Doublet Group distance statistics: 51214

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.004, 0.021, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.003, 0.021, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.003, 0.022, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.006, 0.028, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.026, 0.087, 0.147, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.087 std_dev=0.061
C4'	A	0, 0.072, 0.172, 0.271, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.172 std_dev=0.100
C2'	A	0, 0.004, 0.110, 0.216, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.110 std_dev=0.106
C3'	A	0, 0.069, 0.182, 0.294, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.182 std_dev=0.112
O3'	A	0, 0.096, 0.235, 0.373, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.235 std_dev=0.139
O2'	B	0, 0.111, 0.272, 0.433, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.272 std_dev=0.161
O2'	A	0, -0.021, 0.151, 0.323, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.151 std_dev=0.172
C2'	B	0, 0.093, 0.330, 0.566, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.330 std_dev=0.237
C5'	A	0, 0.108, 0.355, 0.602, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.355 std_dev=0.247
O5'	A	0, -0.015, 0.480, 0.975, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.480 std_dev=0.495
P	A	0, -0.132, 0.804, 1.740, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.804 std_dev=0.936
C3'	B	0, -0.145, 0.792, 1.729, 2.385 max_d=2.385 avg_d=0.792 std_dev=0.937
OP1	A	0, -0.052, 0.886, 1.824, 2.443 max_d=2.443 avg_d=0.886 std_dev=0.938
OP2	A	0, -0.233, 1.056, 2.346, 3.257 max_d=3.257 avg_d=1.056 std_dev=1.289
C1'	B	0, -0.393, 1.020, 2.433, 3.456 max_d=3.456 avg_d=1.020 std_dev=1.413
O3'	B	0, -0.471, 1.243, 2.956, 4.196 max_d=4.196 avg_d=1.243 std_dev=1.713
N9	B	0, -0.542, 1.247, 3.035, 4.330 max_d=4.330 avg_d=1.247 std_dev=1.789
C4'	B	0, -0.536, 1.327, 3.191, 4.541 max_d=4.541 avg_d=1.327 std_dev=1.863
O4'	B	0, -0.630, 1.386, 3.401, 4.867 max_d=4.867 avg_d=1.386 std_dev=2.016
C8	B	0, -0.634, 1.414, 3.461, 4.941 max_d=4.941 avg_d=1.414 std_dev=2.047
C4	B	0, -0.744, 1.549, 3.841, 5.506 max_d=5.506 avg_d=1.549 std_dev=2.293
N7	B	0, -0.737, 1.599, 3.934, 5.623 max_d=5.623 avg_d=1.599 std_dev=2.336
O5'	B	0, -0.728, 1.786, 4.300, 6.118 max_d=6.118 avg_d=1.786 std_dev=2.514
C5	B	0, -0.822, 1.751, 4.324, 6.191 max_d=6.191 avg_d=1.751 std_dev=2.573
N3	B	0, -0.917, 1.801, 4.519, 6.499 max_d=6.499 avg_d=1.801 std_dev=2.718
C5'	B	0, -0.888, 1.927, 4.741, 6.787 max_d=6.787 avg_d=1.927 std_dev=2.815
OP2	B	0, -0.869, 1.951, 4.772, 6.810 max_d=6.810 avg_d=1.951 std_dev=2.821
C6	B	0, -1.050, 2.228, 5.505, 7.889 max_d=7.889 avg_d=2.228 std_dev=3.278
P	B	0, -1.124, 2.304, 5.732, 8.221 max_d=8.221 avg_d=2.304 std_dev=3.428
C2	B	0, -1.198, 2.324, 5.846, 8.414 max_d=8.414 avg_d=2.324 std_dev=3.522
N6	B	0, -1.107, 2.470, 6.047, 8.647 max_d=8.647 avg_d=2.470 std_dev=3.577
N1	B	0, -1.257, 2.541, 6.339, 9.106 max_d=9.106 avg_d=2.541 std_dev=3.798
