Doublet Group distance statistics: 51171

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 0, 1, 1, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, -0.002, 0.013, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.013 std_dev=0.015
C5	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.007, 0.013, 0.033, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.013 std_dev=0.020
C4	A	0, -0.002, 0.018, 0.038, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.020
N3	A	0, -0.006, 0.015, 0.035, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.015 std_dev=0.021
C1'	A	0, -0.007, 0.017, 0.041, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.017 std_dev=0.024
O6	A	0, -0.001, 0.024, 0.049, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.024 std_dev=0.025
N9	A	0, -0.004, 0.022, 0.049, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.022 std_dev=0.026
N7	A	0, -0.006, 0.031, 0.068, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.031 std_dev=0.037
N2	A	0, -0.010, 0.034, 0.078, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.034 std_dev=0.044
C8	A	0, -0.006, 0.039, 0.084, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.039 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.012, 0.065, 0.118, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.065 std_dev=0.053
C2'	A	0, 0.031, 0.130, 0.230, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.130 std_dev=0.099
C4'	A	0, 0.016, 0.116, 0.215, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.116 std_dev=0.100
O5'	A	0, 0.108, 0.221, 0.334, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.221 std_dev=0.113
C3'	A	0, 0.024, 0.160, 0.295, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.160 std_dev=0.136
O2'	A	0, 0.047, 0.189, 0.331, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.189 std_dev=0.142
C5'	A	0, 0.055, 0.199, 0.343, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.199 std_dev=0.144
O2'	B	0, 0.202, 0.430, 0.657, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.430 std_dev=0.227
P	A	0, 0.200, 0.445, 0.690, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.445 std_dev=0.245
O3'	A	0, 0.003, 0.268, 0.533, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.268 std_dev=0.265
C2'	B	0, 0.233, 0.511, 0.790, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.511 std_dev=0.279
OP2	A	0, 0.275, 0.563, 0.851, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.563 std_dev=0.288
OP1	A	0, 0.200, 0.542, 0.884, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.542 std_dev=0.342
OP2	B	0, 0.334, 0.778, 1.223, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.778 std_dev=0.444
C3'	B	0, 0.133, 0.678, 1.223, 2.101 max_d=2.101 avg_d=0.678 std_dev=0.545
O5'	B	0, 0.189, 0.839, 1.490, 2.312 max_d=2.312 avg_d=0.839 std_dev=0.651
C1'	B	0, -0.008, 0.831, 1.670, 2.627 max_d=2.627 avg_d=0.831 std_dev=0.839
P	B	0, 0.107, 0.999, 1.892, 3.097 max_d=3.097 avg_d=0.999 std_dev=0.892
C4'	B	0, -0.040, 0.856, 1.751, 2.742 max_d=2.742 avg_d=0.856 std_dev=0.895
O4'	B	0, -0.098, 0.942, 1.981, 3.316 max_d=3.316 avg_d=0.942 std_dev=1.040
C5'	B	0, -0.175, 1.108, 2.390, 3.792 max_d=3.792 avg_d=1.108 std_dev=1.282
O3'	B	0, -0.329, 1.098, 2.525, 4.623 max_d=4.623 avg_d=1.098 std_dev=1.427
N1	B	0, -0.389, 1.135, 2.660, 4.415 max_d=4.415 avg_d=1.135 std_dev=1.525
OP1	B	0, -0.200, 1.398, 2.995, 4.950 max_d=4.950 avg_d=1.398 std_dev=1.598
C6	B	0, -0.437, 1.221, 2.878, 4.772 max_d=4.772 avg_d=1.221 std_dev=1.657
O2	B	0, -0.625, 1.417, 3.459, 5.740 max_d=5.740 avg_d=1.417 std_dev=2.042
C2	B	0, -0.739, 1.448, 3.636, 6.087 max_d=6.087 avg_d=1.448 std_dev=2.188
C5	B	0, -0.843, 1.567, 3.976, 6.661 max_d=6.661 avg_d=1.567 std_dev=2.410
