Doublet Group distance statistics: 51182

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.004, 0.022, 0.041, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.009, 0.031, 0.052, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.032 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.013, 0.047, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.047 std_dev=0.034
N2	A	0, 0.017, 0.058, 0.098, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.058 std_dev=0.041
C2'	B	0, 0.146, 0.512, 0.879, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.512 std_dev=0.367
O3'	A	0, 0.316, 1.082, 1.848, 1.661 max_d=1.661 avg_d=1.082 std_dev=0.766
O4'	B	0, 0.316, 1.093, 1.871, 1.742 max_d=1.742 avg_d=1.093 std_dev=0.778
C1'	B	0, 0.328, 1.124, 1.920, 1.744 max_d=1.744 avg_d=1.124 std_dev=0.796
O2'	B	0, 0.359, 1.227, 2.095, 1.846 max_d=1.846 avg_d=1.227 std_dev=0.868
C3'	B	0, 0.392, 1.343, 2.294, 2.080 max_d=2.080 avg_d=1.343 std_dev=0.951
O4'	A	0, 0.452, 1.543, 2.634, 2.330 max_d=2.330 avg_d=1.543 std_dev=1.091
C3'	A	0, 0.477, 1.631, 2.785, 2.482 max_d=2.482 avg_d=1.631 std_dev=1.154
C2'	A	0, 0.490, 1.675, 2.859, 2.515 max_d=2.515 avg_d=1.675 std_dev=1.184
C4'	A	0, 0.569, 1.943, 3.317, 2.925 max_d=2.925 avg_d=1.943 std_dev=1.374
O3'	B	0, 0.607, 2.077, 3.547, 3.195 max_d=3.195 avg_d=2.077 std_dev=1.470
C4'	B	0, 0.630, 2.155, 3.680, 3.299 max_d=3.299 avg_d=2.155 std_dev=1.525
O2'	A	0, 0.801, 2.735, 4.669, 4.113 max_d=4.113 avg_d=2.735 std_dev=1.934
N1	B	0, 0.882, 3.012, 5.143, 4.586 max_d=4.586 avg_d=3.012 std_dev=2.131
C5'	A	0, 1.081, 3.689, 6.298, 5.541 max_d=5.541 avg_d=3.689 std_dev=2.609
C5'	B	0, 1.151, 3.931, 6.712, 5.981 max_d=5.981 avg_d=3.931 std_dev=2.781
C6	B	0, 1.179, 4.029, 6.878, 6.118 max_d=6.118 avg_d=4.029 std_dev=2.849
C2	B	0, 1.293, 4.416, 7.539, 6.676 max_d=6.676 avg_d=4.416 std_dev=3.123
O5'	B	0, 1.337, 4.568, 7.800, 6.966 max_d=6.966 avg_d=4.568 std_dev=3.232
O2	B	0, 1.358, 4.636, 7.915, 6.983 max_d=6.983 avg_d=4.636 std_dev=3.278
O5'	A	0, 1.439, 4.912, 8.386, 7.385 max_d=7.385 avg_d=4.912 std_dev=3.474
C5	B	0, 1.686, 5.757, 9.828, 8.712 max_d=8.712 avg_d=5.757 std_dev=4.071
N3	B	0, 1.771, 6.047, 10.324, 9.131 max_d=9.131 avg_d=6.047 std_dev=4.276
P	B	0, 1.869, 6.386, 10.903, 9.716 max_d=9.716 avg_d=6.386 std_dev=4.517
C4	B	0, 1.923, 6.567, 11.211, 9.923 max_d=9.923 avg_d=6.567 std_dev=4.644
P	A	0, 1.995, 6.810, 11.625, 10.235 max_d=10.235 avg_d=6.810 std_dev=4.815
OP2	B	0, 2.169, 7.412, 12.655, 11.270 max_d=11.270 avg_d=7.412 std_dev=5.243
OP1	A	0, 2.179, 7.440, 12.701, 11.204 max_d=11.204 avg_d=7.440 std_dev=5.261
OP1	B	0, 2.202, 7.521, 12.840, 11.385 max_d=11.385 avg_d=7.521 std_dev=5.319
OP2	A	0, 2.213, 7.559, 12.906, 11.442 max_d=11.442 avg_d=7.559 std_dev=5.346
N4	B	0, 2.442, 8.338, 14.234, 12.579 max_d=12.579 avg_d=8.338 std_dev=5.896

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.27	0.00	0.50	0.09	0.24
C2	0.02	0.00	0.03	0.14	0.01	0.38	0.00	0.73	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.40	0.08	0.31	0.38	0.00	0.04	0.93	0.54
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.32	0.33	0.03
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.07	0.11	0.18	0.14	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.16	0.05	0.04	0.43	0.15
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.16	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.15	0.16	0.00	0.60	0.16	0.14
