Doublet Group distance statistics: 51204

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 3, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.016, 0.028, 0.039, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.023, 0.043, 0.063, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.043 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.011, 0.032, 0.053, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.032 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.018, 0.046, 0.074, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.046 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.013, 0.043, 0.074, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.043 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.035, 0.068, 0.101, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.068 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.040, 0.075, 0.111, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.075 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.028, 0.064, 0.101, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.064 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.028, 0.118, 0.208, 0.302 max_d=0.302 avg_d=0.118 std_dev=0.090
C2'	A	0, 0.043, 0.150, 0.257, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.150 std_dev=0.107
C4'	A	0, 0.047, 0.159, 0.270, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.159 std_dev=0.111
C3'	A	0, 0.037, 0.189, 0.342, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.189 std_dev=0.152
O2'	A	0, 0.067, 0.253, 0.439, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.253 std_dev=0.186
O3'	A	0, 0.072, 0.284, 0.496, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.284 std_dev=0.212
C5'	A	0, 0.055, 0.278, 0.501, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.278 std_dev=0.223
O5'	A	0, 0.227, 0.478, 0.729, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.478 std_dev=0.251
O2'	B	0, 0.166, 0.451, 0.736, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.451 std_dev=0.285
P	A	0, 0.308, 0.611, 0.914, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.611 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.381, 0.707, 1.034, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.707 std_dev=0.327
OP2	A	0, 0.261, 0.642, 1.023, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.642 std_dev=0.381
OP1	A	0, 0.430, 0.823, 1.215, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.823 std_dev=0.392
C1'	B	0, 0.485, 0.909, 1.334, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.909 std_dev=0.425
C4	B	0, 0.338, 0.763, 1.189, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.763 std_dev=0.426
C3'	B	0, 0.416, 0.853, 1.290, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.853 std_dev=0.437
O3'	B	0, 0.384, 0.873, 1.362, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.873 std_dev=0.489
N9	B	0, 0.500, 1.018, 1.536, 1.704 max_d=1.704 avg_d=1.018 std_dev=0.518
N3	B	0, 0.524, 1.086, 1.649, 1.751 max_d=1.751 avg_d=1.086 std_dev=0.563
C4'	B	0, 0.606, 1.269, 1.932, 2.214 max_d=2.214 avg_d=1.269 std_dev=0.663
C5	B	0, 0.508, 1.225, 1.942, 2.437 max_d=2.437 avg_d=1.225 std_dev=0.717
C5'	B	0, 0.665, 1.397, 2.128, 2.497 max_d=2.497 avg_d=1.397 std_dev=0.732
O4'	B	0, 0.590, 1.364, 2.137, 2.257 max_d=2.257 avg_d=1.364 std_dev=0.774
C6	B	0, 0.477, 1.259, 2.042, 2.755 max_d=2.755 avg_d=1.259 std_dev=0.783
N1	B	0, 0.519, 1.340, 2.162, 2.724 max_d=2.724 avg_d=1.340 std_dev=0.822
C2	B	0, 0.571, 1.436, 2.300, 2.529 max_d=2.529 avg_d=1.436 std_dev=0.865
O5'	B	0, 0.863, 1.798, 2.732, 2.880 max_d=2.880 avg_d=1.798 std_dev=0.934
N6	B	0, 0.607, 1.738, 2.870, 3.761 max_d=3.761 avg_d=1.738 std_dev=1.132
C8	B	0, 0.574, 1.731, 2.889, 3.045 max_d=3.045 avg_d=1.731 std_dev=1.157
N7	B	0, 0.617, 1.868, 3.119, 3.429 max_d=3.429 avg_d=1.868 std_dev=1.251
OP2	B	0, 1.357, 2.695, 4.033, 4.185 max_d=4.185 avg_d=2.695 std_dev=1.338
P	B	0, 1.009, 2.699, 4.388, 4.498 max_d=4.498 avg_d=2.699 std_dev=1.690
OP1	B	0, 1.060, 3.278, 5.496, 6.186 max_d=6.186 avg_d=3.278 std_dev=2.218

