Doublet Group distance statistics: 51120

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 3, 16, 20, 8, 7, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.016, 0.028, 0.039, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.027 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.014, 0.029, 0.045, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.029 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.020, 0.036, 0.052, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.036 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.019, 0.039, 0.059, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.039 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.031, 0.062, 0.093, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.062 std_dev=0.031
C5	B	0, 0.175, 0.339, 0.502, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.339 std_dev=0.163
N6	B	0, 0.152, 0.318, 0.484, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.318 std_dev=0.166
N7	B	0, 0.248, 0.414, 0.580, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.414 std_dev=0.166
C8	B	0, 0.274, 0.445, 0.617, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.445 std_dev=0.171
C6	B	0, 0.126, 0.298, 0.471, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.298 std_dev=0.172
N9	B	0, 0.225, 0.401, 0.577, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.401 std_dev=0.176
C4	B	0, 0.155, 0.342, 0.528, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.342 std_dev=0.187
O5'	B	0, 0.279, 0.482, 0.685, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.482 std_dev=0.203
C1'	B	0, 0.233, 0.438, 0.643, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.438 std_dev=0.205
O4'	B	0, 0.246, 0.454, 0.662, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.454 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.086, 0.296, 0.505, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.296 std_dev=0.209
C4'	B	0, 0.253, 0.478, 0.703, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.478 std_dev=0.225
C5'	B	0, 0.256, 0.482, 0.708, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.482 std_dev=0.226
C3'	B	0, 0.258, 0.487, 0.716, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.487 std_dev=0.229
C2'	B	0, 0.225, 0.456, 0.687, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.456 std_dev=0.231
P	B	0, 0.292, 0.524, 0.756, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.524 std_dev=0.232
OP2	B	0, 0.292, 0.526, 0.761, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.526 std_dev=0.235
N3	B	0, 0.101, 0.339, 0.578, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.339 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.093, 0.334, 0.576, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.334 std_dev=0.242
O3'	B	0, 0.286, 0.555, 0.823, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.555 std_dev=0.268
O2'	B	0, 0.191, 0.467, 0.743, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.467 std_dev=0.276
OP1	B	0, 0.331, 0.608, 0.885, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.608 std_dev=0.277
O4'	A	0, -0.200, 0.110, 0.421, 2.441 max_d=2.441 avg_d=0.110 std_dev=0.310
C2'	A	0, -0.193, 0.147, 0.487, 2.674 max_d=2.674 avg_d=0.147 std_dev=0.340
C4'	A	0, -0.227, 0.154, 0.535, 2.979 max_d=2.979 avg_d=0.154 std_dev=0.381
C3'	A	0, -0.264, 0.165, 0.595, 3.385 max_d=3.385 avg_d=0.165 std_dev=0.429
O3'	A	0, -0.275, 0.198, 0.671, 3.738 max_d=3.738 avg_d=0.198 std_dev=0.473
O2'	A	0, -0.292, 0.231, 0.755, 4.077 max_d=4.077 avg_d=0.231 std_dev=0.523
C5'	A	0, -0.506, 0.264, 1.033, 5.978 max_d=5.978 avg_d=0.264 std_dev=0.769
O5'	A	0, -0.630, 0.339, 1.308, 7.418 max_d=7.418 avg_d=0.339 std_dev=0.969
