Doublet Group distance statistics: 51210

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.025 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.014, 0.030, 0.045, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.015, 0.034, 0.054, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.034 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.018, 0.042, 0.067, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.042 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.025, 0.054, 0.083, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.054 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.014, 0.046, 0.078, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.046 std_dev=0.032
O2'	A	0, 0.159, 0.336, 0.512, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.336 std_dev=0.177
O4'	A	0, 0.146, 0.323, 0.500, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.323 std_dev=0.177
C2'	A	0, 0.131, 0.308, 0.485, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.308 std_dev=0.177
C2'	B	0, 0.160, 0.356, 0.553, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.356 std_dev=0.197
N7	B	0, 0.118, 0.336, 0.555, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.336 std_dev=0.218
C8	B	0, 0.082, 0.305, 0.528, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.305 std_dev=0.223
C5	B	0, 0.088, 0.330, 0.572, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.330 std_dev=0.242
N9	B	0, 0.013, 0.270, 0.526, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.270 std_dev=0.256
C4	B	0, 0.020, 0.284, 0.549, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.284 std_dev=0.265
C6	B	0, 0.116, 0.386, 0.655, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.386 std_dev=0.269
C4'	A	0, 0.160, 0.430, 0.700, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.430 std_dev=0.270
N6	B	0, 0.165, 0.442, 0.719, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.442 std_dev=0.277
C3'	A	0, 0.191, 0.475, 0.760, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.475 std_dev=0.284
O2'	B	0, 0.068, 0.356, 0.644, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.356 std_dev=0.288
C1'	B	0, -0.005, 0.286, 0.577, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.286 std_dev=0.291
O4'	B	0, 0.297, 0.590, 0.883, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.590 std_dev=0.293
N3	B	0, 0.009, 0.302, 0.595, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.302 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.271, 0.569, 0.867, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.569 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.089, 0.392, 0.695, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.392 std_dev=0.303
C2	B	0, 0.042, 0.350, 0.659, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.350 std_dev=0.309
C4'	B	0, 0.416, 0.758, 1.101, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.758 std_dev=0.343
O3'	B	0, 0.326, 0.687, 1.049, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.687 std_dev=0.361
O5'	A	0, 0.152, 0.533, 0.914, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.533 std_dev=0.381
O3'	A	0, 0.237, 0.630, 1.022, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.630 std_dev=0.393
C5'	A	0, 0.324, 0.777, 1.229, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.777 std_dev=0.453
O5'	B	0, 0.001, 0.590, 1.178, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.590 std_dev=0.588
C5'	B	0, 0.697, 1.301, 1.905, 1.754 max_d=1.754 avg_d=1.301 std_dev=0.604
P	A	0, -0.211, 0.588, 1.386, 2.356 max_d=2.356 avg_d=0.588 std_dev=0.798
OP1	A	0, -0.051, 0.834, 1.719, 2.737 max_d=2.737 avg_d=0.834 std_dev=0.885
P	B	0, -0.298, 0.756, 1.811, 3.089 max_d=3.089 avg_d=0.756 std_dev=1.054
OP2	A	0, -0.334, 0.749, 1.831, 3.144 max_d=3.144 avg_d=0.749 std_dev=1.083
