Doublet Group distance statistics: 51196

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 7, 11, 2, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.024, 0.043, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.028 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.037 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.034 std_dev=0.029
O2'	A	0, 0.084, 0.160, 0.237, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.160 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.025, 0.106, 0.187, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.106 std_dev=0.081
O4'	A	0, -0.014, 0.108, 0.229, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.108 std_dev=0.122
C4'	A	0, 0.046, 0.226, 0.407, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.226 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.015, 0.199, 0.382, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.199 std_dev=0.184
O2'	B	0, 0.098, 0.293, 0.488, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.293 std_dev=0.195
C5'	A	0, 0.100, 0.361, 0.622, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.361 std_dev=0.261
O3'	A	0, 0.024, 0.300, 0.576, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.300 std_dev=0.276
C2'	B	0, 0.026, 0.455, 0.884, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.455 std_dev=0.429
N9	B	0, 0.024, 0.505, 0.986, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.505 std_dev=0.481
O3'	B	0, 0.011, 0.531, 1.052, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.531 std_dev=0.521
C8	B	0, 0.038, 0.567, 1.096, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.567 std_dev=0.529
N7	B	0, 0.044, 0.575, 1.105, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.575 std_dev=0.531
C1'	B	0, -0.105, 0.633, 1.372, 2.199 max_d=2.199 avg_d=0.633 std_dev=0.739
C3'	B	0, -0.152, 0.721, 1.594, 2.531 max_d=2.531 avg_d=0.721 std_dev=0.873
C5	B	0, -0.188, 0.773, 1.733, 2.848 max_d=2.848 avg_d=0.773 std_dev=0.961
C4	B	0, -0.267, 0.802, 1.871, 3.044 max_d=3.044 avg_d=0.802 std_dev=1.069
O5'	A	0, -0.303, 0.830, 1.964, 3.149 max_d=3.149 avg_d=0.830 std_dev=1.134
O4'	B	0, -0.321, 0.935, 2.191, 3.558 max_d=3.558 avg_d=0.935 std_dev=1.256
P	A	0, -0.350, 0.947, 2.245, 3.498 max_d=3.498 avg_d=0.947 std_dev=1.297
C4'	B	0, -0.364, 0.994, 2.352, 3.828 max_d=3.828 avg_d=0.994 std_dev=1.358
C6	B	0, -0.545, 1.172, 2.890, 4.724 max_d=4.724 avg_d=1.172 std_dev=1.717
N6	B	0, -0.538, 1.265, 3.068, 5.022 max_d=5.022 avg_d=1.265 std_dev=1.803
N3	B	0, -0.683, 1.201, 3.086, 4.944 max_d=4.944 avg_d=1.201 std_dev=1.885
OP2	A	0, -0.643, 1.307, 3.256, 5.187 max_d=5.187 avg_d=1.307 std_dev=1.949
OP1	A	0, -0.649, 1.350, 3.349, 5.400 max_d=5.400 avg_d=1.350 std_dev=1.999
C5'	B	0, -0.672, 1.411, 3.494, 5.738 max_d=5.738 avg_d=1.411 std_dev=2.083
O5'	B	0, -0.838, 1.589, 4.016, 6.475 max_d=6.475 avg_d=1.589 std_dev=2.427
N1	B	0, -0.950, 1.547, 4.044, 6.525 max_d=6.525 avg_d=1.547 std_dev=2.497
C2	B	0, -0.990, 1.541, 4.072, 6.507 max_d=6.507 avg_d=1.541 std_dev=2.531
OP1	B	0, -1.118, 2.150, 5.417, 8.717 max_d=8.717 avg_d=2.150 std_dev=3.268
P	B	0, -1.196, 2.159, 5.513, 8.866 max_d=8.866 avg_d=2.159 std_dev=3.354
OP2	B	0, -1.334, 2.442, 6.218, 10.105 max_d=10.105 avg_d=2.442 std_dev=3.776

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.01	0.08	0.32	0.20
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.16	0.03	0.43	0.01	0.28	0.91	0.48
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.03	0.09	0.11	0.09	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.24	0.08	0.28	0.16	0.21
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.11	0.07	0.12	0.14	0.10	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.31	0.12	0.46	0.06	0.23
