C3'	B	0, 0.053, 0.384, 0.716, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.384 std_dev=0.332
C3'	A	0, 0.085, 0.418, 0.752, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.418 std_dev=0.333
C4'	B	0, 0.253, 0.593, 0.932, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.593 std_dev=0.340
O4'	B	0, 0.239, 0.581, 0.923, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.581 std_dev=0.342
O2'	B	0, 0.300, 0.662, 1.023, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.662 std_dev=0.361
O3'	B	0, 0.046, 0.436, 0.825, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.436 std_dev=0.389
O5'	A	0, 0.068, 0.476, 0.884, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.476 std_dev=0.408
C5'	B	0, 0.369, 0.831, 1.293, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.831 std_dev=0.462
O3'	A	0, 0.167, 0.648, 1.130, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.648 std_dev=0.482
P	A	0, 0.007, 0.497, 0.987, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.497 std_dev=0.490
C5'	A	0, -0.010, 0.572, 1.153, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.572 std_dev=0.582
OP1	A	0, 0.014, 0.607, 1.201, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.607 std_dev=0.594
OP2	A	0, 0.065, 0.669, 1.273, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.669 std_dev=0.604
O5'	B	0, 0.920, 1.627, 2.335, 2.269 max_d=2.269 avg_d=1.627 std_dev=0.707
P	B	0, 0.836, 1.630, 2.425, 2.592 max_d=2.592 avg_d=1.630 std_dev=0.795
OP2	B	0, 0.734, 1.623, 2.513, 2.899 max_d=2.899 avg_d=1.623 std_dev=0.890
OP1	B	0, 0.739, 1.689, 2.638, 2.990 max_d=2.990 avg_d=1.689 std_dev=0.950

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.02	0.14	0.35	0.10
C2	0.02	0.00	0.10	0.21	0.01	0.12	0.01	0.25	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.21	0.03	0.27	0.02	0.24	0.48	0.24
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.06	0.07	0.12	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.21	0.04	0.25	0.21	0.09
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.15	0.00	0.15	0.03	0.18	0.14	0.21	0.23	0.19	0.14	0.09	0.03	0.01	0.01	0.28	0.18	0.33	0.14	0.17
C4	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02	0.29	0.01	0.25	0.46	0.24
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.14	0.12	0.14	0.12	0.10	0.13	0.08	0.05	0.03	0.01	0.02	0.15	0.18	0.30	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.13	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.03	0.36	0.01	0.34	0.52	0.33
C5'	0.04	0.25	0.03	0.03	0.23	0.00	0.28	0.00	0.31	0.23	0.30	0.24	0.21	0.29	0.17	0.05	0.04	0.02	0.01	0.34	0.20	0.33	0.03
C6	0.02	0.02	0.05	0.18	0.01	0.14	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.03	0.36	0.00	0.38	0.55	0.35
C8	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.12	0.01	0.23	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.15	0.04	0.38	0.02	0.31	0.48	0.30
N1	0.03	0.01	0.07	0.21	0.02	0.14	0.01	0.30	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.21	0.04	0.31	0.02	0.32	0.52	0.30
