Doublet Group distance statistics: 51162

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 2, 4, 4, 3, 4, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.011, 0.022, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.021, 0.035, 0.049, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.035 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.018, 0.033, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.033 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.020, 0.037, 0.054, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.037 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.036 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.020, 0.040, 0.061, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.040 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.029, 0.053, 0.077, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.053 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.037 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.011, 0.046, 0.082, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.046 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.029, 0.136, 0.244, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.136 std_dev=0.108
C2'	A	0, 0.066, 0.195, 0.324, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.195 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.146, 0.323, 0.500, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.323 std_dev=0.177
C4'	A	0, 0.078, 0.259, 0.441, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.259 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.110, 0.302, 0.494, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.302 std_dev=0.192
O2'	B	0, 0.281, 0.511, 0.741, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.511 std_dev=0.230
O4'	B	0, 0.336, 0.594, 0.852, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.594 std_dev=0.258
C4'	B	0, 0.379, 0.645, 0.910, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.645 std_dev=0.265
C5'	A	0, 0.155, 0.428, 0.701, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.428 std_dev=0.273
C2'	B	0, 0.328, 0.605, 0.882, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.605 std_dev=0.277
C1'	B	0, 0.295, 0.577, 0.858, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.577 std_dev=0.282
C3'	B	0, 0.387, 0.676, 0.965, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.676 std_dev=0.289
O3'	B	0, 0.394, 0.683, 0.972, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.683 std_dev=0.289
O3'	A	0, 0.182, 0.476, 0.771, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.476 std_dev=0.294
C5'	B	0, 0.480, 0.823, 1.167, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.823 std_dev=0.344
C6	B	0, 0.459, 0.813, 1.166, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.813 std_dev=0.354
N1	B	0, 0.312, 0.675, 1.037, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.675 std_dev=0.363
O5'	B	0, 0.501, 0.921, 1.342, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.921 std_dev=0.420
C5	B	0, 0.478, 0.927, 1.377, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.927 std_dev=0.450
C2	B	0, 0.289, 0.742, 1.194, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.742 std_dev=0.452
O2	B	0, 0.329, 0.785, 1.240, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.785 std_dev=0.455
P	B	0, 0.609, 1.098, 1.588, 1.842 max_d=1.842 avg_d=1.098 std_dev=0.489
OP2	B	0, 0.629, 1.163, 1.697, 2.037 max_d=2.037 avg_d=1.163 std_dev=0.534
OP1	B	0, 0.635, 1.169, 1.704, 1.948 max_d=1.948 avg_d=1.169 std_dev=0.534
N3	B	0, 0.325, 0.868, 1.410, 1.843 max_d=1.843 avg_d=0.868 std_dev=0.543
C4	B	0, 0.354, 0.914, 1.474, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.914 std_dev=0.560
N4	B	0, 0.404, 1.065, 1.726, 2.288 max_d=2.288 avg_d=1.065 std_dev=0.661
