Doublet Group distance statistics: 51205

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N2	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C8	B	0, 0.068, 0.386, 0.704, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.386 std_dev=0.318
O4'	B	0, 0.034, 0.356, 0.677, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.356 std_dev=0.321
N9	B	0, 0.055, 0.390, 0.726, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.390 std_dev=0.335
C1'	B	0, 0.031, 0.374, 0.717, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.374 std_dev=0.343
P	B	0, -0.010, 0.360, 0.730, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.360 std_dev=0.370
O2'	B	0, 0.001, 0.372, 0.744, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.372 std_dev=0.371
O5'	B	0, -0.024, 0.368, 0.761, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.368 std_dev=0.392
C2'	B	0, -0.029, 0.450, 0.929, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.450 std_dev=0.479
O4'	A	0, -0.106, 0.381, 0.868, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.381 std_dev=0.487
C5'	B	0, -0.024, 0.486, 0.996, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.486 std_dev=0.510
C2'	A	0, -0.117, 0.396, 0.909, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.396 std_dev=0.513
OP2	B	0, -0.024, 0.490, 1.004, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.490 std_dev=0.514
C4'	B	0, -0.040, 0.476, 0.991, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.476 std_dev=0.516
OP1	B	0, -0.016, 0.503, 1.021, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.503 std_dev=0.519
N7	B	0, 0.019, 0.555, 1.091, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.555 std_dev=0.536
C3'	B	0, -0.076, 0.541, 1.157, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.541 std_dev=0.617
O2'	A	0, -0.155, 0.512, 1.179, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.512 std_dev=0.667
C4	B	0, -0.050, 0.648, 1.347, 1.925 max_d=1.925 avg_d=0.648 std_dev=0.698
C5	B	0, -0.053, 0.666, 1.386, 2.041 max_d=2.041 avg_d=0.666 std_dev=0.719
C3'	A	0, -0.177, 0.638, 1.454, 1.919 max_d=1.919 avg_d=0.638 std_dev=0.816
C4'	A	0, -0.197, 0.657, 1.511, 1.980 max_d=1.980 avg_d=0.657 std_dev=0.854
O3'	B	0, -0.164, 0.718, 1.600, 2.048 max_d=2.048 avg_d=0.718 std_dev=0.882
O3'	A	0, -0.178, 0.777, 1.733, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.777 std_dev=0.955
C6	B	0, -0.168, 0.917, 2.001, 3.037 max_d=3.037 avg_d=0.917 std_dev=1.085
N3	B	0, -0.165, 0.920, 2.005, 2.858 max_d=2.858 avg_d=0.920 std_dev=1.085
N6	B	0, -0.204, 1.016, 2.235, 3.420 max_d=3.420 avg_d=1.016 std_dev=1.219
C2	B	0, -0.256, 1.138, 2.532, 3.706 max_d=3.706 avg_d=1.138 std_dev=1.394
N1	B	0, -0.261, 1.135, 2.530, 3.807 max_d=3.807 avg_d=1.135 std_dev=1.395
C5'	A	0, -0.335, 1.133, 2.601, 3.415 max_d=3.415 avg_d=1.133 std_dev=1.468