P	A	0, -0.899, 0.478, 1.856, 10.602 max_d=10.602 avg_d=0.478 std_dev=1.377
OP2	A	0, -0.956, 0.557, 2.069, 11.683 max_d=11.683 avg_d=0.557 std_dev=1.513
OP1	A	0, -0.972, 0.572, 2.116, 11.934 max_d=11.934 avg_d=0.572 std_dev=1.544

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.13	0.02	0.15	0.08	0.12
C2	0.03	0.00	0.06	0.23	0.00	0.23	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.11	0.14	0.56	0.01	0.52	0.78	0.67
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.05	0.02	0.06	0.06	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.14	0.05	0.19	0.10	0.17
C3'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.16	0.00	0.13	0.01	0.17	0.03	0.21	0.25	0.21	0.07	0.07	0.02	0.01	0.01	0.05	0.16	0.05	0.08	0.05
C4	0.01	0.00	0.04	0.16	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.07	0.29	0.01	0.24	0.35	0.31
C4'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.12	0.00	0.07	0.00	0.11	0.08	0.18	0.27	0.22	0.05	0.03	0.09	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.08	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.08	0.02	0.25	0.01	0.27	0.31	0.26
C5'	0.03	0.40	0.06	0.01	0.19	0.00	0.12	0.00	0.19	0.18	0.31	0.51	0.37	0.13	0.06	0.05	0.07	0.01	0.01	0.16	0.15	0.13	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.17	0.01	0.11	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.05	0.32	0.00	0.29	0.47	0.37
C8	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.08	0.32	0.01	0.48	0.27	0.34
N1	0.02	0.00	0.06	0.21	0.01	0.18	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.12	0.10	0.46	0.01	0.40	0.68	0.56
N2	0.04	0.00	0.06	0.25	0.01	0.27	0.01	0.51	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.12	0.16	0.70	0.01	0.73	1.03	0.89
N3	0.03	0.01	0.06	0.21	0.00	0.22	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.10	0.15	0.50	0.01	0.43	0.62	0.56
N7	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.05	0.27	0.01	0.45	0.25	0.29
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.18	0.01	0.24	0.15	0.18
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.12	0.09	0.10	0.05	0.13	0.04	0.17	0.21	0.17	0.06	0.06	0.00	0.05	0.06	0.11	0.12	0.17	0.09	0.15
O3'	0.10	0.11	0.03	0.01	0.07	0.01	0.08	0.07	0.10	0.05	0.12	0.12	0.10	0.05	0.06	0.05	0.00	0.07	0.13	0.10	0.22	0.17	0.14
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.10	0.16	0.15	0.05	0.01	0.06	0.07	0.00	0.11	0.04	0.08	0.09	0.08
O5'	0.13	0.56	0.14	0.05	0.29	0.01	0.25	0.01	0.32	0.32	0.46	0.70	0.50	0.27	0.18	0.11	0.13	0.11	0.00	0.30	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.16	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.04	0.30	0.00	0.31	0.44	0.34
OP1	0.15	0.52	0.19	0.05	0.24	0.09	0.27	0.15	0.29	0.48	0.40	0.73	0.43	0.45	0.24	0.17	0.22	0.08	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.78	0.10	0.08	0.35	0.08	0.31	0.13	0.47	0.27	0.68	1.03	0.62	0.25	0.15	0.09	0.17	0.09	0.02	0.44	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.67	0.17	0.05	0.31	0.02	0.26	0.01	0.37	0.34	0.56	0.89	0.56	0.29	0.18	0.15	0.14	0.08	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.08	0.14	0.13	0.07	0.12	0.05	0.10	0.06	0.06	0.05	0.10	0.10	0.05	0.08	0.17	0.16	0.11	0.10	0.10	0.12	0.08
C2	0.14	0.15	0.16	0.15	0.13	0.13	0.11	0.11	0.11	0.11	0.13	0.15	0.09	0.10	0.12	0.18	0.16	0.13	0.10	0.09	0.13	0.09
C2'	0.14	0.11	0.14	0.13	0.10	0.14	0.07	0.12	0.07	0.08	0.07	0.13	0.09	0.07	0.10	0.17	0.14	0.14	0.11	0.12	0.13	0.10
C3'	0.12	0.10	0.11	0.10	0.10	0.12	0.09	0.11	0.10	0.09	0.09	0.11	0.12	0.09	0.10	0.12	0.11	0.13	0.11	0.12	0.12	0.10
C4	0.12	0.12	0.14	0.13	0.10	0.12	0.07	0.10	0.06	0.07	0.08	0.12	0.07	0.06	0.10	0.17	0.15	0.11	0.08	0.08	0.12	0.07
