Doublet Group distance statistics: 51153

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N7	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C8	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
O6	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C2'	B	0, 0.000, 0.315, 0.629, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.315 std_dev=0.315
C1'	B	0, 0.000, 0.320, 0.641, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.320 std_dev=0.320
O2'	B	0, 0.000, 0.337, 0.673, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.337 std_dev=0.337
C3'	B	0, 0.000, 0.345, 0.690, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.345 std_dev=0.345
O4'	B	0, 0.000, 0.447, 0.893, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.447 std_dev=0.447
C2	B	0, 0.000, 0.513, 1.025, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.513 std_dev=0.513
C4'	B	0, 0.000, 0.627, 1.254, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.627 std_dev=0.627
N3	B	0, 0.000, 0.719, 1.438, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.719 std_dev=0.719
O2'	A	0, 0.000, 0.722, 1.443, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.722 std_dev=0.722
O4'	A	0, 0.000, 0.733, 1.466, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.733 std_dev=0.733
C2'	A	0, 0.000, 0.739, 1.478, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.739 std_dev=0.739
N1	B	0, 0.000, 0.775, 1.550, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.775 std_dev=0.775
O3'	B	0, 0.000, 1.062, 2.124, 2.124 max_d=2.124 avg_d=1.062 std_dev=1.062
C4'	A	0, 0.000, 1.162, 2.324, 2.324 max_d=2.324 avg_d=1.162 std_dev=1.162
C3'	A	0, 0.000, 1.219, 2.439, 2.439 max_d=2.439 avg_d=1.219 std_dev=1.219
O2	B	0, 0.000, 1.317, 2.634, 2.634 max_d=2.634 avg_d=1.317 std_dev=1.317
C5'	B	0, 0.000, 1.321, 2.642, 2.642 max_d=2.642 avg_d=1.321 std_dev=1.321
O5'	B	0, 0.000, 1.558, 3.117, 3.117 max_d=3.117 avg_d=1.558 std_dev=1.558
C4	B	0, 0.000, 1.733, 3.466, 3.466 max_d=3.466 avg_d=1.733 std_dev=1.733
O5'	A	0, 0.000, 1.734, 3.468, 3.468 max_d=3.468 avg_d=1.734 std_dev=1.734
O3'	A	0, 0.000, 1.811, 3.621, 3.621 max_d=3.621 avg_d=1.811 std_dev=1.811
C5'	A	0, 0.000, 1.823, 3.647, 3.647 max_d=3.647 avg_d=1.823 std_dev=1.823
C6	B	0, 0.000, 1.926, 3.852, 3.852 max_d=3.852 avg_d=1.926 std_dev=1.926
OP2	B	0, 0.000, 1.932, 3.863, 3.863 max_d=3.863 avg_d=1.932 std_dev=1.932
P	B	0, 0.000, 2.065, 4.130, 4.130 max_d=4.130 avg_d=2.065 std_dev=2.065
O4	B	0, 0.000, 2.079, 4.158, 4.158 max_d=4.158 avg_d=2.079 std_dev=2.079
P	A	0, 0.000, 2.261, 4.521, 4.521 max_d=4.521 avg_d=2.261 std_dev=2.261
C5	B	0, 0.000, 2.424, 4.848, 4.848 max_d=4.848 avg_d=2.424 std_dev=2.424
OP1	B	0, 0.000, 2.545, 5.090, 5.090 max_d=5.090 avg_d=2.545 std_dev=2.545
OP1	A	0, 0.000, 2.602, 5.203, 5.203 max_d=5.203 avg_d=2.602 std_dev=2.602
OP2	A	0, 0.000, 3.168, 6.335, 6.335 max_d=6.335 avg_d=3.168 std_dev=3.168

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.32	0.00	0.06
C2	0.03	0.00	0.42	0.45	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.32	0.58	0.14	0.16	0.01	0.39	0.29	0.07
C2'	0.01	0.42	0.00	0.01	0.25	0.00	0.17	0.03	0.25	0.08	0.35	0.49	0.41	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.10	0.21	0.28	0.02	0.12
C3'	0.02	0.45	0.01	0.00	0.30	0.01	0.27	0.04	0.35	0.03	0.42	0.50	0.40	0.13	0.14	0.01	0.01	0.01	0.09	0.33	0.08	0.01	0.09
C4	0.02	0.01	0.25	0.30	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.36	0.08	0.12	0.00	0.45	0.28	0.05
