Doublet Group distance statistics: 51139

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.005, 0.023, 0.040, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.016, 0.038, 0.059, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.038 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.002, 0.029, 0.056, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.029 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.014, 0.042, 0.069, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.042 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.012, 0.047, 0.083, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.047 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.018, 0.107, 0.197, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.107 std_dev=0.090
C4'	A	0, 0.036, 0.147, 0.259, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.147 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.018, 0.134, 0.249, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.134 std_dev=0.115
O2'	A	0, 0.056, 0.202, 0.347, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.202 std_dev=0.145
C3'	A	0, 0.028, 0.178, 0.327, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.178 std_dev=0.149
C2	B	0, 0.264, 0.429, 0.594, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.429 std_dev=0.165
O2	B	0, 0.266, 0.440, 0.614, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.440 std_dev=0.174
N1	B	0, 0.250, 0.433, 0.615, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.433 std_dev=0.183
C1'	B	0, 0.265, 0.450, 0.635, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.450 std_dev=0.185
N3	B	0, 0.300, 0.499, 0.698, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.499 std_dev=0.199
C5'	A	0, 0.059, 0.272, 0.485, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.272 std_dev=0.213
O5'	A	0, 0.159, 0.373, 0.588, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.373 std_dev=0.214
C2'	B	0, 0.339, 0.559, 0.778, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.559 std_dev=0.219
O3'	A	0, 0.027, 0.259, 0.491, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.259 std_dev=0.232
O3'	B	0, 0.286, 0.521, 0.756, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.521 std_dev=0.235
C6	B	0, 0.273, 0.517, 0.761, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.517 std_dev=0.244
C4	B	0, 0.314, 0.570, 0.825, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.570 std_dev=0.256
C3'	B	0, 0.375, 0.639, 0.902, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.639 std_dev=0.263
C5	B	0, 0.296, 0.576, 0.857, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.576 std_dev=0.281
P	A	0, 0.207, 0.494, 0.781, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.494 std_dev=0.287
O2'	B	0, 0.252, 0.561, 0.870, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.561 std_dev=0.309
OP1	A	0, 0.241, 0.553, 0.865, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.553 std_dev=0.312
O4	B	0, 0.347, 0.665, 0.983, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.665 std_dev=0.318
C4'	B	0, 0.392, 0.730, 1.067, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.730 std_dev=0.338
O4'	B	0, 0.315, 0.673, 1.031, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.673 std_dev=0.358
OP2	A	0, 0.248, 0.613, 0.978, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.613 std_dev=0.365
P	B	0, 0.467, 0.976, 1.486, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.976 std_dev=0.510
C5'	B	0, 0.443, 0.967, 1.490, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.967 std_dev=0.524