O5'	A	0, -0.385, 1.206, 2.796, 3.544 max_d=3.544 avg_d=1.206 std_dev=1.590
P	A	0, -0.499, 1.538, 3.576, 4.486 max_d=4.486 avg_d=1.538 std_dev=2.038
OP2	A	0, -0.518, 1.635, 3.787, 4.703 max_d=4.703 avg_d=1.635 std_dev=2.153
OP1	A	0, -0.694, 2.097, 4.888, 6.083 max_d=6.083 avg_d=2.097 std_dev=2.791

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.15	0.02	0.13	0.23	0.15
C2	0.01	0.00	0.27	0.16	0.00	0.23	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.10	0.29	0.17	0.01	0.30	0.44	0.12
C2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.15	0.02	0.09	0.01	0.14	0.14	0.22	0.32	0.26	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.04	0.15	0.09
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.18	0.00	0.24	0.00	0.25	0.24	0.21	0.12	0.13	0.27	0.17	0.01	0.01	0.01	0.13	0.27	0.06	0.17	0.12
C4	0.00	0.00	0.15	0.18	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.16	0.28	0.01	0.20	0.59	0.29
C4'	0.02	0.23	0.02	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.04	0.26	0.14	0.33	0.23	0.21	0.07	0.16	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.09	0.24	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.20	0.08	0.46	0.01	0.42	0.89	0.52
C5'	0.01	0.30	0.01	0.00	0.05	0.01	0.14	0.00	0.06	0.45	0.16	0.45	0.28	0.39	0.15	0.14	0.05	0.01	0.01	0.13	0.10	0.10	0.02
C6	0.01	0.00	0.14	0.25	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.22	0.14	0.41	0.00	0.35	0.89	0.46
C8	0.01	0.01	0.14	0.24	0.00	0.26	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.21	0.14	0.71	0.02	0.75	0.99	0.79
N1	0.01	0.00	0.22	0.21	0.01	0.14	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.23	0.25	0.00	0.20	0.67	0.24
N2	0.01	0.00	0.32	0.12	0.01	0.33	0.01	0.45	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.05	0.35	0.22	0.01	0.51	0.29	0.21
N3	0.01	0.00	0.26	0.13	0.00	0.23	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.06	0.28	0.15	0.01	0.27	0.37	0.10
N7	0.01	0.01	0.08	0.27	0.00	0.21	0.00	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.25	0.06	0.70	0.02	0.77	1.15	0.82
N9	0.00	0.01	0.03	0.17	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.02	0.37	0.01	0.32	0.59	0.40
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.04	0.16	0.09	0.14	0.04	0.28	0.12	0.34	0.23	0.25	0.10	0.00	0.06	0.15	0.07	0.09	0.03	0.13	0.08
O3'	0.05	0.10	0.01	0.01	0.13	0.02	0.20	0.05	0.22	0.21	0.16	0.05	0.06	0.25	0.11	0.06	0.00	0.02	0.17	0.26	0.08	0.24	0.14
O4'	0.00	0.29	0.01	0.01	0.16	0.00	0.08	0.01	0.14	0.14	0.23	0.35	0.28	0.06	0.02	0.15	0.02	0.00	0.17	0.10	0.17	0.16	0.13
O5'	0.15	0.17	0.07	0.13	0.28	0.01	0.46	0.01	0.41	0.71	0.25	0.22	0.15	0.70	0.37	0.07	0.17	0.17	0.00	0.49	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.12	0.27	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.26	0.10	0.49	0.00	0.49	1.06	0.58