N3	B	0, -1.160, 1.836, 4.833, 8.200 max_d=8.200 avg_d=1.836 std_dev=2.996
C4	B	0, -1.248, 1.875, 4.997, 8.500 max_d=8.500 avg_d=1.875 std_dev=3.122
N4	B	0, -1.613, 2.311, 6.234, 10.707 max_d=10.707 avg_d=2.311 std_dev=3.923

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.14	0.15
C2	0.05	0.00	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.11	0.01	0.12	0.26	0.22
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.01	0.07	0.03	0.09	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.12	0.06	0.03
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.06	0.09	0.12	0.09	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.09	0.19	0.14	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.11	0.01	0.14	0.25	0.22
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.09	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.14	0.01	0.20	0.31	0.27
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.06	0.07	0.05	0.11	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.10	0.04	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.03	0.15	0.00	0.22	0.34	0.28
C8	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.15	0.01	0.20	0.27	0.26
N1	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.02	0.13	0.01	0.18	0.31	0.26
N2	0.06	0.00	0.12	0.12	0.01	0.09	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.05	0.10	0.01	0.10	0.25	0.21
N3	0.05	0.00	0.09	0.09	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.11	0.04	0.10	0.01	0.10	0.23	0.20
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.04	0.16	0.01	0.25	0.33	0.29
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.12	0.21	0.20
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.06	0.06	0.02	0.09	0.14	0.09	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.02	0.06	0.16	0.06	0.04
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.09	0.01	0.11	0.05	0.13	0.08	0.14	0.16	0.11	0.11	0.05	0.05	0.00	0.01	0.11	0.15	0.36	0.28	0.21
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.05	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.03	0.10	0.14	0.16
O5'	0.07	0.11	0.04	0.05	0.11	0.01	0.14	0.01	0.15	0.15	0.13	0.10	0.10	0.16	0.10	0.02	0.11	0.06	0.00	0.16	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.02	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.03	0.16	0.00	0.27	0.37	0.31
OP1	0.07	0.12	0.12	0.19	0.14	0.07	0.20	0.04	0.22	0.20	0.18	0.10	0.10	0.25	0.12	0.16	0.36	0.10	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.26	0.06	0.14	0.25	0.03	0.31	0.02	0.34	0.27	0.31	0.25	0.23	0.33	0.21	0.06	0.28	0.14	0.02	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.22	0.03	0.09	0.22	0.03	0.27	0.01	0.28	0.26	0.26	0.21	0.20	0.29	0.20	0.04	0.21	0.16	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.49	1.22	0.29	0.35	1.29	0.38	1.02	0.46	0.80	0.85	1.40	1.42	1.33	0.20	0.78	0.22	0.22	0.44	0.22	0.23
C2	0.28	0.33	0.21	0.24	0.34	0.35	0.21	0.36	0.18	0.19	0.42	0.41	0.44	0.21	0.33	0.45	0.27	0.28	0.18	0.27
C2'	0.23	0.91	0.24	0.30	1.02	0.52	0.77	0.59	0.55	0.58	1.11	1.16	0.97	0.25	0.57	0.26	0.29	0.49	0.16	0.31
C3'	0.22	1.03	0.24	0.31	1.21	0.63	0.87	0.73	0.59	0.62	1.30	1.41	1.09	0.27	0.59	0.35	0.37	0.64	0.16	0.40
C4	0.41	0.57	0.23	0.26	0.57	0.17	0.50	0.17	0.46	0.48	0.60	0.59	0.61	0.14	0.52	0.34	0.18	0.15	0.18	0.17
C4'	0.43	1.44	0.31	0.40	1.67	0.64	1.25	0.76	0.90	0.93	1.78	1.92	1.50	0.27	0.82	0.30	0.38	0.72	0.27	0.41
C5	0.38	0.45	0.22	0.25	0.45	0.19	0.42	0.17	0.40	0.41	0.47	0.47	0.47	0.15	0.47	0.37	0.19	0.14	0.18	0.18
C5'	0.44	1.50	0.30	0.41	1.80	0.65	1.34	0.79	0.95	0.97	1.91	2.11	1.56	0.27	0.84	0.30	0.40	0.79	0.31	0.44
C6	0.32	0.24	0.21	0.24	0.25	0.29	0.21	0.28	0.24	0.23	0.29	0.30	0.27	0.19	0.38	0.43	0.24	0.21	0.19	0.24
