Doublet Group distance statistics: 51119

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 4, 4, 16, 11, 9, 9, 2, 1, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.014, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.013, 0.021, 0.030, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.021 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.025, 0.037, 0.050, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.037 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.003, 0.027, 0.051, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.027 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.005, 0.029, 0.053, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.029 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.003, 0.032, 0.061, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.032 std_dev=0.029
O3'	A	0, 0.067, 0.151, 0.236, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.151 std_dev=0.085
C3'	A	0, 0.032, 0.143, 0.254, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.143 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.000, 0.114, 0.229, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.114 std_dev=0.114
C4'	A	0, 0.017, 0.137, 0.257, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.137 std_dev=0.120
O4'	A	0, -0.007, 0.125, 0.256, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.125 std_dev=0.131
O5'	A	0, 0.037, 0.215, 0.392, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.215 std_dev=0.178
N6	B	0, 0.110, 0.303, 0.496, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.303 std_dev=0.193
O2'	A	0, -0.024, 0.174, 0.373, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.174 std_dev=0.199
OP2	A	0, 0.123, 0.332, 0.541, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.332 std_dev=0.209
C6	B	0, 0.137, 0.348, 0.559, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.348 std_dev=0.211
C5'	A	0, -0.003, 0.218, 0.438, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.218 std_dev=0.220
C5	B	0, 0.203, 0.428, 0.654, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.428 std_dev=0.225
N1	B	0, 0.125, 0.353, 0.580, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.353 std_dev=0.228
N7	B	0, 0.255, 0.486, 0.717, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.486 std_dev=0.231
P	A	0, 0.049, 0.293, 0.536, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.293 std_dev=0.243
C2	B	0, 0.170, 0.421, 0.672, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.421 std_dev=0.251
C4	B	0, 0.230, 0.482, 0.735, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.482 std_dev=0.253
C8	B	0, 0.296, 0.557, 0.817, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.557 std_dev=0.260
N3	B	0, 0.218, 0.484, 0.750, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.484 std_dev=0.266
N9	B	0, 0.294, 0.565, 0.836, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.565 std_dev=0.271
C1'	B	0, 0.357, 0.668, 0.978, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.668 std_dev=0.310
OP1	A	0, 0.046, 0.366, 0.685, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.366 std_dev=0.320
C2'	B	0, 0.413, 0.733, 1.054, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.733 std_dev=0.321
O4'	B	0, 0.382, 0.726, 1.070, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.726 std_dev=0.344
C3'	B	0, 0.430, 0.786, 1.142, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.786 std_dev=0.356
O2'	B	0, 0.423, 0.809, 1.196, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.809 std_dev=0.387
C4'	B	0, 0.420, 0.807, 1.195, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.807 std_dev=0.388
O5'	B	0, 0.391, 0.788, 1.185, 2.137 max_d=2.137 avg_d=0.788 std_dev=0.397
C5'	B	0, 0.412, 0.836, 1.259, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.836 std_dev=0.424
