Doublet Group distance statistics: 51128

back

Distances from reference structure (by RMSD)

10, 18, 13, 8, 4, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.004, 0.021, 0.039, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.009, 0.027, 0.044, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.027 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.029 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.022 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.020, 0.046, 0.072, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.046 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.005, 0.036, 0.067, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.036 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.017, 0.074, 0.132, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.074 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.027, 0.085, 0.143, 0.306 max_d=0.306 avg_d=0.085 std_dev=0.058
C4'	A	0, 0.039, 0.109, 0.178, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.109 std_dev=0.069
O2'	A	0, 0.064, 0.142, 0.221, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.142 std_dev=0.078
C3'	A	0, 0.025, 0.114, 0.203, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.114 std_dev=0.089
O3'	A	0, 0.047, 0.175, 0.303, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.175 std_dev=0.128
C4'	B	0, 0.070, 0.205, 0.339, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.205 std_dev=0.134
O3'	B	0, 0.108, 0.244, 0.379, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.244 std_dev=0.135
C3'	B	0, 0.094, 0.234, 0.373, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.234 std_dev=0.140
C5'	B	0, 0.085, 0.234, 0.383, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.234 std_dev=0.149
O2'	B	0, 0.074, 0.226, 0.379, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.226 std_dev=0.153
C2'	B	0, 0.085, 0.238, 0.391, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.238 std_dev=0.153
O5'	B	0, 0.098, 0.252, 0.405, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.252 std_dev=0.154
C5'	A	0, 0.078, 0.238, 0.398, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.238 std_dev=0.160
O4'	B	0, 0.056, 0.228, 0.399, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.228 std_dev=0.171
P	B	0, 0.085, 0.258, 0.431, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.258 std_dev=0.173
OP1	B	0, 0.084, 0.257, 0.430, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.257 std_dev=0.173
C1'	B	0, 0.070, 0.246, 0.422, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.246 std_dev=0.176
O5'	A	0, 0.035, 0.216, 0.398, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.216 std_dev=0.181
P	A	0, 0.087, 0.293, 0.500, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.293 std_dev=0.206
OP2	B	0, 0.108, 0.323, 0.537, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.323 std_dev=0.215
N1	B	0, 0.093, 0.315, 0.536, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.315 std_dev=0.222
OP2	A	0, 0.136, 0.396, 0.655, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.396 std_dev=0.260
C2	B	0, 0.114, 0.383, 0.652, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.383 std_dev=0.269
C6	B	0, 0.064, 0.338, 0.612, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.338 std_dev=0.274
O2	B	0, 0.128, 0.429, 0.730, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.429 std_dev=0.301
C5	B	0, 0.082, 0.400, 0.718, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.400 std_dev=0.318
N3	B	0, 0.113, 0.432, 0.751, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.432 std_dev=0.319
