Doublet Group distance statistics: 51179

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.012, 0.022, 0.033, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.031 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.015, 0.030, 0.044, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.025, 0.042, 0.060, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.042 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.019, 0.037, 0.054, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.037 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.019, 0.037, 0.055, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.037 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.024, 0.046, 0.068, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.046 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.028, 0.052, 0.076, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.052 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.040, 0.068, 0.096, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.068 std_dev=0.028
O6	A	0, 0.035, 0.068, 0.102, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.068 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.025, 0.074, 0.123, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.074 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.169, 0.294, 0.419, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.294 std_dev=0.125
C4'	A	0, 0.134, 0.262, 0.390, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.262 std_dev=0.128
C5'	A	0, 0.164, 0.358, 0.553, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.358 std_dev=0.195
P	A	0, 0.219, 0.421, 0.624, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.421 std_dev=0.203
O3'	B	0, 0.281, 0.513, 0.744, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.513 std_dev=0.231
C3'	B	0, 0.271, 0.505, 0.738, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.505 std_dev=0.233
OP2	A	0, 0.189, 0.454, 0.718, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.454 std_dev=0.264
C3'	A	0, 0.458, 0.746, 1.033, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.746 std_dev=0.287
C2'	B	0, 0.266, 0.559, 0.853, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.559 std_dev=0.293
C4'	B	0, 0.510, 0.846, 1.182, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.846 std_dev=0.336
C6	B	0, 0.571, 0.954, 1.338, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.954 std_dev=0.384
C1'	B	0, 0.481, 0.864, 1.248, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.864 std_dev=0.384
N1	B	0, 0.516, 0.907, 1.297, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.907 std_dev=0.390
O4'	B	0, 0.556, 0.951, 1.345, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.951 std_dev=0.395
OP1	A	0, 0.579, 0.997, 1.414, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.997 std_dev=0.417
O2'	B	0, 0.540, 0.964, 1.389, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.964 std_dev=0.425
C5'	B	0, 0.698, 1.127, 1.556, 1.342 max_d=1.342 avg_d=1.127 std_dev=0.429
O5'	B	0, 0.713, 1.157, 1.601, 1.425 max_d=1.425 avg_d=1.157 std_dev=0.444
C2	B	0, 0.570, 1.014, 1.458, 1.631 max_d=1.631 avg_d=1.014 std_dev=0.444
O5'	A	0, 0.681, 1.126, 1.571, 1.427 max_d=1.427 avg_d=1.126 std_dev=0.445
C5	B	0, 0.692, 1.140, 1.589, 1.561 max_d=1.561 avg_d=1.140 std_dev=0.449
O2'	A	0, 0.734, 1.196, 1.659, 1.480 max_d=1.480 avg_d=1.196 std_dev=0.462
O2	B	0, 0.614, 1.088, 1.562, 1.717 max_d=1.717 avg_d=1.088 std_dev=0.474
N3	B	0, 0.623, 1.103, 1.583, 1.754 max_d=1.754 avg_d=1.103 std_dev=0.480
C4	B	0, 0.691, 1.176, 1.660, 1.732 max_d=1.732 avg_d=1.176 std_dev=0.485
P	B	0, 0.809, 1.318, 1.826, 1.657 max_d=1.657 avg_d=1.318 std_dev=0.508
N4	B	0, 0.790, 1.342, 1.894, 1.916 max_d=1.916 avg_d=1.342 std_dev=0.552
O3'	A	0, 1.065, 1.716, 2.366, 2.038 max_d=2.038 avg_d=1.716 std_dev=0.650
