Doublet Group distance statistics: 51203

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.013, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.017, 0.028, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.019, 0.030, 0.041, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.030 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.017, 0.029, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.026 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.030, 0.050, 0.070, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.050 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.039, 0.065, 0.091, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.065 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.043, 0.070, 0.098, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.070 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.012, 0.088, 0.164, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.088 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.080, 0.168, 0.255, 0.307 max_d=0.307 avg_d=0.168 std_dev=0.087
C3'	A	0, 0.136, 0.272, 0.409, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.272 std_dev=0.136
C4'	A	0, 0.133, 0.270, 0.406, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.270 std_dev=0.136
O2'	A	0, 0.053, 0.214, 0.376, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.214 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.177, 0.375, 0.573, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.375 std_dev=0.198
O3'	B	0, 0.244, 0.448, 0.652, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.448 std_dev=0.204
C5'	A	0, 0.218, 0.441, 0.664, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.441 std_dev=0.223
C3'	B	0, 0.143, 0.375, 0.606, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.375 std_dev=0.231
O5'	A	0, 0.238, 0.476, 0.714, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.476 std_dev=0.238
P	A	0, 0.347, 0.624, 0.900, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.624 std_dev=0.276
OP1	A	0, 0.373, 0.662, 0.951, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.662 std_dev=0.289
O4'	B	0, 0.233, 0.523, 0.813, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.523 std_dev=0.290
C4'	B	0, 0.219, 0.513, 0.806, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.513 std_dev=0.294
OP2	A	0, 0.394, 0.688, 0.983, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.688 std_dev=0.295
C2'	B	0, 0.261, 0.559, 0.856, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.559 std_dev=0.298
C1'	B	0, 0.250, 0.556, 0.862, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.556 std_dev=0.306
C5'	B	0, 0.410, 0.733, 1.056, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.733 std_dev=0.323
N3	B	0, 0.360, 0.688, 1.016, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.688 std_dev=0.328
O5'	B	0, 0.488, 0.821, 1.154, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.821 std_dev=0.333
O2'	B	0, 0.572, 0.917, 1.263, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.917 std_dev=0.345
OP2	B	0, 0.474, 0.823, 1.171, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.823 std_dev=0.348
N9	B	0, 0.252, 0.612, 0.972, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.612 std_dev=0.360
C8	B	0, 0.406, 0.789, 1.172, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.789 std_dev=0.383
P	B	0, 0.384, 0.771, 1.158, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.771 std_dev=0.387
C2	B	0, 0.439, 0.826, 1.212, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.826 std_dev=0.387
C4	B	0, 0.223, 0.613, 1.003, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.613 std_dev=0.390
N7	B	0, 0.392, 0.832, 1.272, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.832 std_dev=0.440
N1	B	0, 0.410, 0.868, 1.327, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.868 std_dev=0.458
C5	B	0, 0.247, 0.708, 1.168, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.708 std_dev=0.461