N2	0.03	0.00	0.12	0.23	0.01	0.12	0.01	0.24	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.25	0.04	0.24	0.03	0.21	0.46	0.22
N3	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.18	0.03	0.24	0.01	0.20	0.44	0.20
N7	0.01	0.02	0.05	0.14	0.01	0.13	0.00	0.29	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.17	0.03	0.41	0.02	0.40	0.55	0.37
N9	0.00	0.02	0.02	0.09	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.28	0.01	0.21	0.42	0.20
O2'	0.02	0.11	0.01	0.03	0.07	0.05	0.05	0.05	0.07	0.02	0.10	0.14	0.11	0.03	0.03	0.00	0.07	0.08	0.03	0.07	0.18	0.29	0.05
O3'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.13	0.03	0.15	0.04	0.18	0.15	0.21	0.25	0.18	0.17	0.08	0.07	0.00	0.02	0.23	0.19	0.39	0.11	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.08	0.02	0.00	0.12	0.03	0.13	0.37	0.13
O5'	0.16	0.27	0.21	0.28	0.29	0.02	0.36	0.01	0.36	0.38	0.31	0.24	0.24	0.41	0.28	0.03	0.23	0.12	0.00	0.39	0.02	0.06	0.00
O6	0.02	0.02	0.04	0.18	0.01	0.15	0.01	0.34	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.19	0.03	0.39	0.00	0.44	0.58	0.40
OP1	0.14	0.24	0.25	0.33	0.25	0.18	0.34	0.20	0.38	0.31	0.32	0.21	0.20	0.40	0.21	0.18	0.39	0.13	0.02	0.44	0.00	0.02	0.01
OP2	0.35	0.48	0.21	0.14	0.46	0.30	0.52	0.33	0.55	0.48	0.52	0.46	0.44	0.55	0.42	0.29	0.11	0.37	0.06	0.58	0.02	0.00	0.00
P	0.10	0.24	0.09	0.17	0.24	0.04	0.33	0.03	0.35	0.30	0.30	0.22	0.20	0.37	0.20	0.05	0.18	0.13	0.00	0.40	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.11	0.18	0.10	0.21	0.12	0.31	0.29	0.26	0.12	0.10	0.25	0.26	0.36	0.08	0.09	0.44	0.73	0.63	0.54
C2	0.18	0.28	0.22	0.09	0.17	0.09	0.27	0.26	0.22	0.18	0.27	0.18	0.39	0.33	0.14	0.12	0.65	0.87	0.82	0.74
C2'	0.11	0.12	0.13	0.12	0.19	0.13	0.29	0.33	0.25	0.11	0.12	0.22	0.25	0.35	0.11	0.07	0.38	0.75	0.65	0.54
C3'	0.14	0.09	0.17	0.21	0.15	0.21	0.27	0.36	0.26	0.13	0.10	0.15	0.19	0.36	0.22	0.15	0.32	0.75	0.60	0.50
C4	0.16	0.26	0.23	0.08	0.10	0.09	0.26	0.28	0.21	0.14	0.23	0.11	0.38	0.35	0.14	0.09	0.59	0.84	0.76	0.68
C4'	0.19	0.22	0.17	0.18	0.25	0.17	0.30	0.27	0.29	0.21	0.23	0.25	0.27	0.36	0.13	0.17	0.28	0.69	0.54	0.44
C5	0.17	0.32	0.26	0.13	0.19	0.10	0.21	0.28	0.18	0.18	0.34	0.19	0.40	0.34	0.21	0.13	0.63	0.87	0.80	0.72
C5'	0.33	0.28	0.34	0.28	0.19	0.30	0.26	0.28	0.29	0.27	0.22	0.16	0.37	0.52	0.26	0.31	0.23	0.68	0.47	0.39
C6	0.19	0.34	0.26	0.15	0.27	0.11	0.23	0.27	0.19	0.21	0.38	0.30	0.41	0.32	0.23	0.16	0.67	0.89	0.84	0.77
C8	0.16	0.26	0.28	0.10	0.09	0.12	0.16	0.32	0.15	0.13	0.24	0.11	0.36	0.36	0.18	0.13	0.51	0.80	0.68	0.61
N1	0.19	0.33	0.24	0.13	0.24	0.11	0.25	0.26	0.21	0.21	0.36	0.26	0.42	0.32	0.19	0.15	0.68	0.88	0.84	0.77
N2	0.19	0.27	0.21	0.08	0.18	0.09	0.27	0.25	0.22	0.18	0.25	0.20	0.38	0.32	0.13	0.12	0.66	0.87	0.82	0.74
N3	0.17	0.23	0.21	0.07	0.15	0.08	0.29	0.26	0.23	0.15	0.19	0.17	0.36	0.33	0.11	0.09	0.60	0.84	0.77	0.69
N7	0.17	0.32	0.28	0.15	0.20	0.11	0.14	0.30	0.14	0.18	0.34	0.21	0.38	0.34	0.25	0.15	0.59	0.86	0.77	0.70
N9	0.14	0.20	0.23	0.06	0.09	0.11	0.26	0.30	0.21	0.10	0.16	0.12	0.35	0.36	0.11	0.09	0.51	0.79	0.69	0.60
