Doublet Group distance statistics: 51181

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.008, 0.021, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.009, 0.024, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.015, 0.035, 0.055, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.035 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.015, 0.035, 0.056, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.035 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.013, 0.035, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.015, 0.038, 0.061, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.038 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.026, 0.071, 0.116, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.071 std_dev=0.045
C2'	A	0, 0.063, 0.152, 0.241, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.152 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.135, 0.320, 0.506, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.320 std_dev=0.185
N1	B	0, 0.113, 0.386, 0.658, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.386 std_dev=0.272
C6	B	0, 0.115, 0.392, 0.669, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.392 std_dev=0.277
C2'	B	0, 0.060, 0.340, 0.620, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.340 std_dev=0.280
C5'	A	0, 0.188, 0.474, 0.760, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.474 std_dev=0.286
C2	B	0, 0.209, 0.503, 0.797, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.503 std_dev=0.294
C5	B	0, 0.210, 0.526, 0.841, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.526 std_dev=0.316
O2	B	0, 0.230, 0.547, 0.863, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.547 std_dev=0.316
C1'	B	0, 0.019, 0.338, 0.657, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.338 std_dev=0.319
C5'	B	0, 0.058, 0.380, 0.702, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.380 std_dev=0.322
C3'	B	0, 0.027, 0.356, 0.686, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.356 std_dev=0.330
O2'	B	0, 0.180, 0.511, 0.841, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.511 std_dev=0.330
O3'	B	0, 0.004, 0.357, 0.709, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.357 std_dev=0.353
N3	B	0, 0.257, 0.611, 0.965, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.611 std_dev=0.354
C4	B	0, 0.266, 0.630, 0.993, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.630 std_dev=0.364
O4'	B	0, -0.035, 0.339, 0.713, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.339 std_dev=0.374
C4'	B	0, -0.068, 0.327, 0.722, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.327 std_dev=0.395
N4	B	0, 0.335, 0.799, 1.264, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.799 std_dev=0.465
O2'	A	0, 0.147, 0.637, 1.128, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.637 std_dev=0.491
C3'	A	0, 0.148, 0.779, 1.410, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.779 std_dev=0.631
O5'	B	0, 0.293, 0.941, 1.590, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.941 std_dev=0.649
OP2	B	0, 0.355, 1.044, 1.732, 1.678 max_d=1.678 avg_d=1.044 std_dev=0.689
P	B	0, 0.312, 1.066, 1.820, 1.781 max_d=1.781 avg_d=1.066 std_dev=0.754
OP1	B	0, 0.425, 1.567, 2.710, 2.678 max_d=2.678 avg_d=1.567 std_dev=1.142
O5'	A	0, 0.620, 1.819, 3.017, 2.898 max_d=2.898 avg_d=1.819 std_dev=1.199
O3'	A	0, 0.204, 1.480, 2.756, 2.763 max_d=2.763 avg_d=1.480 std_dev=1.276
P	A	0, 0.484, 2.155, 3.827, 3.799 max_d=3.799 avg_d=2.155 std_dev=1.672
OP1	A	0, 0.449, 2.466, 4.483, 4.483 max_d=4.483 avg_d=2.466 std_dev=2.017
