Doublet Group distance statistics: 51145

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C2'	B	0, 0.042, 0.198, 0.354, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.198 std_dev=0.156
O2'	A	0, -0.009, 0.266, 0.541, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.266 std_dev=0.275
C2'	A	0, -0.039, 0.283, 0.605, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.283 std_dev=0.322
O4'	A	0, -0.037, 0.323, 0.684, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.323 std_dev=0.360
O4'	B	0, -0.008, 0.406, 0.820, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.406 std_dev=0.414
O2'	B	0, 0.040, 0.522, 1.005, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.522 std_dev=0.482
C4'	A	0, -0.073, 0.474, 1.021, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.474 std_dev=0.547
C3'	A	0, -0.069, 0.495, 1.058, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.495 std_dev=0.563
C1'	B	0, -0.066, 0.595, 1.256, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.595 std_dev=0.661
C3'	B	0, -0.010, 0.737, 1.484, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.737 std_dev=0.747
C4'	B	0, -0.061, 0.752, 1.565, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.752 std_dev=0.813
O3'	A	0, -0.122, 0.696, 1.515, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.696 std_dev=0.819
C5'	A	0, -0.057, 0.764, 1.585, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.764 std_dev=0.821
P	B	0, 0.128, 1.032, 1.936, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.032 std_dev=0.904
C5'	B	0, -0.042, 0.987, 2.016, 2.235 max_d=2.235 avg_d=0.987 std_dev=1.029
O5'	B	0, -0.034, 1.043, 2.120, 2.345 max_d=2.345 avg_d=1.043 std_dev=1.077
N1	B	0, -0.135, 1.032, 2.200, 2.461 max_d=2.461 avg_d=1.032 std_dev=1.168
O3'	B	0, -0.109, 1.190, 2.489, 2.776 max_d=2.776 avg_d=1.190 std_dev=1.299
C6	B	0, -0.151, 1.223, 2.596, 2.903 max_d=2.903 avg_d=1.223 std_dev=1.373
OP1	B	0, 0.293, 1.793, 3.293, 3.325 max_d=3.325 avg_d=1.793 std_dev=1.500
O5'	A	0, -0.134, 1.457, 3.049, 3.406 max_d=3.406 avg_d=1.457 std_dev=1.591
OP2	B	0, -0.245, 1.452, 3.149, 3.533 max_d=3.533 avg_d=1.452 std_dev=1.697
OP2	A	0, -0.122, 1.607, 3.335, 3.712 max_d=3.712 avg_d=1.607 std_dev=1.728
P	A	0, -0.133, 1.665, 3.464, 3.864 max_d=3.864 avg_d=1.665 std_dev=1.799
C2	B	0, -0.221, 1.608, 3.437, 3.845 max_d=3.845 avg_d=1.608 std_dev=1.829
OP1	A	0, -0.168, 1.838, 3.844, 4.293 max_d=4.293 avg_d=1.838 std_dev=2.006
O2	B	0, -0.254, 1.822, 3.898, 4.362 max_d=4.362 avg_d=1.822 std_dev=2.076
C5	B	0, -0.235, 1.846, 3.926, 4.389 max_d=4.389 avg_d=1.846 std_dev=2.081
N3	B	0, -0.286, 2.106, 4.499, 5.034 max_d=5.034 avg_d=2.106 std_dev=2.392
C4	B	0, -0.295, 2.252, 4.799, 5.366 max_d=5.366 avg_d=2.252 std_dev=2.547
O4	B	0, -0.364, 2.830, 6.024, 6.737 max_d=6.737 avg_d=2.830 std_dev=3.194

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.01	0.21	0.53	0.22
C2	0.01	0.00	0.22	0.31	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.31	0.08	0.11	0.01	0.17	0.51	0.22
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.12	0.02	0.06	0.03	0.11	0.09	0.17	0.26	0.21	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.13	0.09	0.09	0.39	0.08
C3'	0.03	0.31	0.00	0.00	0.23	0.00	0.22	0.02	0.27	0.06	0.31	0.33	0.27	0.13	0.13	0.02	0.00	0.03	0.31	0.27	0.06	0.13	0.13
C4	0.01	0.00	0.12	0.23	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.21	0.04	0.13	0.01	0.22	0.54	0.23
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.03	0.08	0.06	0.05	0.05	0.04	0.11	0.03	0.00	0.01	0.09	0.08	0.29	0.06
