Doublet Group distance statistics: 51192

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 14, 6, 1, 4, 0, 1, 0, 1, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.004, 0.021, 0.037, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.003, 0.021, 0.039, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.021 std_dev=0.018
C2	A	0, -0.002, 0.017, 0.036, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.017 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.003, 0.023, 0.044, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.023 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.001, 0.023, 0.045, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.023 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.008, 0.030, 0.053, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.030 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.002, 0.033, 0.064, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.033 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.003, 0.037, 0.071, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.037 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.045, 0.216, 0.387, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.216 std_dev=0.171
O4'	A	0, 0.041, 0.213, 0.386, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.213 std_dev=0.172
C4'	B	0, 0.078, 0.273, 0.469, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.273 std_dev=0.195
O4'	B	0, 0.073, 0.277, 0.480, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.277 std_dev=0.203
O2'	A	0, 0.042, 0.263, 0.484, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.263 std_dev=0.221
C4'	A	0, 0.105, 0.343, 0.581, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.343 std_dev=0.238
C3'	A	0, 0.099, 0.360, 0.620, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.360 std_dev=0.261
C5'	B	0, 0.087, 0.361, 0.635, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.361 std_dev=0.274
C3'	B	0, 0.041, 0.343, 0.645, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.343 std_dev=0.302
O5'	B	0, 0.102, 0.405, 0.707, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.405 std_dev=0.303
C1'	B	0, 0.040, 0.348, 0.657, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.348 std_dev=0.308
O5'	A	0, 0.223, 0.537, 0.851, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.537 std_dev=0.314
O2'	B	0, 0.053, 0.370, 0.686, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.370 std_dev=0.316
C2'	B	0, 0.028, 0.374, 0.721, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.374 std_dev=0.347
O3'	A	0, 0.137, 0.499, 0.860, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.499 std_dev=0.361
O3'	B	0, 0.015, 0.391, 0.767, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.391 std_dev=0.376
N3	B	0, 0.077, 0.461, 0.845, 1.561 max_d=1.561 avg_d=0.461 std_dev=0.384
N9	B	0, 0.001, 0.417, 0.832, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.417 std_dev=0.415
P	B	0, 0.111, 0.528, 0.945, 2.086 max_d=2.086 avg_d=0.528 std_dev=0.417
P	A	0, 0.145, 0.565, 0.986, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.565 std_dev=0.420
C4	B	0, 0.017, 0.460, 0.904, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.460 std_dev=0.443
C2	B	0, 0.067, 0.521, 0.975, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.521 std_dev=0.454
C5'	A	0, 0.123, 0.585, 1.048, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.585 std_dev=0.463
OP1	B	0, 0.124, 0.630, 1.136, 2.388 max_d=2.388 avg_d=0.630 std_dev=0.506
OP2	B	0, 0.054, 0.562, 1.070, 2.526 max_d=2.526 avg_d=0.562 std_dev=0.508
C8	B	0, -0.058, 0.471, 1.000, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.471 std_dev=0.529
N1	B	0, 0.018, 0.573, 1.128, 2.166 max_d=2.166 avg_d=0.573 std_dev=0.555
C5	B	0, -0.032, 0.523, 1.078, 2.092 max_d=2.092 avg_d=0.523 std_dev=0.555
C6	B	0, -0.027, 0.576, 1.179, 2.310 max_d=2.310 avg_d=0.576 std_dev=0.603
