Doublet Group distance statistics: 51167

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 5, 4, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.012, 0.026, 0.039, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.010, 0.026, 0.043, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.005, 0.023, 0.040, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.003, 0.022, 0.042, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.022 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.006, 0.040, 0.074, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.040 std_dev=0.034
N2	A	0, 0.027, 0.063, 0.099, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.063 std_dev=0.036
O4'	A	0, -0.004, 0.110, 0.224, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.110 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.006, 0.136, 0.266, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.136 std_dev=0.130
O2'	A	0, 0.044, 0.217, 0.389, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.217 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.005, 0.187, 0.369, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.187 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.005, 0.199, 0.392, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.199 std_dev=0.193
C2'	B	0, 0.254, 0.462, 0.670, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.462 std_dev=0.208
O2'	B	0, 0.264, 0.497, 0.729, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.497 std_dev=0.233
O3'	A	0, 0.010, 0.297, 0.585, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.297 std_dev=0.287
C5'	A	0, 0.007, 0.306, 0.605, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.306 std_dev=0.299
O5'	A	0, -0.018, 0.428, 0.874, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.428 std_dev=0.446
N1	B	0, 0.177, 0.624, 1.072, 2.102 max_d=2.102 avg_d=0.624 std_dev=0.447
C4	B	0, 0.265, 0.712, 1.160, 1.991 max_d=1.991 avg_d=0.712 std_dev=0.447
N4	B	0, 0.301, 0.773, 1.244, 2.021 max_d=2.021 avg_d=0.773 std_dev=0.471
C1'	B	0, 0.127, 0.599, 1.070, 2.228 max_d=2.228 avg_d=0.599 std_dev=0.472
C5	B	0, 0.236, 0.722, 1.208, 2.322 max_d=2.322 avg_d=0.722 std_dev=0.486
C6	B	0, 0.162, 0.689, 1.216, 2.539 max_d=2.539 avg_d=0.689 std_dev=0.527
C3'	B	0, 0.027, 0.558, 1.089, 2.526 max_d=2.526 avg_d=0.558 std_dev=0.531
C2	B	0, 0.110, 0.696, 1.282, 2.687 max_d=2.687 avg_d=0.696 std_dev=0.586
N3	B	0, 0.136, 0.748, 1.361, 2.788 max_d=2.788 avg_d=0.748 std_dev=0.613
P	A	0, -0.133, 0.526, 1.186, 3.004 max_d=3.004 avg_d=0.526 std_dev=0.660
O3'	B	0, -0.166, 0.543, 1.252, 3.301 max_d=3.301 avg_d=0.543 std_dev=0.709
O4'	B	0, -0.083, 0.705, 1.494, 3.693 max_d=3.693 avg_d=0.705 std_dev=0.789
O2	B	0, -0.023, 0.777, 1.577, 3.679 max_d=3.679 avg_d=0.777 std_dev=0.800
C4'	B	0, -0.132, 0.681, 1.494, 3.797 max_d=3.797 avg_d=0.681 std_dev=0.813
OP2	A	0, -0.149, 0.706, 1.562, 3.933 max_d=3.933 avg_d=0.706 std_dev=0.855
OP1	A	0, -0.563, 0.617, 1.797, 5.266 max_d=5.266 avg_d=0.617 std_dev=1.180
C5'	B	0, -0.392, 0.856, 2.104, 5.739 max_d=5.739 avg_d=0.856 std_dev=1.248
O5'	B	0, -0.343, 0.941, 2.225, 5.927 max_d=5.927 avg_d=0.941 std_dev=1.284
OP2	B	0, -0.458, 1.116, 2.690, 7.284 max_d=7.284 avg_d=1.116 std_dev=1.574
P	B	0, -0.614, 1.087, 2.789, 7.779 max_d=7.779 avg_d=1.087 std_dev=1.702
OP1	B	0, -0.866, 1.208, 3.282, 9.383 max_d=9.383 avg_d=1.208 std_dev=2.074

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.03	0.35	0.41	0.28
