Doublet Group distance statistics: 51166

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 5, 8, 1, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.010, 0.029, 0.047, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.029 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.018, 0.037, 0.055, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.037 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.015, 0.037, 0.058, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.037 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.012, 0.034, 0.055, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.034 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.020, 0.048, 0.076, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.048 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.041, 0.123, 0.206, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.123 std_dev=0.083
C4'	B	0, 0.149, 0.263, 0.377, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.263 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.028, 0.152, 0.275, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.152 std_dev=0.124
C3'	B	0, 0.155, 0.288, 0.421, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.288 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.107, 0.263, 0.419, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.263 std_dev=0.156
C2'	B	0, 0.156, 0.312, 0.469, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.312 std_dev=0.157
O4'	B	0, 0.146, 0.318, 0.490, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.318 std_dev=0.172
C3'	A	0, 0.096, 0.268, 0.441, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.268 std_dev=0.172
C5'	B	0, 0.128, 0.302, 0.476, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.302 std_dev=0.174
C1'	B	0, 0.150, 0.328, 0.506, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.328 std_dev=0.178
O2'	A	0, 0.059, 0.248, 0.437, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.248 std_dev=0.189
O5'	B	0, 0.121, 0.313, 0.505, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.313 std_dev=0.192
O3'	B	0, 0.165, 0.373, 0.581, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.373 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.180, 0.411, 0.642, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.411 std_dev=0.231
O2'	B	0, 0.143, 0.383, 0.624, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.383 std_dev=0.241
C2	B	0, 0.162, 0.429, 0.697, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.429 std_dev=0.268
C5'	A	0, 0.162, 0.463, 0.763, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.463 std_dev=0.301
O2	B	0, 0.133, 0.435, 0.737, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.435 std_dev=0.302
P	B	0, 0.080, 0.389, 0.698, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.389 std_dev=0.309
OP1	B	0, 0.136, 0.447, 0.757, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.447 std_dev=0.310
O3'	A	0, 0.107, 0.420, 0.733, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.420 std_dev=0.313
C6	B	0, 0.221, 0.558, 0.894, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.558 std_dev=0.337
N3	B	0, 0.180, 0.525, 0.869, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.525 std_dev=0.344
OP2	B	0, 0.053, 0.436, 0.819, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.436 std_dev=0.383
C4	B	0, 0.203, 0.610, 1.017, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.610 std_dev=0.407
C5	B	0, 0.232, 0.655, 1.079, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.655 std_dev=0.424
O5'	A	0, 0.051, 0.501, 0.951, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.501 std_dev=0.450
P	A	0, 0.140, 0.628, 1.117, 2.236 max_d=2.236 avg_d=0.628 std_dev=0.489
