Doublet Group distance statistics: 51200

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 7, 6, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.013, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C6	A	0, -0.002, 0.009, 0.021, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.009 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.015, 0.031, 0.046, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.014, 0.030, 0.045, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.033 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.013, 0.031, 0.048, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.031 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.028, 0.049, 0.069, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.049 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.041, 0.067, 0.092, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.067 std_dev=0.026
C3'	A	0, 0.042, 0.081, 0.120, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.081 std_dev=0.039
O2'	A	0, 0.053, 0.106, 0.158, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.106 std_dev=0.053
C4'	A	0, 0.041, 0.093, 0.146, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.093 std_dev=0.053
O3'	A	0, 0.061, 0.116, 0.171, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.116 std_dev=0.055
C5'	A	0, 0.067, 0.149, 0.232, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.149 std_dev=0.083
O4'	B	0, 0.062, 0.164, 0.265, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.164 std_dev=0.102
O5'	A	0, 0.071, 0.174, 0.276, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.174 std_dev=0.103
C4	B	0, 0.085, 0.189, 0.293, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.189 std_dev=0.104
N9	B	0, 0.080, 0.187, 0.293, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.187 std_dev=0.106
C4'	B	0, 0.080, 0.188, 0.295, 0.451 max_d=0.451 avg_d=0.188 std_dev=0.108
C1'	B	0, 0.066, 0.175, 0.284, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.175 std_dev=0.109
C5	B	0, 0.099, 0.211, 0.323, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.211 std_dev=0.112
C3'	B	0, 0.087, 0.203, 0.320, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.203 std_dev=0.117
N3	B	0, 0.072, 0.189, 0.306, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.189 std_dev=0.117
C2'	B	0, 0.089, 0.208, 0.326, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.208 std_dev=0.119
C6	B	0, 0.107, 0.226, 0.346, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.226 std_dev=0.120
C8	B	0, 0.093, 0.212, 0.332, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.212 std_dev=0.120
O3'	B	0, 0.086, 0.207, 0.329, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.207 std_dev=0.122
N1	B	0, 0.103, 0.227, 0.350, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.227 std_dev=0.123
C2	B	0, 0.084, 0.209, 0.334, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.209 std_dev=0.125
C5'	B	0, 0.113, 0.238, 0.364, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.238 std_dev=0.126
N7	B	0, 0.101, 0.228, 0.355, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.228 std_dev=0.127
O2'	B	0, 0.085, 0.215, 0.344, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.215 std_dev=0.129
O5'	B	0, 0.111, 0.251, 0.390, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.251 std_dev=0.139
N6	B	0, 0.111, 0.251, 0.391, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.251 std_dev=0.140
P	B	0, 0.115, 0.283, 0.451, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.283 std_dev=0.168
OP2	B	0, 0.139, 0.313, 0.487, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.313 std_dev=0.174
P	A	0, 0.032, 0.209, 0.387, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.209 std_dev=0.177
OP2	A	0, 0.053, 0.236, 0.419, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.236 std_dev=0.183
OP1	B	0, 0.135, 0.319, 0.502, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.319 std_dev=0.183
OP1	A	0, 0.056, 0.265, 0.473, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.265 std_dev=0.208

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.04
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.03	0.02	0.06	0.05	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03
C4	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.08	0.05	0.06
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01
C5	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.02	0.11	0.09	0.09
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.06	0.04	0.03	0.03	0.07	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02	0.07	0.01	0.11	0.09	0.09
C8	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.11	0.09	0.09
N1	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.07	0.08
N2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.03	0.01	0.05	0.04	0.04
N3	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.03	0.02	0.06	0.04	0.04
N7	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.09	0.01	0.13	0.11	0.12
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.08	0.05	0.06
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.01	0.04	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.04	0.08	0.08	0.07
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.09	0.05
