Doublet Group distance statistics: 51172

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 6, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.014, 0.026, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.015, 0.028, 0.041, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.028 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.017, 0.037, 0.057, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.037 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.021, 0.045, 0.069, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.033, 0.068, 0.103, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.068 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.017, 0.054, 0.090, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.054 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.023, 0.064, 0.106, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.064 std_dev=0.042
O2'	A	0, 0.188, 0.328, 0.468, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.328 std_dev=0.140
C2'	A	0, 0.073, 0.225, 0.377, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.225 std_dev=0.152
O4'	A	0, 0.031, 0.206, 0.381, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.206 std_dev=0.175
O3'	B	0, 0.338, 0.519, 0.701, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.519 std_dev=0.182
O2'	B	0, 0.443, 0.661, 0.879, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.661 std_dev=0.218
C3'	B	0, 0.405, 0.631, 0.857, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.631 std_dev=0.226
C4'	A	0, 0.167, 0.401, 0.635, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.401 std_dev=0.234
C2'	B	0, 0.482, 0.723, 0.963, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.723 std_dev=0.241
C3'	A	0, 0.116, 0.367, 0.618, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.367 std_dev=0.251
C4'	B	0, 0.385, 0.637, 0.890, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.637 std_dev=0.252
C1'	B	0, 0.469, 0.743, 1.018, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.743 std_dev=0.275
C5'	B	0, 0.434, 0.709, 0.984, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.709 std_dev=0.275
O4'	B	0, 0.400, 0.692, 0.983, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.692 std_dev=0.292
N1	B	0, 0.437, 0.743, 1.049, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.743 std_dev=0.306
C6	B	0, 0.467, 0.789, 1.110, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.789 std_dev=0.322
O3'	A	0, 0.228, 0.572, 0.915, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.572 std_dev=0.344
O5'	B	0, 0.531, 0.904, 1.276, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.904 std_dev=0.373
C2	B	0, 0.298, 0.694, 1.090, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.694 std_dev=0.396
C5	B	0, 0.375, 0.772, 1.168, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.772 std_dev=0.396
O2	B	0, 0.252, 0.677, 1.101, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.677 std_dev=0.425
C5'	A	0, 0.315, 0.747, 1.179, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.747 std_dev=0.432
OP1	B	0, 0.696, 1.129, 1.563, 1.723 max_d=1.723 avg_d=1.129 std_dev=0.434
P	B	0, 0.635, 1.095, 1.555, 1.966 max_d=1.966 avg_d=1.095 std_dev=0.460
C4	B	0, 0.252, 0.738, 1.224, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.738 std_dev=0.486
N3	B	0, 0.211, 0.703, 1.195, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.703 std_dev=0.492
OP2	B	0, 0.615, 1.155, 1.696, 2.435 max_d=2.435 avg_d=1.155 std_dev=0.541
O5'	A	0, 0.421, 0.965, 1.509, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.965 std_dev=0.544
N4	B	0, 0.204, 0.796, 1.389, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.796 std_dev=0.593
OP2	A	0, 0.797, 1.400, 2.003, 1.886 max_d=1.886 avg_d=1.400 std_dev=0.603