O3'	B	0, 0.444, 0.871, 1.298, 2.074 max_d=2.074 avg_d=0.871 std_dev=0.427
P	B	0, 0.382, 0.812, 1.241, 2.315 max_d=2.315 avg_d=0.812 std_dev=0.429
OP1	B	0, 0.410, 1.034, 1.657, 2.712 max_d=2.712 avg_d=1.034 std_dev=0.623
OP2	B	0, 0.120, 1.234, 2.348, 4.084 max_d=4.084 avg_d=1.234 std_dev=1.114

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.08	0.12	0.08
C2	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.07	0.13	0.12	0.01	0.12	0.14	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.06	0.09	0.07	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.11	0.04	0.12	0.16	0.13
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.07	0.10	0.07	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.05	0.08	0.07	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.06	0.09	0.01	0.11	0.15	0.12
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.11	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.09	0.01	0.12	0.15	0.13
C5'	0.03	0.10	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.10	0.13	0.09	0.09	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.09	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.06	0.10	0.00	0.12	0.15	0.13
C8	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.05	0.06	0.09	0.01	0.11	0.15	0.13
N1	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.06	0.10	0.11	0.01	0.12	0.14	0.12
N2	0.04	0.00	0.09	0.10	0.01	0.11	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.09	0.15	0.13	0.01	0.13	0.13	0.12
N3	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.06	0.12	0.10	0.01	0.10	0.14	0.11
N7	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.04	0.04	0.09	0.01	0.12	0.15	0.13
N9	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.14	0.11
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.05	0.05	0.12	0.10	0.17	0.12	0.10	0.04	0.00	0.04	0.01	0.13	0.05	0.15	0.22	0.16
O3'	0.05	0.07	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.06	0.09	0.06	0.04	0.04	0.04	0.00	0.06	0.05	0.03	0.08	0.07	0.04
O4'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.06	0.10	0.15	0.12	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.05	0.08	0.10	0.08
O5'	0.06	0.12	0.11	0.06	0.09	0.01	0.09	0.01	0.10	0.09	0.11	0.13	0.10	0.09	0.08	0.13	0.05	0.08	0.00	0.11	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.05	0.11	0.00	0.13	0.15	0.13
OP1	0.08	0.12	0.12	0.08	0.11	0.06	0.12	0.06	0.12	0.11	0.12	0.13	0.10	0.12	0.10	0.15	0.08	0.08	0.02	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.14	0.16	0.07	0.15	0.04	0.15	0.02	0.15	0.15	0.14	0.13	0.14	0.15	0.14	0.22	0.07	0.10	0.02	0.15	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.13	0.05	0.12	0.02	0.13	0.01	0.13	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.11	0.16	0.04	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.18	0.14	0.13	0.14	0.12	0.13	0.11	0.13	0.13	0.15	0.17	0.12	0.12	0.14	0.20	0.14	0.15	0.11	0.45	0.33	0.12
C2	0.12	0.14	0.15	0.20	0.12	0.16	0.13	0.19	0.12	0.15	0.13	0.13	0.12	0.15	0.13	0.15	0.24	0.13	0.20	0.57	0.51	0.22
C2'	0.16	0.18	0.16	0.18	0.17	0.16	0.16	0.15	0.16	0.16	0.17	0.18	0.17	0.17	0.16	0.19	0.20	0.16	0.11	0.48	0.43	0.13
C3'	0.15	0.16	0.14	0.13	0.14	0.13	0.13	0.11	0.13	0.13	0.14	0.16	0.14	0.13	0.14	0.20	0.15	0.15	0.11	0.45	0.35	0.11
C4	0.11	0.14	0.12	0.16	0.11	0.12	0.11	0.13	0.11	0.12	0.13	0.12	0.11	0.12	0.11	0.14	0.19	0.11	0.14	0.51	0.42	0.15
C4'	0.18	0.20	0.16	0.12	0.16	0.13	0.13	0.11	0.13	0.13	0.17	0.20	0.12	0.12	0.15	0.24	0.12	0.17	0.15	0.46	0.29	0.15
C5	0.11	0.13	0.14	0.18	0.11	0.14	0.12	0.15	0.11	0.13	0.13	0.12	0.11	0.13	0.11	0.14	0.21	0.11	0.16	0.51	0.44	0.16
C5'	0.20	0.23	0.19	0.12	0.19	0.14	0.16	0.13	0.16	0.14	0.20	0.23	0.13	0.13	0.18	0.26	0.12	0.18	0.19	0.48	0.29	0.18
C6	0.15	0.14	0.18	0.23	0.14	0.19	0.15	0.21	0.14	0.17	0.14	0.14	0.14	0.17	0.15	0.17	0.27	0.15	0.22	0.55	0.52	0.22