C4	B	0, 0.116, 0.445, 0.773, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.445 std_dev=0.328
OP1	A	0, 0.113, 0.466, 0.818, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.466 std_dev=0.352
O4	B	0, 0.129, 0.515, 0.901, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.515 std_dev=0.386

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.03	0.20	0.19	0.12
C2	0.04	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.10	0.02	0.20	0.20	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.08	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.21	0.12	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.06	0.06	0.08	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.05	0.20	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.10	0.03	0.18	0.20	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.17	0.12	0.07
C5	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02	0.12	0.02	0.17	0.22	0.12
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.04	0.05	0.01	0.01	0.09	0.14	0.14	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.06	0.03	0.12	0.01	0.18	0.23	0.12
C8	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.14	0.03	0.16	0.22	0.13
N1	0.03	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.03	0.11	0.01	0.19	0.21	0.11
N2	0.05	0.01	0.08	0.08	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.10	0.05	0.10	0.02	0.22	0.19	0.11
N3	0.04	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.04	0.09	0.02	0.20	0.19	0.11
N7	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.03	0.14	0.03	0.17	0.23	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.03	0.18	0.20	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.08	0.11	0.08	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.08	0.06	0.25	0.11	0.10
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.03	0.06	0.05	0.06	0.07	0.07	0.10	0.06	0.08	0.04	0.03	0.00	0.02	0.16	0.07	0.26	0.12	0.12
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.12	0.04	0.20	0.20	0.15
O5'	0.08	0.10	0.05	0.09	0.10	0.02	0.12	0.01	0.12	0.14	0.11	0.10	0.09	0.14	0.11	0.08	0.16	0.12	0.00	0.14	0.03	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.07	0.04	0.14	0.00	0.18	0.25	0.14
OP1	0.20	0.20	0.21	0.20	0.18	0.17	0.17	0.14	0.18	0.16	0.19	0.22	0.20	0.17	0.18	0.25	0.26	0.20	0.03	0.18	0.00	0.02	0.02
OP2	0.19	0.20	0.12	0.11	0.20	0.12	0.22	0.14	0.23	0.22	0.21	0.19	0.19	0.23	0.20	0.11	0.12	0.20	0.02	0.25	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.11	0.08	0.07	0.11	0.07	0.12	0.02	0.12	0.13	0.11	0.11	0.11	0.13	0.11	0.10	0.12	0.15	0.01	0.14	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.17	0.15	0.11	0.16	0.11	0.18	0.13	0.19	0.17	0.16	0.18	0.18	0.11	0.16	0.14	0.11	0.11	0.14	0.09
C2	0.08	0.10	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.08	0.09	0.13	0.13	0.11	0.09	0.08	0.11	0.10	0.20	0.11
C2'	0.12	0.15	0.10	0.08	0.14	0.10	0.17	0.15	0.17	0.14	0.15	0.18	0.13	0.09	0.15	0.09	0.15	0.11	0.16	0.11
C3'	0.11	0.15	0.09	0.08	0.14	0.09	0.18	0.15	0.18	0.12	0.15	0.20	0.12	0.08	0.16	0.08	0.14	0.11	0.14	0.09
C4	0.11	0.11	0.11	0.09	0.10	0.09	0.12	0.11	0.13	0.11	0.11	0.14	0.15	0.11	0.11	0.08	0.11	0.09	0.17	0.10
C4'	0.16	0.18	0.13	0.11	0.18	0.11	0.21	0.14	0.21	0.17	0.19	0.21	0.16	0.10	0.20	0.13	0.12	0.13	0.13	0.09
C5	0.10	0.11	0.10	0.09	0.10	0.08	0.12	0.10	0.12	0.10	0.11	0.14	0.14	0.11	0.11	0.08	0.11	0.10	0.18	0.11
C5'	0.15	0.18	0.13	0.11	0.19	0.12	0.22	0.15	0.21	0.17	0.19	0.21	0.15	0.11	0.21	0.13	0.13	0.18	0.16	0.13
C6	0.08	0.10	0.09	0.09	0.09	0.08	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.13	0.12	0.11	0.09	0.07	0.11	0.10	0.19	0.11