OP2	B	0, -0.291, 1.284, 2.858, 4.748 max_d=4.748 avg_d=1.284 std_dev=1.575
OP1	B	0, -0.332, 1.334, 2.999, 4.999 max_d=4.999 avg_d=1.334 std_dev=1.665

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.38	0.05	0.22
C2	0.02	0.00	0.02	0.14	0.01	0.13	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.17	0.07	0.25	0.01	0.20	0.21	0.20
C2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.27	0.16	0.10
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.12	0.15	0.13	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.10	0.16	0.30	0.06
C4	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.15	0.01	0.15	0.12	0.11
C4'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.03	0.09	0.16	0.13	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.28	0.18	0.09
C5	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.12	0.01	0.21	0.26	0.21
C5'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.04	0.15	0.25	0.19	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.09	0.14	0.22	0.01
C6	0.02	0.00	0.02	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.15	0.01	0.12	0.24	0.13
C8	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.45	0.33	0.37
N1	0.02	0.00	0.02	0.12	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.15	0.05	0.20	0.01	0.15	0.14	0.11
N2	0.03	0.00	0.02	0.15	0.01	0.16	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.20	0.09	0.29	0.02	0.35	0.40	0.36
N3	0.02	0.01	0.02	0.13	0.00	0.13	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.07	0.24	0.01	0.11	0.20	0.14
N7	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.06	0.01	0.38	0.39	0.35
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.32	0.16	0.24
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.02	0.31	0.22	0.09
O3'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.09	0.01	0.09	0.02	0.12	0.02	0.15	0.20	0.14	0.05	0.03	0.03	0.00	0.01	0.09	0.13	0.09	0.51	0.16
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.09	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.42	0.10	0.27
O5'	0.04	0.25	0.04	0.07	0.15	0.01	0.12	0.00	0.15	0.04	0.20	0.29	0.24	0.06	0.08	0.05	0.09	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.02	0.14	0.00	0.14	0.32	0.16
OP1	0.38	0.20	0.27	0.16	0.15	0.28	0.21	0.14	0.12	0.45	0.15	0.35	0.11	0.38	0.32	0.31	0.09	0.42	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.21	0.16	0.30	0.12	0.18	0.26	0.22	0.24	0.33	0.14	0.40	0.20	0.39	0.16	0.22	0.51	0.10	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.20	0.10	0.06	0.11	0.09	0.21	0.01	0.13	0.37	0.11	0.36	0.14	0.35	0.24	0.09	0.16	0.27	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.29	0.26	0.28	0.28	0.25	0.29	0.30	0.30	0.28	0.30	0.28	0.30	0.30	0.27	0.26	0.28	0.23	0.06	0.70	0.21	0.16
C2	0.18	0.32	0.17	0.15	0.28	0.14	0.29	0.18	0.31	0.23	0.32	0.29	0.31	0.26	0.23	0.17	0.13	0.15	0.27	0.90	0.12	0.34
C2'	0.33	0.37	0.33	0.35	0.37	0.32	0.38	0.36	0.38	0.38	0.38	0.37	0.38	0.39	0.36	0.33	0.35	0.31	0.10	0.80	0.05	0.28
C3'	0.15	0.24	0.19	0.24	0.24	0.17	0.27	0.23	0.28	0.26	0.27	0.22	0.30	0.29	0.22	0.18	0.25	0.12	0.05	0.31	0.31	0.02
C4	0.22	0.30	0.21	0.22	0.28	0.21	0.29	0.26	0.30	0.26	0.31	0.28	0.30	0.28	0.25	0.22	0.21	0.20	0.18	0.93	0.19	0.28
C4'	0.09	0.17	0.14	0.18	0.16	0.13	0.19	0.17	0.21	0.16	0.20	0.15	0.23	0.20	0.13	0.13	0.21	0.08	0.11	0.10	0.60	0.18
C5	0.19	0.29	0.18	0.20	0.26	0.19	0.27	0.24	0.29	0.23	0.30	0.26	0.30	0.26	0.22	0.19	0.18	0.18	0.21	1.00	0.20	0.30
C5'	0.16	0.15	0.19	0.22	0.14	0.20	0.16	0.21	0.17	0.14	0.16	0.14	0.19	0.16	0.14	0.18	0.23	0.18	0.21	0.22	1.01	0.40
C6	0.15	0.29	0.14	0.15	0.24	0.15	0.26	0.20	0.29	0.20	0.30	0.25	0.30	0.24	0.19	0.14	0.13	0.14	0.26	1.03	0.17	0.34
C8	0.22	0.29	0.23	0.25	0.27	0.24	0.28	0.29	0.29	0.25	0.29	0.27	0.29	0.27	0.25	0.24	0.25	0.22	0.13	0.90	0.25	0.22