OP1	B	0, -1.505, 2.883, 7.272, 10.470 max_d=10.470 avg_d=2.883 std_dev=4.389

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.26	0.11
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.07	0.00	0.10	0.29	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.04	0.02	0.02	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.08	0.16	0.12	0.06
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.07	0.08	0.05	0.02	0.02	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.24	0.11	0.13
C4	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.07	0.01	0.10	0.27	0.13
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.12	0.12	0.03
C5	0.00	0.01	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.02	0.10	0.00	0.14	0.26	0.15
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.02	0.03	0.09	0.05	0.02	0.05	0.01	0.00	0.08	0.12	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.10	0.00	0.16	0.27	0.16
C8	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.09	0.01	0.13	0.25	0.14
N1	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.09	0.00	0.13	0.28	0.15
N2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.06	0.00	0.08	0.29	0.13
N3	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.08	0.29	0.13
N7	0.00	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.03	0.11	0.01	0.17	0.25	0.17
N9	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.08	0.27	0.12
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.03	0.06	0.17	0.12	0.02
O3'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.02	0.10	0.05	0.12	0.09	0.09	0.04	0.03	0.12	0.05	0.05	0.00	0.01	0.16	0.14	0.41	0.24	0.24
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.02	0.06	0.34	0.19
O5'	0.02	0.07	0.06	0.10	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.09	0.09	0.06	0.06	0.11	0.06	0.03	0.16	0.09	0.00	0.11	0.02	0.04	0.00
O6	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.11	0.00	0.19	0.26	0.18
OP1	0.03	0.10	0.16	0.24	0.10	0.12	0.14	0.12	0.16	0.13	0.13	0.08	0.08	0.17	0.08	0.17	0.41	0.06	0.02	0.19	0.00	0.02	0.00
OP2	0.26	0.29	0.12	0.11	0.27	0.12	0.26	0.05	0.27	0.25	0.28	0.29	0.29	0.25	0.27	0.12	0.24	0.34	0.04	0.26	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.13	0.06	0.13	0.13	0.03	0.15	0.01	0.16	0.14	0.15	0.13	0.13	0.17	0.12	0.02	0.24	0.19	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	1.21	0.13	0.38	0.49	1.06	0.42	1.41	0.76	0.27	1.12	0.92	0.72	0.05	0.04	0.21	0.34	0.90	1.12	1.60	1.01	1.32
C2	0.40	0.26	0.04	0.19	0.33	0.15	0.33	0.12	0.30	0.39	0.27	0.29	0.30	0.37	0.38	0.05	0.57	0.50	0.12	0.11	0.15	0.14
C2'	0.53	1.01	0.05	0.53	0.23	1.40	0.16	1.82	0.53	0.62	0.93	0.70	0.49	0.34	0.31	0.09	0.35	1.31	1.48	2.02	1.35	1.73
C3'	0.55	1.15	0.05	0.57	0.26	1.47	0.17	1.98	0.60	0.68	1.06	0.78	0.56	0.38	0.33	0.10	0.39	1.38	1.63	2.32	1.55	1.97
C4	0.35	0.40	0.06	0.10	0.03	0.60	0.04	0.74	0.14	0.39	0.34	0.26	0.12	0.26	0.24	0.13	0.20	0.75	0.59	0.73	0.56	0.70
C4'	0.23	1.62	0.12	0.52	0.65	1.31	0.58	1.84	1.05	0.32	1.54	1.21	1.01	0.04	0.04	0.21	0.53	1.07	1.51	2.27	1.41	1.82