C4'	0.01	0.38	0.01	0.00	0.16	0.00	0.04	0.00	0.13	0.24	0.27	0.50	0.37	0.16	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.18	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.04	0.45	0.01	0.99	0.26	0.49
C5'	0.02	0.73	0.04	0.01	0.29	0.00	0.09	0.00	0.25	0.38	0.53	0.97	0.68	0.27	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.24	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.13	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.28	0.00	0.84	0.07	0.29
C8	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.24	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.09	0.23	0.95	0.01	1.39	0.90	1.05
N1	0.02	0.00	0.03	0.11	0.01	0.27	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.04	0.22	0.10	0.00	0.38	0.54	0.19
N2	0.03	0.00	0.04	0.18	0.01	0.50	0.00	0.97	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.53	0.13	0.38	0.72	0.00	0.44	1.43	0.98
N3	0.02	0.00	0.03	0.14	0.00	0.37	0.00	0.68	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.40	0.07	0.31	0.32	0.00	0.06	0.80	0.44
N7	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.16	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.08	0.15	0.87	0.02	1.45	0.86	1.01
N9	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.47	0.01	0.84	0.27	0.48
O2'	0.01	0.40	0.00	0.02	0.14	0.01	0.04	0.04	0.10	0.22	0.26	0.53	0.40	0.17	0.03	0.00	0.02	0.00	0.10	0.05	0.26	0.39	0.02
O3'	0.04	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.04	0.13	0.07	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.20	0.03	0.16	0.39	0.20
O4'	0.00	0.31	0.01	0.00	0.15	0.00	0.04	0.01	0.10	0.23	0.22	0.38	0.31	0.15	0.02	0.00	0.02	0.00	0.29	0.06	0.40	0.16	0.25
O5'	0.27	0.38	0.10	0.16	0.16	0.01	0.45	0.01	0.28	0.95	0.10	0.72	0.32	0.87	0.47	0.10	0.20	0.29	0.00	0.41	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.03	0.06	0.41	0.00	1.05	0.24	0.47
OP1	0.50	0.04	0.32	0.04	0.60	0.08	0.99	0.13	0.84	1.39	0.38	0.44	0.06	1.45	0.84	0.26	0.16	0.40	0.01	1.05	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.93	0.33	0.43	0.16	0.18	0.26	0.24	0.07	0.90	0.54	1.43	0.80	0.86	0.27	0.39	0.39	0.16	0.01	0.24	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.54	0.03	0.15	0.14	0.02	0.49	0.02	0.29	1.05	0.19	0.98	0.44	1.01	0.48	0.02	0.20	0.25	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	1.32	0.11	0.52	1.25	0.87	0.67	1.39	0.39	0.68	1.57	1.47	1.59	0.35	0.66	0.31	1.14	1.87	1.00	1.30
C2	0.37	1.40	0.16	0.38	1.77	0.64	1.36	0.76	0.97	0.95	1.80	2.00	1.31	0.14	0.72	0.13	0.29	0.60	0.25	0.19
C2'	0.13	1.02	0.07	0.54	0.89	1.02	0.34	1.58	0.11	0.42	1.21	1.06	1.31	0.38	0.57	0.55	1.32	2.13	1.22	1.55
C3'	0.40	1.18	0.33	0.24	0.88	0.71	0.33	1.38	0.18	0.59	1.28	0.98	1.56	0.69	0.20	0.28	1.24	2.20	1.35	1.58
C4	0.38	1.49	0.15	0.44	1.73	0.76	1.19	1.06	0.80	0.91	1.89	2.02	1.56	0.24	0.72	0.20	0.65	1.16	0.24	0.65
C4'	1.01	1.85	0.84	0.27	1.53	0.13	0.97	0.77	0.81	1.23	1.95	1.62	2.24	1.12	0.26	0.37	0.65	1.60	0.77	0.97
C5	0.39	1.56	0.16	0.41	1.99	0.70	1.45	0.93	0.98	1.00	2.05	2.37	1.53	0.17	0.73	0.15	0.47	0.92	0.06	0.41
C5'	1.65	2.42	1.52	0.98	2.05	0.55	1.54	0.10	1.42	1.84	2.46	2.10	2.80	1.75	0.98	1.00	0.07	0.94	0.11	0.30
C6	0.39	1.53	0.16	0.36	2.15	0.61	1.68	0.71	1.15	1.05	2.09	2.58	1.38	0.08	0.73	0.09	0.20	0.53	0.45	0.06
C8	0.38	1.54	0.15	0.46	1.77	0.79	1.18	1.17	0.76	0.90	1.96	2.13	1.65	0.26	0.71	0.22	0.80	1.42	0.44	0.84
N1	0.37	1.45	0.16	0.34	2.06	0.57	1.65	0.62	1.16	1.03	1.97	2.41	1.26	0.05	0.71	0.07	0.10	0.36	0.56	0.06
N2	0.33	1.22	0.15	0.34	1.56	0.57	1.29	0.59	0.96	0.89	1.54	1.71	1.06	0.09	0.69	0.11	0.13	0.34	0.42	0.02