N7	B	0, -0.071, 0.537, 1.145, 2.202 max_d=2.202 avg_d=0.537 std_dev=0.608
N6	B	0, -0.057, 0.645, 1.346, 2.663 max_d=2.663 avg_d=0.645 std_dev=0.702
OP2	A	0, -0.063, 0.762, 1.586, 2.586 max_d=2.586 avg_d=0.762 std_dev=0.824
OP1	A	0, -0.029, 0.986, 2.001, 3.251 max_d=3.251 avg_d=0.986 std_dev=1.015

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.51	0.22	0.08
C2	0.05	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.16	0.04	0.20	0.02	0.86	0.56	0.15
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.07	0.09	0.13	0.11	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.16	0.06	0.28	0.27	0.08
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.13	0.11	0.16	0.12	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.23	0.09	0.14	0.28	0.13
C4	0.03	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.20	0.02	0.83	0.53	0.13
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.06	0.07	0.05	0.08	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.09	0.15	0.22	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.23	0.02	0.97	0.68	0.17
C5'	0.02	0.11	0.02	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.15	0.11	0.13	0.11	0.09	0.14	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.17	0.23	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.09	0.03	0.24	0.01	1.03	0.73	0.18
C8	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.23	0.04	0.87	0.57	0.14
N1	0.04	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.13	0.03	0.22	0.01	0.97	0.67	0.17
N2	0.06	0.01	0.13	0.16	0.01	0.07	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.21	0.06	0.19	0.02	0.83	0.54	0.15
N3	0.05	0.00	0.11	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.05	0.18	0.02	0.77	0.48	0.13
N7	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.25	0.04	1.01	0.73	0.18
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.18	0.03	0.73	0.43	0.11
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.07	0.06	0.07	0.08	0.05	0.11	0.16	0.11	0.05	0.02	0.00	0.04	0.05	0.09	0.08	0.23	0.18	0.08
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.09	0.14	0.13	0.21	0.15	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.22	0.10	0.31	0.28	0.17
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.04	0.42	0.18	0.10
O5'	0.09	0.20	0.16	0.23	0.20	0.02	0.23	0.01	0.24	0.23	0.22	0.19	0.18	0.25	0.18	0.09	0.22	0.08	0.00	0.25	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.09	0.02	0.09	0.02	0.17	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.08	0.10	0.04	0.25	0.00	1.10	0.81	0.21
OP1	0.51	0.86	0.28	0.14	0.83	0.15	0.97	0.23	1.03	0.87	0.97	0.83	0.77	1.01	0.73	0.23	0.31	0.42	0.02	1.10	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.56	0.27	0.28	0.53	0.22	0.68	0.34	0.73	0.57	0.67	0.54	0.48	0.73	0.43	0.18	0.28	0.18	0.02	0.81	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.08	0.13	0.13	0.04	0.17	0.02	0.18	0.14	0.17	0.15	0.13	0.18	0.11	0.08	0.17	0.10	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.16	0.15	0.15	0.16	0.14	0.17	0.14	0.15	0.16	0.16	0.14	0.14	0.15	0.18	0.14	0.17	0.15	0.22	0.16	0.15
C2	0.15	0.16	0.13	0.09	0.16	0.13	0.18	0.22	0.18	0.20	0.17	0.15	0.20	0.20	0.17	0.19	0.12	0.08	0.18	0.19	0.12	0.13
C2'	0.07	0.13	0.08	0.09	0.07	0.08	0.07	0.08	0.09	0.08	0.12	0.12	0.08	0.07	0.07	0.10	0.11	0.10	0.08	0.14	0.09	0.08
C3'	0.07	0.13	0.07	0.10	0.07	0.10	0.06	0.11	0.08	0.07	0.11	0.11	0.08	0.06	0.06	0.09	0.14	0.10	0.13	0.13	0.11	0.11
C4	0.11	0.14	0.12	0.09	0.12	0.11	0.13	0.18	0.14	0.14	0.14	0.13	0.15	0.14	0.12	0.18	0.10	0.10	0.15	0.20	0.12	0.12
C4'	0.18	0.26	0.18	0.13	0.22	0.12	0.21	0.10	0.23	0.18	0.25	0.24	0.22	0.19	0.19	0.19	0.14	0.15	0.10	0.15	0.13	0.10
C5	0.13	0.15	0.12	0.09	0.15	0.12	0.17	0.20	0.18	0.18	0.17	0.14	0.20	0.19	0.15	0.18	0.11	0.09	0.16	0.22	0.12	0.13
C5'	0.18	0.33	0.18	0.11	0.25	0.09	0.24	0.08	0.28	0.17	0.32	0.30	0.27	0.20	0.20	0.20	0.13	0.13	0.09	0.13	0.10	0.08
C6	0.16	0.18	0.13	0.09	0.19	0.12	0.22	0.23	0.22	0.24	0.20	0.17	0.25	0.25	0.19	0.19	0.12	0.09	0.19	0.23	0.13	0.15
