Doublet Group distance statistics: 51127

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 2, 8, 27, 20, 9, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.017, 0.027, 0.036, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.027 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.019, 0.029, 0.040, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.018, 0.029, 0.040, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.029 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.022, 0.033, 0.045, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.033 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.024, 0.036, 0.049, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.036 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.026, 0.038, 0.051, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.038 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.019, 0.033, 0.046, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.033 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.017, 0.038, 0.058, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.038 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.027, 0.049, 0.072, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.049 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.041, 0.066, 0.090, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.066 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.032, 0.060, 0.087, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.060 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.093, 0.143, 0.193, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.143 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.020, 0.086, 0.151, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.086 std_dev=0.065
C3'	A	0, 0.203, 0.294, 0.385, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.294 std_dev=0.091
O2'	A	0, 0.205, 0.306, 0.408, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.306 std_dev=0.101
C4'	A	0, 0.249, 0.369, 0.490, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.369 std_dev=0.121
O3'	A	0, 0.196, 0.327, 0.457, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.327 std_dev=0.130
C1'	B	0, 0.468, 0.627, 0.786, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.627 std_dev=0.159
C2'	B	0, 0.444, 0.609, 0.774, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.609 std_dev=0.165
O4'	B	0, 0.426, 0.592, 0.758, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.592 std_dev=0.166
O2'	B	0, 0.561, 0.732, 0.903, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.732 std_dev=0.171
N1	B	0, 0.500, 0.697, 0.893, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.697 std_dev=0.196
C4'	B	0, 0.334, 0.539, 0.745, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.539 std_dev=0.206
C5'	A	0, 0.415, 0.622, 0.828, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.622 std_dev=0.207
O5'	A	0, 0.507, 0.716, 0.926, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.716 std_dev=0.210
C6	B	0, 0.521, 0.737, 0.954, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.737 std_dev=0.216
C3'	B	0, 0.340, 0.557, 0.774, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.557 std_dev=0.217
OP2	A	0, 0.627, 0.864, 1.101, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.864 std_dev=0.237
P	A	0, 0.608, 0.849, 1.090, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.849 std_dev=0.241
O3'	B	0, 0.282, 0.526, 0.770, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.526 std_dev=0.244
C2	B	0, 0.478, 0.735, 0.992, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.735 std_dev=0.257
C5	B	0, 0.515, 0.786, 1.058, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.786 std_dev=0.271
O2	B	0, 0.467, 0.750, 1.032, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.750 std_dev=0.282