OP1	0.13	0.30	0.04	0.06	0.20	0.10	0.42	0.10	0.35	0.75	0.20	0.51	0.27	0.77	0.32	0.03	0.08	0.17	0.01	0.49	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.44	0.15	0.17	0.59	0.04	0.89	0.10	0.89	0.99	0.67	0.29	0.37	1.15	0.59	0.13	0.24	0.16	0.01	1.06	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.12	0.09	0.12	0.29	0.01	0.52	0.02	0.46	0.79	0.24	0.21	0.10	0.82	0.40	0.08	0.14	0.13	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.75	0.43	0.62	0.44	0.54	0.26	0.54	0.38	0.08	0.61	0.71	0.26	0.04	0.25	0.24	0.81	0.29	0.35	0.35	0.16	0.23
C2	0.34	1.09	0.30	0.45	0.68	0.41	0.56	0.33	0.73	0.13	0.97	1.00	0.65	0.26	0.39	0.22	0.66	0.27	0.13	0.14	0.09	0.03
C2'	0.08	0.40	0.24	0.46	0.08	0.36	0.15	0.41	0.08	0.44	0.23	0.38	0.21	0.45	0.10	0.15	0.71	0.06	0.18	0.31	0.13	0.11
C3'	0.51	0.70	0.73	0.99	0.45	0.81	0.25	0.90	0.32	0.09	0.53	0.70	0.17	0.07	0.34	0.47	1.22	0.46	0.76	0.93	0.55	0.66
C4	0.37	1.00	0.39	0.58	0.60	0.51	0.45	0.45	0.62	0.07	0.86	0.91	0.52	0.15	0.35	0.26	0.81	0.29	0.26	0.25	0.09	0.13
C4'	0.96	1.12	1.16	1.38	0.91	1.17	0.73	1.23	0.79	0.55	0.98	1.13	0.66	0.52	0.81	0.87	1.53	0.87	1.15	1.14	0.91	0.98
C5	0.37	1.12	0.37	0.56	0.66	0.48	0.53	0.42	0.72	0.10	0.99	1.00	0.64	0.21	0.38	0.30	0.83	0.27	0.25	0.27	0.09	0.13
C5'	1.28	1.38	1.56	1.81	1.21	1.47	1.05	1.51	1.09	0.91	1.25	1.39	0.97	0.87	1.14	1.27	1.99	1.13	1.54	1.57	1.34	1.36
C6	0.35	1.23	0.33	0.49	0.72	0.42	0.61	0.35	0.83	0.15	1.11	1.07	0.76	0.29	0.40	0.31	0.76	0.25	0.19	0.22	0.07	0.09
C8	0.38	0.99	0.42	0.63	0.58	0.52	0.42	0.49	0.59	0.06	0.85	0.90	0.48	0.11	0.33	0.30	0.88	0.29	0.33	0.36	0.15	0.21
N1	0.33	1.23	0.29	0.43	0.73	0.38	0.63	0.31	0.84	0.17	1.11	1.08	0.77	0.32	0.40	0.27	0.68	0.24	0.14	0.16	0.08	0.04
N2	0.30	1.07	0.24	0.34	0.70	0.32	0.59	0.24	0.75	0.16	0.96	1.00	0.67	0.30	0.40	0.15	0.52	0.23	0.06	0.07	0.13	0.04
N3	0.37	0.95	0.36	0.53	0.60	0.50	0.45	0.42	0.60	0.07	0.82	0.89	0.50	0.16	0.35	0.21	0.73	0.30	0.20	0.18	0.07	0.08
N7	0.38	1.10	0.40	0.60	0.64	0.50	0.50	0.45	0.69	0.09	0.97	0.98	0.60	0.18	0.36	0.32	0.87	0.28	0.29	0.33	0.12	0.18
N9	0.37	0.91	0.42	0.62	0.54	0.53	0.37	0.51	0.52	0.05	0.77	0.84	0.42	0.08	0.31	0.26	0.85	0.29	0.32	0.32	0.13	0.19
O2'	0.24	0.16	0.17	0.13	0.22	0.12	0.44	0.17	0.32	0.78	0.08	0.13	0.48	0.77	0.41	0.38	0.28	0.27	0.34	0.29	0.55	0.45
O3'	0.59	0.72	0.83	1.07	0.50	0.89	0.29	1.01	0.34	0.16	0.55	0.73	0.19	0.12	0.41	0.56	1.25	0.56	0.90	1.13	0.73	0.85
O4'	0.82	1.10	0.94	1.14	0.84	0.98	0.66	0.95	0.75	0.42	0.95	1.08	0.62	0.41	0.70	0.68	1.31	0.71	0.81	0.68	0.56	0.60
O5'	1.04	1.16	1.34	1.63	0.99	1.27	0.85	1.31	0.89	0.73	1.04	1.16	0.79	0.70	0.92	1.10	1.91	0.89	1.35	1.47	1.20	1.21
O6	0.33	1.30	0.31	0.47	0.75	0.39	0.66	0.33	0.90	0.18	1.20	1.10	0.85	0.33	0.41	0.34	0.74	0.23	0.18	0.22	0.06	0.08
OP1	1.60	1.66	2.01	2.28	1.56	1.74	1.47	1.74	1.49	1.39	1.59	1.67	1.43	1.36	1.52	1.74	2.54	1.38	1.96	2.08	1.94	1.83
OP2	0.72	0.86	1.04	1.38	0.70	0.96	0.60	1.04	0.65	0.51	0.76	0.85	0.57	0.50	0.64	0.77	1.70	0.57	1.18	1.47	1.19	1.14