P	A	0, 0.699, 1.308, 1.917, 1.928 max_d=1.928 avg_d=1.308 std_dev=0.609
OP1	A	0, 0.782, 1.402, 2.021, 1.935 max_d=1.935 avg_d=1.402 std_dev=0.620

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.03	0.21	0.24	0.15
C2	0.04	0.00	0.09	0.14	0.02	0.06	0.02	0.19	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.16	0.02	0.43	0.02	0.43	0.57	0.45
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.07	0.06	0.12	0.10	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.04	0.28	0.21	0.19
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.10	0.04	0.11	0.16	0.12	0.17	0.13	0.14	0.08	0.01	0.01	0.01	0.30	0.12	0.35	0.17	0.25
C4	0.02	0.02	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02	0.46	0.02	0.45	0.52	0.45
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.11	0.15	0.07	0.07	0.05	0.16	0.07	0.06	0.01	0.00	0.03	0.14	0.12	0.25	0.04
C5	0.02	0.02	0.03	0.10	0.01	0.11	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.04	0.58	0.02	0.59	0.69	0.62
C5'	0.05	0.19	0.03	0.04	0.21	0.01	0.30	0.00	0.31	0.32	0.25	0.17	0.15	0.36	0.19	0.07	0.04	0.03	0.01	0.36	0.13	0.34	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.11	0.01	0.11	0.01	0.31	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.11	0.10	0.04	0.60	0.00	0.63	0.77	0.66
C8	0.02	0.02	0.07	0.16	0.01	0.15	0.01	0.32	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.17	0.06	0.59	0.03	0.57	0.54	0.57
N1	0.03	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.25	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.15	0.12	0.03	0.52	0.02	0.54	0.70	0.57
N2	0.04	0.01	0.12	0.17	0.03	0.07	0.03	0.17	0.03	0.03	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.19	0.22	0.03	0.38	0.04	0.38	0.55	0.41
N3	0.04	0.01	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.15	0.15	0.02	0.37	0.01	0.37	0.47	0.37
N7	0.02	0.02	0.06	0.14	0.01	0.16	0.01	0.36	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.06	0.66	0.04	0.67	0.73	0.69
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.07	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.42	0.03	0.40	0.40	0.38
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.06	0.08	0.07	0.11	0.04	0.15	0.19	0.15	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.06	0.10	0.14	0.20	0.06
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.04	0.10	0.17	0.12	0.22	0.15	0.16	0.07	0.05	0.00	0.01	0.22	0.11	0.35	0.14	0.22
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.02	0.06	0.02	0.05	0.01	0.00	0.07	0.06	0.10	0.28	0.08
O5'	0.19	0.43	0.22	0.30	0.46	0.03	0.58	0.01	0.60	0.59	0.52	0.38	0.37	0.66	0.42	0.06	0.22	0.07	0.00	0.67	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.04	0.12	0.02	0.14	0.02	0.36	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.10	0.11	0.06	0.67	0.00	0.72	0.88	0.76
OP1	0.21	0.43	0.28	0.35	0.45	0.12	0.59	0.13	0.63	0.57	0.54	0.38	0.37	0.67	0.40	0.14	0.35	0.10	0.02	0.72	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.57	0.21	0.17	0.52	0.25	0.69	0.34	0.77	0.54	0.70	0.55	0.47	0.73	0.40	0.20	0.14	0.28	0.01	0.88	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.45	0.19	0.25	0.45	0.04	0.62	0.02	0.66	0.57	0.57	0.41	0.37	0.69	0.38	0.06	0.22	0.08	0.01	0.76	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.25	0.19	0.20	0.31	0.27	0.35	0.35	0.33	0.27	0.27	0.33	0.24	0.13	0.17	0.29	0.33	0.43	0.37	0.36
C2	0.16	0.17	0.13	0.13	0.15	0.16	0.16	0.19	0.17	0.16	0.17	0.16	0.21	0.12	0.12	0.17	0.15	0.18	0.17	0.15
C2'	0.21	0.22	0.14	0.14	0.25	0.18	0.27	0.26	0.25	0.22	0.22	0.26	0.24	0.11	0.16	0.23	0.27	0.41	0.33	0.33
C3'	0.25	0.27	0.20	0.18	0.24	0.19	0.23	0.20	0.22	0.24	0.26	0.25	0.33	0.20	0.19	0.24	0.22	0.41	0.28	0.29
C4	0.20	0.20	0.16	0.18	0.22	0.23	0.25	0.29	0.25	0.21	0.20	0.22	0.22	0.13	0.16	0.23	0.25	0.31	0.28	0.26