OP1	A	0, 0.737, 1.031, 1.325, 1.743 max_d=1.743 avg_d=1.031 std_dev=0.294
C5'	B	0, 0.206, 0.520, 0.834, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.520 std_dev=0.314
N3	B	0, 0.477, 0.803, 1.130, 1.916 max_d=1.916 avg_d=0.803 std_dev=0.327
C4	B	0, 0.500, 0.831, 1.161, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.831 std_dev=0.330
O5'	B	0, 0.287, 0.645, 1.003, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.645 std_dev=0.358
O4	B	0, 0.531, 0.922, 1.313, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.922 std_dev=0.391
P	B	0, 0.579, 1.053, 1.527, 2.539 max_d=2.539 avg_d=1.053 std_dev=0.474
OP1	B	0, 0.737, 1.272, 1.808, 2.841 max_d=2.841 avg_d=1.272 std_dev=0.536
OP2	B	0, 0.634, 1.216, 1.799, 2.877 max_d=2.877 avg_d=1.216 std_dev=0.582

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.14	0.08
C2	0.03	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.15	0.02	0.20	0.29	0.19
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.09	0.11	0.05
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.07	0.09	0.10	0.08	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.10	0.10	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.15	0.01	0.18	0.26	0.18
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.06	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.18	0.01	0.23	0.31	0.23
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.13	0.13	0.11	0.07	0.07	0.15	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.15	0.06	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.19	0.01	0.26	0.34	0.25
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.17	0.02	0.20	0.25	0.20
N1	0.03	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.18	0.02	0.24	0.33	0.23
N2	0.04	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.12	0.04	0.15	0.03	0.19	0.29	0.18
N3	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.14	0.02	0.17	0.25	0.16
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.20	0.03	0.24	0.31	0.24
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.13	0.01	0.15	0.21	0.15
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.05	0.07	0.03	0.08	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.07	0.10	0.10	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.09	0.08	0.10	0.12	0.09	0.09	0.05	0.04	0.00	0.02	0.09	0.10	0.14	0.12	0.10
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.03	0.08	0.11	0.07
O5'	0.07	0.15	0.04	0.05	0.15	0.01	0.18	0.01	0.19	0.17	0.18	0.15	0.14	0.20	0.13	0.04	0.09	0.08	0.00	0.21	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.10	0.03	0.21	0.00	0.29	0.37	0.28
OP1	0.08	0.20	0.09	0.10	0.18	0.06	0.23	0.06	0.26	0.20	0.24	0.19	0.17	0.24	0.15	0.10	0.14	0.08	0.02	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.29	0.11	0.10	0.26	0.06	0.31	0.04	0.34	0.25	0.33	0.29	0.25	0.31	0.21	0.10	0.12	0.11	0.02	0.37	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.19	0.05	0.06	0.18	0.02	0.23	0.02	0.25	0.20	0.23	0.18	0.16	0.24	0.15	0.05	0.10	0.07	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.15	0.14	0.12	0.12	0.11	0.10	0.12	0.09	0.10	0.15	0.20	0.17	0.15	0.13	0.12	0.11	0.18	0.25	0.12
C2	0.15	0.16	0.15	0.12	0.15	0.14	0.16	0.23	0.16	0.15	0.15	0.19	0.21	0.12	0.16	0.13	0.19	0.25	0.34	0.25
C2'	0.09	0.13	0.11	0.09	0.11	0.10	0.10	0.11	0.10	0.10	0.13	0.18	0.14	0.11	0.11	0.11	0.10	0.20	0.23	0.11
C3'	0.09	0.12	0.12	0.10	0.10	0.09	0.10	0.11	0.10	0.09	0.12	0.17	0.13	0.11	0.11	0.11	0.11	0.23	0.22	0.13
C4	0.11	0.16	0.14	0.09	0.14	0.11	0.13	0.18	0.12	0.12	0.16	0.22	0.20	0.10	0.16	0.11	0.14	0.21	0.29	0.19
C4'	0.10	0.14	0.15	0.14	0.12	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.15	0.19	0.15	0.18	0.13	0.12	0.11	0.20	0.23	0.10
