Doublet Group distance statistics: 51123

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C5	A	0, 0.010, 0.033, 0.057, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.033 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.012, 0.041, 0.069, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.041 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.012, 0.041, 0.071, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.041 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.012, 0.042, 0.071, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.042 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.019, 0.066, 0.113, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.066 std_dev=0.047
N7	A	0, 0.022, 0.073, 0.125, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.073 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.028, 0.095, 0.161, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.095 std_dev=0.067
N3	B	0, 0.099, 0.338, 0.577, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.338 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.123, 0.419, 0.716, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.419 std_dev=0.297
C2	B	0, 0.123, 0.420, 0.717, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.420 std_dev=0.297
C4	B	0, 0.125, 0.426, 0.728, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.426 std_dev=0.302
C5	B	0, 0.137, 0.467, 0.797, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.467 std_dev=0.330
N1	B	0, 0.137, 0.467, 0.797, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.467 std_dev=0.330
N6	B	0, 0.141, 0.483, 0.824, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.483 std_dev=0.341
N9	B	0, 0.187, 0.639, 1.092, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.639 std_dev=0.452
N7	B	0, 0.195, 0.666, 1.137, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.666 std_dev=0.471
C8	B	0, 0.227, 0.776, 1.325, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.776 std_dev=0.549
C1'	B	0, 0.227, 0.778, 1.328, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.778 std_dev=0.550
C2'	B	0, 0.269, 0.918, 1.568, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.918 std_dev=0.650
C3'	B	0, 0.470, 1.605, 2.741, 2.443 max_d=2.443 avg_d=1.605 std_dev=1.135
O3'	B	0, 0.479, 1.635, 2.792, 2.492 max_d=2.492 avg_d=1.635 std_dev=1.157
C2'	A	0, 0.515, 1.757, 2.999, 2.638 max_d=2.638 avg_d=1.757 std_dev=1.242
O4'	A	0, 0.527, 1.800, 3.072, 2.702 max_d=2.702 avg_d=1.800 std_dev=1.273
O2'	B	0, 0.558, 1.905, 3.253, 2.871 max_d=2.871 avg_d=1.905 std_dev=1.347
C4'	B	0, 0.601, 2.053, 3.505, 3.087 max_d=3.087 avg_d=2.053 std_dev=1.452
O4'	B	0, 0.617, 2.106, 3.595, 3.169 max_d=3.169 avg_d=2.106 std_dev=1.489
O2'	A	0, 0.619, 2.113, 3.606, 3.184 max_d=3.184 avg_d=2.113 std_dev=1.494
C4'	A	0, 0.693, 2.368, 4.042, 3.559 max_d=3.559 avg_d=2.368 std_dev=1.674
C3'	A	0, 0.767, 2.617, 4.468, 3.927 max_d=3.927 avg_d=2.617 std_dev=1.851
O3'	A	0, 0.986, 3.367, 5.747, 5.054 max_d=5.054 avg_d=3.367 std_dev=2.381