C4'	0.21	0.22	0.12	0.08	0.22	0.15	0.24	0.18	0.22	0.20	0.21	0.24	0.27	0.11	0.07	0.22	0.20	0.42	0.28	0.28
C5	0.19	0.19	0.15	0.17	0.20	0.22	0.23	0.28	0.23	0.19	0.19	0.20	0.22	0.12	0.15	0.22	0.24	0.31	0.27	0.26
C5'	0.24	0.26	0.15	0.10	0.22	0.15	0.21	0.15	0.20	0.22	0.24	0.23	0.33	0.17	0.09	0.23	0.18	0.41	0.26	0.26
C6	0.16	0.18	0.13	0.14	0.16	0.19	0.18	0.24	0.19	0.17	0.17	0.16	0.22	0.12	0.12	0.19	0.19	0.25	0.22	0.20
C8	0.22	0.22	0.17	0.20	0.26	0.26	0.31	0.34	0.29	0.24	0.23	0.27	0.23	0.13	0.17	0.27	0.31	0.42	0.36	0.35
N1	0.15	0.17	0.12	0.12	0.15	0.16	0.15	0.20	0.16	0.15	0.17	0.15	0.22	0.12	0.11	0.17	0.15	0.19	0.18	0.15
N2	0.15	0.17	0.13	0.11	0.14	0.12	0.13	0.12	0.14	0.14	0.17	0.15	0.21	0.14	0.09	0.14	0.10	0.11	0.13	0.09
N3	0.19	0.19	0.16	0.17	0.19	0.21	0.22	0.25	0.22	0.19	0.19	0.20	0.21	0.12	0.15	0.21	0.20	0.24	0.23	0.20
N7	0.20	0.20	0.16	0.18	0.22	0.24	0.26	0.31	0.26	0.21	0.20	0.23	0.22	0.12	0.16	0.25	0.28	0.37	0.32	0.31
N9	0.23	0.23	0.18	0.20	0.27	0.26	0.31	0.34	0.30	0.25	0.24	0.28	0.23	0.14	0.18	0.27	0.30	0.39	0.34	0.33
O2'	0.26	0.26	0.18	0.11	0.28	0.17	0.30	0.21	0.28	0.25	0.26	0.30	0.27	0.20	0.14	0.27	0.23	0.41	0.32	0.32
O3'	0.29	0.31	0.25	0.22	0.24	0.22	0.19	0.19	0.19	0.26	0.29	0.24	0.39	0.26	0.25	0.26	0.21	0.45	0.29	0.30
O4'	0.23	0.24	0.17	0.19	0.31	0.24	0.35	0.33	0.32	0.25	0.26	0.33	0.23	0.12	0.17	0.26	0.33	0.50	0.40	0.39
O5'	0.24	0.23	0.26	0.24	0.24	0.24	0.26	0.25	0.25	0.24	0.23	0.25	0.22	0.30	0.27	0.23	0.24	0.34	0.24	0.25
O6	0.16	0.18	0.12	0.13	0.16	0.18	0.16	0.23	0.17	0.16	0.18	0.16	0.24	0.12	0.12	0.19	0.18	0.24	0.21	0.20
OP1	0.26	0.26	0.27	0.24	0.28	0.24	0.29	0.24	0.28	0.27	0.27	0.30	0.26	0.31	0.26	0.26	0.24	0.34	0.22	0.24
OP2	0.36	0.35	0.43	0.40	0.35	0.38	0.36	0.37	0.36	0.35	0.34	0.35	0.34	0.49	0.43	0.35	0.35	0.37	0.32	0.32
P	0.24	0.23	0.27	0.24	0.24	0.24	0.25	0.23	0.25	0.24	0.23	0.25	0.22	0.32	0.28	0.23	0.21	0.28	0.19	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.08	0.10	0.12	0.10
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.06	0.03	0.13	0.16	0.21	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.05	0.07	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.06	0.05
C4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.08	0.03	0.19	0.25	0.31	0.25
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.03	0.06	0.02	0.07	0.01	0.00	0.02	0.08	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.02	0.22	0.27	0.33	0.27
C5'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.12	0.01	0.15	0.00	0.13	0.07	0.09	0.13	0.03	0.07	0.03	0.01	0.01	0.11	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.20	0.22	0.26	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.13	0.15	0.19	0.16
N3	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.03	0.17	0.20	0.26	0.22
N4	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.08	0.03	0.20	0.27	0.33	0.27
O2	0.03	0.01	0.08	0.06	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.08	0.04	0.10	0.12	0.18	0.14
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.06	0.07	0.03	0.07	0.03	0.03	0.09	0.08	0.13	0.00	0.05	0.06	0.04	0.08	0.05	0.05
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.08	0.01	0.11	0.03	0.11	0.05	0.07	0.08	0.08	0.05	0.00	0.01	0.06	0.12	0.11	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.10	0.13	0.13	0.12
O5'	0.08	0.13	0.03	0.04	0.19	0.02	0.22	0.01	0.20	0.13	0.17	0.20	0.10	0.04	0.06	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.16	0.05	0.07	0.25	0.08	0.27	0.11	0.22	0.15	0.20	0.27	0.12	0.08	0.12	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.21	0.04	0.06	0.31	0.04	0.33	0.02	0.26	0.19	0.26	0.33	0.18	0.05	0.11	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.17	0.03	0.05	0.25	0.03	0.27	0.02	0.22	0.16	0.22	0.27	0.14	0.05	0.09	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00