C5	0.01	0.00	0.06	0.22	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.23	0.02	0.19	0.01	0.25	0.51	0.23
C5'	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.06	0.06	0.05	0.04	0.06	0.05	0.10	0.07	0.02	0.00	0.07	0.10	0.19	0.02
C6	0.00	0.01	0.11	0.27	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.30	0.03	0.20	0.00	0.22	0.47	0.21
C8	0.02	0.00	0.09	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.06	0.19	0.02	0.33	0.57	0.24
N1	0.01	0.01	0.17	0.31	0.00	0.08	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.33	0.06	0.16	0.00	0.19	0.48	0.22
N2	0.02	0.00	0.26	0.33	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.33	0.11	0.10	0.01	0.14	0.50	0.22
N3	0.02	0.00	0.21	0.27	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.24	0.08	0.09	0.01	0.17	0.53	0.23
N7	0.02	0.00	0.05	0.13	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.15	0.04	0.22	0.02	0.32	0.52	0.23
N9	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.12	0.01	0.26	0.56	0.24
O2'	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.11	0.05	0.10	0.04	0.09	0.02	0.06	0.03	0.09	0.05	0.00	0.12	0.07	0.13	0.05	0.05	0.33	0.01
O3'	0.05	0.31	0.03	0.00	0.21	0.03	0.23	0.07	0.30	0.07	0.33	0.33	0.24	0.15	0.09	0.12	0.00	0.05	0.39	0.32	0.34	0.14	0.33
O4'	0.00	0.08	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.06	0.11	0.08	0.04	0.01	0.07	0.05	0.00	0.18	0.02	0.23	0.51	0.25
O5'	0.06	0.11	0.13	0.31	0.13	0.01	0.19	0.00	0.20	0.19	0.16	0.10	0.09	0.22	0.12	0.13	0.39	0.18	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.27	0.01	0.09	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.32	0.02	0.23	0.00	0.23	0.42	0.20
OP1	0.21	0.17	0.09	0.06	0.22	0.08	0.25	0.10	0.22	0.33	0.19	0.14	0.17	0.32	0.26	0.05	0.34	0.23	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.53	0.51	0.39	0.13	0.54	0.29	0.51	0.19	0.47	0.57	0.48	0.50	0.53	0.52	0.56	0.33	0.14	0.51	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.22	0.08	0.13	0.23	0.06	0.23	0.02	0.21	0.24	0.22	0.22	0.23	0.23	0.24	0.01	0.33	0.25	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.25	0.06	0.38	1.16	0.48	1.48	0.32	0.96	0.18	0.27	0.96	0.08	0.74	1.49	0.37	0.83	0.83	0.90	0.31
C2	0.34	1.06	0.10	0.05	0.79	0.06	0.18	0.19	0.06	0.53	1.15	1.24	0.19	0.21	0.82	0.18	0.39	0.33	1.36	0.19
C2'	0.41	0.21	0.33	0.69	1.03	0.81	1.19	0.73	0.71	0.05	0.31	0.81	0.28	0.99	1.38	0.62	1.23	1.41	0.47	0.74
C3'	0.29	0.04	0.19	0.60	1.24	0.76	1.34	0.72	0.82	0.19	0.52	0.62	0.10	0.89	1.67	0.55	1.27	1.58	0.36	0.85
C4	0.38	0.96	0.09	0.19	0.14	0.25	0.61	0.09	0.43	0.32	0.87	1.44	0.18	0.48	0.10	0.31	0.58	0.39	1.24	0.07
C4'	0.06	0.25	0.10	0.35	1.73	0.52	1.80	0.43	1.20	0.49	0.89	0.46	0.19	0.73	2.27	0.32	0.99	1.21	0.61	0.56
C5	0.44	1.24	0.10	0.10	0.69	0.14	0.19	0.17	0.17	0.53	1.34	1.64	0.24	0.40	0.76	0.28	0.42	0.26	1.39	0.21
C5'	0.02	0.22	0.20	0.26	1.70	0.45	1.83	0.35	1.24	0.50	0.83	0.49	0.28	0.66	2.26	0.28	0.94	1.14	0.68	0.52
C6	0.45	1.42	0.11	0.03	1.32	0.05	0.43	0.34	0.21	0.72	1.71	1.66	0.27	0.23	1.55	0.21	0.25	0.44	1.50	0.39
C8	0.40	0.91	0.10	0.24	0.19	0.31	0.84	0.10	0.54	0.26	0.73	1.52	0.20	0.61	0.33	0.35	0.61	0.42	1.22	0.09
N1	0.40	1.33	0.11	0.07	1.37	0.09	0.64	0.36	0.33	0.73	1.62	1.47	0.25	0.13	1.54	0.15	0.21	0.50	1.50	0.41
N2	0.23	0.83	0.09	0.07	0.79	0.09	0.42	0.23	0.24	0.49	0.94	0.89	0.15	0.06	0.83	0.06	0.32	0.40	1.31	0.21
N3	0.32	0.81	0.09	0.18	0.09	0.24	0.54	0.11	0.42	0.27	0.69	1.20	0.15	0.41	0.06	0.28	0.61	0.46	1.16	0.06
