Doublet Group distance statistics: 51150

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.002, 0.018, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.001, 0.020, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.026 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.035, 0.121, 0.207, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.121 std_dev=0.086
C2'	A	0, 0.036, 0.128, 0.219, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.128 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.043, 0.158, 0.272, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.158 std_dev=0.114
C3'	A	0, 0.054, 0.186, 0.318, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.186 std_dev=0.132
C5'	A	0, 0.074, 0.261, 0.448, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.261 std_dev=0.187
O2'	A	0, 0.079, 0.270, 0.460, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.270 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.091, 0.319, 0.547, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.319 std_dev=0.228
O2'	B	0, 0.121, 0.548, 0.974, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.548 std_dev=0.427
O4'	B	0, 0.143, 0.713, 1.283, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.713 std_dev=0.570
C4'	B	0, 0.201, 0.894, 1.587, 1.689 max_d=1.689 avg_d=0.894 std_dev=0.693
C1'	B	0, 0.018, 0.736, 1.453, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.736 std_dev=0.717
C2'	B	0, 0.084, 0.803, 1.522, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.803 std_dev=0.719
O5'	A	0, -0.209, 0.760, 1.729, 2.127 max_d=2.127 avg_d=0.760 std_dev=0.969
C3'	B	0, 0.126, 1.145, 2.165, 2.477 max_d=2.477 avg_d=1.145 std_dev=1.020
O5'	B	0, 0.004, 1.050, 2.095, 2.476 max_d=2.476 avg_d=1.050 std_dev=1.045
C5'	B	0, 0.285, 1.364, 2.444, 2.640 max_d=2.640 avg_d=1.364 std_dev=1.079
OP1	B	0, -0.023, 1.068, 2.160, 2.568 max_d=2.568 avg_d=1.068 std_dev=1.092
OP2	A	0, -0.282, 0.913, 2.108, 2.601 max_d=2.601 avg_d=0.913 std_dev=1.195
P	B	0, -0.070, 1.138, 2.346, 2.810 max_d=2.810 avg_d=1.138 std_dev=1.208
P	A	0, -0.292, 0.926, 2.144, 2.647 max_d=2.647 avg_d=0.926 std_dev=1.218
OP2	B	0, -0.074, 1.196, 2.466, 2.955 max_d=2.955 avg_d=1.196 std_dev=1.270
O3'	B	0, 0.089, 1.400, 2.711, 3.153 max_d=3.153 avg_d=1.400 std_dev=1.311
N1	B	0, -0.260, 1.086, 2.431, 2.981 max_d=2.981 avg_d=1.086 std_dev=1.345
C6	B	0, -0.290, 1.192, 2.674, 3.281 max_d=3.281 avg_d=1.192 std_dev=1.482
OP1	A	0, -0.335, 1.234, 2.804, 3.449 max_d=3.449 avg_d=1.234 std_dev=1.569
O2	B	0, -0.357, 1.472, 3.301, 4.050 max_d=4.050 avg_d=1.472 std_dev=1.829
C2	B	0, -0.473, 1.433, 3.339, 4.127 max_d=4.127 avg_d=1.433 std_dev=1.906
C5	B	0, -0.496, 1.602, 3.701, 4.566 max_d=4.566 avg_d=1.602 std_dev=2.098
N3	B	0, -0.601, 1.921, 4.442, 5.483 max_d=5.483 avg_d=1.921 std_dev=2.522
C4	B	0, -0.628, 2.017, 4.663, 5.755 max_d=5.755 avg_d=2.017 std_dev=2.646
O4	B	0, -0.659, 2.471, 5.600, 6.886 max_d=6.886 avg_d=2.471 std_dev=3.129

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.02	0.05	0.04	0.09
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.42	0.01	0.43	0.52	0.46
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.27	0.03	0.22	0.10	0.24
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.05	0.01	0.01	0.02	0.41	0.06	0.35	0.10	0.33