C4'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.07	0.10	0.09	0.07	0.09	0.05	0.02	0.04	0.00	0.02	0.11	0.08	0.19	0.02
C5	0.01	0.00	0.17	0.27	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.35	0.04	0.16	0.00	0.54	0.45	0.09
C5'	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.08	0.00	0.09	0.08	0.07	0.04	0.03	0.10	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.10	0.25	0.31	0.00
C6	0.02	0.01	0.25	0.35	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.46	0.06	0.19	0.00	0.53	0.51	0.12
C8	0.00	0.01	0.08	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.09	0.08	0.00	0.59	0.38	0.04
N1	0.03	0.00	0.35	0.42	0.01	0.10	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.56	0.11	0.19	0.01	0.46	0.42	0.11
N2	0.04	0.00	0.49	0.50	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.40	0.66	0.16	0.16	0.02	0.34	0.25	0.07
N3	0.03	0.00	0.41	0.40	0.00	0.07	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.30	0.49	0.14	0.12	0.00	0.37	0.21	0.04
N7	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.18	0.04	0.14	0.00	0.63	0.53	0.09
N9	0.00	0.01	0.07	0.14	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.01	0.06	0.01	0.45	0.21	0.01
O2'	0.00	0.32	0.00	0.01	0.15	0.02	0.09	0.00	0.15	0.08	0.25	0.40	0.30	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.08	0.12	0.16	0.04	0.09
O3'	0.01	0.58	0.02	0.01	0.36	0.04	0.35	0.05	0.46	0.05	0.56	0.66	0.49	0.18	0.16	0.03	0.00	0.02	0.07	0.46	0.15	0.01	0.06
O4'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.06	0.09	0.11	0.16	0.14	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.14	0.14	0.01
O5'	0.04	0.16	0.10	0.09	0.12	0.02	0.16	0.01	0.19	0.08	0.19	0.16	0.12	0.14	0.06	0.08	0.07	0.00	0.00	0.21	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.21	0.33	0.00	0.11	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.12	0.46	0.05	0.21	0.00	0.57	0.60	0.14
OP1	0.32	0.39	0.28	0.08	0.45	0.08	0.54	0.25	0.53	0.59	0.46	0.34	0.37	0.63	0.45	0.16	0.15	0.14	0.01	0.57	0.00	0.01	0.01
OP2	0.00	0.29	0.02	0.01	0.28	0.19	0.45	0.31	0.51	0.38	0.42	0.25	0.21	0.53	0.21	0.04	0.01	0.14	0.01	0.60	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.07	0.12	0.09	0.05	0.02	0.09	0.00	0.12	0.04	0.11	0.07	0.04	0.09	0.01	0.09	0.06	0.01	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.36	0.12	0.21	0.11	0.19	0.33	0.06	0.25	0.05	0.23	0.75	0.08	0.59	0.21	0.16	0.09	0.14	0.87	0.40
C2	0.01	0.25	0.08	0.19	0.53	0.16	0.90	0.16	0.78	0.21	0.01	0.87	0.06	0.61	0.63	0.02	0.31	0.71	1.20	0.85
C2'	0.64	0.78	0.63	0.73	0.42	0.64	0.31	0.48	0.38	0.60	0.66	1.04	0.58	1.11	0.30	0.63	0.57	0.39	0.40	0.11
C3'	0.65	0.65	0.67	0.78	0.26	0.67	0.22	0.48	0.34	0.54	0.48	0.87	0.68	1.22	0.10	0.63	0.55	0.31	0.50	0.05
C4	0.05	0.30	0.09	0.19	0.41	0.16	0.73	0.10	0.60	0.11	0.08	0.87	0.06	0.62	0.52	0.07	0.18	0.54	1.11	0.73
C4'	0.21	0.25	0.22	0.31	0.17	0.27	0.26	0.12	0.13	0.10	0.09	0.52	0.26	0.74	0.33	0.23	0.15	0.12	0.92	0.38
C5	0.04	0.29	0.09	0.20	0.48	0.14	0.84	0.18	0.69	0.15	0.05	0.88	0.07	0.65	0.61	0.03	0.31	0.73	1.20	0.88
C5'	0.18	0.16	0.19	0.29	0.35	0.24	0.43	0.05	0.26	0.01	0.05	0.46	0.28	0.77	0.55	0.18	0.04	0.30	1.09	0.54
C6	0.01	0.26	0.08	0.19	0.58	0.12	0.97	0.26	0.81	0.21	0.00	0.88	0.07	0.65	0.71	0.01	0.45	0.93	1.29	1.03
C8	0.08	0.33	0.11	0.20	0.32	0.15	0.62	0.09	0.50	0.05	0.14	0.83	0.08	0.64	0.45	0.08	0.15	0.51	1.09	0.71
N1	0.00	0.24	0.08	0.18	0.60	0.13	0.99	0.26	0.85	0.23	0.03	0.87	0.06	0.63	0.71	0.02	0.46	0.93	1.29	1.03
N2	0.01	0.21	0.08	0.18	0.55	0.18	0.93	0.16	0.83	0.25	0.05	0.82	0.05	0.59	0.62	0.00	0.34	0.72	1.20	0.85
