Doublet Group distance statistics: 51212

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N9	A	0, -0.004, 0.020, 0.043, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.024
C4	A	0, -0.001, 0.023, 0.047, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.023 std_dev=0.024
C2	A	0, -0.006, 0.018, 0.042, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.018 std_dev=0.024
C5	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.025 std_dev=0.024
N3	A	0, -0.004, 0.024, 0.052, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.024 std_dev=0.028
C1'	A	0, -0.008, 0.022, 0.052, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.022 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.008, 0.040, 0.071, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.040 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.005, 0.038, 0.071, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.038 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.004, 0.040, 0.076, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.040 std_dev=0.036
N2	A	0, -0.002, 0.039, 0.080, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.039 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.036, 0.084, 0.132, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.084 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.043, 0.098, 0.153, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.098 std_dev=0.055
C4'	A	0, 0.072, 0.157, 0.243, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.157 std_dev=0.085
C3'	A	0, 0.084, 0.172, 0.261, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.172 std_dev=0.088
O2'	A	0, 0.051, 0.168, 0.286, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.168 std_dev=0.118
C5'	A	0, 0.119, 0.243, 0.366, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.243 std_dev=0.124
O5'	A	0, 0.116, 0.252, 0.388, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.252 std_dev=0.136
O3'	A	0, 0.120, 0.285, 0.449, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.285 std_dev=0.164
P	A	0, 0.128, 0.300, 0.472, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.300 std_dev=0.172
C1'	B	0, 0.135, 0.311, 0.487, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.311 std_dev=0.176
O4'	B	0, 0.173, 0.353, 0.534, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.353 std_dev=0.180
C4'	B	0, 0.172, 0.354, 0.536, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.354 std_dev=0.182
OP1	A	0, 0.165, 0.350, 0.535, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.350 std_dev=0.185
OP2	A	0, 0.134, 0.339, 0.543, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.339 std_dev=0.205
C3'	B	0, 0.219, 0.442, 0.666, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.442 std_dev=0.224
C2'	B	0, 0.209, 0.438, 0.668, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.438 std_dev=0.230
P	B	0, 0.170, 0.415, 0.660, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.415 std_dev=0.245
C5'	B	0, 0.160, 0.427, 0.693, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.427 std_dev=0.267
C5	B	0, 0.245, 0.548, 0.852, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.548 std_dev=0.303
C6	B	0, 0.233, 0.540, 0.846, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.540 std_dev=0.307
C4	B	0, 0.228, 0.538, 0.848, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.538 std_dev=0.310
N6	B	0, 0.223, 0.535, 0.847, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.535 std_dev=0.312
OP2	B	0, 0.256, 0.585, 0.914, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.585 std_dev=0.329
O2'	B	0, 0.306, 0.641, 0.976, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.641 std_dev=0.335
OP1	B	0, 0.150, 0.504, 0.859, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.504 std_dev=0.354
O3'	B	0, 0.295, 0.651, 1.008, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.651 std_dev=0.357
N9	B	0, 0.218, 0.591, 0.964, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.591 std_dev=0.373
O5'	B	0, 0.131, 0.659, 1.187, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.659 std_dev=0.528