O5'	B	0, 0.351, 0.906, 1.460, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.906 std_dev=0.555
OP2	B	0, 0.519, 1.093, 1.667, 1.692 max_d=1.692 avg_d=1.093 std_dev=0.574
OP1	B	0, 0.600, 1.497, 2.394, 3.061 max_d=3.061 avg_d=1.497 std_dev=0.897

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.10	0.05
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.06	0.01	0.07	0.17	0.09
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.10	0.08	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.07	0.10	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.06	0.10	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.05	0.09	0.09	0.06
C4	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.16	0.08
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.09	0.01	0.10	0.19	0.10
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.06	0.05	0.03	0.03	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.10	0.00	0.12	0.20	0.11
C8	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.07	0.09	0.01	0.09	0.16	0.09
N1	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.08	0.01	0.09	0.19	0.11
N2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.04	0.06	0.02	0.06	0.17	0.09
N3	0.03	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.05	0.01	0.05	0.16	0.08
N7	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.06	0.10	0.01	0.12	0.19	0.11
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.06	0.01	0.05	0.14	0.07
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.07	0.09	0.07	0.06	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.07	0.09	0.07	0.05
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.09	0.07	0.13	0.10	0.09	0.03	0.04	0.00	0.02	0.09	0.07	0.14	0.12	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.07	0.02	0.04	0.03	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.09	0.08	0.08
O5'	0.03	0.06	0.04	0.06	0.07	0.01	0.09	0.01	0.10	0.09	0.08	0.06	0.05	0.10	0.06	0.04	0.09	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.12	0.00	0.14	0.21	0.13
OP1	0.04	0.07	0.07	0.09	0.07	0.07	0.10	0.09	0.12	0.09	0.09	0.06	0.05	0.12	0.05	0.09	0.14	0.09	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.17	0.10	0.09	0.16	0.04	0.19	0.03	0.20	0.16	0.19	0.17	0.16	0.19	0.14	0.07	0.12	0.08	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.05	0.06	0.08	0.02	0.10	0.03	0.11	0.09	0.11	0.09	0.08	0.11	0.07	0.05	0.10	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.23	0.20	0.24	0.14	0.17	0.20	0.10	0.08	0.24	0.15	0.35	0.17	0.31	0.21	0.28	0.25	0.27	0.17
C2	0.10	0.15	0.20	0.19	0.30	0.12	0.26	0.24	0.19	0.13	0.25	0.13	0.21	0.10	0.35	0.09	0.32	0.18	0.36	0.16
C2'	0.11	0.19	0.24	0.16	0.27	0.13	0.20	0.13	0.14	0.12	0.27	0.18	0.41	0.13	0.32	0.22	0.28	0.25	0.25	0.16
C3'	0.11	0.22	0.24	0.16	0.32	0.13	0.24	0.13	0.17	0.15	0.31	0.20	0.41	0.13	0.38	0.22	0.28	0.25	0.25	0.16
C4	0.11	0.12	0.22	0.19	0.27	0.11	0.22	0.21	0.14	0.09	0.23	0.14	0.30	0.12	0.34	0.14	0.30	0.19	0.32	0.15
C4'	0.11	0.19	0.22	0.18	0.29	0.13	0.20	0.16	0.13	0.11	0.28	0.18	0.36	0.15	0.36	0.21	0.27	0.29	0.26	0.17
C5	0.12	0.10	0.22	0.19	0.26	0.12	0.22	0.22	0.14	0.08	0.18	0.16	0.28	0.12	0.34	0.14	0.32	0.21	0.35	0.17
C5'	0.11	0.17	0.22	0.19	0.28	0.13	0.20	0.17	0.12	0.10	0.27	0.17	0.35	0.16	0.36	0.22	0.27	0.29	0.27	0.18
C6	0.13	0.11	0.21	0.19	0.25	0.13	0.24	0.23	0.16	0.10	0.16	0.19	0.23	0.12	0.33	0.12	0.33	0.25	0.39	0.19
C8	0.13	0.10	0.23	0.20	0.25	0.13	0.19	0.21	0.11	0.07	0.20	0.13	0.32	0.15	0.33	0.19	0.30	0.21	0.31	0.16