O5'	A	0, 0.003, 1.045, 2.088, 2.843 max_d=2.843 avg_d=1.045 std_dev=1.043
OP2	A	0, 0.106, 1.224, 2.342, 3.953 max_d=3.953 avg_d=1.224 std_dev=1.118
P	A	0, 0.036, 1.244, 2.452, 3.844 max_d=3.844 avg_d=1.244 std_dev=1.208
OP1	A	0, -0.091, 1.379, 2.849, 5.629 max_d=5.629 avg_d=1.379 std_dev=1.470

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.29	0.03	0.42	0.23	0.22
C2	0.04	0.00	0.15	0.15	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.21	0.04	0.59	0.03	0.80	0.47	0.56
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.08	0.11	0.18	0.15	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.30	0.07	0.51	0.18	0.28
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.12	0.16	0.13	0.19	0.15	0.15	0.07	0.02	0.01	0.01	0.36	0.14	0.59	0.14	0.34
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.63	0.02	0.78	0.43	0.56
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.12	0.06	0.10	0.07	0.12	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.09	0.25	0.31	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.81	0.02	0.96	0.61	0.75
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.16	0.09	0.09	0.07	0.18	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.15	0.31	0.42	0.02
C6	0.03	0.02	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.15	0.04	0.83	0.01	1.03	0.70	0.81
C8	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.12	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.05	0.83	0.03	0.87	0.47	0.69
N1	0.04	0.01	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.18	0.04	0.73	0.02	0.94	0.61	0.71
N2	0.05	0.01	0.18	0.19	0.02	0.10	0.02	0.09	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.22	0.27	0.05	0.51	0.04	0.74	0.44	0.50
N3	0.04	0.01	0.15	0.15	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.16	0.19	0.04	0.51	0.02	0.70	0.38	0.47
N7	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.12	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.18	0.05	0.92	0.03	1.02	0.67	0.84
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.59	0.02	0.69	0.33	0.48
O2'	0.01	0.17	0.01	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.06	0.13	0.22	0.16	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.07	0.28	0.20	0.08
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.15	0.17	0.18	0.27	0.19	0.18	0.07	0.04	0.00	0.02	0.23	0.18	0.56	0.14	0.29
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.15	0.05	0.25	0.36	0.12
O5'	0.29	0.59	0.30	0.36	0.63	0.01	0.81	0.01	0.83	0.83	0.73	0.51	0.51	0.92	0.59	0.06	0.23	0.15	0.00	0.92	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.03	0.07	0.14	0.02	0.09	0.02	0.15	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.07	0.18	0.05	0.92	0.00	1.13	0.82	0.92
OP1	0.42	0.80	0.51	0.59	0.78	0.25	0.96	0.31	1.03	0.87	0.94	0.74	0.70	1.02	0.69	0.28	0.56	0.25	0.02	1.13	0.00	0.02	0.01
OP2	0.23	0.47	0.18	0.14	0.43	0.31	0.61	0.42	0.70	0.47	0.61	0.44	0.38	0.67	0.33	0.20	0.14	0.36	0.02	0.82	0.02	0.00	0.01
P	0.22	0.56	0.28	0.34	0.56	0.04	0.75	0.02	0.81	0.69	0.71	0.50	0.47	0.84	0.48	0.08	0.29	0.12	0.01	0.92	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.13	0.17	0.18	0.14	0.26	0.20	0.32	0.21	0.16	0.13	0.14	0.16	0.20	0.17	0.24	0.28	0.33	0.29	0.30
C2	0.15	0.15	0.15	0.13	0.18	0.17	0.25	0.28	0.24	0.15	0.15	0.19	0.22	0.23	0.16	0.15	0.25	0.30	0.29	0.29
C2'	0.12	0.12	0.12	0.14	0.12	0.20	0.15	0.27	0.16	0.12	0.12	0.12	0.16	0.15	0.15	0.18	0.26	0.34	0.29	0.29
C3'	0.12	0.13	0.12	0.12	0.13	0.19	0.15	0.26	0.16	0.12	0.14	0.14	0.18	0.15	0.14	0.18	0.25	0.35	0.29	0.28
C4	0.15	0.13	0.16	0.15	0.15	0.23	0.23	0.33	0.24	0.15	0.12	0.15	0.20	0.22	0.16	0.21	0.28	0.34	0.31	0.32
C4'	0.17	0.19	0.16	0.14	0.20	0.21	0.19	0.26	0.19	0.17	0.21	0.21	0.23	0.18	0.11	0.21	0.24	0.32	0.26	0.26
C5	0.15	0.16	0.15	0.15	0.17	0.22	0.24	0.34	0.25	0.16	0.16	0.18	0.24	0.22	0.16	0.20	0.29	0.37	0.31	0.34
