Doublet Group distance statistics: 51135

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 5, 4, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.010, 0.030, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.013, 0.034, 0.056, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.034 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.009, 0.031, 0.054, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.031 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.014, 0.038, 0.062, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.038 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.028, 0.075, 0.121, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.075 std_dev=0.046
C2'	A	0, 0.027, 0.081, 0.135, 0.192 max_d=0.192 avg_d=0.081 std_dev=0.054
C4'	A	0, 0.049, 0.141, 0.233, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.141 std_dev=0.092
O2'	A	0, 0.064, 0.170, 0.276, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.170 std_dev=0.106
C3'	A	0, 0.046, 0.155, 0.264, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.155 std_dev=0.109
C5'	A	0, 0.124, 0.253, 0.383, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.253 std_dev=0.129
O4'	B	0, 0.189, 0.320, 0.451, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.320 std_dev=0.131
C1'	B	0, 0.208, 0.356, 0.504, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.356 std_dev=0.148
C2	B	0, 0.162, 0.312, 0.461, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.312 std_dev=0.149
O2	B	0, 0.201, 0.350, 0.500, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.350 std_dev=0.149
O3'	A	0, 0.121, 0.274, 0.427, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.274 std_dev=0.153
C4'	B	0, 0.217, 0.374, 0.532, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.374 std_dev=0.157
N3	B	0, 0.183, 0.341, 0.499, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.341 std_dev=0.158
N1	B	0, 0.200, 0.361, 0.522, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.361 std_dev=0.161
O5'	A	0, 0.128, 0.294, 0.460, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.294 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.237, 0.420, 0.603, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.420 std_dev=0.183
C5'	B	0, 0.200, 0.394, 0.589, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.394 std_dev=0.194
C3'	B	0, 0.228, 0.427, 0.626, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.427 std_dev=0.199
C2'	B	0, 0.231, 0.431, 0.631, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.431 std_dev=0.200
C6	B	0, 0.292, 0.512, 0.732, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.512 std_dev=0.220
O2'	B	0, 0.270, 0.491, 0.713, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.491 std_dev=0.221
C5	B	0, 0.315, 0.536, 0.758, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.536 std_dev=0.221
O4	B	0, 0.199, 0.423, 0.646, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.423 std_dev=0.223
O5'	B	0, 0.295, 0.532, 0.769, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.532 std_dev=0.237
P	A	0, 0.214, 0.457, 0.699, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.457 std_dev=0.242
O3'	B	0, 0.276, 0.521, 0.765, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.521 std_dev=0.244
P	B	0, 0.246, 0.495, 0.745, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.495 std_dev=0.250
OP1	B	0, 0.268, 0.555, 0.842, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.555 std_dev=0.287
OP2	B	0, 0.270, 0.570, 0.869, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.570 std_dev=0.299
OP2	A	0, 0.290, 0.595, 0.901, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.595 std_dev=0.306
OP1	A	0, 0.262, 0.584, 0.905, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.584 std_dev=0.321

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.08	0.19	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.09	0.03	0.11	0.28	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.06	0.16	0.08
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.11	0.10	0.10	0.08	0.11	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.04	0.13	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.09	0.01	0.11	0.26	0.15
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.06	0.05	0.09	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.09	0.05	0.08	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.12	0.01	0.14	0.29	0.17
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.08	0.00	0.11	0.00	0.12	0.13	0.10	0.08	0.06	0.14	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.14	0.02	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.12	0.02	0.12	0.00	0.16	0.31	0.18
C8	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.11	0.03	0.13	0.25	0.16
N1	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.11	0.02	0.13	0.31	0.17
N2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.02	0.08	0.04	0.10	0.28	0.15
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.08	0.02	0.10	0.26	0.14
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.13	0.03	0.16	0.28	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.10	0.24	0.14
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.04	0.06	0.03	0.08	0.12	0.08	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.06	0.06	0.10	0.09	0.06