C8	0.11	0.15	0.13	0.12	0.12	0.13	0.13	0.17	0.14	0.13	0.15	0.14	0.15	0.13	0.12	0.17	0.12	0.12	0.14	0.22	0.13	0.14
N1	0.17	0.18	0.14	0.10	0.19	0.13	0.22	0.24	0.23	0.25	0.20	0.17	0.25	0.25	0.20	0.19	0.13	0.09	0.20	0.23	0.13	0.15
N2	0.18	0.18	0.15	0.12	0.18	0.15	0.20	0.25	0.20	0.22	0.19	0.17	0.22	0.22	0.19	0.20	0.15	0.11	0.21	0.19	0.12	0.13
N3	0.11	0.13	0.12	0.08	0.12	0.11	0.13	0.18	0.14	0.14	0.13	0.13	0.14	0.14	0.12	0.18	0.09	0.09	0.15	0.18	0.11	0.11
N7	0.12	0.15	0.12	0.10	0.14	0.12	0.16	0.19	0.17	0.17	0.16	0.14	0.18	0.18	0.14	0.17	0.12	0.10	0.16	0.23	0.12	0.14
N9	0.11	0.14	0.13	0.11	0.11	0.13	0.12	0.16	0.12	0.12	0.14	0.13	0.13	0.12	0.11	0.17	0.11	0.13	0.14	0.21	0.13	0.13
O2'	0.11	0.13	0.10	0.13	0.07	0.16	0.07	0.17	0.07	0.14	0.11	0.10	0.07	0.12	0.10	0.10	0.15	0.15	0.16	0.21	0.16	0.15
O3'	0.09	0.13	0.08	0.15	0.08	0.17	0.08	0.20	0.09	0.10	0.11	0.11	0.09	0.09	0.09	0.08	0.19	0.15	0.23	0.17	0.19	0.18
O4'	0.23	0.29	0.22	0.17	0.25	0.17	0.25	0.16	0.26	0.22	0.28	0.27	0.25	0.23	0.23	0.22	0.16	0.21	0.16	0.21	0.18	0.15
O5'	0.22	0.26	0.20	0.18	0.22	0.22	0.22	0.22	0.22	0.22	0.25	0.24	0.22	0.22	0.22	0.21	0.17	0.24	0.21	0.25	0.22	0.21
O6	0.17	0.20	0.14	0.10	0.21	0.13	0.25	0.24	0.26	0.27	0.23	0.18	0.29	0.29	0.21	0.19	0.13	0.09	0.21	0.26	0.15	0.17
OP1	0.49	0.36	0.37	0.36	0.44	0.45	0.47	0.45	0.45	0.55	0.39	0.38	0.47	0.54	0.49	0.36	0.29	0.54	0.46	0.36	0.44	0.46
OP2	0.35	0.25	0.28	0.29	0.31	0.39	0.31	0.44	0.28	0.36	0.26	0.27	0.28	0.35	0.34	0.27	0.25	0.42	0.39	0.49	0.39	0.42
P	0.13	0.24	0.14	0.12	0.16	0.11	0.15	0.11	0.18	0.12	0.23	0.21	0.17	0.12	0.13	0.14	0.14	0.12	0.11	0.15	0.12	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.09	0.12
C2	0.04	0.00	0.16	0.20	0.01	0.10	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.12	0.24	0.03	0.19	0.24	0.30	0.29
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.13	0.16	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.08	0.06
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.10	0.12	0.16	0.18	0.09	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.14	0.09	0.05
C4	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.14	0.18	0.21	0.22
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.06	0.09	0.09	0.07	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.07	0.04	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.13	0.20	0.21	0.23
C5'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.10	0.08	0.12	0.11	0.10	0.08	0.05	0.03	0.04	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.12	0.02	0.15	0.24	0.27	0.27
C8	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.18	0.13	0.14	0.13
N1	0.03	0.00	0.13	0.16	0.02	0.09	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.10	0.19	0.03	0.18	0.26	0.31	0.30
N3	0.03	0.01	0.16	0.18	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.21	0.03	0.17	0.20	0.26	0.25
N6	0.03	0.02	0.07	0.09	0.02	0.07	0.02	0.10	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.10	0.03	0.14	0.26	0.27	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.15	0.17	0.17	0.18
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.12	0.12	0.13	0.16
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.11	0.07	0.05
O3'	0.01	0.24	0.01	0.01	0.10	0.02	0.07	0.04	0.12	0.13	0.19	0.21	0.10	0.11	0.04	0.03	0.00	0.02	0.09	0.25	0.14	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.13	0.08	0.12
O5'	0.09	0.19	0.05	0.04	0.14	0.02	0.13	0.01	0.15	0.18	0.18	0.17	0.14	0.15	0.12	0.04	0.09	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.24	0.09	0.14	0.18	0.07	0.20	0.05	0.24	0.13	0.26	0.20	0.26	0.17	0.12	0.11	0.25	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.30	0.08	0.09	0.21	0.04	0.21	0.02	0.27	0.14	0.31	0.26	0.27	0.17	0.13	0.07	0.14	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.29	0.06	0.05	0.22	0.04	0.23	0.02	0.27	0.13	0.30	0.25	0.28	0.18	0.16	0.05	0.11	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00