N3	0.37	1.41	0.15	0.44	1.57	0.75	1.09	1.02	0.75	0.87	1.73	1.78	1.47	0.26	0.71	0.20	0.62	1.05	0.21	0.59
N7	0.39	1.58	0.16	0.43	1.98	0.73	1.41	1.02	0.94	0.99	2.08	2.40	1.60	0.19	0.73	0.17	0.58	1.11	0.10	0.56
N9	0.36	1.47	0.14	0.48	1.59	0.81	1.01	1.22	0.65	0.84	1.82	1.87	1.63	0.29	0.70	0.24	0.88	1.50	0.57	0.94
O2'	0.59	0.29	0.63	1.24	0.21	1.73	0.33	2.29	0.59	0.30	0.50	0.41	0.56	0.28	1.25	1.26	2.01	2.70	1.82	2.18
O3'	0.05	0.73	0.13	0.72	0.39	1.14	0.20	1.84	0.34	0.13	0.82	0.49	1.15	0.27	0.66	0.68	1.80	2.77	2.00	2.17
O4'	0.91	1.89	0.66	0.05	1.72	0.29	1.13	0.85	0.89	1.24	2.09	1.88	2.22	0.87	0.11	0.29	0.67	1.49	0.64	0.88
O5'	1.78	2.41	1.63	1.19	2.04	0.79	1.58	0.18	1.50	1.91	2.42	2.07	2.79	1.80	1.24	1.19	0.30	0.63	0.14	0.03
O6	0.38	1.53	0.15	0.33	2.28	0.56	1.83	0.61	1.26	1.08	2.13	2.79	1.32	0.01	0.72	0.05	0.07	0.33	0.68	0.13
OP1	1.82	2.21	1.78	1.58	1.87	1.13	1.52	0.58	1.49	1.85	2.18	1.87	2.52	1.84	1.78	1.33	0.68	0.21	0.49	0.35
OP2	2.69	3.11	2.68	2.31	2.82	1.82	2.48	1.28	2.44	2.76	3.09	2.82	3.35	2.85	2.33	2.11	1.43	0.55	1.27	1.11
P	2.29	2.74	2.21	1.88	2.37	1.43	2.00	0.85	1.96	2.34	2.71	2.37	3.07	2.32	1.99	1.74	0.95	0.05	0.76	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.12	0.03	0.29	0.10
C2	0.00	0.00	0.08	0.17	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.05	0.03	0.02	0.08	0.19	0.03
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.09	0.10	0.11	0.01	0.05	0.03	0.16	0.00	0.01	0.01	0.24	0.20	0.39	0.24
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.25	0.00	0.24	0.01	0.20	0.16	0.22	0.27	0.12	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04
C4	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.15	0.03	0.13	0.17	0.10	0.14
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.13	0.00	0.16	0.00	0.15	0.08	0.08	0.14	0.02	0.19	0.01	0.00	0.02	0.08	0.07	0.02
C5	0.00	0.00	0.09	0.24	0.00	0.16	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.19	0.07	0.15	0.18	0.13	0.16
C5'	0.03	0.04	0.10	0.01	0.15	0.00	0.18	0.00	0.15	0.06	0.09	0.17	0.02	0.08	0.13	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.00	0.00	0.11	0.20	0.00	0.15	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.14	0.08	0.08	0.12	0.22	0.07
N1	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.04	0.01	0.01	0.07	0.24	0.01
N3	0.00	0.00	0.05	0.22	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.08	0.02	0.08	0.12	0.14	0.08
N4	0.00	0.01	0.03	0.27	0.00	0.14	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.19	0.03	0.17	0.20	0.04	0.19
O2	0.01	0.00	0.16	0.12	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.14	0.07	0.03	0.05	0.21	0.03
O2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.28	0.19	0.29	0.08	0.24	0.16	0.22	0.31	0.06	0.00	0.02	0.13	0.14	0.08	0.38	0.16
O3'	0.15	0.05	0.01	0.01	0.15	0.01	0.19	0.13	0.14	0.04	0.08	0.19	0.14	0.02	0.00	0.09	0.21	0.23	0.25	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.03	0.07	0.13	0.09	0.00	0.09	0.09	0.23	0.08
O5'	0.12	0.02	0.24	0.03	0.13	0.02	0.15	0.01	0.08	0.01	0.08	0.17	0.03	0.14	0.21	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.08	0.20	0.02	0.17	0.08	0.18	0.09	0.12	0.07	0.12	0.20	0.05	0.08	0.23	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.19	0.39	0.04	0.10	0.07	0.13	0.02	0.22	0.24	0.14	0.04	0.21	0.38	0.25	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.03	0.24	0.04	0.14	0.02	0.16	0.01	0.07	0.01	0.08	0.19	0.03	0.16	0.22	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00