C4	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.44	0.01	0.29	0.89	0.49
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.21	0.01
C5	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.55	0.01	0.39	1.19	0.63
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.04	0.03	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.32	0.35	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.58	0.00	0.42	1.29	0.67
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.53	0.01	0.37	1.04	0.58
N1	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.17	0.02	0.51	0.01	0.36	1.14	0.59
N2	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.19	0.03	0.38	0.01	0.24	0.82	0.43
N3	0.02	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.13	0.02	0.37	0.01	0.23	0.75	0.41
N7	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.02	0.60	0.01	0.45	1.31	0.69
N9	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.39	0.01	0.25	0.74	0.42
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.07	0.10	0.07	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05	0.11	0.13	0.05
O3'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.10	0.01	0.11	0.02	0.15	0.07	0.17	0.19	0.13	0.10	0.05	0.04	0.00	0.01	0.22	0.16	0.52	0.30	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.15	0.09
O5'	0.17	0.43	0.24	0.31	0.44	0.01	0.55	0.01	0.58	0.53	0.51	0.38	0.37	0.60	0.39	0.05	0.22	0.03	0.00	0.63	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.63	0.00	0.48	1.47	0.75
OP1	0.08	0.28	0.28	0.46	0.29	0.15	0.39	0.32	0.42	0.37	0.36	0.24	0.23	0.45	0.25	0.11	0.52	0.05	0.01	0.48	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.91	0.16	0.06	0.89	0.21	1.19	0.35	1.29	1.04	1.14	0.82	0.75	1.31	0.74	0.13	0.30	0.15	0.02	1.47	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.48	0.21	0.23	0.49	0.01	0.63	0.01	0.67	0.58	0.59	0.43	0.41	0.69	0.42	0.05	0.14	0.09	0.00	0.75	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.28	0.19	0.44	0.10	0.06	0.28	0.22	0.21	0.48	0.10	0.27	0.34	0.52	0.21	0.12	0.41	0.13	0.56	0.55	1.04	0.84
C2	0.36	0.72	0.07	0.08	0.21	0.33	0.21	0.08	0.11	0.48	0.33	0.76	0.36	0.58	0.04	0.07	0.14	0.44	0.12	0.15	0.06	0.15
C2'	0.15	0.25	0.25	0.45	0.35	0.08	0.51	0.09	0.52	0.53	0.39	0.21	0.62	0.61	0.35	0.18	0.48	0.09	0.45	0.32	0.90	0.63
C3'	0.19	0.43	0.27	0.47	0.46	0.10	0.61	0.09	0.66	0.55	0.57	0.35	0.76	0.66	0.40	0.20	0.53	0.10	0.45	0.28	0.94	0.61
C4	0.23	0.54	0.07	0.23	0.10	0.24	0.25	0.05	0.17	0.49	0.21	0.54	0.39	0.57	0.09	0.08	0.27	0.36	0.17	0.30	0.46	0.43
C4'	0.16	0.12	0.25	0.53	0.27	0.09	0.43	0.21	0.40	0.51	0.25	0.11	0.51	0.56	0.32	0.17	0.52	0.06	0.68	0.54	1.26	0.92
C5	0.32	0.67	0.05	0.17	0.17	0.32	0.23	0.08	0.15	0.47	0.29	0.67	0.42	0.59	0.05	0.07	0.24	0.47	0.07	0.22	0.29	0.30
C5'	0.13	0.12	0.24	0.51	0.27	0.07	0.44	0.17	0.43	0.51	0.27	0.10	0.55	0.58	0.31	0.16	0.53	0.08	0.65	0.52	1.27	0.90
C6	0.43	0.85	0.09	0.07	0.27	0.41	0.19	0.15	0.11	0.45	0.40	0.85	0.42	0.59	0.09	0.07	0.17	0.57	0.17	0.12	0.06	0.10
C8	0.19	0.48	0.10	0.30	0.08	0.21	0.27	0.06	0.20	0.48	0.18	0.48	0.42	0.57	0.10	0.09	0.34	0.35	0.29	0.38	0.70	0.57
N1	0.46	0.90	0.11	0.06	0.30	0.41	0.18	0.15	0.09	0.46	0.43	0.92	0.39	0.59	0.10	0.08	0.13	0.56	0.24	0.10	0.17	0.06
N2	0.40	0.77	0.12	0.08	0.25	0.33	0.18	0.09	0.09	0.49	0.36	0.85	0.32	0.57	0.05	0.09	0.10	0.43	0.22	0.11	0.21	0.07
N3	0.22	0.52	0.06	0.20	0.10	0.22	0.24	0.07	0.16	0.49	0.21	0.54	0.36	0.56	0.10	0.08	0.23	0.32	0.14	0.27	0.36	0.38
N7	0.29	0.61	0.06	0.22	0.14	0.30	0.25	0.07	0.17	0.48	0.25	0.61	0.44	0.59	0.05	0.07	0.29	0.45	0.13	0.27	0.45	0.40
N9	0.14	0.42	0.12	0.33	0.07	0.16	0.28	0.10	0.20	0.49	0.15	0.41	0.39	0.56	0.14	0.10	0.35	0.27	0.35	0.41	0.75	0.62