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.02	0.11	0.20	0.08
C2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.02	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.10	0.03	0.10	0.02	0.14	0.30	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.06	0.07	0.12	0.09	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.05	0.11	0.21	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.10	0.06	0.13	0.09	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.14	0.04	0.11	0.18	0.11
C4	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.10	0.01	0.13	0.28	0.13
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.04	0.07	0.05	0.05	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.04	0.13	0.10	0.04
C5	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.13	0.01	0.17	0.32	0.18
C5'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.08	0.05	0.09	0.05	0.08	0.06	0.02	0.02	0.09	0.14	0.06	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.07	0.04	0.02	0.13	0.01	0.19	0.35	0.19
C8	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.04	0.14	0.02	0.14	0.27	0.15
N1	0.03	0.01	0.07	0.06	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.09	0.07	0.03	0.12	0.02	0.17	0.33	0.17
N2	0.04	0.01	0.12	0.13	0.02	0.07	0.03	0.08	0.03	0.03	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.14	0.15	0.04	0.10	0.04	0.15	0.29	0.13
N3	0.03	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.10	0.03	0.09	0.02	0.13	0.27	0.12
N7	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.09	0.03	0.15	0.02	0.19	0.33	0.19
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.10	0.02	0.11	0.25	0.11
O2'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.05	0.07	0.05	0.08	0.07	0.04	0.09	0.14	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.06	0.06	0.08	0.11	0.17	0.08
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.04	0.10	0.07	0.15	0.10	0.09	0.03	0.03	0.00	0.03	0.18	0.05	0.11	0.15	0.11
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.14	0.03	0.15	0.16	0.10
O5'	0.09	0.10	0.08	0.14	0.10	0.03	0.13	0.02	0.13	0.14	0.12	0.10	0.09	0.15	0.10	0.06	0.18	0.14	0.00	0.15	0.02	0.02	0.02
O6	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.08	0.05	0.03	0.15	0.00	0.24	0.38	0.23
OP1	0.11	0.14	0.11	0.11	0.13	0.13	0.17	0.14	0.19	0.14	0.17	0.15	0.13	0.19	0.11	0.11	0.11	0.15	0.02	0.24	0.00	0.03	0.01
OP2	0.20	0.30	0.21	0.18	0.28	0.10	0.32	0.06	0.35	0.27	0.33	0.29	0.27	0.33	0.25	0.17	0.15	0.16	0.02	0.38	0.03	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.09	0.11	0.13	0.04	0.18	0.03	0.19	0.15	0.17	0.13	0.12	0.19	0.11	0.08	0.11	0.10	0.02	0.23	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.42	0.15	0.28	0.17	0.31	0.21	0.23	0.17	0.38	0.25	0.40	0.25	0.41	0.17	0.14	0.52	0.24	0.40	0.54	0.86	0.61
C2	0.16	0.69	0.17	0.11	0.13	0.13	0.33	0.27	0.15	0.75	0.39	0.57	0.31	0.75	0.33	0.13	0.24	0.18	0.35	0.55	0.57	0.68
C2'	0.17	0.28	0.11	0.27	0.13	0.37	0.21	0.29	0.20	0.28	0.18	0.29	0.29	0.34	0.13	0.11	0.52	0.30	0.22	0.66	0.69	0.40
C3'	0.19	0.25	0.12	0.29	0.15	0.43	0.24	0.37	0.27	0.26	0.22	0.26	0.36	0.34	0.13	0.14	0.52	0.35	0.18	0.79	0.69	0.35
C4	0.11	0.58	0.12	0.15	0.14	0.14	0.29	0.13	0.18	0.60	0.31	0.51	0.34	0.63	0.24	0.12	0.39	0.10	0.36	0.48	0.70	0.65
C4'	0.19	0.28	0.13	0.32	0.14	0.43	0.20	0.37	0.21	0.26	0.20	0.28	0.29	0.32	0.12	0.12	0.56	0.34	0.32	0.75	0.88	0.47
C5	0.12	0.65	0.13	0.14	0.15	0.12	0.36	0.15	0.24	0.68	0.35	0.55	0.43	0.74	0.28	0.13	0.39	0.10	0.35	0.51	0.68	0.66
C5'	0.18	0.29	0.12	0.32	0.16	0.44	0.25	0.39	0.28	0.29	0.24	0.27	0.38	0.37	0.14	0.13	0.55	0.34	0.30	0.80	0.90	0.45
C6	0.14	0.74	0.15	0.11	0.17	0.10	0.41	0.24	0.26	0.79	0.40	0.61	0.48	0.85	0.33	0.14	0.32	0.14	0.33	0.56	0.60	0.68
C8	0.14	0.54	0.12	0.22	0.15	0.24	0.30	0.14	0.22	0.55	0.29	0.49	0.39	0.61	0.21	0.13	0.49	0.17	0.37	0.51	0.81	0.64
N1	0.17	0.77	0.17	0.11	0.16	0.14	0.40	0.30	0.22	0.82	0.43	0.62	0.43	0.86	0.36	0.14	0.25	0.19	0.34	0.59	0.55	0.68
N2	0.23	0.73	0.22	0.16	0.14	0.23	0.32	0.37	0.12	0.81	0.45	0.58	0.24	0.77	0.39	0.13	0.15	0.29	0.37	0.62	0.51	0.69