OP2	A	0, 0.500, 2.658, 4.815, 4.794 max_d=4.794 avg_d=2.658 std_dev=2.157

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.27	0.00	0.39	0.02	0.60	0.33	0.39
C2	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.56	0.02	0.83	0.02	0.96	1.14	0.91
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.21	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.38	0.14	0.07
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.10	0.01	0.23	0.01	0.18	0.40	0.06	0.15	0.08	0.39	0.18	0.02	0.01	0.01	0.05	0.24	0.45	0.10	0.12
C4	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.28	0.01	0.87	0.02	1.08	1.05	0.94
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.06	0.18	0.01	0.11	0.07	0.18	0.08	0.24	0.04	0.00	0.02	0.09	0.33	0.17	0.04
C5	0.01	0.00	0.02	0.23	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.09	0.01	1.06	0.01	1.38	1.37	1.21
C5'	0.07	0.06	0.21	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.14	0.14	0.10	0.03	0.03	0.17	0.06	0.05	0.21	0.01	0.01	0.17	0.38	0.36	0.02
C6	0.02	0.01	0.02	0.18	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.19	0.02	1.10	0.01	1.42	1.52	1.29
C8	0.01	0.00	0.02	0.40	0.01	0.18	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.23	0.03	0.97	0.02	1.38	1.05	1.09
N1	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.40	0.02	0.99	0.02	1.21	1.39	1.14
N2	0.02	0.00	0.03	0.15	0.01	0.11	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.72	0.03	0.73	0.01	0.81	1.06	0.80
N3	0.02	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.55	0.02	0.72	0.02	0.84	0.93	0.77
N7	0.01	0.00	0.03	0.39	0.00	0.18	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.33	0.18	0.03	1.12	0.02	1.56	1.40	1.31
N9	0.00	0.01	0.01	0.18	0.01	0.08	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.10	0.01	0.78	0.02	1.03	0.81	0.82
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.24	0.24	0.32	0.05	0.33	0.29	0.28	0.16	0.17	0.33	0.21	0.00	0.04	0.15	0.10	0.37	0.35	0.18	0.09
O3'	0.27	0.56	0.01	0.01	0.28	0.04	0.09	0.21	0.19	0.23	0.40	0.72	0.55	0.18	0.10	0.04	0.00	0.16	0.08	0.10	0.54	0.11	0.18
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.15	0.16	0.00	0.44	0.02	0.56	0.27	0.36
O5'	0.39	0.83	0.09	0.05	0.87	0.02	1.06	0.01	1.10	0.97	0.99	0.73	0.72	1.12	0.78	0.10	0.08	0.44	0.00	1.18	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.01	0.24	0.02	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.37	0.10	0.02	1.18	0.00	1.58	1.69	1.43
OP1	0.60	0.96	0.38	0.45	1.08	0.33	1.38	0.38	1.42	1.38	1.21	0.81	0.84	1.56	1.03	0.35	0.54	0.56	0.01	1.58	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	1.14	0.14	0.10	1.05	0.17	1.37	0.36	1.52	1.05	1.39	1.06	0.93	1.40	0.81	0.18	0.11	0.27	0.01	1.69	0.01	0.00	0.00
P	0.39	0.91	0.07	0.12	0.94	0.04	1.21	0.02	1.29	1.09	1.14	0.80	0.77	1.31	0.82	0.09	0.18	0.36	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.25	0.03	0.08	0.31	0.12	0.20	0.22	0.11	0.14	0.32	0.35	0.25	0.09	0.06	0.06	0.53	0.87	0.21	0.60
C2	0.07	0.13	0.07	0.07	0.03	0.12	0.13	0.18	0.15	0.06	0.16	0.04	0.23	0.06	0.02	0.12	0.52	0.60	0.15	0.57
C2'	0.09	0.26	0.07	0.03	0.32	0.04	0.23	0.13	0.15	0.17	0.33	0.37	0.26	0.13	0.03	0.06	0.55	1.00	0.22	0.69
C3'	0.36	0.35	0.40	0.41	0.22	0.36	0.15	0.32	0.21	0.31	0.31	0.18	0.40	0.42	0.41	0.33	0.97	1.60	0.18	1.13
C4	0.08	0.19	0.07	0.11	0.18	0.17	0.07	0.25	0.11	0.07	0.26	0.23	0.23	0.05	0.07	0.15	0.54	0.77	0.05	0.59
C4'	0.25	0.33	0.21	0.15	0.33	0.12	0.29	0.03	0.26	0.29	0.35	0.34	0.33	0.24	0.15	0.20	0.60	1.20	0.34	0.58
C5	0.12	0.15	0.09	0.12	0.14	0.20	0.17	0.28	0.19	0.10	0.22	0.19	0.20	0.04	0.08	0.20	0.52	0.81	0.08	0.58