N1	B	0, 0.196, 1.611, 3.025, 3.465 max_d=3.465 avg_d=1.611 std_dev=1.414
N7	B	0, 0.100, 1.599, 3.098, 3.473 max_d=3.473 avg_d=1.599 std_dev=1.499
N3	B	0, 0.093, 1.597, 3.100, 3.485 max_d=3.485 avg_d=1.597 std_dev=1.504
C8	B	0, 0.059, 1.586, 3.113, 3.462 max_d=3.462 avg_d=1.586 std_dev=1.527
C2	B	0, 0.058, 2.059, 4.060, 4.609 max_d=4.609 avg_d=2.059 std_dev=2.001

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.01	0.11	0.06	0.05
C2	0.05	0.00	0.10	0.07	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.14	0.11	0.03	0.15	0.01	0.14	0.10	0.10
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.07	0.12	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.07	0.03
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.10	0.08	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04
C4	0.03	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.16	0.02	0.14	0.10	0.10
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.06	0.06	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.15	0.01	0.12	0.09	0.09
C5'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.13	0.00	0.10	0.08	0.08
C8	0.03	0.02	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.04	0.16	0.02	0.13	0.08	0.10
N1	0.04	0.01	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.11	0.07	0.01	0.14	0.01	0.12	0.09	0.08
N2	0.06	0.00	0.12	0.10	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.18	0.14	0.05	0.16	0.02	0.15	0.11	0.10
N3	0.06	0.01	0.10	0.08	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.11	0.04	0.16	0.02	0.16	0.11	0.11
N7	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.04	0.14	0.03	0.11	0.08	0.09
N9	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.15	0.01	0.14	0.09	0.10
O2'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.06	0.06	0.04	0.11	0.18	0.13	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.04	0.05	0.05	0.04	0.03
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.08	0.07	0.14	0.11	0.08	0.03	0.05	0.00	0.01	0.15	0.06	0.05	0.09	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.10	0.03	0.12	0.06	0.06
O5'	0.09	0.15	0.02	0.06	0.16	0.01	0.15	0.01	0.13	0.16	0.14	0.16	0.16	0.14	0.15	0.04	0.15	0.10	0.00	0.11	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.03	0.11	0.00	0.07	0.07	0.06
OP1	0.11	0.14	0.08	0.06	0.14	0.08	0.12	0.10	0.10	0.13	0.12	0.15	0.16	0.11	0.14	0.05	0.05	0.12	0.02	0.07	0.00	0.00	0.01
OP2	0.06	0.10	0.07	0.05	0.10	0.03	0.09	0.02	0.08	0.08	0.09	0.11	0.11	0.08	0.09	0.04	0.09	0.06	0.02	0.07	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.10	0.03	0.04	0.10	0.02	0.09	0.01	0.08	0.10	0.08	0.10	0.11	0.09	0.10	0.03	0.11	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.81	0.09	0.18	0.18	0.09	0.15	0.27	0.16	0.68	0.56	0.70	0.14	0.58	0.22	0.14	0.28	0.19	0.48	0.34	0.23	0.21
C2	0.22	1.46	0.15	0.17	0.28	0.12	0.25	0.12	0.21	1.32	0.98	1.25	0.17	1.13	0.43	0.18	0.28	0.15	0.14	0.40	0.19	0.11
C2'	0.18	0.76	0.10	0.16	0.16	0.14	0.18	0.34	0.15	0.71	0.52	0.64	0.17	0.61	0.27	0.12	0.23	0.25	0.49	0.38	0.23	0.24
C3'	0.17	0.78	0.09	0.13	0.16	0.15	0.18	0.38	0.16	0.71	0.54	0.64	0.17	0.62	0.26	0.12	0.21	0.26	0.48	0.41	0.23	0.24
C4	0.15	1.25	0.09	0.19	0.25	0.07	0.19	0.17	0.20	1.06	0.86	1.07	0.14	0.92	0.33	0.14	0.31	0.15	0.32	0.37	0.21	0.14
C4'	0.13	0.68	0.11	0.15	0.16	0.15	0.15	0.36	0.16	0.56	0.48	0.57	0.15	0.49	0.20	0.17	0.21	0.22	0.51	0.39	0.24	0.25
C5	0.17	1.41	0.10	0.19	0.27	0.08	0.23	0.16	0.21	1.20	0.97	1.18	0.16	1.06	0.37	0.14	0.31	0.14	0.33	0.36	0.22	0.16
C5'	0.11	0.76	0.12	0.16	0.18	0.13	0.15	0.36	0.17	0.60	0.54	0.63	0.15	0.53	0.20	0.20	0.24	0.21	0.51	0.38	0.24	0.25
C6	0.20	1.58	0.12	0.18	0.28	0.10	0.29	0.14	0.22	1.36	1.08	1.29	0.21	1.24	0.43	0.16	0.29	0.14	0.25	0.37	0.22	0.15
C8	0.13	1.18	0.09	0.19	0.24	0.04	0.17	0.20	0.19	0.97	0.82	0.99	0.13	0.85	0.29	0.14	0.31	0.16	0.45	0.33	0.22	0.20
N1	0.22	1.61	0.15	0.17	0.28	0.12	0.30	0.13	0.22	1.43	1.10	1.33	0.21	1.28	0.46	0.19	0.28	0.14	0.18	0.39	0.20	0.13
N2	0.25	1.53	0.19	0.17	0.30	0.14	0.26	0.09	0.22	1.43	1.01	1.34	0.16	1.20	0.47	0.23	0.26	0.14	0.13	0.42	0.17	0.11