C8	0.12	0.14	0.12	0.13	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.13	0.13	0.12	0.12	0.12	0.16	0.15	0.12	0.11	0.45	0.33	0.12
N1	0.14	0.14	0.18	0.24	0.14	0.20	0.15	0.23	0.13	0.17	0.14	0.13	0.14	0.17	0.15	0.16	0.27	0.15	0.24	0.58	0.54	0.25
N2	0.13	0.14	0.15	0.22	0.13	0.18	0.13	0.21	0.12	0.16	0.13	0.13	0.13	0.16	0.14	0.15	0.25	0.14	0.22	0.59	0.53	0.24
N3	0.11	0.14	0.12	0.17	0.11	0.13	0.11	0.15	0.11	0.12	0.13	0.13	0.11	0.13	0.11	0.14	0.20	0.11	0.15	0.53	0.45	0.17
N7	0.10	0.13	0.12	0.15	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.11	0.12	0.12	0.11	0.12	0.11	0.14	0.18	0.10	0.12	0.47	0.38	0.13
N9	0.12	0.15	0.12	0.13	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11	0.14	0.14	0.12	0.12	0.12	0.16	0.15	0.12	0.11	0.47	0.36	0.12
O2'	0.21	0.25	0.23	0.26	0.23	0.23	0.23	0.21	0.23	0.22	0.25	0.25	0.23	0.22	0.22	0.23	0.28	0.21	0.17	0.47	0.53	0.18
O3'	0.17	0.16	0.15	0.12	0.14	0.13	0.11	0.11	0.11	0.12	0.13	0.17	0.11	0.11	0.14	0.23	0.13	0.16	0.15	0.39	0.30	0.13
O4'	0.20	0.24	0.18	0.12	0.19	0.14	0.15	0.12	0.15	0.14	0.21	0.23	0.12	0.13	0.18	0.26	0.11	0.18	0.17	0.46	0.29	0.16
O5'	0.16	0.19	0.14	0.11	0.15	0.12	0.14	0.13	0.14	0.13	0.17	0.18	0.14	0.13	0.14	0.20	0.12	0.15	0.17	0.47	0.36	0.17
O6	0.19	0.16	0.22	0.28	0.18	0.24	0.18	0.26	0.17	0.21	0.16	0.17	0.16	0.20	0.19	0.20	0.32	0.19	0.27	0.58	0.56	0.27
OP1	0.17	0.20	0.15	0.11	0.16	0.12	0.14	0.13	0.15	0.13	0.18	0.19	0.14	0.13	0.15	0.22	0.10	0.15	0.19	0.46	0.36	0.20
OP2	0.17	0.21	0.15	0.13	0.17	0.13	0.16	0.15	0.16	0.15	0.20	0.20	0.16	0.15	0.16	0.21	0.14	0.16	0.19	0.49	0.39	0.20
P	0.17	0.22	0.15	0.10	0.17	0.12	0.15	0.13	0.16	0.13	0.19	0.20	0.14	0.13	0.15	0.22	0.10	0.15	0.19	0.46	0.36	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.12	0.33	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.17	0.26	0.23	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.11	0.14	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.08	0.08	0.08	0.09	0.09	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.13	0.11	0.15	0.09
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.15	0.22	0.27	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.20	0.23	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.16	0.30	0.31	0.14
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.09	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.32	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.17	0.35	0.29	0.16
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.15	0.21	0.42	0.11
N1	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.17	0.32	0.26	0.16
N3	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.16	0.20	0.23	0.15
N6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.16	0.41	0.33	0.16
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.16	0.30	0.40	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.13	0.16	0.32	0.10
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.05	0.05	0.02	0.08	0.08	0.05	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.09	0.19	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.10	0.08	0.11	0.10	0.11	0.09	0.04	0.05	0.00	0.02	0.14	0.16	0.27	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.21	0.47	0.12
O5'	0.08	0.17	0.10	0.13	0.15	0.01	0.16	0.01	0.17	0.15	0.17	0.16	0.16	0.16	0.13	0.06	0.14	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.12	0.26	0.11	0.11	0.22	0.20	0.30	0.32	0.35	0.21	0.32	0.20	0.41	0.30	0.16	0.09	0.16	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.23	0.14	0.15	0.27	0.23	0.31	0.19	0.29	0.42	0.26	0.23	0.33	0.40	0.32	0.19	0.27	0.47	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.07	0.09	0.13	0.03	0.14	0.01	0.16	0.11	0.16	0.15	0.16	0.13	0.10	0.05	0.12	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00