C2	0.05	0.00	0.12	0.13	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.16	0.04	0.35	0.02	0.73	0.46	0.46
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.10	0.15	0.12	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.06	0.26	0.27	0.22
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.06	0.11	0.16	0.12	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.22	0.07	0.19	0.17	0.18
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.35	0.02	0.72	0.47	0.46
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.09	0.07	0.05	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.17	0.07
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.40	0.02	0.89	0.50	0.54
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.09	0.10	0.08	0.10	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.10	0.05	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.09	0.03	0.41	0.01	0.95	0.49	0.55
C8	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.04	0.40	0.04	0.80	0.52	0.53
N1	0.04	0.01	0.10	0.11	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	0.02	0.39	0.01	0.86	0.47	0.51
N2	0.06	0.01	0.15	0.16	0.02	0.09	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.21	0.06	0.34	0.02	0.68	0.44	0.43
N3	0.05	0.01	0.12	0.12	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.13	0.14	0.04	0.33	0.02	0.64	0.45	0.42
N7	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.43	0.04	0.96	0.52	0.58
N9	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.33	0.03	0.62	0.48	0.43
O2'	0.01	0.15	0.01	0.03	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.03	0.12	0.18	0.13	0.02	0.02	0.00	0.07	0.04	0.05	0.08	0.07	0.25	0.10
O3'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.08	0.01	0.06	0.03	0.09	0.06	0.14	0.21	0.14	0.05	0.02	0.07	0.00	0.01	0.15	0.09	0.10	0.15	0.08
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.06	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.05	0.22	0.39	0.22
O5'	0.19	0.35	0.19	0.22	0.35	0.02	0.40	0.01	0.41	0.40	0.39	0.34	0.33	0.43	0.33	0.05	0.15	0.09	0.00	0.43	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.06	0.07	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.08	0.09	0.05	0.43	0.00	1.04	0.49	0.59
OP1	0.35	0.73	0.26	0.19	0.72	0.04	0.89	0.05	0.95	0.80	0.86	0.68	0.64	0.96	0.62	0.07	0.10	0.22	0.02	1.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.41	0.46	0.27	0.17	0.47	0.17	0.50	0.08	0.49	0.52	0.47	0.44	0.45	0.52	0.48	0.25	0.15	0.39	0.02	0.49	0.02	0.00	0.01
P	0.28	0.46	0.22	0.18	0.46	0.07	0.54	0.02	0.55	0.53	0.51	0.43	0.42	0.58	0.43	0.10	0.08	0.22	0.01	0.59	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.40	0.13	0.20	0.25	0.14	0.14	0.26	0.13	0.25	0.38	0.26	0.55	0.22	0.40	0.14	0.34	0.50	0.37	0.40
C2	0.12	0.10	0.12	0.14	0.11	0.18	0.13	0.22	0.14	0.12	0.10	0.11	0.11	0.14	0.15	0.15	0.19	0.33	0.27	0.24
C2'	0.15	0.33	0.12	0.33	0.17	0.34	0.11	0.51	0.13	0.16	0.32	0.18	0.50	0.18	0.51	0.16	0.57	0.76	0.57	0.64
C3'	0.13	0.33	0.13	0.37	0.17	0.40	0.13	0.59	0.15	0.15	0.33	0.18	0.51	0.17	0.53	0.20	0.65	0.89	0.66	0.74
C4	0.20	0.24	0.14	0.11	0.17	0.12	0.14	0.14	0.15	0.19	0.22	0.17	0.30	0.18	0.17	0.17	0.14	0.23	0.20	0.18
C4'	0.22	0.46	0.12	0.29	0.28	0.26	0.12	0.45	0.11	0.24	0.46	0.30	0.65	0.22	0.50	0.10	0.54	0.80	0.57	0.64
C5	0.20	0.21	0.14	0.12	0.17	0.18	0.16	0.21	0.17	0.19	0.20	0.16	0.24	0.17	0.12	0.21	0.16	0.28	0.23	0.21
C5'	0.21	0.45	0.11	0.28	0.29	0.25	0.12	0.44	0.10	0.24	0.46	0.31	0.64	0.20	0.48	0.09	0.52	0.80	0.57	0.63
C6	0.18	0.15	0.14	0.17	0.14	0.26	0.17	0.33	0.19	0.17	0.14	0.14	0.15	0.16	0.16	0.23	0.28	0.45	0.35	0.34