N3	0.17	1.23	0.11	0.18	0.26	0.09	0.18	0.15	0.20	1.08	0.84	1.08	0.13	0.90	0.34	0.14	0.30	0.16	0.21	0.39	0.19	0.11
N7	0.15	1.36	0.09	0.19	0.26	0.06	0.21	0.18	0.21	1.12	0.94	1.12	0.15	1.00	0.34	0.14	0.31	0.15	0.40	0.34	0.22	0.19
N9	0.12	1.08	0.09	0.19	0.23	0.05	0.15	0.21	0.18	0.90	0.75	0.92	0.12	0.77	0.27	0.14	0.31	0.16	0.43	0.34	0.22	0.18
O2'	0.20	0.46	0.10	0.13	0.11	0.20	0.19	0.43	0.12	0.54	0.30	0.38	0.19	0.47	0.25	0.12	0.18	0.30	0.46	0.38	0.22	0.22
O3'	0.23	0.63	0.09	0.08	0.11	0.21	0.22	0.44	0.13	0.69	0.43	0.51	0.20	0.61	0.30	0.07	0.12	0.32	0.40	0.44	0.26	0.25
O4'	0.10	0.74	0.13	0.19	0.19	0.11	0.14	0.30	0.18	0.57	0.52	0.63	0.14	0.49	0.18	0.19	0.27	0.18	0.52	0.36	0.24	0.24
O5'	0.22	0.87	0.10	0.14	0.16	0.17	0.26	0.36	0.17	0.85	0.60	0.71	0.24	0.77	0.33	0.13	0.21	0.28	0.49	0.34	0.21	0.22
O6	0.21	1.66	0.13	0.17	0.27	0.11	0.32	0.14	0.22	1.43	1.15	1.33	0.24	1.33	0.46	0.17	0.28	0.14	0.26	0.37	0.22	0.16
OP1	0.23	0.84	0.12	0.15	0.15	0.22	0.27	0.43	0.15	0.85	0.58	0.67	0.24	0.78	0.34	0.14	0.19	0.31	0.46	0.43	0.28	0.28
OP2	0.21	1.11	0.06	0.12	0.15	0.14	0.27	0.35	0.12	1.04	0.76	0.88	0.22	0.96	0.37	0.10	0.23	0.27	0.43	0.37	0.18	0.19
P	0.18	0.96	0.08	0.14	0.16	0.15	0.23	0.35	0.14	0.88	0.66	0.77	0.21	0.80	0.31	0.13	0.22	0.25	0.48	0.36	0.21	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.04	0.01	0.07	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.22	0.28	0.26	0.03
C2	0.08	0.00	0.59	0.21	0.00	0.42	0.01	0.55	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	1.04	0.11	0.63	0.33	0.32	0.31	0.25
C2'	0.01	0.59	0.00	0.01	0.27	0.01	0.07	0.11	0.22	0.40	0.43	0.60	0.14	0.26	0.05	0.00	0.01	0.01	0.18	0.15	0.28	0.04
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.08	0.01	0.02	0.04	0.07	0.19	0.15	0.21	0.05	0.14	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.21	0.17	0.03
C4	0.05	0.00	0.27	0.08	0.00	0.20	0.01	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.46	0.07	0.32	0.30	0.24	0.14	0.06
C4'	0.01	0.42	0.01	0.01	0.20	0.00	0.11	0.00	0.19	0.14	0.34	0.40	0.13	0.06	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.36	0.17	0.01
C5	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.11	0.00	0.24	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.16	0.07	0.15	0.31	0.20	0.35	0.09
C5'	0.06	0.55	0.11	0.04	0.30	0.00	0.24	0.00	0.33	0.16	0.48	0.50	0.27	0.15	0.14	0.09	0.04	0.02	0.00	0.44	0.22	0.01
C6	0.04	0.01	0.22	0.07	0.01	0.19	0.02	0.33	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.41	0.08	0.27	0.32	0.20	0.18	0.05
C8	0.01	0.01	0.40	0.19	0.01	0.14	0.01	0.16	0.03	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.57	0.11	0.29	0.34	0.27	0.76	0.29
N1	0.07	0.01	0.43	0.15	0.01	0.34	0.01	0.48	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.78	0.09	0.49	0.32	0.24	0.12	0.15
N3	0.09	0.00	0.60	0.21	0.01	0.40	0.01	0.50	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	1.01	0.10	0.64	0.31	0.32	0.25	0.23
N6	0.02	0.01	0.14	0.05	0.02	0.13	0.03	0.27	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.07	0.03	0.28	0.09	0.17	0.35	0.20	0.29	0.08
N7	0.01	0.01	0.26	0.14	0.02	0.06	0.01	0.15	0.03	0.00	0.02	0.02	0.07	0.00	0.02	0.36	0.09	0.14	0.34	0.25	0.71	0.27
N9	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.28	0.23	0.39	0.09
O2'	0.01	1.04	0.00	0.01	0.46	0.02	0.16	0.09	0.41	0.57	0.78	1.01	0.28	0.36	0.04	0.00	0.04	0.01	0.12	0.07	0.30	0.08
O3'	0.04	0.11	0.01	0.01	0.07	0.03	0.07	0.04	0.08	0.11	0.09	0.10	0.09	0.09	0.06	0.04	0.00	0.01	0.15	0.22	0.12	0.04
O4'	0.00	0.63	0.01	0.01	0.32	0.01	0.15	0.02	0.27	0.29	0.49	0.64	0.17	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.40	0.19	0.08
O5'	0.22	0.33	0.18	0.04	0.30	0.01	0.31	0.00	0.32	0.34	0.32	0.31	0.35	0.34	0.28	0.12	0.15	0.24	0.00	0.01	0.04	0.01
OP1	0.28	0.32	0.15	0.21	0.24	0.36	0.20	0.44	0.20	0.27	0.24	0.32	0.20	0.25	0.23	0.07	0.22	0.40	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.26	0.31	0.28	0.17	0.14	0.17	0.35	0.22	0.18	0.76	0.12	0.25	0.29	0.71	0.39	0.30	0.12	0.19	0.04	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.25	0.04	0.03	0.06	0.01	0.09	0.01	0.05	0.29	0.15	0.23	0.08	0.27	0.09	0.08	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00