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.03	0.05
O5'	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.07	0.08	0.05	0.03	0.03	0.09	0.05	0.07	0.04	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.06	0.03	0.08	0.00	0.12	0.10	0.11
OP1	0.06	0.06	0.03	0.02	0.08	0.02	0.11	0.02	0.11	0.11	0.09	0.05	0.06	0.13	0.08	0.08	0.05	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.05	0.05	0.06	0.05	0.04	0.09	0.03	0.09	0.09	0.07	0.04	0.04	0.11	0.05	0.08	0.09	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.05	0.02	0.03	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.09	0.08	0.04	0.04	0.12	0.06	0.07	0.05	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.10	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.10	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.06	0.06	0.10	0.09	0.06	0.07	0.08	0.08	0.07
C2	0.09	0.10	0.10	0.09	0.07	0.08	0.08	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.11	0.10	0.07	0.08	0.10	0.07	0.09
C2'	0.07	0.09	0.09	0.09	0.05	0.06	0.06	0.08	0.06	0.08	0.08	0.07	0.06	0.07	0.06	0.12	0.14	0.05	0.07	0.11	0.09	0.08
C3'	0.07	0.09	0.09	0.09	0.06	0.06	0.06	0.08	0.06	0.08	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.12	0.13	0.05	0.08	0.12	0.10	0.09
C4	0.07	0.10	0.07	0.07	0.06	0.05	0.07	0.07	0.08	0.07	0.10	0.08	0.08	0.06	0.06	0.10	0.09	0.05	0.06	0.09	0.06	0.07
C4'	0.06	0.09	0.07	0.07	0.06	0.05	0.06	0.09	0.06	0.07	0.08	0.08	0.06	0.06	0.06	0.11	0.10	0.05	0.07	0.10	0.09	0.08
C5	0.08	0.10	0.09	0.07	0.08	0.06	0.08	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.11	0.09	0.06	0.07	0.09	0.07	0.08
C5'	0.06	0.10	0.07	0.07	0.06	0.05	0.06	0.09	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.06	0.06	0.10	0.09	0.05	0.08	0.10	0.09	0.09
C6	0.10	0.11	0.10	0.09	0.09	0.08	0.10	0.09	0.11	0.10	0.12	0.10	0.11	0.10	0.10	0.12	0.10	0.08	0.09	0.11	0.08	0.10
C8	0.07	0.10	0.07	0.06	0.07	0.05	0.07	0.08	0.08	0.07	0.10	0.08	0.08	0.07	0.06	0.10	0.09	0.05	0.07	0.09	0.07	0.07
N1	0.10	0.11	0.10	0.09	0.09	0.08	0.09	0.09	0.10	0.10	0.11	0.09	0.11	0.10	0.10	0.12	0.10	0.08	0.08	0.10	0.08	0.09
N2	0.12	0.11	0.12	0.12	0.08	0.11	0.08	0.10	0.09	0.10	0.10	0.07	0.09	0.09	0.10	0.12	0.11	0.10	0.10	0.12	0.09	0.11
N3	0.07	0.10	0.08	0.08	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.07	0.10	0.08	0.08	0.06	0.06	0.10	0.10	0.05	0.06	0.09	0.06	0.07
N7	0.08	0.10	0.08	0.07	0.08	0.06	0.08	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.11	0.09	0.06	0.07	0.09	0.08	0.08
N9	0.06	0.10	0.07	0.06	0.06	0.05	0.06	0.08	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.06	0.06	0.10	0.09	0.05	0.06	0.08	0.07	0.06
O2'	0.05	0.10	0.08	0.08	0.05	0.05	0.05	0.10	0.06	0.06	0.09	0.09	0.05	0.05	0.05	0.12	0.14	0.05	0.08	0.09	0.08	0.07
O3'	0.09	0.08	0.10	0.11	0.07	0.08	0.07	0.09	0.07	0.10	0.08	0.07	0.08	0.09	0.08	0.13	0.14	0.07	0.10	0.14	0.12	0.11
O4'	0.07	0.10	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.11	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.07	0.10	0.08	0.07	0.08	0.09	0.09	0.08
O5'	0.06	0.10	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.10	0.07	0.07	0.09	0.09	0.07	0.07	0.06	0.10	0.08	0.05	0.08	0.11	0.11	0.10
O6	0.11	0.12	0.11	0.09	0.11	0.09	0.11	0.10	0.12	0.11	0.13	0.11	0.12	0.11	0.11	0.13	0.10	0.09	0.10	0.11	0.09	0.11
OP1	0.06	0.11	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.11	0.08	0.07	0.10	0.10	0.07	0.07	0.07	0.10	0.07	0.06	0.10	0.13	0.13	0.12
OP2	0.07	0.10	0.08	0.08	0.07	0.08	0.07	0.12	0.07	0.08	0.09	0.09	0.07	0.07	0.07	0.10	0.09	0.07	0.12	0.17	0.16	0.15
P	0.05	0.10	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.10	0.06	0.06	0.09	0.08	0.06	0.06	0.05	0.09	0.07	0.04	0.09	0.13	0.12	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.06	0.08	0.04
C2	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.05	0.07	0.08	0.10	0.07
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.09	0.06
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.07	0.10	0.06
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.06	0.08	0.10	0.07
C5'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.07	0.09	0.06
C8	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.08	0.10	0.11	0.08
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.07	0.10	0.06
N3	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.07	0.08	0.10	0.07
N6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.08	0.09	0.07
N7	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.08	0.10	0.11	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.07	0.09	0.06
O2'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.10	0.10	0.07
O3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.06	0.04	0.03
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.04	0.06	0.03
O5'	0.04	0.07	0.05	0.03	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.08	0.06	0.07	0.06	0.08	0.05	0.05	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.08	0.09	0.06	0.07	0.04	0.08	0.03	0.07	0.10	0.07	0.08	0.08	0.10	0.07	0.10	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.10	0.09	0.04	0.10	0.03	0.10	0.01	0.09	0.11	0.10	0.10	0.09	0.11	0.09	0.10	0.04	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.06	0.03	0.06	0.01	0.07	0.02	0.06	0.08	0.06	0.07	0.07	0.08	0.06	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00