C6	B	0, 0.309, 0.804, 1.300, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.804 std_dev=0.495
OP1	B	0, 0.495, 1.051, 1.607, 1.730 max_d=1.730 avg_d=1.051 std_dev=0.556
N6	B	0, 0.363, 0.938, 1.512, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.938 std_dev=0.574

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.14	0.07	0.05
C2	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.02	0.11	0.02	0.15	0.11	0.10
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.07	0.12	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.04	0.21	0.13	0.10
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.09	0.06	0.10	0.08	0.09	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.24	0.15	0.12
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.12	0.02	0.15	0.10	0.10
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.02	0.04	0.03	0.08	0.03	0.03	0.04	0.00	0.02	0.05	0.16	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.17	0.02	0.17	0.13	0.13
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.08	0.04	0.04	0.15	0.07	0.03	0.04	0.01	0.01	0.14	0.11	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.17	0.01	0.17	0.15	0.15
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.04	0.18	0.03	0.17	0.10	0.12
N1	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.14	0.02	0.16	0.13	0.12
N2	0.03	0.01	0.12	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.03	0.10	0.03	0.14	0.11	0.09
N3	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.02	0.09	0.02	0.14	0.10	0.08
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.20	0.03	0.18	0.14	0.16
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.02	0.15	0.09	0.08
O2'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.05	0.10	0.15	0.11	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.06	0.23	0.12	0.09
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.06	0.09	0.09	0.14	0.10	0.09	0.04	0.03	0.00	0.04	0.06	0.07	0.29	0.18	0.15
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.04	0.00	0.06	0.02	0.10	0.11	0.07
O5'	0.06	0.11	0.05	0.05	0.12	0.02	0.17	0.01	0.17	0.18	0.14	0.10	0.09	0.20	0.11	0.04	0.06	0.06	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.05	0.02	0.14	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.06	0.07	0.02	0.20	0.00	0.19	0.17	0.18
OP1	0.14	0.15	0.21	0.24	0.15	0.16	0.17	0.11	0.17	0.17	0.16	0.14	0.14	0.18	0.15	0.23	0.29	0.10	0.02	0.19	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.11	0.13	0.15	0.10	0.04	0.13	0.03	0.15	0.10	0.13	0.11	0.10	0.14	0.09	0.12	0.18	0.11	0.02	0.17	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.10	0.12	0.10	0.03	0.13	0.02	0.15	0.12	0.12	0.09	0.08	0.16	0.08	0.09	0.15	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.23	0.09	0.14	0.10	0.14	0.07	0.17	0.11	0.12	0.19	0.20	0.10	0.09	0.07	0.07	0.16	0.12	0.18	0.12	0.24	0.13
C2	0.27	0.19	0.23	0.21	0.19	0.24	0.21	0.22	0.18	0.30	0.18	0.16	0.19	0.27	0.25	0.21	0.23	0.27	0.18	0.16	0.29	0.18
C2'	0.10	0.17	0.10	0.09	0.10	0.09	0.12	0.10	0.12	0.18	0.15	0.14	0.14	0.17	0.11	0.13	0.13	0.10	0.11	0.08	0.23	0.09
C3'	0.11	0.17	0.10	0.10	0.10	0.10	0.12	0.12	0.12	0.18	0.15	0.13	0.14	0.17	0.11	0.12	0.15	0.11	0.13	0.07	0.20	0.07
C4	0.17	0.20	0.15	0.16	0.11	0.17	0.12	0.15	0.12	0.21	0.17	0.15	0.13	0.18	0.15	0.14	0.20	0.17	0.13	0.11	0.25	0.13
C4'	0.09	0.23	0.08	0.11	0.12	0.13	0.10	0.19	0.14	0.12	0.20	0.20	0.13	0.11	0.08	0.08	0.13	0.11	0.21	0.12	0.18	0.12
C5	0.20	0.19	0.16	0.16	0.15	0.17	0.17	0.15	0.17	0.24	0.19	0.15	0.18	0.22	0.19	0.16	0.20	0.20	0.13	0.11	0.25	0.13
C5'	0.08	0.24	0.08	0.10	0.12	0.13	0.09	0.20	0.13	0.10	0.21	0.21	0.11	0.08	0.07	0.07	0.13	0.11	0.22	0.13	0.17	0.13
C6	0.25	0.21	0.20	0.18	0.21	0.21	0.24	0.18	0.23	0.30	0.23	0.18	0.25	0.29	0.25	0.19	0.21	0.25	0.15	0.12	0.26	0.14
C8	0.14	0.20	0.12	0.14	0.10	0.14	0.10	0.15	0.12	0.17	0.17	0.16	0.12	0.14	0.12	0.11	0.18	0.14	0.16	0.13	0.24	0.14
N1	0.28	0.21	0.22	0.21	0.23	0.24	0.26	0.22	0.24	0.32	0.22	0.19	0.25	0.31	0.28	0.20	0.23	0.29	0.18	0.15	0.28	0.17