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.34	0.00	0.34	0.39	0.37
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.39	0.01	0.41	0.49	0.44
C5'	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.03	0.01	0.00	0.07	0.04	0.03	0.03	0.02	0.01	0.06	0.12	0.43	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.44	0.00	0.50	0.61	0.51
C8	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.01	0.24	0.01	0.25	0.24	0.28
N1	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.45	0.00	0.50	0.60	0.51
N2	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.10	0.03	0.43	0.00	0.44	0.53	0.47
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.36	0.01	0.35	0.41	0.38
N7	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.33	0.01	0.37	0.43	0.40
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.24	0.01	0.22	0.21	0.25
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.00	0.07	0.10	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.12	0.05	0.07	0.04	0.10
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.10	0.08	0.10	0.10	0.09	0.09	0.06	0.02	0.00	0.02	0.44	0.10	0.42	0.14	0.37
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.16	0.02	0.12	0.22	0.11
O5'	0.08	0.42	0.27	0.41	0.34	0.01	0.39	0.01	0.44	0.24	0.45	0.43	0.36	0.33	0.24	0.12	0.44	0.16	0.00	0.45	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.45	0.00	0.54	0.67	0.55
OP1	0.05	0.43	0.22	0.35	0.34	0.01	0.41	0.12	0.50	0.25	0.50	0.44	0.35	0.37	0.22	0.07	0.42	0.12	0.02	0.54	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.52	0.10	0.10	0.39	0.25	0.49	0.43	0.61	0.24	0.60	0.53	0.41	0.43	0.21	0.04	0.14	0.22	0.02	0.67	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.46	0.24	0.33	0.37	0.02	0.44	0.01	0.51	0.28	0.51	0.47	0.38	0.40	0.25	0.10	0.37	0.11	0.01	0.55	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.68	1.49	0.34	0.25	1.53	0.25	1.24	0.46	1.02	1.09	1.65	1.62	0.04	0.09	1.61	0.55	0.07	0.23	0.10	0.17
C2	0.40	1.00	0.24	0.34	1.21	0.36	1.08	0.70	0.88	0.83	1.18	0.91	0.14	0.16	1.22	0.42	0.04	0.39	0.10	0.18
C2'	0.56	1.17	0.18	0.06	1.15	0.12	0.92	0.25	0.76	0.86	1.26	1.31	0.13	0.31	1.21	0.46	0.10	0.09	0.16	0.01
C3'	0.53	1.20	0.14	0.10	1.20	0.10	0.93	0.18	0.75	0.85	1.33	1.35	0.17	0.46	1.29	0.42	0.21	0.08	0.25	0.12
C4	0.61	1.47	0.32	0.32	1.64	0.32	1.36	0.62	1.10	1.11	1.70	1.45	0.09	0.09	1.70	0.53	0.01	0.32	0.07	0.17
C4'	0.60	1.36	0.22	0.06	1.43	0.11	1.12	0.26	0.89	0.97	1.55	1.51	0.12	0.34	1.56	0.47	0.09	0.07	0.14	0.02
C5	0.57	1.48	0.31	0.33	1.77	0.32	1.44	0.64	1.12	1.10	1.80	1.45	0.11	0.11	1.88	0.49	0.04	0.33	0.08	0.15
C5'	0.63	1.45	0.23	0.07	1.58	0.13	1.24	0.29	0.97	1.03	1.69	1.59	0.12	0.37	1.74	0.50	0.10	0.09	0.14	0.01
C6	0.47	1.31	0.27	0.34	1.65	0.33	1.36	0.68	1.03	0.98	1.62	1.24	0.12	0.15	1.76	0.42	0.09	0.36	0.10	0.14
C8	0.67	1.66	0.35	0.30	1.89	0.29	1.51	0.57	1.18	1.20	1.97	1.71	0.07	0.09	2.04	0.54	0.01	0.28	0.07	0.16
N1	0.38	1.07	0.24	0.34	1.38	0.34	1.18	0.70	0.91	0.83	1.33	0.99	0.14	0.17	1.43	0.37	0.09	0.39	0.11	0.15
N2	0.20	0.58	0.17	0.32	0.76	0.36	0.72	0.73	0.61	0.51	0.70	0.49	0.15	0.20	0.76	0.30	0.06	0.43	0.12	0.19
N3	0.56	1.24	0.29	0.33	1.35	0.35	1.17	0.64	0.99	1.00	1.38	1.17	0.11	0.11	1.36	0.53	0.03	0.35	0.08	0.19
