Doublet Group distance statistics: 51159

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 8, 5, 6, 2, 4, 3, 6, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.024, 0.042, 0.060, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.042 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.017, 0.037, 0.057, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.037 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.003, 0.028, 0.054, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.028 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.049, 0.139, 0.228, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.139 std_dev=0.089
C2'	A	0, 0.037, 0.127, 0.216, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.127 std_dev=0.090
O2'	A	0, 0.087, 0.190, 0.292, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.190 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.135, 0.261, 0.387, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.261 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.130, 0.266, 0.401, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.266 std_dev=0.135
P	A	0, 0.226, 0.372, 0.517, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.372 std_dev=0.146
O5'	A	0, 0.183, 0.350, 0.517, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.350 std_dev=0.167
C5'	A	0, 0.184, 0.383, 0.582, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.383 std_dev=0.199
OP2	A	0, 0.207, 0.412, 0.617, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.412 std_dev=0.205
OP1	A	0, 0.258, 0.465, 0.672, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.465 std_dev=0.207
O3'	A	0, 0.231, 0.440, 0.648, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.440 std_dev=0.208
O2'	B	0, 0.241, 0.495, 0.749, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.495 std_dev=0.254
C3'	B	0, 0.208, 0.516, 0.825, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.516 std_dev=0.309
C2'	B	0, 0.206, 0.531, 0.857, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.531 std_dev=0.326
OP2	B	0, 0.214, 0.781, 1.348, 3.128 max_d=3.128 avg_d=0.781 std_dev=0.567
C4'	B	0, 0.006, 0.611, 1.217, 3.228 max_d=3.228 avg_d=0.611 std_dev=0.606
O5'	B	0, 0.077, 0.731, 1.385, 3.378 max_d=3.378 avg_d=0.731 std_dev=0.654
O3'	B	0, -0.018, 0.676, 1.370, 3.465 max_d=3.465 avg_d=0.676 std_dev=0.694
C1'	B	0, -0.083, 0.626, 1.336, 3.789 max_d=3.789 avg_d=0.626 std_dev=0.710
P	B	0, -0.017, 0.802, 1.622, 4.488 max_d=4.488 avg_d=0.802 std_dev=0.819
O4'	B	0, -0.195, 0.629, 1.452, 4.337 max_d=4.337 avg_d=0.629 std_dev=0.823
C5'	B	0, -0.110, 0.727, 1.564, 4.672 max_d=4.672 avg_d=0.727 std_dev=0.837
OP1	B	0, -0.127, 0.901, 1.929, 5.746 max_d=5.746 avg_d=0.901 std_dev=1.028
N1	B	0, -0.311, 0.762, 1.835, 5.572 max_d=5.572 avg_d=0.762 std_dev=1.073
C6	B	0, -0.211, 0.893, 1.997, 5.659 max_d=5.659 avg_d=0.893 std_dev=1.104
C5	B	0, -0.395, 1.066, 2.527, 7.459 max_d=7.459 avg_d=1.066 std_dev=1.461
C2	B	0, -0.599, 0.874, 2.347, 7.719 max_d=7.719 avg_d=0.874 std_dev=1.473
O2	B	0, -0.593, 0.888, 2.370, 7.914 max_d=7.914 avg_d=0.888 std_dev=1.481
C4	B	0, -0.773, 1.108, 2.989, 9.432 max_d=9.432 avg_d=1.108 std_dev=1.881
N3	B	0, -0.859, 1.035, 2.929, 9.674 max_d=9.674 avg_d=1.035 std_dev=1.894
N4	B	0, -0.991, 1.307, 3.604, 11.427 max_d=11.427 avg_d=1.307 std_dev=2.297

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.12	0.08