C5'	B	0, 1.151, 3.929, 6.707, 5.911 max_d=5.911 avg_d=3.929 std_dev=2.778
C5'	A	0, 1.274, 4.350, 7.426, 6.531 max_d=6.531 avg_d=4.350 std_dev=3.076
O5'	B	0, 1.291, 4.410, 7.528, 6.640 max_d=6.640 avg_d=4.410 std_dev=3.118
O5'	A	0, 1.443, 4.927, 8.410, 7.395 max_d=7.395 avg_d=4.927 std_dev=3.484
P	B	0, 1.804, 6.161, 10.517, 9.257 max_d=9.257 avg_d=6.161 std_dev=4.356
OP2	B	0, 1.841, 6.286, 10.731, 9.431 max_d=9.431 avg_d=6.286 std_dev=4.445
P	A	0, 1.976, 6.748, 11.520, 10.133 max_d=10.133 avg_d=6.748 std_dev=4.772
OP1	B	0, 2.021, 6.899, 11.778, 10.372 max_d=10.372 avg_d=6.899 std_dev=4.878
OP1	A	0, 2.038, 6.957, 11.876, 10.453 max_d=10.453 avg_d=6.957 std_dev=4.919
OP2	A	0, 2.310, 7.885, 13.461, 11.835 max_d=11.835 avg_d=7.885 std_dev=5.576

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.19	0.11	0.04
C2	0.02	0.00	0.04	0.23	0.01	0.45	0.00	0.71	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.17	0.43	0.87	0.01	0.89	1.53	1.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.06	0.04	0.06	0.03	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.10	0.08	0.01	0.18	0.09
C3'	0.02	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.01	0.07	0.37	0.09	0.37	0.24	0.33	0.14	0.02	0.00	0.00	0.16	0.15	0.13	0.12	0.15
C4	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.16	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.21	0.25	0.00	0.19	0.61	0.34
C4'	0.02	0.45	0.01	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.10	0.33	0.30	0.60	0.43	0.24	0.06	0.09	0.04	0.00	0.00	0.02	0.13	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.17	0.09	0.04	0.01	0.05	0.32	0.06
C5'	0.01	0.71	0.00	0.01	0.21	0.00	0.04	0.00	0.13	0.53	0.47	1.00	0.65	0.43	0.11	0.08	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.17	0.17	0.00	0.20	0.64	0.32
C8	0.01	0.01	0.04	0.37	0.00	0.33	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.33	0.21	0.61	0.02	0.62	0.44	0.58
N1	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.30	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.03	0.32	0.58	0.00	0.63	1.21	0.80
N2	0.02	0.00	0.03	0.37	0.01	0.60	0.01	1.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.30	0.52	1.23	0.01	1.33	2.09	1.57
N3	0.01	0.00	0.03	0.24	0.00	0.43	0.00	0.65	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.18	0.43	0.78	0.00	0.70	1.26	0.92
N7	0.01	0.01	0.05	0.33	0.01	0.24	0.00	0.43	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.33	0.11	0.49	0.02	0.50	0.29	0.46
N9	0.00	0.01	0.03	0.14	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.14	0.01	0.21	0.10	0.10
O2'	0.02	0.20	0.01	0.02	0.05	0.09	0.04	0.08	0.02	0.23	0.12	0.27	0.19	0.18	0.07	0.00	0.00	0.08	0.02	0.02	0.21	0.03	0.07
O3'	0.02	0.17	0.02	0.00	0.02	0.04	0.17	0.03	0.13	0.33	0.03	0.30	0.18	0.33	0.12	0.00	0.00	0.03	0.18	0.21	0.21	0.05	0.17
O4'	0.00	0.43	0.01	0.00	0.21	0.00	0.09	0.00	0.17	0.21	0.32	0.52	0.43	0.11	0.00	0.08	0.03	0.00	0.09	0.12	0.27	0.04	0.09