N7	0.62	1.61	0.33	0.32	1.92	0.31	1.54	0.62	1.18	1.17	1.97	1.62	0.09	0.11	2.08	0.52	0.03	0.30	0.07	0.15
N9	0.67	1.58	0.34	0.30	1.71	0.29	1.39	0.55	1.12	1.16	1.81	1.64	0.07	0.07	1.81	0.56	0.04	0.28	0.08	0.17
O2'	0.52	0.97	0.17	0.05	0.93	0.11	0.76	0.19	0.65	0.73	1.02	1.10	0.12	0.31	0.98	0.42	0.03	0.10	0.11	0.03
O3'	0.44	1.00	0.10	0.24	0.97	0.16	0.72	0.16	0.57	0.69	1.10	1.17	0.21	0.62	1.05	0.34	0.31	0.20	0.34	0.24
O4'	0.68	1.54	0.34	0.22	1.64	0.22	1.31	0.43	1.05	1.11	1.76	1.67	0.05	0.14	1.78	0.54	0.07	0.20	0.10	0.15
O5'	0.46	1.53	0.12	0.15	1.69	0.25	1.21	0.19	0.86	0.97	1.85	1.72	0.26	0.57	1.91	0.20	0.47	0.39	0.47	0.40
O6	0.44	1.28	0.27	0.34	1.68	0.33	1.37	0.69	1.01	0.95	1.63	1.23	0.13	0.16	1.82	0.39	0.12	0.36	0.11	0.13
OP1	0.49	1.57	0.14	0.18	1.74	0.29	1.23	0.27	0.87	0.99	1.90	1.76	0.22	0.63	1.99	0.20	0.53	0.52	0.52	0.50
OP2	0.39	1.46	0.09	0.24	1.61	0.35	1.09	0.31	0.75	0.89	1.78	1.67	0.26	0.65	1.83	0.13	0.69	0.56	0.71	0.63
P	0.44	1.55	0.11	0.18	1.74	0.29	1.22	0.23	0.86	0.96	1.89	1.73	0.26	0.61	1.99	0.17	0.54	0.47	0.55	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.20	0.18	0.46	0.19
C2	0.02	0.00	0.12	0.12	0.00	0.02	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.18	0.01	0.04	0.21	0.36	0.68	0.29
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.09	0.20	0.01	0.04	0.05	0.02	0.12	0.11	0.10	0.06
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.04	0.13	0.01	0.09	0.20	0.01	0.04	0.03	0.01	0.32	0.12	0.13	0.20
C4	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.23	0.52	0.85	0.38
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.03	0.04	0.06	0.04	0.04	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02
C5	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.06	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.00	0.08	0.23	0.48	0.85	0.37
C5'	0.08	0.13	0.02	0.04	0.20	0.00	0.22	0.00	0.22	0.15	0.16	0.09	0.05	0.11	0.20	0.06	0.00	0.20	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.07	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.08	0.23	0.36	0.71	0.31
N1	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.01	0.21	0.30	0.62	0.26
N3	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.15	0.01	0.01	0.22	0.46	0.78	0.34
O2	0.04	0.00	0.20	0.20	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.29	0.01	0.09	0.20	0.32	0.63	0.26
O2'	0.07	0.08	0.01	0.01	0.06	0.06	0.09	0.05	0.10	0.04	0.07	0.16	0.00	0.05	0.07	0.13	0.15	0.13	0.03	0.13
O3'	0.05	0.18	0.04	0.04	0.06	0.04	0.08	0.11	0.09	0.05	0.15	0.29	0.05	0.00	0.04	0.04	0.48	0.20	0.43	0.37
O4	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.04	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.05	0.22	0.58	0.88	0.40
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.06	0.08	0.01	0.01	0.09	0.13	0.04	0.05	0.00	0.37	0.17	0.55	0.28
O5'	0.20	0.21	0.12	0.32	0.23	0.01	0.23	0.00	0.23	0.21	0.22	0.20	0.15	0.48	0.22	0.37	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.18	0.36	0.11	0.12	0.52	0.02	0.48	0.20	0.36	0.30	0.46	0.32	0.13	0.20	0.58	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.46	0.68	0.10	0.13	0.85	0.12	0.85	0.15	0.71	0.62	0.78	0.63	0.03	0.43	0.88	0.55	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.29	0.06	0.20	0.38	0.02	0.37	0.02	0.31	0.26	0.34	0.26	0.13	0.37	0.40	0.28	0.00	0.00	0.01	0.00