C5'	0.03	0.09	0.07	0.08	0.15	0.13	0.11	0.17	0.04	0.04	0.14	0.20	0.08	0.08	0.11	0.08	0.35	1.16	0.44	0.37
C6	0.13	0.12	0.09	0.11	0.13	0.19	0.24	0.25	0.23	0.13	0.16	0.12	0.19	0.05	0.06	0.20	0.53	0.76	0.01	0.59
C8	0.08	0.18	0.07	0.13	0.24	0.21	0.10	0.30	0.10	0.08	0.27	0.33	0.21	0.05	0.10	0.17	0.49	0.91	0.25	0.55
N1	0.11	0.11	0.09	0.09	0.11	0.15	0.22	0.22	0.21	0.12	0.12	0.09	0.19	0.05	0.04	0.17	0.52	0.66	0.10	0.58
N2	0.05	0.10	0.05	0.04	0.03	0.07	0.12	0.13	0.12	0.04	0.09	0.03	0.23	0.07	0.03	0.08	0.49	0.48	0.25	0.54
N3	0.05	0.20	0.05	0.08	0.15	0.12	0.03	0.19	0.07	0.05	0.25	0.17	0.25	0.06	0.03	0.11	0.54	0.65	0.09	0.58
N7	0.12	0.15	0.09	0.14	0.18	0.22	0.15	0.31	0.17	0.10	0.23	0.26	0.19	0.04	0.10	0.21	0.50	0.88	0.19	0.56
N9	0.05	0.21	0.05	0.11	0.26	0.17	0.11	0.26	0.06	0.08	0.29	0.32	0.23	0.06	0.08	0.13	0.52	0.86	0.17	0.58
O2'	0.10	0.24	0.17	0.29	0.35	0.35	0.20	0.48	0.05	0.08	0.36	0.46	0.24	0.16	0.28	0.20	0.11	0.39	0.54	0.25
O3'	0.87	0.82	0.99	1.00	0.56	0.84	0.45	0.75	0.56	0.76	0.73	0.48	0.94	1.03	0.99	0.77	1.38	1.67	0.60	1.51
O4'	0.06	0.26	0.03	0.13	0.36	0.18	0.29	0.29	0.18	0.17	0.34	0.40	0.23	0.05	0.11	0.10	0.42	0.86	0.41	0.41
O5'	0.41	0.65	0.34	0.19	0.82	0.18	0.83	0.19	0.69	0.59	0.74	0.87	0.59	0.38	0.22	0.31	0.64	1.88	0.14	0.90
O6	0.14	0.12	0.09	0.11	0.17	0.20	0.28	0.26	0.25	0.15	0.14	0.18	0.17	0.05	0.06	0.22	0.52	0.78	0.01	0.59
OP1	0.24	0.61	0.18	0.10	0.91	0.15	0.85	0.30	0.61	0.50	0.79	1.06	0.52	0.24	0.11	0.08	0.66	2.01	0.12	0.88
OP2	0.57	0.96	0.48	0.26	1.22	0.17	1.11	0.13	0.85	0.80	1.14	1.36	0.92	0.57	0.31	0.38	0.64	1.92	0.17	0.93
P	0.34	0.69	0.27	0.07	0.93	0.06	0.88	0.20	0.66	0.57	0.83	1.04	0.62	0.33	0.09	0.20	0.65	1.94	0.11	0.88

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.31	0.41	0.11	0.27
C2	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.05	0.04	0.49	0.62	0.20	0.48
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.08	0.00	0.01	0.01	0.33	0.29	0.23	0.32
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.19	0.07
C4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.58	0.90	0.09	0.58
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.17	0.01	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.55	0.94	0.02	0.53
C5'	0.02	0.02	0.05	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.41	0.14	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.49	0.81	0.04	0.44
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.03	0.45	0.63	0.10	0.42
N3	0.00	0.00	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.03	0.56	0.76	0.19	0.56
N4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.04	0.03	0.62	0.98	0.10	0.64
O2	0.02	0.00	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.14	0.05	0.04	0.42	0.46	0.28	0.43
O2'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03	0.06	0.02	0.04	0.09	0.06	0.14	0.00	0.02	0.01	0.29	0.17	0.32	0.33
O3'	0.04	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.00	0.04	0.13	0.22	0.20	0.07
O4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.22	0.44	0.02	0.16
O5'	0.31	0.49	0.33	0.03	0.58	0.03	0.55	0.01	0.49	0.45	0.56	0.62	0.42	0.29	0.13	0.22	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.41	0.62	0.29	0.01	0.90	0.17	0.94	0.41	0.81	0.63	0.76	0.98	0.46	0.17	0.22	0.44	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.20	0.23	0.19	0.09	0.01	0.02	0.14	0.04	0.10	0.19	0.10	0.28	0.32	0.20	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.27	0.48	0.32	0.07	0.58	0.03	0.53	0.01	0.44	0.42	0.56	0.64	0.43	0.33	0.07	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00