C4'	0.18	0.15	0.14	0.14	0.14	0.17	0.12	0.17	0.11	0.13	0.12	0.17	0.12	0.11	0.15	0.15	0.13	0.19	0.16	0.16	0.18	0.17
C5	0.13	0.15	0.15	0.14	0.11	0.12	0.08	0.10	0.07	0.08	0.10	0.14	0.07	0.06	0.11	0.18	0.16	0.12	0.08	0.08	0.12	0.07
C5'	0.39	0.31	0.37	0.36	0.31	0.39	0.25	0.38	0.21	0.29	0.23	0.36	0.18	0.24	0.33	0.41	0.36	0.40	0.34	0.34	0.32	0.33
C6	0.15	0.18	0.17	0.15	0.14	0.14	0.12	0.11	0.11	0.11	0.16	0.17	0.08	0.10	0.14	0.19	0.17	0.14	0.09	0.09	0.13	0.08
C8	0.11	0.10	0.13	0.12	0.08	0.11	0.05	0.10	0.07	0.06	0.07	0.11	0.12	0.05	0.08	0.16	0.15	0.11	0.09	0.10	0.12	0.08
N1	0.15	0.17	0.17	0.16	0.15	0.14	0.13	0.12	0.13	0.12	0.16	0.17	0.10	0.11	0.14	0.19	0.17	0.14	0.10	0.10	0.13	0.09
N2	0.14	0.16	0.17	0.15	0.14	0.14	0.12	0.12	0.12	0.12	0.14	0.15	0.11	0.12	0.13	0.18	0.17	0.13	0.10	0.10	0.13	0.10
N3	0.12	0.13	0.15	0.13	0.11	0.12	0.08	0.10	0.08	0.08	0.10	0.13	0.07	0.08	0.10	0.17	0.16	0.11	0.09	0.09	0.12	0.08
N7	0.12	0.14	0.15	0.13	0.09	0.12	0.05	0.10	0.06	0.06	0.07	0.14	0.11	0.05	0.09	0.17	0.15	0.11	0.08	0.09	0.12	0.08
N9	0.11	0.10	0.13	0.12	0.08	0.11	0.05	0.09	0.05	0.06	0.06	0.11	0.09	0.05	0.08	0.16	0.15	0.10	0.09	0.09	0.12	0.08
O2'	0.18	0.13	0.20	0.18	0.11	0.19	0.08	0.16	0.10	0.09	0.09	0.16	0.16	0.09	0.12	0.26	0.21	0.18	0.13	0.15	0.16	0.12
O3'	0.15	0.11	0.14	0.13	0.11	0.15	0.09	0.14	0.09	0.10	0.09	0.13	0.10	0.10	0.12	0.17	0.14	0.16	0.12	0.12	0.11	0.10
O4'	0.16	0.15	0.10	0.10	0.14	0.15	0.13	0.15	0.12	0.13	0.13	0.17	0.13	0.12	0.15	0.10	0.08	0.18	0.15	0.15	0.18	0.16
O5'	0.52	0.41	0.52	0.51	0.42	0.53	0.32	0.51	0.26	0.38	0.29	0.48	0.17	0.31	0.45	0.58	0.52	0.53	0.46	0.45	0.40	0.44
O6	0.17	0.20	0.19	0.17	0.17	0.15	0.14	0.12	0.15	0.13	0.20	0.19	0.11	0.12	0.16	0.20	0.18	0.15	0.10	0.10	0.13	0.09
OP1	0.99	0.77	1.05	1.03	0.82	1.02	0.69	0.99	0.57	0.79	0.59	0.89	0.42	0.68	0.88	1.12	1.08	0.98	0.92	0.92	0.83	0.89
OP2	0.70	0.45	0.73	0.71	0.50	0.74	0.36	0.69	0.26	0.46	0.28	0.58	0.23	0.35	0.56	0.84	0.76	0.70	0.60	0.60	0.48	0.56
P	0.71	0.52	0.75	0.73	0.55	0.74	0.41	0.70	0.31	0.51	0.35	0.62	0.20	0.40	0.60	0.84	0.77	0.71	0.62	0.62	0.53	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02	0.06	0.07	0.12	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.05	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.04	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.07	0.11	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.07	0.09	0.13	0.09
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.07	0.09	0.14	0.09
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.07	0.09	0.12	0.08
N1	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.06	0.08	0.13	0.08
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.05	0.06	0.10	0.06
N6	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.07	0.10	0.15	0.10
N7	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.08	0.10	0.14	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.10	0.06
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.09	0.04	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.11	0.07	0.06
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.04
O5'	0.04	0.06	0.03	0.03	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.07	0.06	0.05	0.07	0.08	0.05	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.07	0.07	0.08	0.07	0.06	0.09	0.05	0.09	0.09	0.08	0.06	0.10	0.10	0.06	0.09	0.11	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.12	0.05	0.04	0.11	0.03	0.13	0.01	0.14	0.12	0.13	0.10	0.15	0.14	0.10	0.04	0.07	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.03	0.04	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.08	0.08	0.06	0.10	0.10	0.06	0.03	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00