Doublet Group distance statistics: 51097

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.002, 0.017, 0.037, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.020
N1	A	0, -0.001, 0.019, 0.038, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.020
C1'	A	0, -0.001, 0.023, 0.047, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.023 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.001, 0.026, 0.050, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.026 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.034 std_dev=0.025
C5	A	0, 0.002, 0.029, 0.056, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.029 std_dev=0.027
C4	A	0, -0.001, 0.028, 0.058, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.028 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.020, 0.053, 0.085, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.053 std_dev=0.032
N2	A	0, 0.004, 0.038, 0.072, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.038 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.011, 0.055, 0.099, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.055 std_dev=0.044
C8	A	0, 0.009, 0.056, 0.104, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.056 std_dev=0.048
O3'	A	0, 0.037, 0.206, 0.376, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.206 std_dev=0.169
C2'	A	0, -0.037, 0.162, 0.361, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.162 std_dev=0.199
C3'	A	0, -0.026, 0.183, 0.392, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.183 std_dev=0.209
N1	B	0, 0.010, 0.243, 0.476, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.243 std_dev=0.233
C6	B	0, 0.018, 0.254, 0.490, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.254 std_dev=0.236
C1'	B	0, 0.070, 0.314, 0.559, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.314 std_dev=0.245
C2	B	0, 0.014, 0.262, 0.510, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.262 std_dev=0.248
O4'	A	0, -0.079, 0.175, 0.429, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.175 std_dev=0.254
C5	B	0, 0.037, 0.293, 0.549, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.293 std_dev=0.256
C4	B	0, -0.007, 0.256, 0.519, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.256 std_dev=0.263
N3	B	0, -0.027, 0.238, 0.502, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.238 std_dev=0.265
N4	B	0, 0.047, 0.317, 0.586, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.317 std_dev=0.270
O4'	B	0, 0.069, 0.339, 0.609, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.339 std_dev=0.270
C3'	B	0, 0.052, 0.325, 0.598, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.325 std_dev=0.273
O5'	A	0, 0.046, 0.347, 0.648, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.347 std_dev=0.301
O2	B	0, 0.023, 0.327, 0.632, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.327 std_dev=0.305
OP2	A	0, -0.007, 0.313, 0.634, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.313 std_dev=0.320
O2'	A	0, -0.011, 0.319, 0.650, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.319 std_dev=0.330
P	A	0, 0.021, 0.380, 0.738, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.380 std_dev=0.359
C4'	A	0, -0.081, 0.297, 0.674, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.297 std_dev=0.378
C4'	B	0, 0.075, 0.463, 0.852, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.463 std_dev=0.389
C2'	B	0, 0.002, 0.409, 0.817, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.409 std_dev=0.408
O3'	B	0, 0.081, 0.507, 0.933, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.507 std_dev=0.426
OP1	A	0, -0.029, 0.481, 0.991, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.481 std_dev=0.510
P	B	0, -0.023, 0.605, 1.232, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.605 std_dev=0.627
C5'	A	0, -0.148, 0.520, 1.187, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.520 std_dev=0.668
OP1	B	0, -0.031, 0.643, 1.317, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.643 std_dev=0.674
C5'	B	0, -0.059, 0.661, 1.380, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.661 std_dev=0.720