O2'	0.19	0.16	0.18	0.13	0.28	0.13	0.33	0.28	0.27	0.17	0.20	0.34	0.26	0.39	0.11	0.14	0.40	0.73	0.63	0.51
O3'	0.16	0.14	0.17	0.22	0.16	0.21	0.27	0.34	0.26	0.15	0.15	0.17	0.23	0.37	0.24	0.16	0.30	0.75	0.59	0.48
O4'	0.11	0.17	0.12	0.13	0.28	0.12	0.33	0.27	0.29	0.18	0.22	0.29	0.20	0.34	0.10	0.10	0.36	0.68	0.57	0.47
O5'	0.23	0.20	0.27	0.13	0.30	0.13	0.40	0.22	0.40	0.27	0.23	0.30	0.19	0.41	0.02	0.16	0.31	0.81	0.64	0.54
O6	0.19	0.36	0.27	0.18	0.33	0.12	0.23	0.26	0.20	0.23	0.42	0.40	0.41	0.31	0.27	0.19	0.69	0.90	0.85	0.80
OP1	0.13	0.12	0.17	0.02	0.15	0.04	0.26	0.18	0.25	0.12	0.09	0.17	0.23	0.36	0.01	0.06	0.24	0.68	0.34	0.32
OP2	0.21	0.37	0.22	0.14	0.47	0.20	0.48	0.37	0.42	0.33	0.43	0.52	0.38	0.21	0.05	0.20	0.38	0.77	0.38	0.40
P	0.07	0.08	0.13	0.03	0.18	0.08	0.28	0.19	0.27	0.12	0.11	0.20	0.16	0.25	0.01	0.04	0.22	0.72	0.40	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.29	0.31	0.21	0.16
C2	0.01	0.00	0.09	0.08	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.10	0.02	0.49	0.42	0.26	0.30
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.07	0.05	0.18	0.00	0.02	0.01	0.29	0.53	0.34	0.30
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.14	0.02	0.17	0.04	0.06	0.07	0.17	0.04	0.01	0.01	0.29	0.65	0.34	0.36
C4	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.05	0.67	0.56	0.46	0.50
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.04	0.07	0.05	0.07	0.03	0.00	0.04	0.28	0.29	0.14
C5	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.18	0.08	0.71	0.58	0.46	0.53
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.09	0.13	0.07	0.07	0.02	0.02	0.02	0.30	0.35	0.02
C6	0.01	0.00	0.11	0.17	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.09	0.65	0.49	0.29	0.41
N1	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.49	0.41	0.22	0.28
N3	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.02	0.58	0.49	0.37	0.41
N4	0.01	0.02	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.06	0.70	0.61	0.55	0.57
O2	0.02	0.01	0.18	0.17	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.22	0.05	0.39	0.37	0.22	0.23
O2'	0.03	0.11	0.00	0.04	0.05	0.07	0.06	0.07	0.07	0.02	0.10	0.07	0.21	0.00	0.06	0.07	0.15	0.46	0.33	0.24
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.08	0.03	0.18	0.02	0.18	0.04	0.07	0.10	0.22	0.06	0.00	0.02	0.13	0.71	0.37	0.36
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.02	0.09	0.03	0.02	0.06	0.05	0.07	0.02	0.00	0.16	0.15	0.33	0.16
O5'	0.29	0.49	0.29	0.29	0.67	0.04	0.71	0.02	0.65	0.49	0.58	0.70	0.39	0.15	0.13	0.16	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.31	0.42	0.53	0.65	0.56	0.28	0.58	0.30	0.49	0.41	0.49	0.61	0.37	0.46	0.71	0.15	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.21	0.26	0.34	0.34	0.46	0.29	0.46	0.35	0.29	0.22	0.37	0.55	0.22	0.33	0.37	0.33	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.30	0.30	0.36	0.50	0.14	0.53	0.02	0.41	0.28	0.41	0.57	0.23	0.24	0.36	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00