N1	0.11	0.11	0.20	0.19	0.28	0.13	0.26	0.23	0.18	0.11	0.18	0.16	0.20	0.10	0.35	0.11	0.33	0.23	0.40	0.18
N2	0.11	0.19	0.18	0.18	0.32	0.15	0.30	0.26	0.24	0.18	0.27	0.13	0.16	0.08	0.34	0.13	0.33	0.16	0.38	0.16
N3	0.10	0.18	0.22	0.19	0.29	0.11	0.24	0.22	0.17	0.12	0.27	0.16	0.28	0.11	0.34	0.11	0.30	0.17	0.32	0.14
N7	0.13	0.09	0.23	0.20	0.24	0.13	0.20	0.22	0.12	0.08	0.17	0.16	0.30	0.14	0.33	0.17	0.32	0.22	0.34	0.17
N9	0.12	0.13	0.23	0.20	0.26	0.12	0.20	0.21	0.12	0.08	0.23	0.13	0.33	0.14	0.33	0.18	0.29	0.20	0.29	0.15
O2'	0.10	0.13	0.22	0.16	0.18	0.15	0.12	0.14	0.06	0.06	0.20	0.14	0.42	0.13	0.22	0.24	0.24	0.27	0.20	0.15
O3'	0.13	0.24	0.25	0.16	0.32	0.16	0.26	0.14	0.20	0.18	0.32	0.23	0.45	0.12	0.37	0.24	0.27	0.24	0.23	0.16
O4'	0.14	0.15	0.23	0.23	0.26	0.17	0.18	0.24	0.10	0.09	0.25	0.15	0.33	0.21	0.33	0.22	0.28	0.30	0.28	0.19
O5'	0.12	0.14	0.24	0.20	0.28	0.14	0.20	0.18	0.12	0.09	0.25	0.13	0.36	0.16	0.36	0.22	0.28	0.25	0.26	0.16
O6	0.14	0.14	0.21	0.20	0.23	0.15	0.24	0.23	0.17	0.12	0.14	0.22	0.22	0.12	0.31	0.14	0.34	0.31	0.42	0.22
OP1	0.11	0.14	0.24	0.18	0.25	0.11	0.19	0.15	0.12	0.10	0.22	0.13	0.38	0.12	0.32	0.22	0.26	0.23	0.26	0.15
OP2	0.20	0.10	0.27	0.26	0.16	0.21	0.10	0.27	0.06	0.10	0.13	0.16	0.37	0.23	0.24	0.28	0.34	0.31	0.31	0.23
P	0.14	0.12	0.24	0.21	0.23	0.16	0.16	0.20	0.08	0.08	0.20	0.13	0.36	0.18	0.31	0.24	0.30	0.27	0.29	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.22	0.14	0.14	0.10
C2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.06	0.02	0.08	0.31	0.38	0.24	0.24
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.10	0.07	0.02	0.08	0.15	0.00	0.02	0.05	0.01	0.47	0.42	0.35	0.30
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.05	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.36	0.52	0.25	0.28
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.04	0.41	0.62	0.33	0.38
C4'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.05	0.06	0.02	0.02	0.07	0.00	0.02	0.20	0.21	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.08	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.06	0.42	0.61	0.33	0.38
C5'	0.05	0.14	0.10	0.04	0.23	0.01	0.24	0.00	0.22	0.15	0.18	0.09	0.08	0.06	0.24	0.02	0.01	0.33	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.07	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.06	0.01	0.08	0.40	0.46	0.27	0.31
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.32	0.34	0.22	0.22
N3	0.02	0.01	0.08	0.05	0.01	0.05	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.06	0.01	0.07	0.36	0.52	0.29	0.32
O2	0.02	0.00	0.15	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.26	0.10	0.03	0.11	0.25	0.29	0.21	0.19
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.08	0.10	0.02	0.13	0.26	0.00	0.07	0.07	0.02	0.51	0.50	0.50	0.39
O3'	0.05	0.06	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.05	0.06	0.10	0.07	0.00	0.04	0.08	0.20	0.46	0.21	0.18
O4	0.02	0.02	0.05	0.05	0.00	0.07	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.00	0.04	0.42	0.70	0.35	0.41
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.07	0.11	0.02	0.08	0.04	0.00	0.11	0.17	0.26	0.24
O5'	0.22	0.31	0.47	0.36	0.41	0.02	0.42	0.01	0.40	0.32	0.36	0.25	0.51	0.20	0.42	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.38	0.42	0.52	0.62	0.20	0.61	0.33	0.46	0.34	0.52	0.29	0.50	0.46	0.70	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.24	0.35	0.25	0.33	0.21	0.33	0.36	0.27	0.22	0.29	0.21	0.50	0.21	0.35	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.30	0.28	0.38	0.05	0.38	0.01	0.31	0.22	0.32	0.19	0.39	0.18	0.41	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00