OP2	B	0, -0.069, 0.669, 1.408, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.669 std_dev=0.738
O2'	B	0, -0.217, 0.571, 1.360, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.571 std_dev=0.789
O5'	B	0, -0.133, 0.732, 1.596, 2.205 max_d=2.205 avg_d=0.732 std_dev=0.865

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.03	0.09	0.00	0.14	0.03	0.15	0.06	0.17
C2	0.04	0.00	0.07	0.10	0.01	0.29	0.01	0.50	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.05	0.21	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.07	0.03	0.05	0.04	0.08	0.09	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.43	0.04	0.33	0.21	0.36
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.07	0.03	0.10	0.13	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.32	0.08	0.21	0.02	0.22
C4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.15	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.06	0.11	0.04	0.02	0.07	0.05	0.09
C4'	0.00	0.29	0.01	0.01	0.15	0.00	0.11	0.01	0.16	0.03	0.24	0.36	0.26	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.03	0.14	0.05	0.21	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.11	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.06	0.03	0.03	0.08	0.05	0.08
C5'	0.06	0.50	0.07	0.03	0.30	0.01	0.27	0.00	0.35	0.08	0.45	0.60	0.45	0.15	0.14	0.05	0.04	0.02	0.02	0.33	0.09	0.37	0.02
C6	0.02	0.00	0.03	0.07	0.01	0.16	0.01	0.35	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.17	0.07	0.09	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04
C8	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.06	0.09	0.04	0.16	0.09	0.16
N1	0.03	0.00	0.04	0.10	0.01	0.24	0.01	0.45	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.22	0.05	0.15	0.06	0.01	0.04	0.03	0.05
N2	0.06	0.00	0.08	0.13	0.01	0.36	0.01	0.60	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.27	0.10	0.26	0.13	0.02	0.16	0.16	0.18
N3	0.04	0.01	0.09	0.07	0.00	0.26	0.00	0.45	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.25	0.04	0.21	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04
N7	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.15	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.06	0.05	0.13	0.08	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.02	0.10	0.03	0.14	0.08	0.15
O2'	0.03	0.25	0.01	0.02	0.18	0.04	0.13	0.05	0.17	0.03	0.22	0.27	0.25	0.06	0.07	0.00	0.06	0.03	0.46	0.15	0.38	0.32	0.41
O3'	0.09	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04	0.07	0.13	0.05	0.10	0.04	0.12	0.09	0.06	0.00	0.06	0.18	0.09	0.07	0.05	0.12
O4'	0.00	0.21	0.01	0.00	0.11	0.00	0.06	0.02	0.09	0.06	0.15	0.26	0.21	0.03	0.02	0.03	0.06	0.00	0.10	0.06	0.12	0.12	0.10
O5'	0.14	0.06	0.43	0.32	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.09	0.06	0.13	0.02	0.06	0.10	0.46	0.18	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.04	0.08	0.02	0.14	0.03	0.33	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.15	0.09	0.06	0.03	0.00	0.05	0.03	0.05
OP1	0.15	0.06	0.33	0.21	0.07	0.05	0.08	0.09	0.04	0.16	0.04	0.16	0.04	0.13	0.14	0.38	0.07	0.12	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.06	0.21	0.02	0.05	0.21	0.05	0.37	0.02	0.09	0.03	0.16	0.04	0.08	0.08	0.32	0.05	0.12	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.06	0.36	0.22	0.09	0.02	0.08	0.02	0.04	0.16	0.05	0.18	0.04	0.13	0.15	0.41	0.12	0.10	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.14	0.30	0.14	0.05	0.21	0.05	0.59	0.05	0.10	0.12	0.10	0.19	0.55	0.21	0.09	0.16	0.23	0.09	0.12
C2	0.27	0.25	0.39	0.22	0.09	0.29	0.12	0.61	0.04	0.18	0.19	0.13	0.34	0.72	0.31	0.21	0.21	0.34	0.18	0.15
C2'	0.14	0.11	0.36	0.19	0.12	0.25	0.03	0.62	0.06	0.10	0.13	0.20	0.14	0.58	0.24	0.08	0.19	0.23	0.16	0.18
C3'	0.05	0.12	0.22	0.06	0.16	0.19	0.15	0.59	0.10	0.09	0.15	0.19	0.13	0.48	0.12	0.11	0.09	0.12	0.05	0.07
C4	0.20	0.20	0.31	0.17	0.03	0.23	0.11	0.56	0.09	0.14	0.16	0.12	0.27	0.58	0.26	0.14	0.17	0.33	0.12	0.14
C4'	0.11	0.14	0.08	0.19	0.21	0.17	0.29	0.52	0.25	0.17	0.16	0.23	0.12	0.38	0.24	0.21	0.21	0.33	0.22	0.20
C5	0.16	0.16	0.23	0.13	0.08	0.16	0.19	0.45	0.14	0.11	0.11	0.15	0.25	0.47	0.25	0.12	0.18	0.40	0.07	0.13