N4	B	0, 0.206, 0.719, 1.232, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.719 std_dev=0.513
OP2	A	0, 0.222, 0.778, 1.333, 2.163 max_d=2.163 avg_d=0.778 std_dev=0.555
OP1	A	0, 0.145, 0.805, 1.465, 3.182 max_d=3.182 avg_d=0.805 std_dev=0.660

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.24	0.02	0.25	0.46	0.28
C2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.14	0.03	0.32	0.01	0.31	0.40	0.26
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.08	0.12	0.10	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.19	0.04	0.28	0.26	0.14
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.03	0.10	0.11	0.10	0.13	0.10	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.21	0.11	0.39	0.14	0.16
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.07	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.33	0.01	0.31	0.43	0.27
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.14	0.08	0.05	0.04	0.15	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.13	0.19	0.29	0.09
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.11	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.37	0.02	0.34	0.41	0.27
C5'	0.06	0.19	0.03	0.03	0.21	0.01	0.29	0.00	0.30	0.30	0.25	0.16	0.15	0.34	0.19	0.05	0.07	0.02	0.01	0.34	0.29	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.11	0.01	0.30	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.09	0.02	0.37	0.01	0.35	0.38	0.26
C8	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.14	0.01	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.03	0.39	0.03	0.32	0.47	0.28
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.08	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.11	0.02	0.35	0.01	0.33	0.39	0.26
N2	0.03	0.01	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.18	0.03	0.30	0.02	0.30	0.40	0.26
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.03	0.30	0.01	0.29	0.42	0.26
N7	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.15	0.00	0.34	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.03	0.40	0.03	0.35	0.41	0.27
N9	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.33	0.02	0.29	0.46	0.28
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.10	0.05	0.07	0.05	0.10	0.02	0.14	0.20	0.16	0.02	0.03	0.00	0.05	0.06	0.07	0.09	0.23	0.26	0.10
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.07	0.09	0.12	0.11	0.18	0.13	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.23	0.10	0.55	0.21	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.24	0.03	0.27	0.54	0.35
O5'	0.24	0.32	0.19	0.21	0.33	0.02	0.37	0.01	0.37	0.39	0.35	0.30	0.30	0.40	0.33	0.07	0.23	0.24	0.00	0.38	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.13	0.02	0.34	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.10	0.03	0.38	0.00	0.36	0.35	0.26
OP1	0.25	0.31	0.28	0.39	0.31	0.19	0.34	0.29	0.35	0.32	0.33	0.30	0.29	0.35	0.29	0.23	0.55	0.27	0.02	0.36	0.00	0.04	0.01
OP2	0.46	0.40	0.26	0.14	0.43	0.29	0.41	0.27	0.38	0.47	0.39	0.40	0.42	0.41	0.46	0.26	0.21	0.54	0.02	0.35	0.04	0.00	0.01
P	0.28	0.26	0.14	0.16	0.27	0.09	0.27	0.01	0.26	0.28	0.26	0.26	0.26	0.27	0.28	0.10	0.26	0.35	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.28	0.18	0.13	0.41	0.14	0.43	0.21	0.38	0.28	0.35	0.45	0.25	0.27	0.14	0.18	0.20	0.28	0.32	0.29
C2	0.22	0.22	0.22	0.16	0.27	0.16	0.31	0.24	0.30	0.25	0.24	0.28	0.20	0.33	0.19	0.23	0.22	0.28	0.29	0.28
C2'	0.19	0.30	0.14	0.14	0.42	0.18	0.43	0.26	0.39	0.29	0.37	0.46	0.26	0.19	0.12	0.22	0.23	0.28	0.33	0.29
C3'	0.21	0.33	0.15	0.16	0.45	0.21	0.45	0.28	0.40	0.31	0.41	0.51	0.29	0.19	0.15	0.24	0.25	0.29	0.33	0.29
C4	0.22	0.25	0.21	0.15	0.33	0.16	0.36	0.23	0.34	0.27	0.29	0.35	0.22	0.32	0.19	0.21	0.21	0.29	0.31	0.29
C4'	0.18	0.31	0.14	0.12	0.46	0.15	0.46	0.23	0.39	0.29	0.41	0.53	0.27	0.20	0.12	0.18	0.21	0.26	0.33	0.27