O5'	0.04	0.87	0.10	0.16	0.25	0.00	0.04	0.00	0.17	0.61	0.58	1.23	0.78	0.49	0.14	0.02	0.18	0.09	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00
O6	0.00	0.01	0.08	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.21	0.12	0.03	0.00	0.07	0.47	0.16
OP1	0.19	0.89	0.01	0.13	0.19	0.13	0.05	0.02	0.20	0.62	0.63	1.33	0.70	0.50	0.21	0.21	0.21	0.27	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	1.53	0.18	0.12	0.61	0.03	0.32	0.13	0.64	0.44	1.21	2.09	1.26	0.29	0.10	0.03	0.05	0.04	0.00	0.47	0.01	0.00	0.00
P	0.04	1.10	0.09	0.15	0.34	0.02	0.06	0.01	0.32	0.58	0.80	1.57	0.92	0.46	0.10	0.07	0.17	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.08	0.13	0.15	0.01	0.21	0.04	0.57	0.03	0.06	0.05	0.07	0.09	0.08	0.01	0.12	0.23	0.25	0.74	1.32	1.13	1.13
C2	0.04	0.15	0.14	0.31	0.06	0.02	0.03	0.09	0.07	0.03	0.14	0.11	0.05	0.03	0.02	0.04	0.27	0.08	0.16	0.36	0.36	0.32
C2'	0.16	0.10	0.07	0.11	0.19	0.51	0.23	0.90	0.21	0.26	0.13	0.13	0.25	0.28	0.21	0.01	0.03	0.51	1.10	1.75	1.55	1.54
C3'	0.80	0.79	0.73	0.78	0.81	1.19	0.79	1.60	0.77	0.81	0.77	0.81	0.71	0.79	0.82	0.65	0.68	1.17	1.79	2.45	2.22	2.24
C4	0.05	0.13	0.13	0.24	0.05	0.06	0.01	0.27	0.03	0.04	0.11	0.10	0.01	0.06	0.02	0.01	0.24	0.14	0.39	0.74	0.64	0.63
C4'	0.67	0.71	0.61	0.62	0.68	1.01	0.64	1.43	0.64	0.64	0.68	0.71	0.57	0.62	0.67	0.58	0.49	1.00	1.60	2.24	1.96	2.01
C5	0.05	0.14	0.12	0.26	0.06	0.00	0.02	0.15	0.06	0.03	0.13	0.11	0.02	0.04	0.03	0.05	0.22	0.08	0.25	0.52	0.43	0.43
C5'	1.20	1.29	1.20	1.20	1.19	1.56	1.09	1.97	1.07	1.07	1.19	1.28	0.91	1.00	1.17	1.18	1.05	1.52	2.12	2.73	2.38	2.50
C6	0.05	0.15	0.12	0.32	0.08	0.09	0.05	0.03	0.09	0.01	0.15	0.12	0.08	0.02	0.04	0.11	0.23	0.01	0.03	0.15	0.12	0.12
C8	0.05	0.10	0.10	0.16	0.02	0.14	0.03	0.42	0.02	0.05	0.07	0.08	0.10	0.08	0.01	0.03	0.18	0.18	0.59	1.08	0.86	0.89
N1	0.04	0.15	0.13	0.34	0.07	0.09	0.05	0.03	0.09	0.02	0.15	0.12	0.08	0.02	0.03	0.10	0.26	0.03	0.02	0.12	0.13	0.11
N2	0.04	0.15	0.15	0.34	0.07	0.04	0.04	0.06	0.08	0.03	0.15	0.12	0.06	0.03	0.03	0.04	0.29	0.08	0.11	0.28	0.31	0.26
N3	0.04	0.13	0.14	0.27	0.05	0.05	0.01	0.24	0.04	0.04	0.12	0.10	0.01	0.05	0.02	0.01	0.26	0.14	0.33	0.65	0.60	0.57
N7	0.06	0.12	0.10	0.21	0.05	0.04	0.01	0.24	0.03	0.04	0.11	0.10	0.04	0.05	0.02	0.04	0.18	0.10	0.37	0.73	0.56	0.58
N9	0.04	0.10	0.12	0.18	0.03	0.15	0.02	0.43	0.01	0.05	0.07	0.08	0.07	0.07	0.01	0.06	0.22	0.19	0.59	1.07	0.90	0.90
O2'	0.31	0.38	0.42	0.35	0.27	0.07	0.18	0.52	0.19	0.14	0.31	0.36	0.09	0.10	0.24	0.53	0.45	0.07	0.74	1.48	1.28	1.24
O3'	0.95	0.89	0.86	0.97	0.94	1.42	0.90	1.89	0.85	0.95	0.85	0.93	0.78	0.91	0.96	0.71	0.84	1.38	2.08	2.81	2.60	2.60
O4'	0.28	0.32	0.23	0.18	0.31	0.54	0.30	0.90	0.31	0.30	0.32	0.32	0.29	0.29	0.30	0.25	0.07	0.56	1.06	1.62	1.38	1.42
O5'	1.30	1.42	1.36	1.31	1.30	1.60	1.18	1.96	1.17	1.15	1.32	1.40	0.99	1.08	1.26	1.41	1.20	1.55	2.10	2.62	2.21	2.38
O6	0.05	0.15	0.10	0.34	0.08	0.16	0.07	0.17	0.11	0.00	0.16	0.12	0.12	0.01	0.05	0.18	0.21	0.05	0.15	0.13	0.15	0.14
OP1	1.46	1.57	1.58	1.55	1.41	1.81	1.24	2.19	1.21	1.22	1.40	1.57	0.99	1.11	1.38	1.64	1.42	1.70	2.31	2.83	2.34	2.58