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.03	0.09	0.02	0.11	0.18	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.07	0.10	0.08	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.05	0.10	0.09	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.10	0.08	0.10	0.08	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.12	0.09	0.07
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.02	0.09	0.01	0.11	0.17	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.03	0.05	0.04	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.12	0.01	0.15	0.20	0.16
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.11	0.06	0.05	0.04	0.11	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.12	0.00	0.16	0.22	0.16
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.14	0.02	0.14	0.18	0.15
N1	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.02	0.11	0.02	0.14	0.20	0.15
N2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.03	0.08	0.03	0.10	0.17	0.12
N3	0.03	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.08	0.02	0.10	0.16	0.11
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.15	0.02	0.18	0.22	0.18
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.10	0.15	0.11
O2'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.06	0.05	0.05	0.05	0.08	0.03	0.11	0.15	0.11	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.04	0.07	0.10	0.07	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.06	0.02	0.09	0.03	0.10	0.12	0.10	0.14	0.10	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.08	0.12	0.17	0.13	0.11
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.03	0.07	0.12	0.09
O5'	0.05	0.09	0.05	0.06	0.09	0.02	0.12	0.01	0.12	0.14	0.11	0.08	0.08	0.15	0.09	0.04	0.08	0.06	0.00	0.14	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.07	0.12	0.03	0.14	0.00	0.19	0.24	0.19
OP1	0.07	0.11	0.10	0.12	0.11	0.07	0.15	0.06	0.16	0.14	0.14	0.10	0.10	0.18	0.10	0.10	0.17	0.07	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.18	0.09	0.09	0.17	0.04	0.20	0.02	0.22	0.18	0.20	0.17	0.16	0.22	0.15	0.07	0.13	0.12	0.02	0.24	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.06	0.07	0.12	0.02	0.16	0.01	0.16	0.15	0.15	0.12	0.11	0.18	0.11	0.05	0.11	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	1.05	0.29	0.13	1.22	0.50	0.89	0.79	0.62	0.66	1.31	1.38	1.08	0.25	0.40	0.22	0.58	0.98	0.48	0.71
C2	0.28	0.24	0.26	0.17	0.26	0.52	0.20	0.66	0.21	0.15	0.31	0.33	0.33	0.31	0.33	0.60	0.51	0.61	0.42	0.61
C2'	0.26	0.91	0.36	0.25	1.11	0.55	0.80	0.81	0.52	0.56	1.17	1.29	0.94	0.37	0.43	0.30	0.57	1.07	0.43	0.74
C3'	0.28	1.02	0.34	0.22	1.29	0.53	0.92	0.80	0.59	0.63	1.33	1.54	1.05	0.32	0.42	0.28	0.55	1.10	0.39	0.72
C4	0.12	0.66	0.27	0.10	0.74	0.55	0.50	0.78	0.31	0.35	0.83	0.86	0.75	0.26	0.19	0.42	0.57	0.84	0.45	0.69
C4'	0.34	1.22	0.29	0.16	1.53	0.46	1.12	0.74	0.76	0.78	1.58	1.82	1.22	0.23	0.47	0.14	0.52	1.05	0.41	0.66
C5	0.14	0.64	0.26	0.10	0.72	0.54	0.47	0.76	0.29	0.32	0.82	0.86	0.73	0.24	0.15	0.44	0.55	0.83	0.44	0.69
C5'	0.36	1.28	0.28	0.16	1.62	0.46	1.17	0.74	0.79	0.82	1.68	1.95	1.29	0.19	0.48	0.14	0.51	1.05	0.39	0.64
C6	0.20	0.43	0.24	0.12	0.49	0.52	0.31	0.70	0.21	0.21	0.57	0.61	0.52	0.25	0.19	0.52	0.53	0.74	0.43	0.65
C8	0.21	0.96	0.28	0.10	1.11	0.53	0.77	0.79	0.51	0.56	1.22	1.30	1.04	0.23	0.27	0.30	0.57	0.97	0.46	0.72
N1	0.29	0.26	0.24	0.15	0.29	0.51	0.22	0.65	0.22	0.17	0.35	0.37	0.34	0.27	0.30	0.59	0.51	0.64	0.42	0.62