N3	0.12	0.57	0.13	0.11	0.12	0.10	0.26	0.16	0.14	0.61	0.32	0.50	0.27	0.61	0.26	0.11	0.32	0.10	0.37	0.47	0.65	0.66
N7	0.13	0.62	0.12	0.18	0.16	0.18	0.35	0.13	0.26	0.64	0.33	0.54	0.45	0.71	0.25	0.13	0.45	0.13	0.35	0.51	0.74	0.66
N9	0.14	0.51	0.13	0.22	0.15	0.23	0.26	0.15	0.19	0.51	0.28	0.46	0.32	0.54	0.20	0.13	0.47	0.17	0.38	0.49	0.79	0.63
O2'	0.25	0.29	0.18	0.31	0.23	0.41	0.23	0.35	0.24	0.25	0.24	0.30	0.27	0.28	0.21	0.20	0.53	0.36	0.28	0.74	0.77	0.44
O3'	0.23	0.25	0.15	0.31	0.18	0.50	0.25	0.47	0.30	0.19	0.28	0.22	0.37	0.27	0.15	0.20	0.50	0.43	0.14	0.98	0.62	0.32
O4'	0.20	0.39	0.17	0.31	0.17	0.36	0.20	0.30	0.18	0.36	0.24	0.37	0.26	0.39	0.17	0.15	0.55	0.28	0.44	0.60	0.97	0.63
O5'	0.12	0.19	0.09	0.25	0.13	0.36	0.33	0.29	0.32	0.42	0.16	0.21	0.47	0.51	0.17	0.13	0.51	0.27	0.31	0.71	0.89	0.49
O6	0.16	0.79	0.16	0.11	0.19	0.12	0.45	0.27	0.31	0.83	0.44	0.63	0.56	0.91	0.35	0.15	0.31	0.16	0.32	0.59	0.58	0.68
OP1	0.17	0.22	0.14	0.29	0.22	0.42	0.40	0.38	0.44	0.42	0.30	0.21	0.59	0.53	0.22	0.20	0.51	0.32	0.24	0.88	0.90	0.47
OP2	0.15	0.08	0.20	0.20	0.28	0.26	0.56	0.20	0.54	0.68	0.28	0.07	0.75	0.80	0.37	0.24	0.43	0.16	0.44	0.56	0.94	0.57
P	0.10	0.16	0.08	0.25	0.15	0.36	0.38	0.29	0.38	0.47	0.18	0.17	0.55	0.57	0.20	0.13	0.51	0.25	0.32	0.71	0.91	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02	0.13	0.01	0.29	0.29	0.43	0.24
C2	0.04	0.00	0.22	0.07	0.01	0.12	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.36	0.19	0.17	0.37	0.24	0.70	0.33
C2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.13	0.01	0.09	0.05	0.14	0.09	0.19	0.20	0.13	0.04	0.02	0.01	0.06	0.02	0.09	0.25	0.19	0.23
C3'	0.03	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.08	0.03	0.08	0.06	0.10	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.32	0.32	0.40	0.38
C4	0.02	0.01	0.13	0.05	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.16	0.09	0.50	0.24	0.85	0.43
C4'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.11	0.09	0.12	0.06	0.09	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.36	0.12	0.15
C5	0.02	0.01	0.09	0.06	0.01	0.03	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.10	0.14	0.05	0.68	0.25	1.19	0.61
C5'	0.04	0.09	0.05	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.13	0.23	0.09	0.09	0.17	0.22	0.11	0.05	0.03	0.02	0.01	0.10	0.17	0.02
C6	0.03	0.01	0.14	0.08	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.15	0.09	0.66	0.24	1.21	0.61
C8	0.02	0.01	0.09	0.03	0.01	0.11	0.02	0.23	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.16	0.10	0.09	0.79	0.32	1.26	0.67
N1	0.03	0.01	0.19	0.08	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.28	0.17	0.14	0.51	0.22	0.97	0.48
N3	0.04	0.00	0.20	0.06	0.01	0.12	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.33	0.19	0.17	0.31	0.25	0.58	0.28
N6	0.04	0.01	0.13	0.10	0.02	0.06	0.03	0.17	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.15	0.14	0.07	0.77	0.29	1.44	0.74
N7	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.09	0.01	0.22	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.02	0.10	0.10	0.05	0.84	0.32	1.44	0.75
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.13	0.01	0.54	0.26	0.84	0.45
O2'	0.02	0.36	0.01	0.05	0.16	0.04	0.10	0.05	0.17	0.16	0.28	0.33	0.15	0.10	0.03	0.00	0.14	0.02	0.19	0.29	0.31	0.33
O3'	0.13	0.19	0.06	0.02	0.16	0.03	0.14	0.03	0.15	0.10	0.17	0.19	0.14	0.10	0.13	0.14	0.00	0.08	0.40	0.53	0.66	0.44
O4'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.09	0.01	0.05	0.02	0.09	0.09	0.14	0.17	0.07	0.05	0.01	0.02	0.08	0.00	0.44	0.34	0.54	0.38
O5'	0.29	0.37	0.09	0.32	0.50	0.01	0.68	0.01	0.66	0.79	0.51	0.31	0.77	0.84	0.54	0.19	0.40	0.44	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.29	0.24	0.25	0.32	0.24	0.36	0.25	0.10	0.24	0.32	0.22	0.25	0.29	0.32	0.26	0.29	0.53	0.34	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.43	0.70	0.19	0.40	0.85	0.12	1.19	0.17	1.21	1.26	0.97	0.58	1.44	1.44	0.84	0.31	0.66	0.54	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.33	0.23	0.38	0.43	0.15	0.61	0.02	0.61	0.67	0.48	0.28	0.74	0.75	0.45	0.33	0.44	0.38	0.01	0.01	0.01	0.00