N7	0.45	1.17	0.11	0.15	0.44	0.20	0.40	0.14	0.29	0.46	1.20	1.68	0.24	0.49	0.47	0.31	0.47	0.25	1.36	0.17
N9	0.35	0.72	0.09	0.28	0.46	0.36	1.05	0.16	0.68	0.13	0.44	1.35	0.16	0.62	0.66	0.35	0.69	0.56	1.12	0.14
O2'	0.25	0.19	0.25	0.68	1.36	0.78	1.39	0.71	0.90	0.31	0.75	0.40	0.19	0.99	1.69	0.50	1.13	1.38	0.46	0.67
O3'	0.11	0.35	0.08	0.55	1.50	0.74	1.47	0.80	0.95	0.42	0.91	0.18	0.07	0.80	1.94	0.46	1.34	1.86	0.14	1.02
O4'	0.04	0.09	0.18	0.20	1.64	0.35	1.85	0.20	1.25	0.46	0.68	0.70	0.20	0.61	2.13	0.22	0.74	0.79	0.93	0.28
O5'	0.18	0.28	0.47	0.07	1.69	0.25	1.90	0.20	1.35	0.61	0.80	0.42	0.58	0.35	2.21	0.15	0.85	1.03	0.73	0.48
O6	0.47	1.53	0.11	0.09	1.63	0.10	0.72	0.45	0.38	0.82	1.91	1.73	0.30	0.16	2.02	0.18	0.15	0.65	1.56	0.53
OP1	0.20	0.29	0.50	0.08	1.67	0.23	1.92	0.17	1.39	0.64	0.80	0.41	0.60	0.37	2.15	0.13	0.81	1.00	0.79	0.44
OP2	0.50	0.26	0.86	0.55	1.44	0.34	1.93	0.53	1.54	0.78	0.56	0.43	0.88	0.14	1.72	0.37	0.28	0.26	1.43	0.33
P	0.29	0.27	0.63	0.24	1.62	0.10	1.95	0.20	1.45	0.68	0.71	0.45	0.70	0.20	2.05	0.13	0.62	0.71	1.01	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.25	0.17	0.50	0.07
C2	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01	0.07	0.01	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.11	0.01	0.15	0.59	0.64	0.48	0.36
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.11	0.07	0.13	0.02	0.06	0.17	0.00	0.01	0.03	0.02	0.18	0.14	0.23	0.12
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.11	0.01	0.03	0.13	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.24	0.15	0.03
C4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.11	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.00	0.07	0.75	0.80	0.49	0.51
C4'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.07	0.05	0.09	0.06	0.01	0.01	0.12	0.00	0.01	0.12	0.25	0.06
C5	0.02	0.01	0.11	0.10	0.01	0.09	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.02	0.68	0.66	0.52	0.44
C5'	0.06	0.22	0.07	0.01	0.31	0.00	0.28	0.00	0.23	0.19	0.28	0.19	0.06	0.04	0.34	0.02	0.00	0.31	0.10	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.11	0.01	0.07	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.01	0.06	0.56	0.49	0.54	0.32
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.50	0.44	0.52	0.26
N3	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.09	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.09	0.00	0.13	0.70	0.79	0.48	0.47
O2	0.01	0.00	0.17	0.13	0.01	0.06	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.20	0.01	0.21	0.52	0.65	0.45	0.32
O2'	0.01	0.24	0.00	0.02	0.06	0.01	0.10	0.06	0.14	0.04	0.20	0.38	0.00	0.04	0.07	0.01	0.13	0.15	0.22	0.10
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.04	0.07	0.02	0.09	0.20	0.04	0.00	0.03	0.05	0.17	0.25	0.17	0.13
O4	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.12	0.02	0.34	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.00	0.07	0.81	0.91	0.47	0.59
O4'	0.00	0.15	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.02	0.06	0.04	0.13	0.21	0.01	0.05	0.07	0.00	0.26	0.15	0.58	0.05
O5'	0.25	0.59	0.18	0.04	0.75	0.01	0.68	0.00	0.56	0.50	0.70	0.52	0.13	0.17	0.81	0.26	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.17	0.64	0.14	0.24	0.80	0.12	0.66	0.31	0.49	0.44	0.79	0.65	0.15	0.25	0.91	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.50	0.48	0.23	0.15	0.49	0.25	0.52	0.10	0.54	0.52	0.48	0.45	0.22	0.17	0.47	0.58	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.36	0.12	0.03	0.51	0.06	0.44	0.02	0.32	0.26	0.47	0.32	0.10	0.13	0.59	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00