C5	0.23	0.24	0.23	0.16	0.31	0.16	0.34	0.24	0.32	0.26	0.27	0.33	0.22	0.34	0.21	0.22	0.22	0.31	0.31	0.30
C5'	0.19	0.31	0.16	0.16	0.46	0.19	0.45	0.26	0.38	0.29	0.41	0.54	0.27	0.23	0.18	0.21	0.22	0.32	0.33	0.30
C6	0.23	0.22	0.24	0.17	0.27	0.17	0.30	0.25	0.30	0.25	0.24	0.28	0.22	0.35	0.23	0.23	0.22	0.31	0.30	0.30
C8	0.22	0.26	0.22	0.15	0.36	0.16	0.38	0.24	0.35	0.27	0.32	0.39	0.24	0.32	0.19	0.21	0.21	0.31	0.32	0.31
N1	0.22	0.21	0.23	0.17	0.25	0.17	0.28	0.24	0.28	0.24	0.23	0.26	0.21	0.34	0.22	0.23	0.22	0.30	0.29	0.29
N2	0.22	0.20	0.21	0.16	0.24	0.17	0.28	0.24	0.28	0.23	0.22	0.25	0.19	0.31	0.19	0.23	0.22	0.26	0.28	0.27
N3	0.22	0.24	0.20	0.15	0.32	0.15	0.35	0.23	0.34	0.26	0.27	0.34	0.21	0.31	0.18	0.21	0.21	0.28	0.30	0.28
N7	0.23	0.25	0.23	0.16	0.33	0.17	0.36	0.24	0.34	0.27	0.29	0.36	0.23	0.34	0.21	0.22	0.22	0.32	0.32	0.31
N9	0.21	0.26	0.21	0.14	0.36	0.15	0.39	0.23	0.36	0.27	0.32	0.40	0.24	0.31	0.18	0.20	0.21	0.30	0.32	0.30
O2'	0.23	0.35	0.18	0.21	0.49	0.24	0.50	0.32	0.44	0.34	0.43	0.53	0.30	0.17	0.18	0.26	0.30	0.29	0.36	0.31
O3'	0.28	0.40	0.21	0.24	0.51	0.28	0.50	0.33	0.44	0.37	0.48	0.57	0.36	0.20	0.21	0.31	0.31	0.32	0.37	0.33
O4'	0.19	0.28	0.17	0.13	0.42	0.13	0.44	0.20	0.38	0.28	0.37	0.49	0.25	0.26	0.14	0.17	0.19	0.28	0.33	0.29
O5'	0.33	0.38	0.30	0.27	0.48	0.28	0.49	0.33	0.46	0.38	0.44	0.52	0.36	0.31	0.26	0.33	0.30	0.30	0.38	0.34
O6	0.22	0.22	0.24	0.17	0.25	0.17	0.28	0.25	0.28	0.24	0.23	0.26	0.22	0.35	0.24	0.23	0.23	0.32	0.29	0.30
OP1	0.37	0.52	0.34	0.27	0.57	0.26	0.53	0.31	0.47	0.45	0.58	0.63	0.56	0.34	0.24	0.32	0.28	0.28	0.37	0.31
OP2	0.31	0.39	0.20	0.27	0.49	0.37	0.50	0.50	0.46	0.38	0.45	0.54	0.37	0.15	0.24	0.40	0.47	0.54	0.55	0.53
P	0.27	0.36	0.20	0.20	0.46	0.26	0.47	0.35	0.43	0.34	0.43	0.52	0.36	0.20	0.17	0.29	0.32	0.37	0.42	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.11	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.11	0.03	0.11	0.12	0.16	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.08	0.06	0.13	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.12	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.02	0.07	0.05	0.11	0.12	0.12	0.02	0.01	0.01	0.07	0.13	0.13	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.03	0.17	0.19	0.24	0.20
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.10	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.07	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.04	0.17	0.19	0.22	0.20
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.06	0.10	0.15	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.05	0.14	0.15	0.16	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.10	0.14	0.11
N3	0.02	0.00	0.08	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.03	0.14	0.15	0.21	0.17
N4	0.03	0.02	0.06	0.12	0.01	0.10	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.14	0.04	0.19	0.23	0.28	0.24
O2	0.04	0.00	0.13	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.14	0.06	0.10	0.11	0.15	0.11
O2'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.07	0.06	0.11	0.00	0.03	0.03	0.04	0.11	0.10	0.05
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.12	0.01	0.10	0.03	0.08	0.05	0.13	0.14	0.14	0.03	0.00	0.01	0.11	0.19	0.19	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.04	0.06	0.03	0.01	0.00	0.08	0.07	0.12	0.09
O5'	0.06	0.11	0.05	0.07	0.17	0.02	0.17	0.01	0.14	0.10	0.14	0.19	0.10	0.04	0.11	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.12	0.11	0.13	0.19	0.07	0.19	0.05	0.15	0.10	0.15	0.23	0.11	0.11	0.19	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.16	0.12	0.13	0.24	0.05	0.22	0.02	0.16	0.14	0.21	0.28	0.15	0.10	0.19	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.07	0.09	0.20	0.02	0.20	0.01	0.15	0.11	0.17	0.24	0.11	0.05	0.14	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00