C8	0.14	0.14	0.12	0.09	0.14	0.09	0.17	0.12	0.17	0.14	0.15	0.16	0.16	0.11	0.15	0.11	0.11	0.11	0.16	0.10
N1	0.08	0.10	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.09	0.08	0.10	0.13	0.12	0.12	0.09	0.08	0.10	0.10	0.20	0.11
N2	0.09	0.11	0.10	0.12	0.10	0.11	0.10	0.12	0.10	0.09	0.11	0.14	0.12	0.12	0.10	0.10	0.12	0.11	0.22	0.13
N3	0.09	0.10	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.11	0.10	0.09	0.09	0.13	0.15	0.11	0.09	0.08	0.11	0.09	0.18	0.11
N7	0.12	0.13	0.10	0.09	0.12	0.08	0.15	0.10	0.15	0.12	0.13	0.15	0.15	0.11	0.13	0.09	0.11	0.11	0.17	0.10
N9	0.14	0.14	0.12	0.10	0.14	0.10	0.16	0.12	0.17	0.14	0.14	0.16	0.16	0.11	0.14	0.11	0.11	0.10	0.15	0.09
O2'	0.13	0.17	0.11	0.08	0.15	0.11	0.18	0.17	0.18	0.15	0.17	0.19	0.13	0.09	0.16	0.09	0.17	0.14	0.17	0.13
O3'	0.09	0.17	0.09	0.08	0.15	0.11	0.19	0.16	0.18	0.11	0.17	0.24	0.11	0.09	0.18	0.08	0.17	0.11	0.15	0.11
O4'	0.18	0.18	0.16	0.13	0.18	0.14	0.21	0.15	0.22	0.19	0.18	0.19	0.19	0.13	0.19	0.17	0.13	0.15	0.14	0.11
O5'	0.17	0.25	0.15	0.11	0.25	0.11	0.24	0.13	0.22	0.20	0.27	0.29	0.17	0.11	0.28	0.14	0.13	0.13	0.14	0.10
O6	0.08	0.11	0.09	0.09	0.09	0.08	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.14	0.12	0.11	0.10	0.08	0.11	0.11	0.20	0.12
OP1	0.27	0.37	0.26	0.26	0.37	0.25	0.32	0.29	0.29	0.30	0.40	0.41	0.27	0.26	0.41	0.26	0.30	0.25	0.28	0.26
OP2	0.14	0.20	0.12	0.13	0.21	0.13	0.20	0.17	0.18	0.16	0.23	0.23	0.15	0.16	0.25	0.12	0.16	0.11	0.20	0.12
P	0.13	0.23	0.11	0.11	0.24	0.11	0.21	0.16	0.18	0.17	0.26	0.27	0.13	0.13	0.28	0.11	0.16	0.11	0.17	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.17	0.07	0.05
C2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.02	0.04	0.08	0.17	0.09	0.07
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.09	0.17	0.01	0.02	0.08	0.01	0.03	0.13	0.10	0.03
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.09	0.04	0.10	0.15	0.02	0.01	0.11	0.01	0.05	0.10	0.12	0.04
C4	0.03	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.11	0.01	0.03	0.11	0.19	0.11	0.10
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.05	0.02	0.07	0.01	0.02	0.11	0.08	0.02
C5	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.04	0.11	0.20	0.11	0.11
C5'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.08	0.05	0.03	0.09	0.02	0.01	0.07	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.10	0.02	0.05	0.09	0.20	0.09	0.09
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.07	0.18	0.07	0.07
N3	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.12	0.01	0.03	0.10	0.18	0.10	0.09
O2	0.06	0.01	0.17	0.15	0.02	0.08	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.16	0.18	0.02	0.07	0.09	0.16	0.10	0.08
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.08	0.16	0.00	0.03	0.06	0.04	0.04	0.13	0.11	0.04
O3'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.10	0.05	0.12	0.18	0.03	0.00	0.14	0.02	0.07	0.08	0.17	0.07
O4	0.03	0.02	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.00	0.03	0.13	0.19	0.12	0.11
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.03	0.07	0.04	0.02	0.03	0.00	0.07	0.17	0.07	0.07
O5'	0.05	0.08	0.03	0.05	0.11	0.02	0.11	0.01	0.09	0.07	0.10	0.09	0.04	0.07	0.13	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.17	0.17	0.13	0.10	0.19	0.11	0.20	0.07	0.20	0.18	0.18	0.16	0.13	0.08	0.19	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.09	0.10	0.12	0.11	0.08	0.11	0.08	0.09	0.07	0.10	0.10	0.11	0.17	0.12	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02
P	0.05	0.07	0.03	0.04	0.10	0.02	0.11	0.02	0.09	0.07	0.09	0.08	0.04	0.07	0.11	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00