OP2	1.73	1.87	1.92	1.86	1.65	2.06	1.38	2.39	1.33	1.35	1.61	1.88	0.98	1.19	1.60	2.03	1.76	1.92	2.48	2.87	2.33	2.63
P	1.50	1.61	1.61	1.55	1.45	1.80	1.27	2.14	1.25	1.25	1.44	1.61	1.00	1.14	1.41	1.71	1.44	1.70	2.25	2.70	2.24	2.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.18	0.00	0.12	0.15	0.10	0.13
C2	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.30	0.01	0.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.09	0.29	0.98	1.50	1.15	1.27
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.13	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.19	0.20	0.15	0.19
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.17	0.27	0.08	0.02	0.21	0.28	0.15	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.09	0.11
C4	0.02	0.00	0.04	0.10	0.00	0.10	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.15	0.45	0.62	0.50	0.55
C4'	0.01	0.30	0.00	0.00	0.10	0.00	0.02	0.00	0.06	0.26	0.20	0.30	0.00	0.20	0.06	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.19	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.08	0.05	0.18	0.34	0.24	0.27
C5'	0.04	0.70	0.13	0.00	0.28	0.00	0.08	0.00	0.24	0.38	0.52	0.66	0.12	0.27	0.02	0.02	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01
C6	0.03	0.00	0.05	0.17	0.01	0.06	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.11	0.38	0.67	0.50	0.55
C8	0.00	0.00	0.02	0.27	0.00	0.26	0.00	0.38	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.01	0.18	0.39	0.39	0.46	0.42
N1	0.04	0.00	0.06	0.08	0.01	0.20	0.00	0.52	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.22	0.74	1.21	0.93	1.01
N3	0.04	0.00	0.06	0.02	0.00	0.30	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.05	0.29	0.94	1.25	1.00	1.12
N6	0.03	0.00	0.05	0.21	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.14	0.07	0.23	0.45	0.32	0.35
N7	0.01	0.00	0.03	0.28	0.00	0.20	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.23	0.07	0.10	0.26	0.27	0.33	0.29
N9	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.03	0.01	0.06	0.13	0.06	0.09
O2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.02	0.16	0.12	0.02	0.07	0.24	0.03	0.15	0.13	0.23	0.11	0.00	0.01	0.11	0.12	0.21	0.09	0.14
O3'	0.18	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.12	0.12	0.01	0.12	0.05	0.14	0.07	0.03	0.01	0.00	0.13	0.24	0.36	0.11	0.24
O4'	0.00	0.29	0.01	0.01	0.15	0.01	0.05	0.00	0.11	0.18	0.22	0.29	0.07	0.10	0.01	0.11	0.13	0.00	0.09	0.12	0.11	0.12
O5'	0.12	0.98	0.19	0.11	0.45	0.00	0.18	0.00	0.38	0.39	0.74	0.94	0.23	0.26	0.06	0.12	0.24	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.15	1.50	0.20	0.17	0.62	0.01	0.34	0.01	0.67	0.39	1.21	1.25	0.45	0.27	0.13	0.21	0.36	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	1.15	0.15	0.09	0.50	0.05	0.24	0.01	0.50	0.46	0.93	1.00	0.32	0.33	0.06	0.09	0.11	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	1.27	0.19	0.11	0.55	0.02	0.27	0.01	0.55	0.42	1.01	1.12	0.35	0.29	0.09	0.14	0.24	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00