N3	0.04	0.29	0.09	0.19	0.43	0.17	0.74	0.07	0.63	0.13	0.06	0.88	0.05	0.60	0.52	0.07	0.15	0.50	1.08	0.68
N7	0.06	0.31	0.10	0.20	0.43	0.14	0.77	0.16	0.62	0.11	0.09	0.87	0.08	0.66	0.56	0.05	0.27	0.69	1.18	0.85
N9	0.08	0.33	0.10	0.20	0.29	0.16	0.56	0.04	0.45	0.04	0.15	0.82	0.07	0.61	0.40	0.10	0.07	0.39	1.03	0.61
O2'	0.63	0.86	0.60	0.66	0.70	0.57	0.61	0.50	0.61	0.70	0.83	0.97	0.50	0.96	0.62	0.62	0.67	0.60	0.25	0.27
O3'	0.87	0.73	0.90	1.01	0.46	0.86	0.53	0.68	0.66	0.76	0.57	0.83	0.94	1.47	0.28	0.82	0.78	0.59	0.28	0.31
O4'	0.07	0.09	0.06	0.02	0.42	0.02	0.61	0.11	0.49	0.18	0.07	0.47	0.05	0.43	0.55	0.02	0.11	0.41	1.15	0.65
O5'	0.27	0.27	0.31	0.42	0.32	0.34	0.43	0.11	0.24	0.09	0.04	0.62	0.38	0.93	0.52	0.27	0.07	0.31	1.04	0.52
O6	0.00	0.24	0.08	0.18	0.63	0.10	1.03	0.32	0.86	0.23	0.03	0.88	0.07	0.65	0.77	0.04	0.54	1.08	1.32	1.14
OP1	0.08	0.13	0.14	0.17	0.45	0.01	0.62	0.34	0.44	0.09	0.07	0.51	0.29	0.72	0.64	0.04	0.38	0.81	1.56	1.04
OP2	0.19	0.04	0.25	0.42	0.80	0.39	0.90	0.11	0.58	0.13	0.32	0.51	0.37	1.01	1.11	0.24	0.05	0.61	1.21	0.72
P	0.21	0.19	0.26	0.37	0.47	0.28	0.60	0.01	0.38	0.00	0.07	0.59	0.35	0.91	0.70	0.19	0.06	0.51	1.20	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.20	0.16	0.45	0.00
C2	0.00	0.00	0.15	0.04	0.01	0.22	0.01	0.44	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.07	0.01	0.30	0.54	0.45	0.23	0.25
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.00	0.14	0.15	0.18	0.01	0.09	0.26	0.00	0.02	0.03	0.01	0.32	0.35	0.13	0.27
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.18	0.09	0.08	0.03	0.02	0.00	0.13	0.02	0.04	0.07	0.20	0.00
C4	0.00	0.01	0.02	0.14	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.03	0.00	0.01	0.29	0.24	0.69	0.06
C4'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.00	0.23	0.00	0.17	0.41	0.19	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.19	0.04
C5	0.00	0.01	0.14	0.18	0.00	0.18	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.46	0.06	0.00	0.21	0.01	0.05	1.09	0.38
C5'	0.07	0.44	0.15	0.01	0.15	0.00	0.14	0.00	0.22	0.11	0.39	0.67	0.04	0.12	0.18	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00
C6	0.00	0.00	0.18	0.18	0.00	0.23	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.49	0.03	0.00	0.28	0.05	0.09	1.08	0.40
N1	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.05	0.00	0.01	0.26	0.20	0.58	0.03
N3	0.00	0.00	0.09	0.08	0.00	0.17	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.00	0.21	0.51	0.45	0.33	0.20
O2	0.00	0.01	0.26	0.03	0.01	0.41	0.01	0.67	0.01	0.01	0.01	0.00	0.49	0.12	0.01	0.54	0.70	0.60	0.10	0.47
O2'	0.00	0.19	0.00	0.02	0.21	0.19	0.46	0.04	0.49	0.11	0.06	0.49	0.00	0.04	0.22	0.10	0.21	0.41	0.15	0.26
O3'	0.16	0.07	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.12	0.03	0.05	0.02	0.12	0.04	0.00	0.04	0.13	0.26	0.31	0.22	0.16
O4	0.00	0.01	0.03	0.13	0.00	0.02	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.04	0.00	0.01	0.32	0.29	0.66	0.04
O4'	0.00	0.30	0.01	0.02	0.01	0.00	0.21	0.01	0.28	0.01	0.21	0.54	0.10	0.13	0.01	0.00	0.06	0.03	0.52	0.18
O5'	0.20	0.54	0.32	0.04	0.29	0.00	0.01	0.00	0.05	0.26	0.51	0.70	0.21	0.26	0.32	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.16	0.45	0.35	0.07	0.24	0.02	0.05	0.01	0.09	0.20	0.45	0.60	0.41	0.31	0.29	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.45	0.23	0.13	0.20	0.69	0.19	1.09	0.03	1.08	0.58	0.33	0.10	0.15	0.22	0.66	0.52	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.00	0.25	0.27	0.00	0.06	0.04	0.38	0.00	0.40	0.03	0.20	0.47	0.26	0.16	0.04	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00