O2'	0.26	0.26	0.28	0.54	0.35	0.14	0.43	0.23	0.42	0.48	0.33	0.25	0.48	0.51	0.37	0.17	0.51	0.12	0.66	0.47	1.15	0.84
O3'	0.33	0.78	0.33	0.50	0.65	0.13	0.75	0.15	0.85	0.57	0.86	0.66	0.92	0.70	0.52	0.25	0.59	0.10	0.46	0.24	0.96	0.55
O4'	0.08	0.29	0.20	0.49	0.09	0.09	0.26	0.29	0.18	0.48	0.11	0.26	0.31	0.50	0.21	0.13	0.45	0.10	0.69	0.67	1.25	0.99
O5'	0.34	0.35	0.40	0.60	0.52	0.18	0.72	0.30	0.72	0.77	0.54	0.32	0.86	0.86	0.55	0.37	0.58	0.16	0.71	0.57	1.25	0.95
O6	0.49	0.95	0.12	0.06	0.34	0.46	0.16	0.21	0.09	0.42	0.48	0.94	0.42	0.58	0.14	0.07	0.15	0.64	0.27	0.09	0.17	0.07
OP1	0.31	0.27	0.32	0.57	0.44	0.20	0.61	0.31	0.59	0.67	0.42	0.26	0.72	0.74	0.47	0.32	0.58	0.17	0.73	0.60	1.31	0.98
OP2	0.46	0.76	0.52	0.59	0.85	0.13	1.12	0.21	1.20	1.05	1.02	0.64	1.41	1.24	0.79	0.50	0.49	0.18	0.60	0.43	1.14	0.83
P	0.34	0.36	0.41	0.61	0.54	0.17	0.76	0.30	0.76	0.81	0.57	0.32	0.93	0.92	0.57	0.39	0.57	0.15	0.72	0.59	1.30	0.98

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.30	0.01	0.33	0.15	0.52	0.29
C2	0.03	0.00	0.18	0.11	0.01	0.10	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.37	0.17	0.52	0.27	1.08	0.59
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.15	0.10	0.09	0.15	0.17	0.07	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.08	0.07	0.13	0.06
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.18	0.00	0.29	0.01	0.28	0.35	0.20	0.06	0.33	0.38	0.20	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.05	0.04
C4	0.02	0.01	0.10	0.18	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.19	0.09	0.68	0.38	1.20	0.71
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.05	0.22	0.04	0.11	0.09	0.19	0.08	0.28	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.29	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.28	0.04	0.05	0.93	0.60	1.65	1.00
C5'	0.04	0.08	0.15	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.08	0.23	0.02	0.09	0.14	0.23	0.07	0.12	0.18	0.01	0.01	0.14	0.14	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.28	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.08	0.09	0.90	0.59	1.71	1.02
C8	0.01	0.01	0.09	0.35	0.00	0.22	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.32	0.16	0.09	1.08	0.69	1.65	1.07
N1	0.03	0.00	0.15	0.20	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.23	0.14	0.72	0.43	1.43	0.82
N3	0.03	0.00	0.17	0.06	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.41	0.16	0.44	0.20	0.90	0.48
N6	0.02	0.01	0.07	0.33	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.32	0.04	0.07	1.04	0.74	1.99	1.19
N7	0.01	0.01	0.04	0.38	0.00	0.19	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.35	0.17	0.04	1.16	0.79	1.95	1.23
N9	0.00	0.01	0.01	0.20	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.20	0.10	0.01	0.71	0.39	1.11	0.69
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.19	0.28	0.28	0.12	0.27	0.32	0.19	0.08	0.32	0.35	0.20	0.00	0.06	0.19	0.15	0.13	0.08	0.03
O3'	0.30	0.37	0.04	0.01	0.19	0.02	0.04	0.18	0.08	0.16	0.23	0.41	0.04	0.17	0.10	0.06	0.00	0.18	0.06	0.38	0.13	0.07
O4'	0.01	0.17	0.02	0.02	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.09	0.14	0.16	0.07	0.04	0.01	0.19	0.18	0.00	0.32	0.16	0.46	0.31
O5'	0.33	0.52	0.08	0.06	0.68	0.01	0.93	0.01	0.90	1.08	0.72	0.44	1.04	1.16	0.71	0.15	0.06	0.32	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.15	0.27	0.07	0.14	0.38	0.07	0.60	0.14	0.59	0.69	0.43	0.20	0.74	0.79	0.39	0.13	0.38	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.52	1.08	0.13	0.05	1.20	0.07	1.65	0.14	1.71	1.65	1.43	0.90	1.99	1.95	1.11	0.08	0.13	0.46	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.59	0.06	0.04	0.71	0.01	1.00	0.01	1.02	1.07	0.82	0.48	1.19	1.23	0.69	0.03	0.07	0.31	0.00	0.01	0.01	0.00