N2	0.33	0.19	0.27	0.25	0.24	0.30	0.25	0.29	0.20	0.35	0.19	0.18	0.21	0.32	0.32	0.22	0.24	0.34	0.25	0.21	0.32	0.23
N3	0.19	0.21	0.18	0.18	0.11	0.19	0.12	0.17	0.12	0.22	0.17	0.16	0.12	0.19	0.17	0.16	0.21	0.20	0.14	0.12	0.27	0.14
N7	0.17	0.19	0.15	0.15	0.13	0.15	0.15	0.14	0.16	0.21	0.18	0.15	0.17	0.19	0.17	0.14	0.19	0.17	0.14	0.11	0.25	0.13
N9	0.13	0.21	0.12	0.15	0.09	0.15	0.08	0.15	0.10	0.16	0.17	0.17	0.10	0.13	0.11	0.10	0.18	0.14	0.15	0.12	0.24	0.13
O2'	0.13	0.22	0.15	0.10	0.16	0.10	0.18	0.11	0.19	0.21	0.21	0.20	0.21	0.21	0.15	0.20	0.11	0.10	0.11	0.08	0.25	0.10
O3'	0.18	0.19	0.17	0.17	0.17	0.17	0.19	0.18	0.19	0.23	0.19	0.17	0.21	0.23	0.18	0.18	0.19	0.18	0.17	0.13	0.20	0.12
O4'	0.12	0.27	0.13	0.16	0.15	0.17	0.11	0.23	0.16	0.10	0.24	0.24	0.13	0.08	0.11	0.10	0.16	0.15	0.25	0.20	0.25	0.20
O5'	0.08	0.24	0.08	0.08	0.12	0.09	0.09	0.16	0.13	0.11	0.21	0.20	0.11	0.09	0.08	0.09	0.10	0.08	0.19	0.10	0.17	0.11
O6	0.27	0.25	0.21	0.18	0.26	0.22	0.30	0.19	0.29	0.33	0.28	0.22	0.31	0.33	0.28	0.20	0.22	0.28	0.15	0.13	0.26	0.15
OP1	0.20	0.30	0.20	0.23	0.21	0.26	0.17	0.33	0.20	0.16	0.26	0.27	0.17	0.15	0.19	0.17	0.22	0.23	0.36	0.26	0.25	0.27
OP2	0.09	0.21	0.08	0.12	0.10	0.13	0.08	0.20	0.11	0.12	0.18	0.18	0.10	0.10	0.09	0.07	0.12	0.10	0.21	0.13	0.18	0.14
P	0.09	0.22	0.09	0.11	0.10	0.12	0.07	0.20	0.11	0.11	0.19	0.19	0.09	0.09	0.08	0.08	0.12	0.10	0.22	0.13	0.17	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.17	0.12	0.04
C2	0.04	0.00	0.14	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.26	0.16	0.07	0.07	0.21	0.11	0.10
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.05	0.06	0.10	0.11	0.14	0.06	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.21	0.09
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.08	0.11	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.20	0.07
C4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.12	0.09	0.04	0.09	0.21	0.11	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.03	0.04	0.07	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.10	0.10	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.14	0.22	0.16	0.13
C5'	0.03	0.05	0.05	0.02	0.06	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.08	0.03	0.17	0.14	0.06	0.04	0.02	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.04	0.02	0.04	0.02	0.11	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.12	0.09	0.04	0.15	0.23	0.16	0.14
C8	0.02	0.01	0.10	0.08	0.00	0.07	0.01	0.12	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.12	0.07	0.07	0.18	0.21	0.17	0.12
N1	0.03	0.00	0.11	0.08	0.02	0.03	0.02	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.20	0.14	0.06	0.10	0.23	0.13	0.13
N3	0.04	0.01	0.14	0.11	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.15	0.06	0.06	0.21	0.09	0.09
N6	0.04	0.02	0.06	0.05	0.03	0.07	0.03	0.17	0.01	0.07	0.03	0.01	0.00	0.07	0.05	0.09	0.08	0.06	0.20	0.24	0.21	0.19
N7	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.07	0.01	0.14	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.09	0.06	0.05	0.19	0.23	0.19	0.16
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.09	0.20	0.12	0.07
O2'	0.01	0.26	0.00	0.01	0.12	0.01	0.07	0.04	0.12	0.12	0.20	0.25	0.09	0.09	0.03	0.00	0.04	0.01	0.08	0.07	0.29	0.15
O3'	0.05	0.16	0.01	0.01	0.09	0.02	0.07	0.02	0.09	0.07	0.14	0.15	0.08	0.06	0.05	0.04	0.00	0.05	0.04	0.07	0.20	0.07
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.06	0.06	0.06	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.22	0.06	0.07
O5'	0.05	0.07	0.07	0.03	0.09	0.02	0.14	0.01	0.15	0.18	0.10	0.06	0.20	0.19	0.09	0.08	0.04	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.17	0.21	0.08	0.06	0.21	0.10	0.22	0.06	0.23	0.21	0.23	0.21	0.24	0.23	0.20	0.07	0.07	0.22	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.11	0.21	0.20	0.11	0.10	0.16	0.05	0.16	0.17	0.13	0.09	0.21	0.19	0.12	0.29	0.20	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.09	0.07	0.09	0.02	0.13	0.01	0.14	0.12	0.13	0.09	0.19	0.16	0.07	0.15	0.07	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00