N1	0.14	0.30	0.13	0.13	0.25	0.13	0.27	0.18	0.31	0.19	0.32	0.27	0.31	0.24	0.19	0.13	0.10	0.12	0.29	0.99	0.14	0.35
N2	0.17	0.33	0.14	0.11	0.29	0.11	0.29	0.15	0.31	0.21	0.33	0.31	0.30	0.24	0.23	0.14	0.09	0.11	0.31	0.79	0.09	0.34
N3	0.22	0.31	0.21	0.21	0.29	0.19	0.30	0.23	0.31	0.26	0.32	0.30	0.30	0.28	0.26	0.22	0.19	0.20	0.21	0.87	0.14	0.30
N7	0.20	0.28	0.20	0.22	0.25	0.21	0.27	0.27	0.28	0.23	0.29	0.26	0.29	0.26	0.22	0.20	0.21	0.19	0.18	0.99	0.24	0.27
N9	0.24	0.30	0.24	0.26	0.28	0.24	0.29	0.29	0.30	0.27	0.30	0.29	0.30	0.29	0.26	0.25	0.26	0.23	0.12	0.85	0.23	0.22
O2'	0.37	0.39	0.38	0.40	0.39	0.38	0.38	0.42	0.38	0.39	0.39	0.39	0.37	0.38	0.38	0.40	0.41	0.36	0.13	0.79	0.33	0.36
O3'	0.10	0.20	0.16	0.21	0.19	0.12	0.23	0.17	0.25	0.22	0.23	0.18	0.27	0.25	0.17	0.14	0.24	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.15	0.22	0.17	0.21	0.21	0.17	0.23	0.22	0.25	0.20	0.24	0.20	0.26	0.23	0.18	0.17	0.23	0.13	0.07	0.37	0.52	0.06
O5'	0.17	0.10	0.15	0.16	0.09	0.20	0.10	0.20	0.13	0.09	0.12	0.09	0.18	0.10	0.11	0.16	0.15	0.22	0.15	0.10	1.05	0.35
O6	0.12	0.27	0.12	0.13	0.21	0.13	0.24	0.19	0.27	0.17	0.29	0.23	0.28	0.21	0.16	0.12	0.11	0.12	0.27	1.07	0.17	0.35
OP1	0.54	0.64	0.54	0.48	0.63	0.41	0.66	0.33	0.66	0.61	0.65	0.62	0.66	0.66	0.59	0.50	0.43	0.47	0.12	0.22	1.11	0.41
OP2	0.80	0.43	0.88	0.95	0.58	0.91	0.46	0.93	0.29	0.73	0.31	0.55	0.13	0.54	0.72	0.86	0.95	0.83	0.37	0.23	0.62	0.13
P	0.59	0.47	0.60	0.58	0.53	0.56	0.50	0.51	0.42	0.59	0.42	0.52	0.35	0.53	0.58	0.58	0.55	0.57	0.13	0.08	0.90	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.15	0.25	0.17
C2	0.04	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.11	0.04	0.39	0.39	0.77	0.46
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.08	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.24	0.39	0.14	0.24
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.08	0.08	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.32	0.59	0.05	0.30
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.40	0.39	0.75	0.46
C4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.17	0.25	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.51	0.51	1.02	0.61
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.07	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.29	0.35	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.52	0.55	1.10	0.64
C8	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.52	0.48	0.92	0.57
N1	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.09	0.03	0.46	0.49	0.97	0.57
N3	0.04	0.00	0.08	0.08	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.08	0.09	0.04	0.34	0.33	0.62	0.39
N6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.08	0.03	0.58	0.63	1.28	0.73
N7	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.03	0.57	0.57	1.15	0.68
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.37	0.35	0.63	0.40
O2'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.09	0.08	0.06	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.09	0.22	0.14	0.08
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.08	0.07	0.09	0.09	0.08	0.07	0.04	0.03	0.00	0.01	0.27	0.71	0.17	0.28
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.08	0.15	0.07
O5'	0.16	0.39	0.24	0.32	0.40	0.01	0.51	0.00	0.52	0.52	0.46	0.34	0.58	0.57	0.37	0.09	0.27	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.39	0.39	0.59	0.39	0.17	0.51	0.29	0.55	0.48	0.49	0.33	0.63	0.57	0.35	0.22	0.71	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.77	0.14	0.05	0.75	0.25	1.02	0.35	1.10	0.92	0.97	0.62	1.28	1.15	0.63	0.14	0.17	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.46	0.24	0.30	0.46	0.01	0.61	0.01	0.64	0.57	0.57	0.39	0.73	0.68	0.40	0.08	0.28	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00