C5'	0.39	0.37	0.21	0.46	0.46	0.40	0.59	0.54	0.55	0.44	0.37	0.44	0.30	0.20	0.53	0.50	0.47	0.59	0.47	0.47
C6	0.14	0.15	0.16	0.09	0.12	0.12	0.23	0.38	0.18	0.09	0.07	0.16	0.28	0.43	0.23	0.11	0.14	0.45	0.03	0.11
C8	0.14	0.14	0.24	0.14	0.06	0.16	0.14	0.49	0.12	0.11	0.10	0.11	0.20	0.46	0.24	0.10	0.22	0.34	0.10	0.14
N1	0.22	0.21	0.27	0.15	0.07	0.19	0.19	0.46	0.13	0.11	0.12	0.13	0.33	0.61	0.28	0.16	0.12	0.42	0.09	0.09
N2	0.33	0.27	0.49	0.30	0.12	0.38	0.12	0.68	0.06	0.22	0.20	0.14	0.36	0.83	0.37	0.27	0.35	0.31	0.30	0.23
N3	0.25	0.24	0.39	0.22	0.10	0.30	0.07	0.65	0.06	0.19	0.20	0.13	0.31	0.68	0.29	0.19	0.21	0.29	0.19	0.18
N7	0.13	0.13	0.19	0.12	0.11	0.13	0.19	0.41	0.16	0.11	0.09	0.16	0.20	0.40	0.24	0.11	0.23	0.40	0.09	0.14
N9	0.16	0.16	0.29	0.15	0.03	0.20	0.09	0.56	0.08	0.11	0.13	0.11	0.22	0.54	0.24	0.11	0.18	0.29	0.10	0.13
O2'	0.36	0.24	0.57	0.43	0.19	0.44	0.31	0.72	0.35	0.31	0.18	0.11	0.23	0.72	0.46	0.31	0.48	0.46	0.43	0.44
O3'	0.13	0.13	0.31	0.11	0.09	0.25	0.05	0.64	0.07	0.12	0.12	0.08	0.16	0.54	0.14	0.09	0.11	0.04	0.03	0.11
O4'	0.03	0.09	0.17	0.08	0.12	0.13	0.20	0.54	0.14	0.06	0.10	0.16	0.14	0.47	0.15	0.07	0.08	0.26	0.11	0.07
O5'	0.27	0.25	0.43	0.26	0.14	0.35	0.08	0.73	0.13	0.21	0.22	0.11	0.30	0.70	0.32	0.22	0.35	0.26	0.40	0.35
O6	0.09	0.10	0.05	0.04	0.18	0.06	0.26	0.26	0.22	0.10	0.06	0.19	0.23	0.23	0.20	0.09	0.14	0.49	0.05	0.14
OP1	0.19	0.16	0.36	0.26	0.04	0.20	0.09	0.48	0.09	0.09	0.14	0.06	0.23	0.68	0.45	0.13	0.22	0.33	0.23	0.18
OP2	0.15	0.11	0.33	0.22	0.08	0.15	0.19	0.45	0.14	0.03	0.08	0.12	0.20	0.68	0.41	0.09	0.16	0.37	0.16	0.08
P	0.18	0.18	0.34	0.22	0.06	0.20	0.07	0.53	0.06	0.10	0.16	0.07	0.25	0.67	0.38	0.11	0.22	0.32	0.24	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.16	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.25	0.00	0.17	0.43	0.06	0.14
C2	0.04	0.00	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.27	0.03	0.26	0.37	0.11	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.07	0.03	0.10	0.25	0.10	0.02	0.04	0.08	0.12	0.00	0.04	0.02	0.16	0.44	0.22	0.17
C3'	0.03	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.05	0.05	0.04	0.12	0.02	0.02	0.02	0.08	0.55	0.07	0.17
C4	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.12	0.01	0.43	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.15	0.03	0.28	0.28	0.12	0.08
C4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.12	0.00	0.17	0.00	0.17	0.08	0.08	0.12	0.08	0.12	0.06	0.00	0.03	0.31	0.09	0.02
C5	0.02	0.00	0.10	0.06	0.01	0.17	0.00	0.52	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.06	0.06	0.24	0.24	0.11	0.05
C5'	0.16	0.25	0.25	0.02	0.43	0.00	0.52	0.00	0.50	0.31	0.32	0.44	0.15	0.16	0.17	0.01	0.01	0.27	0.26	0.05
C6	0.02	0.01	0.10	0.06	0.02	0.17	0.00	0.50	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.07	0.06	0.21	0.29	0.09	0.06
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.31	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.19	0.02	0.23	0.37	0.09	0.11
N3	0.03	0.00	0.04	0.05	0.00	0.08	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.23	0.03	0.28	0.33	0.12	0.11
N4	0.01	0.01	0.08	0.04	0.00	0.12	0.02	0.44	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.13	0.03	0.30	0.25	0.13	0.08
O2	0.08	0.01	0.12	0.12	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.38	0.06	0.24	0.39	0.11	0.15
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.16	0.12	0.19	0.16	0.16	0.07	0.11	0.17	0.17	0.00	0.10	0.06	0.16	0.48	0.31	0.18
O3'	0.25	0.27	0.04	0.02	0.15	0.06	0.06	0.17	0.07	0.19	0.23	0.13	0.38	0.10	0.00	0.26	0.13	0.76	0.19	0.30
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.06	0.06	0.26	0.00	0.31	0.41	0.18	0.21
O5'	0.17	0.26	0.16	0.08	0.28	0.03	0.24	0.01	0.21	0.23	0.28	0.30	0.24	0.16	0.13	0.31	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.43	0.37	0.44	0.55	0.28	0.31	0.24	0.27	0.29	0.37	0.33	0.25	0.39	0.48	0.76	0.41	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.06	0.11	0.22	0.07	0.12	0.09	0.11	0.26	0.09	0.09	0.12	0.13	0.11	0.31	0.19	0.18	0.03	0.02	0.00	0.00
P	0.14	0.13	0.17	0.17	0.08	0.02	0.05	0.05	0.06	0.11	0.11	0.08	0.15	0.18	0.30	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00