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.04	0.12	0.11	0.11	0.12	0.10	0.12	0.07	0.03	0.00	0.02	0.03	0.13	0.05	0.10	0.04
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.03	0.08	0.17	0.11
O5'	0.04	0.09	0.02	0.02	0.09	0.01	0.12	0.01	0.12	0.11	0.11	0.08	0.08	0.13	0.08	0.06	0.03	0.05	0.00	0.14	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.03	0.05	0.11	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.13	0.03	0.14	0.00	0.19	0.33	0.21
OP1	0.08	0.11	0.06	0.04	0.11	0.05	0.14	0.02	0.16	0.13	0.13	0.10	0.10	0.16	0.10	0.10	0.05	0.08	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.28	0.16	0.13	0.26	0.08	0.29	0.06	0.31	0.25	0.31	0.28	0.26	0.28	0.24	0.09	0.10	0.17	0.02	0.33	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.15	0.08	0.06	0.15	0.04	0.17	0.02	0.18	0.16	0.17	0.15	0.14	0.18	0.14	0.06	0.04	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.12	0.14	0.12	0.14	0.10	0.13	0.11	0.13	0.11	0.15	0.15	0.17	0.14	0.17	0.11	0.14	0.12	0.14	0.10
C2	0.14	0.08	0.14	0.12	0.13	0.11	0.21	0.13	0.24	0.14	0.10	0.11	0.17	0.13	0.11	0.12	0.23	0.14	0.16	0.14
C2'	0.09	0.11	0.14	0.10	0.13	0.08	0.11	0.08	0.11	0.10	0.14	0.15	0.18	0.14	0.15	0.08	0.11	0.10	0.11	0.07
C3'	0.09	0.10	0.14	0.11	0.12	0.07	0.11	0.06	0.11	0.09	0.13	0.13	0.19	0.16	0.15	0.07	0.10	0.09	0.11	0.07
C4	0.13	0.09	0.14	0.11	0.13	0.10	0.19	0.12	0.21	0.14	0.10	0.13	0.17	0.12	0.14	0.10	0.19	0.13	0.15	0.12
C4'	0.08	0.10	0.13	0.10	0.12	0.07	0.10	0.07	0.10	0.08	0.13	0.12	0.17	0.15	0.16	0.07	0.11	0.10	0.12	0.08
C5	0.13	0.09	0.14	0.11	0.15	0.10	0.23	0.13	0.24	0.15	0.10	0.13	0.17	0.12	0.16	0.11	0.22	0.15	0.16	0.14
C5'	0.09	0.11	0.14	0.11	0.15	0.08	0.13	0.07	0.12	0.10	0.15	0.13	0.19	0.17	0.19	0.08	0.12	0.11	0.12	0.09
C6	0.15	0.09	0.15	0.12	0.16	0.12	0.25	0.14	0.27	0.16	0.10	0.12	0.17	0.13	0.15	0.12	0.25	0.17	0.18	0.17
C8	0.12	0.11	0.14	0.11	0.16	0.10	0.20	0.12	0.20	0.14	0.14	0.14	0.16	0.13	0.19	0.10	0.18	0.13	0.14	0.12
N1	0.15	0.09	0.14	0.12	0.15	0.12	0.25	0.14	0.27	0.16	0.10	0.12	0.17	0.13	0.13	0.13	0.26	0.17	0.18	0.17
N2	0.15	0.10	0.14	0.12	0.14	0.12	0.22	0.13	0.25	0.15	0.12	0.12	0.17	0.13	0.13	0.13	0.25	0.14	0.17	0.15
N3	0.13	0.07	0.14	0.11	0.11	0.10	0.18	0.12	0.21	0.13	0.08	0.12	0.17	0.12	0.11	0.10	0.19	0.13	0.15	0.12
N7	0.13	0.10	0.14	0.11	0.17	0.10	0.23	0.13	0.23	0.15	0.12	0.13	0.17	0.13	0.19	0.11	0.21	0.15	0.16	0.14
N9	0.12	0.11	0.14	0.11	0.14	0.10	0.17	0.12	0.18	0.13	0.13	0.14	0.17	0.13	0.17	0.10	0.17	0.12	0.14	0.11
O2'	0.10	0.10	0.17	0.15	0.11	0.13	0.09	0.11	0.09	0.09	0.12	0.12	0.22	0.20	0.13	0.10	0.14	0.16	0.15	0.12
O3'	0.08	0.09	0.15	0.12	0.11	0.07	0.09	0.06	0.09	0.08	0.11	0.11	0.19	0.18	0.12	0.07	0.09	0.09	0.12	0.07
O4'	0.10	0.13	0.13	0.11	0.16	0.09	0.13	0.10	0.12	0.11	0.17	0.16	0.16	0.14	0.19	0.10	0.14	0.11	0.14	0.10
O5'	0.09	0.11	0.11	0.10	0.14	0.08	0.13	0.08	0.12	0.10	0.14	0.12	0.15	0.14	0.18	0.08	0.12	0.11	0.13	0.09
O6	0.15	0.10	0.15	0.13	0.18	0.13	0.28	0.16	0.28	0.17	0.12	0.12	0.18	0.14	0.17	0.13	0.28	0.20	0.21	0.20
OP1	0.12	0.14	0.12	0.11	0.14	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12	0.15	0.17	0.16	0.14	0.17	0.12	0.18	0.16	0.19	0.14
OP2	0.20	0.13	0.23	0.22	0.15	0.21	0.23	0.19	0.25	0.20	0.11	0.11	0.27	0.26	0.14	0.18	0.24	0.26	0.22	0.22
P	0.12	0.08	0.14	0.13	0.10	0.12	0.14	0.11	0.15	0.12	0.08	0.11	0.19	0.17	0.11	0.10	0.18	0.16	0.16	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.11	0.03
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.07	0.06	0.13	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.05	0.11	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.08	0.15	0.06
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.10	0.04	0.05	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.09	0.14	0.07
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.01	0.09	0.09	0.15	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.03	0.06	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.04	0.10	0.09	0.15	0.09
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.05	0.06	0.08	0.06	0.03	0.07	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.13	0.02	0.05	0.09	0.08	0.13	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.07	0.06	0.12	0.05
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.08	0.08	0.14	0.07
O2	0.06	0.00	0.11	0.09	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.12	0.01	0.09	0.07	0.05	0.12	0.06
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.04	0.02	0.06	0.10	0.00	0.04	0.07	0.06	0.06	0.06	0.13	0.05
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.12	0.03	0.13	0.04	0.06	0.12	0.04	0.00	0.07	0.01	0.15	0.12	0.17	0.12
O4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.02	0.09	0.10	0.16	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.09	0.06	0.01	0.02	0.00	0.09	0.09	0.09	0.06
O5'	0.05	0.07	0.04	0.08	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.07	0.08	0.07	0.06	0.15	0.09	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.06	0.06	0.08	0.09	0.09	0.06	0.09	0.07	0.08	0.06	0.08	0.05	0.06	0.12	0.10	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.13	0.15	0.14	0.15	0.08	0.15	0.05	0.13	0.12	0.14	0.12	0.13	0.17	0.16	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.06	0.06	0.07	0.09	0.02	0.09	0.01	0.08	0.05	0.07	0.06	0.05	0.12	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00