OP2	B	0, 1.217, 1.966, 2.714, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.966 std_dev=0.748
OP1	B	0, 1.418, 2.314, 3.211, 2.916 max_d=2.916 avg_d=2.314 std_dev=0.897

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.10	0.04	0.19	0.08	0.07
C2	0.03	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.15	0.10	0.02	0.18	0.05	0.14	0.11	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.08	0.05	0.03	0.06	0.07	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.20	0.05	0.09
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05	0.07	0.07	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.06	0.13	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.09	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.07	0.01	0.18	0.04	0.14	0.10	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.16	0.08	0.05
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.11	0.05	0.03	0.22	0.03	0.14	0.14	0.15
C5'	0.04	0.09	0.08	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.14	0.14	0.12	0.07	0.08	0.15	0.09	0.06	0.04	0.01	0.01	0.16	0.11	0.09	0.02
C6	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.06	0.01	0.14	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.13	0.05	0.05	0.24	0.02	0.15	0.16	0.16
C8	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.06	0.02	0.14	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.04	0.22	0.03	0.14	0.10	0.13
N1	0.03	0.02	0.06	0.05	0.02	0.04	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.14	0.07	0.04	0.21	0.04	0.15	0.15	0.14
N2	0.02	0.01	0.07	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.15	0.13	0.02	0.16	0.06	0.14	0.11	0.10
N3	0.04	0.02	0.08	0.07	0.01	0.04	0.02	0.08	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.14	0.11	0.02	0.16	0.06	0.14	0.09	0.09
N7	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.05	0.04	0.23	0.03	0.14	0.15	0.16
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.09	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.02	0.17	0.04	0.16	0.08	0.09
O2'	0.01	0.15	0.01	0.02	0.11	0.05	0.11	0.06	0.13	0.06	0.14	0.15	0.14	0.09	0.05	0.00	0.03	0.04	0.12	0.13	0.22	0.05	0.09
O3'	0.08	0.10	0.01	0.00	0.07	0.02	0.05	0.04	0.05	0.06	0.07	0.13	0.11	0.05	0.05	0.03	0.00	0.07	0.12	0.05	0.13	0.12	0.09
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.07	0.00	0.06	0.06	0.21	0.11	0.10
O5'	0.10	0.18	0.12	0.12	0.18	0.02	0.22	0.01	0.24	0.22	0.21	0.16	0.16	0.23	0.17	0.12	0.12	0.06	0.00	0.25	0.01	0.02	0.01
O6	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.07	0.03	0.16	0.02	0.03	0.04	0.06	0.06	0.03	0.04	0.13	0.05	0.06	0.25	0.00	0.16	0.18	0.18
OP1	0.19	0.14	0.20	0.13	0.14	0.16	0.14	0.11	0.15	0.14	0.15	0.14	0.14	0.14	0.16	0.22	0.13	0.21	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.11	0.05	0.11	0.10	0.08	0.14	0.09	0.16	0.10	0.15	0.11	0.09	0.15	0.08	0.05	0.12	0.11	0.02	0.18	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.09	0.07	0.10	0.05	0.15	0.02	0.16	0.13	0.14	0.10	0.09	0.16	0.09	0.09	0.09	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.08	0.10	0.11	0.09	0.12	0.09	0.10	0.08	0.09	0.13	0.11	0.07	0.10	0.08	0.12	0.12	0.27	0.13
C2	0.16	0.13	0.15	0.16	0.13	0.15	0.14	0.13	0.15	0.15	0.13	0.13	0.15	0.15	0.16	0.16	0.16	0.09	0.25	0.15
C2'	0.09	0.10	0.09	0.12	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.09	0.09	0.12	0.13	0.06	0.13	0.09	0.12	0.11	0.29	0.14
C3'	0.11	0.13	0.11	0.13	0.15	0.13	0.15	0.12	0.14	0.12	0.14	0.18	0.15	0.07	0.13	0.12	0.14	0.14	0.23	0.15
C4	0.12	0.11	0.12	0.13	0.11	0.13	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11	0.12	0.12	0.12	0.13	0.13	0.14	0.12	0.28	0.15
C4'	0.09	0.11	0.09	0.12	0.14	0.11	0.14	0.10	0.12	0.11	0.12	0.17	0.13	0.06	0.12	0.10	0.13	0.14	0.26	0.15
C5	0.14	0.12	0.13	0.14	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.11	0.12	0.13	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.27	0.15