C5'	0.19	0.22	0.18	0.14	0.22	0.21	0.21	0.26	0.21	0.20	0.24	0.24	0.26	0.19	0.11	0.22	0.24	0.33	0.27	0.27
C6	0.15	0.18	0.15	0.13	0.19	0.19	0.26	0.32	0.26	0.16	0.18	0.20	0.26	0.22	0.15	0.17	0.28	0.36	0.31	0.33
C8	0.17	0.16	0.17	0.18	0.17	0.26	0.23	0.36	0.24	0.17	0.17	0.17	0.23	0.22	0.18	0.23	0.30	0.39	0.31	0.34
N1	0.14	0.16	0.15	0.13	0.18	0.17	0.26	0.29	0.25	0.15	0.16	0.20	0.25	0.22	0.15	0.14	0.26	0.34	0.30	0.31
N2	0.18	0.20	0.16	0.15	0.23	0.17	0.28	0.26	0.26	0.18	0.20	0.26	0.24	0.23	0.19	0.15	0.23	0.30	0.28	0.27
N3	0.15	0.13	0.15	0.13	0.16	0.20	0.24	0.30	0.24	0.15	0.13	0.17	0.20	0.23	0.15	0.20	0.26	0.30	0.29	0.30
N7	0.16	0.19	0.16	0.17	0.19	0.24	0.25	0.35	0.25	0.17	0.19	0.19	0.26	0.22	0.17	0.21	0.30	0.39	0.31	0.35
N9	0.17	0.13	0.17	0.18	0.15	0.26	0.22	0.35	0.23	0.16	0.13	0.14	0.19	0.22	0.17	0.24	0.30	0.36	0.31	0.33
O2'	0.13	0.16	0.12	0.12	0.16	0.16	0.15	0.21	0.14	0.13	0.17	0.17	0.20	0.14	0.13	0.15	0.22	0.30	0.26	0.24
O3'	0.13	0.17	0.15	0.15	0.17	0.18	0.16	0.25	0.16	0.14	0.18	0.18	0.22	0.16	0.18	0.17	0.26	0.36	0.31	0.29
O4'	0.22	0.19	0.20	0.19	0.20	0.26	0.23	0.30	0.24	0.21	0.20	0.21	0.21	0.21	0.16	0.26	0.27	0.32	0.28	0.29
O5'	0.23	0.22	0.16	0.12	0.22	0.33	0.24	0.45	0.26	0.22	0.24	0.23	0.27	0.17	0.12	0.34	0.35	0.49	0.33	0.41
O6	0.15	0.21	0.15	0.13	0.22	0.19	0.29	0.31	0.27	0.18	0.22	0.24	0.29	0.23	0.15	0.16	0.28	0.37	0.31	0.33
OP1	0.31	0.27	0.21	0.27	0.28	0.49	0.30	0.64	0.32	0.27	0.29	0.30	0.31	0.21	0.26	0.46	0.53	0.70	0.49	0.60
OP2	0.23	0.35	0.24	0.17	0.29	0.28	0.23	0.42	0.23	0.24	0.37	0.31	0.46	0.27	0.20	0.28	0.33	0.51	0.35	0.42
P	0.19	0.27	0.16	0.10	0.25	0.30	0.21	0.44	0.21	0.19	0.31	0.28	0.36	0.18	0.12	0.29	0.33	0.50	0.31	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.10	0.10	0.14	0.09
C2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.11	0.03	0.17	0.17	0.24	0.19
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.09	0.09	0.12	0.00	0.02	0.01	0.08	0.16	0.18	0.10
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.10	0.05	0.10	0.11	0.12	0.02	0.01	0.02	0.09	0.20	0.19	0.12
C4	0.03	0.02	0.08	0.10	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.03	0.21	0.24	0.29	0.26
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.07	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.09	0.04
C5	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.13	0.04	0.22	0.23	0.25	0.24
C5'	0.04	0.10	0.02	0.02	0.16	0.01	0.19	0.00	0.16	0.10	0.13	0.18	0.08	0.06	0.05	0.02	0.01	0.08	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.11	0.04	0.20	0.18	0.20	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.15	0.14	0.18	0.15
N3	0.04	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.13	0.03	0.20	0.21	0.29	0.24
N4	0.03	0.03	0.09	0.11	0.01	0.07	0.02	0.18	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.08	0.15	0.03	0.23	0.28	0.32	0.29
O2	0.06	0.01	0.12	0.12	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.12	0.15	0.06	0.15	0.16	0.25	0.17
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.07	0.06	0.04	0.06	0.03	0.02	0.09	0.08	0.12	0.00	0.04	0.04	0.05	0.16	0.17	0.08
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.13	0.02	0.13	0.05	0.11	0.06	0.13	0.15	0.15	0.04	0.00	0.02	0.14	0.29	0.24	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.10	0.10	0.13	0.11
O5'	0.10	0.17	0.08	0.09	0.21	0.02	0.22	0.01	0.20	0.15	0.20	0.23	0.15	0.05	0.14	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.17	0.16	0.20	0.24	0.09	0.23	0.08	0.18	0.14	0.21	0.28	0.16	0.16	0.29	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.24	0.18	0.19	0.29	0.09	0.25	0.04	0.20	0.18	0.29	0.32	0.25	0.17	0.24	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.19	0.10	0.12	0.26	0.04	0.24	0.02	0.18	0.15	0.24	0.29	0.17	0.08	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00