P	1.16	1.27	1.50	1.79	1.13	1.33	1.01	1.33	1.05	0.90	1.18	1.27	0.97	0.88	1.06	1.25	2.08	0.96	1.47	1.59	1.39	1.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.01	0.09	0.06	0.18	0.12
C2	0.02	0.00	0.29	0.31	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.26	0.16	0.29	0.28	0.51	0.30
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.14	0.02	0.06	0.04	0.12	0.17	0.23	0.29	0.08	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.17	0.15	0.25	0.19
C3'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.25	0.00	0.29	0.02	0.33	0.19	0.34	0.26	0.35	0.25	0.17	0.02	0.01	0.01	0.12	0.14	0.11	0.12
C4	0.01	0.00	0.14	0.25	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.16	0.08	0.33	0.32	0.47	0.33
C4'	0.03	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.09	0.20	0.03	0.06	0.14	0.20	0.08	0.20	0.04	0.01	0.02	0.06	0.06	0.04
C5	0.01	0.00	0.06	0.29	0.00	0.12	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.18	0.04	0.48	0.51	0.66	0.51
C5'	0.00	0.03	0.04	0.02	0.12	0.00	0.24	0.00	0.22	0.34	0.12	0.02	0.30	0.36	0.16	0.14	0.08	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03
C6	0.02	0.01	0.12	0.33	0.00	0.09	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.24	0.06	0.49	0.55	0.73	0.53
C8	0.01	0.01	0.17	0.19	0.00	0.20	0.00	0.34	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.10	0.12	0.50	0.50	0.55	0.51
N1	0.02	0.00	0.23	0.34	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.27	0.12	0.40	0.43	0.64	0.43
N3	0.02	0.00	0.29	0.26	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.22	0.15	0.23	0.20	0.40	0.23
N6	0.02	0.01	0.08	0.35	0.00	0.14	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.26	0.04	0.57	0.68	0.85	0.64
N7	0.01	0.01	0.09	0.25	0.00	0.20	0.00	0.36	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.31	0.16	0.07	0.58	0.63	0.74	0.63
N9	0.01	0.01	0.01	0.17	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.06	0.03	0.30	0.28	0.37	0.29
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.13	0.20	0.23	0.14	0.20	0.30	0.11	0.06	0.25	0.31	0.17	0.00	0.08	0.17	0.07	0.07	0.19	0.08
O3'	0.13	0.26	0.02	0.01	0.16	0.04	0.18	0.08	0.24	0.10	0.27	0.22	0.26	0.16	0.06	0.08	0.00	0.05	0.18	0.30	0.20	0.22
O4'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.12	0.12	0.15	0.04	0.07	0.03	0.17	0.05	0.00	0.11	0.09	0.19	0.14
O5'	0.09	0.29	0.17	0.12	0.33	0.02	0.48	0.01	0.49	0.50	0.40	0.23	0.57	0.58	0.30	0.07	0.18	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.28	0.15	0.14	0.32	0.06	0.51	0.06	0.55	0.50	0.43	0.20	0.68	0.63	0.28	0.07	0.30	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.51	0.25	0.11	0.47	0.06	0.66	0.02	0.73	0.55	0.64	0.40	0.85	0.74	0.37	0.19	0.20	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.30	0.19	0.12	0.33	0.04	0.51	0.03	0.53	0.51	0.43	0.23	0.64	0.63	0.29	0.08	0.22	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00