C8	0.24	0.32	0.15	0.14	0.22	0.13	0.17	0.16	0.17	0.24	0.30	0.22	0.40	0.19	0.25	0.20	0.19	0.30	0.24	0.23
N1	0.14	0.10	0.14	0.20	0.12	0.27	0.16	0.35	0.17	0.13	0.10	0.11	0.11	0.15	0.22	0.20	0.31	0.50	0.38	0.38
N2	0.08	0.07	0.11	0.20	0.09	0.20	0.13	0.26	0.13	0.08	0.07	0.09	0.10	0.14	0.28	0.10	0.24	0.42	0.33	0.29
N3	0.16	0.19	0.13	0.11	0.14	0.10	0.13	0.13	0.13	0.16	0.18	0.14	0.24	0.16	0.15	0.13	0.14	0.22	0.19	0.16
N7	0.23	0.26	0.15	0.11	0.20	0.17	0.17	0.19	0.18	0.22	0.24	0.19	0.31	0.18	0.16	0.22	0.16	0.26	0.22	0.20
N9	0.23	0.32	0.14	0.15	0.22	0.12	0.15	0.17	0.15	0.22	0.30	0.21	0.42	0.20	0.29	0.17	0.23	0.33	0.26	0.26
O2'	0.21	0.42	0.16	0.37	0.23	0.38	0.13	0.57	0.14	0.21	0.41	0.24	0.63	0.26	0.58	0.19	0.65	0.89	0.66	0.74
O3'	0.15	0.33	0.17	0.45	0.17	0.53	0.19	0.78	0.23	0.15	0.33	0.18	0.52	0.18	0.61	0.32	0.83	1.14	0.84	0.96
O4'	0.29	0.48	0.15	0.21	0.32	0.14	0.17	0.27	0.16	0.30	0.47	0.33	0.65	0.25	0.43	0.17	0.37	0.58	0.41	0.44
O5'	0.39	0.54	0.25	0.10	0.35	0.11	0.19	0.20	0.20	0.37	0.52	0.34	0.72	0.40	0.26	0.27	0.31	0.56	0.40	0.41
O6	0.18	0.14	0.15	0.21	0.15	0.31	0.19	0.42	0.21	0.17	0.14	0.14	0.15	0.16	0.21	0.26	0.36	0.58	0.43	0.44
OP1	0.62	0.71	0.46	0.21	0.49	0.32	0.35	0.20	0.38	0.56	0.66	0.45	0.90	0.64	0.14	0.52	0.19	0.43	0.31	0.29
OP2	0.70	0.90	0.53	0.29	0.73	0.36	0.56	0.27	0.55	0.71	0.89	0.73	1.07	0.64	0.24	0.57	0.26	0.44	0.31	0.31
P	0.53	0.68	0.37	0.14	0.49	0.22	0.33	0.17	0.34	0.51	0.65	0.47	0.86	0.51	0.19	0.42	0.23	0.48	0.33	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.16	0.07
C2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.06	0.02	0.05	0.06	0.17	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.11	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.16	0.05
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.04	0.05	0.09	0.02	0.01	0.01	0.08	0.09	0.15	0.04
C4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.05	0.03	0.09	0.11	0.20	0.12
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.04
C5	0.03	0.02	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.04	0.11	0.13	0.21	0.13
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.04	0.06	0.08	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.08	0.07	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.08	0.04	0.09	0.10	0.19	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.07	0.17	0.08
N3	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.06	0.03	0.07	0.08	0.18	0.10
N4	0.02	0.02	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.07	0.06	0.03	0.09	0.13	0.20	0.12
O2	0.02	0.01	0.11	0.09	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.15	0.12	0.03	0.04	0.05	0.18	0.08
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.09	0.07	0.15	0.00	0.04	0.03	0.05	0.08	0.16	0.06
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.03	0.08	0.02	0.06	0.06	0.12	0.04	0.00	0.01	0.11	0.11	0.15	0.05
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.09	0.09	0.16	0.08
O5'	0.04	0.05	0.04	0.08	0.09	0.01	0.11	0.02	0.09	0.05	0.07	0.09	0.04	0.05	0.11	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.06	0.08	0.09	0.11	0.08	0.13	0.08	0.10	0.07	0.08	0.13	0.05	0.08	0.11	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.17	0.16	0.15	0.20	0.12	0.21	0.07	0.19	0.17	0.18	0.20	0.18	0.16	0.15	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.08	0.05	0.04	0.12	0.04	0.13	0.02	0.11	0.08	0.10	0.12	0.08	0.06	0.05	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00