N2	0.44	0.22	0.28	0.24	0.20	0.48	0.29	0.55	0.36	0.32	0.18	0.18	0.26	0.35	0.51	0.69	0.46	0.45	0.40	0.54
N3	0.15	0.45	0.27	0.13	0.49	0.56	0.33	0.76	0.21	0.21	0.57	0.58	0.54	0.30	0.24	0.50	0.55	0.73	0.43	0.66
N7	0.16	0.82	0.27	0.09	0.94	0.53	0.63	0.78	0.40	0.45	1.05	1.12	0.91	0.23	0.19	0.37	0.56	0.92	0.45	0.71
N9	0.19	0.91	0.28	0.10	1.03	0.53	0.73	0.80	0.49	0.53	1.14	1.19	0.98	0.25	0.28	0.31	0.58	0.94	0.46	0.71
O2'	0.29	0.90	0.38	0.30	1.13	0.49	0.86	0.74	0.57	0.58	1.14	1.29	0.90	0.39	0.52	0.21	0.53	1.09	0.44	0.72
O3'	0.31	0.97	0.38	0.30	1.25	0.55	0.90	0.80	0.57	0.61	1.28	1.53	0.99	0.38	0.46	0.33	0.55	1.14	0.35	0.72
O4'	0.37	1.24	0.28	0.17	1.49	0.47	1.09	0.75	0.77	0.80	1.58	1.72	1.26	0.18	0.48	0.18	0.56	1.00	0.48	0.67
O5'	0.33	1.23	0.29	0.15	1.51	0.50	1.07	0.78	0.72	0.76	1.60	1.82	1.27	0.19	0.41	0.21	0.54	1.07	0.40	0.68
O6	0.23	0.41	0.24	0.13	0.47	0.51	0.30	0.68	0.21	0.21	0.55	0.59	0.49	0.24	0.20	0.52	0.52	0.73	0.43	0.65
OP1	0.35	1.27	0.29	0.14	1.62	0.48	1.16	0.75	0.77	0.80	1.67	1.99	1.30	0.19	0.41	0.19	0.52	1.09	0.42	0.67
OP2	0.30	1.15	0.31	0.19	1.41	0.54	0.98	0.81	0.64	0.69	1.50	1.72	1.20	0.24	0.38	0.29	0.56	1.07	0.42	0.72
P	0.33	1.23	0.28	0.16	1.54	0.51	1.09	0.78	0.72	0.76	1.62	1.88	1.28	0.20	0.43	0.22	0.54	1.07	0.40	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.07	0.09	0.05
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.13	0.03	0.12	0.12	0.17	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.03	0.11	0.02	0.11	0.03	0.07	0.09	0.19	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.08	0.05
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.09	0.01	0.15	0.02	0.16	0.05	0.10	0.11	0.19	0.02	0.01	0.02	0.09	0.10	0.08	0.07
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.13	0.03	0.15	0.16	0.20	0.16
C4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.04	0.06	0.07	0.09	0.02	0.00	0.01	0.08	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.11	0.15	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.19	0.05	0.13	0.14	0.18	0.15
C5'	0.01	0.07	0.02	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.09	0.11	0.07	0.10	0.04	0.01	0.01	0.09	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.19	0.05	0.11	0.10	0.13	0.11
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02	0.09	0.09	0.13	0.09
N3	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.12	0.03	0.14	0.15	0.20	0.15
N4	0.02	0.02	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.10	0.16	0.03	0.16	0.19	0.23	0.19
O2	0.04	0.01	0.19	0.19	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.17	0.24	0.06	0.12	0.13	0.17	0.11
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.08	0.09	0.09	0.10	0.08	0.04	0.09	0.10	0.17	0.00	0.05	0.06	0.07	0.11	0.07	0.08
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.13	0.02	0.19	0.04	0.19	0.06	0.12	0.16	0.24	0.05	0.00	0.02	0.15	0.13	0.12	0.11
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.03	0.06	0.06	0.02	0.00	0.08	0.08	0.10	0.08
O5'	0.05	0.12	0.05	0.09	0.15	0.01	0.13	0.01	0.11	0.09	0.14	0.16	0.12	0.07	0.15	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.12	0.09	0.10	0.16	0.08	0.14	0.09	0.10	0.09	0.15	0.19	0.13	0.11	0.13	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.17	0.08	0.08	0.20	0.04	0.18	0.03	0.13	0.13	0.20	0.23	0.17	0.07	0.12	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.12	0.05	0.07	0.16	0.03	0.15	0.02	0.11	0.09	0.15	0.19	0.11	0.08	0.11	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00