C5'	0.09	0.12	0.07	0.10	0.14	0.10	0.15	0.10	0.13	0.11	0.12	0.17	0.14	0.07	0.10	0.10	0.11	0.13	0.22	0.14
C6	0.15	0.13	0.14	0.13	0.11	0.13	0.12	0.12	0.13	0.13	0.12	0.11	0.14	0.15	0.13	0.15	0.13	0.12	0.26	0.14
C8	0.10	0.09	0.10	0.11	0.09	0.11	0.10	0.11	0.10	0.09	0.09	0.11	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.13	0.28	0.15
N1	0.17	0.15	0.16	0.15	0.14	0.15	0.14	0.13	0.15	0.16	0.14	0.13	0.16	0.17	0.15	0.17	0.15	0.10	0.25	0.14
N2	0.18	0.15	0.18	0.18	0.15	0.17	0.17	0.14	0.18	0.17	0.15	0.15	0.16	0.16	0.18	0.18	0.19	0.09	0.23	0.15
N3	0.13	0.11	0.12	0.14	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.13	0.13	0.12	0.14	0.13	0.16	0.11	0.27	0.15
N7	0.13	0.11	0.13	0.13	0.11	0.13	0.11	0.12	0.11	0.11	0.11	0.12	0.12	0.13	0.13	0.13	0.14	0.14	0.28	0.15
N9	0.10	0.08	0.10	0.10	0.09	0.10	0.10	0.11	0.09	0.09	0.08	0.11	0.11	0.10	0.11	0.10	0.12	0.12	0.28	0.14
O2'	0.13	0.13	0.11	0.12	0.11	0.15	0.11	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.16	0.12	0.13	0.15	0.09	0.09	0.27	0.09
O3'	0.15	0.17	0.15	0.17	0.20	0.16	0.20	0.15	0.18	0.16	0.18	0.22	0.19	0.12	0.17	0.15	0.20	0.19	0.24	0.20
O4'	0.07	0.09	0.08	0.09	0.12	0.09	0.12	0.08	0.10	0.08	0.10	0.15	0.11	0.07	0.10	0.08	0.12	0.13	0.27	0.14
O5'	0.15	0.18	0.15	0.16	0.19	0.16	0.19	0.17	0.18	0.17	0.18	0.21	0.20	0.16	0.16	0.16	0.19	0.22	0.33	0.22
O6	0.14	0.12	0.13	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.13	0.12	0.11	0.14	0.14	0.12	0.14	0.12	0.13	0.25	0.14
OP1	0.09	0.08	0.10	0.08	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.08	0.09	0.09	0.16	0.09	0.08	0.06	0.07	0.13	0.05
OP2	0.06	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.08	0.05	0.05	0.05	0.08	0.08	0.11	0.08	0.05	0.10	0.14	0.27	0.14
P	0.04	0.06	0.05	0.04	0.08	0.04	0.09	0.06	0.07	0.05	0.06	0.10	0.08	0.10	0.05	0.04	0.07	0.13	0.23	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.09	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.07	0.02	0.07	0.09	0.13	0.09
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.09	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.13	0.06
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.10	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.14	0.05
C4	0.04	0.02	0.03	0.06	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.05	0.10	0.10	0.19	0.11
C4'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.07	0.06	0.06	0.02	0.01	0.03	0.08	0.10	0.04
C5	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.05	0.10	0.09	0.18	0.10
C5'	0.02	0.05	0.03	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.06	0.11	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.10	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.08	0.07	0.13	0.08
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.08	0.12	0.07
N3	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.07	0.03	0.08	0.09	0.16	0.09
N4	0.05	0.04	0.04	0.07	0.01	0.07	0.02	0.11	0.03	0.04	0.03	0.00	0.06	0.04	0.08	0.05	0.12	0.12	0.22	0.13
O2	0.05	0.01	0.09	0.10	0.04	0.06	0.02	0.07	0.02	0.03	0.03	0.06	0.00	0.08	0.10	0.04	0.08	0.10	0.13	0.09
O2'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.06	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.04	0.08	0.00	0.03	0.04	0.04	0.09	0.14	0.07
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.08	0.10	0.03	0.00	0.02	0.06	0.07	0.18	0.06
O4'	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.11	0.13	0.13	0.11
O5'	0.06	0.07	0.04	0.05	0.10	0.03	0.10	0.01	0.08	0.06	0.08	0.12	0.08	0.04	0.06	0.11	0.00	0.03	0.02	0.02
OP1	0.09	0.09	0.06	0.05	0.10	0.08	0.09	0.10	0.07	0.08	0.09	0.12	0.10	0.09	0.07	0.13	0.03	0.00	0.02	0.02
OP2	0.11	0.13	0.13	0.14	0.19	0.10	0.18	0.06	0.13	0.12	0.16	0.22	0.13	0.14	0.18	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.09	0.06	0.05	0.11	0.04	0.10	0.02	0.08	0.07	0.09	0.13	0.09	0.07	0.06	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00