C5	0.12	0.17	0.14	0.09	0.16	0.12	0.15	0.20	0.14	0.13	0.18	0.23	0.20	0.10	0.17	0.11	0.17	0.25	0.31	0.23
C5'	0.11	0.16	0.16	0.14	0.13	0.10	0.10	0.11	0.10	0.11	0.16	0.20	0.16	0.18	0.15	0.12	0.10	0.21	0.23	0.10
C6	0.14	0.17	0.15	0.11	0.16	0.14	0.17	0.24	0.16	0.14	0.17	0.22	0.21	0.11	0.18	0.13	0.20	0.29	0.35	0.28
C8	0.10	0.18	0.13	0.09	0.16	0.10	0.13	0.16	0.11	0.12	0.19	0.24	0.18	0.12	0.18	0.10	0.13	0.21	0.27	0.17
N1	0.15	0.16	0.15	0.12	0.16	0.15	0.18	0.25	0.17	0.15	0.16	0.20	0.21	0.12	0.18	0.13	0.21	0.29	0.37	0.29
N2	0.17	0.16	0.16	0.15	0.17	0.17	0.19	0.25	0.19	0.17	0.16	0.18	0.20	0.15	0.18	0.15	0.21	0.26	0.36	0.27
N3	0.12	0.15	0.14	0.09	0.13	0.11	0.13	0.18	0.13	0.12	0.15	0.19	0.21	0.10	0.14	0.11	0.15	0.20	0.29	0.19
N7	0.11	0.18	0.14	0.09	0.17	0.11	0.14	0.19	0.13	0.13	0.19	0.24	0.19	0.10	0.18	0.11	0.16	0.24	0.30	0.22
N9	0.10	0.17	0.13	0.09	0.14	0.10	0.12	0.15	0.11	0.11	0.17	0.22	0.19	0.11	0.16	0.11	0.12	0.19	0.27	0.15
O2'	0.11	0.12	0.13	0.14	0.11	0.14	0.12	0.14	0.12	0.11	0.12	0.16	0.13	0.18	0.11	0.14	0.14	0.22	0.22	0.12
O3'	0.11	0.12	0.12	0.10	0.12	0.09	0.13	0.09	0.13	0.11	0.13	0.16	0.14	0.11	0.13	0.11	0.12	0.25	0.21	0.12
O4'	0.11	0.15	0.16	0.14	0.13	0.11	0.11	0.12	0.10	0.11	0.16	0.20	0.17	0.18	0.15	0.13	0.11	0.18	0.25	0.11
O5'	0.10	0.13	0.15	0.12	0.11	0.12	0.10	0.16	0.10	0.10	0.14	0.17	0.16	0.14	0.13	0.14	0.14	0.24	0.23	0.16
O6	0.15	0.17	0.15	0.12	0.17	0.15	0.19	0.25	0.18	0.15	0.18	0.22	0.21	0.12	0.19	0.14	0.22	0.32	0.38	0.31
OP1	0.10	0.15	0.15	0.12	0.13	0.12	0.10	0.17	0.10	0.10	0.16	0.21	0.16	0.15	0.15	0.12	0.16	0.28	0.26	0.19
OP2	0.16	0.13	0.17	0.16	0.14	0.23	0.16	0.30	0.17	0.14	0.14	0.16	0.19	0.16	0.14	0.23	0.28	0.37	0.33	0.32
P	0.11	0.13	0.15	0.11	0.12	0.14	0.10	0.19	0.11	0.10	0.14	0.18	0.17	0.14	0.13	0.15	0.17	0.27	0.25	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.10	0.29	0.11
C2	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.01	0.03	0.17	0.15	0.28	0.17
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.06	0.12	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.19	0.31	0.14
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.12	0.05	0.08	0.13	0.02	0.01	0.08	0.01	0.06	0.21	0.27	0.14
C4	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.25	0.25	0.31	0.26
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.07	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.12	0.23	0.07
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.04	0.26	0.25	0.30	0.26
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.12	0.08	0.05	0.03	0.16	0.01	0.01	0.13	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.01	0.04	0.23	0.18	0.28	0.20
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.16	0.13	0.28	0.15
N3	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.01	0.03	0.22	0.20	0.29	0.22
O2	0.04	0.01	0.12	0.13	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.15	0.02	0.05	0.15	0.15	0.29	0.16
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.09	0.15	0.00	0.05	0.08	0.05	0.05	0.18	0.29	0.12
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.09	0.02	0.13	0.03	0.13	0.05	0.09	0.15	0.05	0.00	0.10	0.02	0.09	0.29	0.26	0.18
O4	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.10	0.00	0.04	0.26	0.28	0.33	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.04	0.00	0.07	0.06	0.30	0.11
O5'	0.08	0.17	0.05	0.06	0.25	0.02	0.26	0.01	0.23	0.16	0.22	0.15	0.05	0.09	0.26	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.15	0.19	0.21	0.25	0.12	0.25	0.13	0.18	0.13	0.20	0.15	0.18	0.29	0.28	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.28	0.31	0.27	0.31	0.23	0.30	0.12	0.28	0.28	0.29	0.29	0.29	0.26	0.33	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.17	0.14	0.14	0.26	0.07	0.26	0.02	0.20	0.15	0.22	0.16	0.12	0.18	0.29	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00