C8	0.46	0.95	0.26	0.30	1.02	0.23	0.82	0.28	0.67	0.70	1.09	1.13	1.02	0.13	0.65	0.27	0.17	0.30	0.20	0.17
N1	0.27	0.38	0.21	0.24	0.42	0.38	0.25	0.39	0.19	0.20	0.51	0.52	0.48	0.21	0.33	0.47	0.28	0.31	0.19	0.29
N2	0.21	0.75	0.24	0.25	0.73	0.50	0.45	0.52	0.28	0.36	0.89	0.84	0.96	0.25	0.31	0.49	0.33	0.43	0.20	0.34
N3	0.36	0.34	0.22	0.25	0.32	0.21	0.32	0.20	0.34	0.34	0.33	0.32	0.35	0.16	0.44	0.38	0.20	0.15	0.18	0.20
N7	0.42	0.69	0.23	0.27	0.73	0.17	0.62	0.18	0.53	0.55	0.77	0.79	0.73	0.13	0.55	0.33	0.17	0.19	0.19	0.16
N9	0.46	0.94	0.26	0.30	0.98	0.23	0.80	0.28	0.66	0.70	1.06	1.07	1.03	0.14	0.65	0.27	0.17	0.28	0.20	0.17
O2'	0.24	1.00	0.23	0.32	1.14	0.66	0.86	0.72	0.60	0.63	1.22	1.28	1.02	0.32	0.64	0.38	0.36	0.58	0.17	0.36
O3'	0.19	0.90	0.17	0.28	1.12	0.78	0.77	0.91	0.46	0.48	1.20	1.34	0.95	0.31	0.51	0.56	0.50	0.79	0.19	0.54
O4'	0.56	1.52	0.31	0.41	1.68	0.48	1.30	0.59	0.99	1.04	1.81	1.89	1.61	0.23	0.91	0.27	0.28	0.60	0.29	0.31
O5'	0.37	1.30	0.25	0.37	1.55	0.56	1.16	0.69	0.82	0.84	1.65	1.82	1.37	0.23	0.78	0.21	0.33	0.69	0.25	0.38
O6	0.30	0.26	0.22	0.24	0.30	0.32	0.21	0.32	0.21	0.21	0.35	0.38	0.30	0.19	0.37	0.45	0.26	0.25	0.19	0.26
OP1	0.42	1.41	0.33	0.42	1.74	0.62	1.30	0.79	0.92	0.92	1.82	2.08	1.44	0.21	0.78	0.29	0.43	0.81	0.38	0.49
OP2	0.30	1.09	0.19	0.40	1.32	0.51	0.98	0.63	0.68	0.70	1.40	1.58	1.13	0.24	0.80	0.14	0.32	0.67	0.23	0.37
P	0.33	1.27	0.20	0.43	1.55	0.60	1.14	0.75	0.79	0.80	1.63	1.85	1.31	0.27	0.87	0.21	0.38	0.78	0.27	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.08	0.06
C2	0.01	0.00	0.10	0.16	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.17	0.02	0.15	0.17	0.22	0.18
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.07	0.02	0.19	0.00	0.01	0.02	0.07	0.10	0.06	0.06
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.15	0.00	0.18	0.01	0.19	0.10	0.17	0.16	0.23	0.01	0.01	0.01	0.16	0.14	0.09	0.13
C4	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.11	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.18	0.01	0.23	0.29	0.33	0.29
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.13	0.06	0.09	0.12	0.08	0.08	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.18	0.00	0.14	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.22	0.02	0.24	0.28	0.30	0.28
C5'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.19	0.01	0.22	0.00	0.19	0.10	0.16	0.21	0.11	0.07	0.03	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01
C6	0.00	0.00	0.10	0.19	0.00	0.13	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.20	0.03	0.17	0.18	0.17	0.19
N1	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.12	0.12	0.14	0.13
N3	0.01	0.00	0.07	0.17	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.19	0.02	0.20	0.24	0.30	0.25
N4	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.20	0.01	0.26	0.34	0.39	0.33
O2	0.01	0.00	0.19	0.23	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.27	0.04	0.13	0.16	0.21	0.16
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.08	0.06	0.07	0.06	0.04	0.09	0.07	0.16	0.00	0.04	0.08	0.06	0.08	0.03	0.06
O3'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.18	0.01	0.22	0.03	0.20	0.09	0.19	0.20	0.27	0.04	0.00	0.01	0.23	0.24	0.16	0.21
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.00	0.14	0.12	0.12	0.10
O5'	0.06	0.15	0.07	0.16	0.23	0.01	0.24	0.00	0.17	0.12	0.20	0.26	0.13	0.06	0.23	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.17	0.10	0.14	0.29	0.05	0.28	0.07	0.18	0.12	0.24	0.34	0.16	0.08	0.24	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.22	0.06	0.09	0.33	0.03	0.30	0.05	0.17	0.14	0.30	0.39	0.21	0.03	0.16	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.18	0.06	0.13	0.29	0.01	0.28	0.01	0.19	0.13	0.25	0.33	0.16	0.06	0.21	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00