C5	0.39	0.17	0.05	0.07	0.13	0.46	0.18	0.54	0.05	0.45	0.12	0.07	0.07	0.35	0.33	0.11	0.35	0.70	0.44	0.50	0.44	0.54
C5'	0.21	1.73	0.14	0.51	0.71	1.29	0.64	1.84	1.14	0.31	1.66	1.28	1.11	0.05	0.06	0.22	0.53	1.05	1.52	2.34	1.44	1.86
C6	0.43	0.26	0.04	0.19	0.37	0.19	0.39	0.17	0.35	0.48	0.29	0.29	0.36	0.46	0.43	0.06	0.59	0.56	0.16	0.12	0.20	0.20
C8	0.33	0.75	0.08	0.20	0.18	0.80	0.12	1.05	0.38	0.41	0.68	0.53	0.35	0.22	0.19	0.16	0.07	0.86	0.85	1.17	0.81	1.03
N1	0.43	0.47	0.05	0.27	0.47	0.08	0.47	0.13	0.48	0.45	0.48	0.47	0.48	0.46	0.45	0.04	0.70	0.45	0.12	0.30	0.12	0.12
N2	0.40	0.58	0.06	0.34	0.49	0.18	0.46	0.30	0.50	0.34	0.55	0.57	0.47	0.38	0.42	0.04	0.77	0.30	0.23	0.45	0.17	0.23
N3	0.35	0.24	0.05	0.07	0.05	0.51	0.08	0.58	0.05	0.35	0.20	0.14	0.04	0.25	0.25	0.12	0.26	0.68	0.46	0.52	0.43	0.53
N7	0.37	0.41	0.06	0.10	0.03	0.60	0.07	0.76	0.13	0.45	0.35	0.25	0.10	0.32	0.28	0.13	0.23	0.78	0.62	0.79	0.61	0.76
N9	0.30	0.81	0.09	0.23	0.24	0.84	0.18	1.09	0.44	0.36	0.73	0.58	0.41	0.16	0.14	0.17	0.09	0.85	0.87	1.19	0.81	1.03
O2'	0.44	1.28	0.04	0.65	0.42	1.54	0.35	2.03	0.77	0.50	1.20	0.92	0.73	0.18	0.18	0.08	0.59	1.29	1.64	2.28	1.47	1.90
O3'	0.64	1.18	0.07	0.64	0.21	1.63	0.12	2.24	0.59	0.82	1.09	0.78	0.55	0.50	0.43	0.09	0.42	1.55	1.87	2.72	1.81	2.30
O4'	0.09	1.57	0.18	0.42	0.72	1.08	0.65	1.50	1.06	0.15	1.48	1.21	1.02	0.17	0.17	0.25	0.48	0.83	1.21	1.83	1.11	1.45
O5'	0.30	1.46	0.11	0.46	0.52	1.22	0.43	1.72	0.88	0.44	1.37	1.06	0.84	0.14	0.09	0.21	0.39	1.08	1.43	2.15	1.39	1.76
O6	0.45	0.45	0.05	0.24	0.48	0.11	0.51	0.11	0.50	0.52	0.48	0.44	0.52	0.53	0.48	0.05	0.68	0.51	0.12	0.25	0.14	0.13
OP1	0.36	1.57	0.06	0.59	0.50	1.37	0.40	1.96	0.91	0.56	1.47	1.12	0.85	0.24	0.15	0.19	0.52	1.20	1.68	2.56	1.70	2.10
OP2	0.20	1.55	0.38	0.23	0.68	0.86	0.58	1.32	0.97	0.32	1.44	1.19	0.91	0.20	0.23	0.50	0.16	0.80	1.08	1.73	1.09	1.40
P	0.16	1.67	0.24	0.36	0.70	1.08	0.60	1.59	1.07	0.30	1.58	1.26	1.02	0.10	0.13	0.35	0.31	0.92	1.32	2.08	1.31	1.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01
C2	0.01	0.00	0.10	0.15	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.01	0.17	0.19	0.31	0.19
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.08	0.10	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.12	0.06
C3'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.04	0.13	0.14	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.12	0.09
C4	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.01	0.11	0.11	0.21	0.13
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.14	0.22	0.15
C5'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.13	0.07	0.13	0.11	0.13	0.09	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.01	0.14	0.19	0.28	0.19
C8	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03
N1	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.01	0.17	0.21	0.32	0.21
N3	0.01	0.00	0.10	0.14	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.01	0.14	0.14	0.26	0.15
N6	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.01	0.13	0.21	0.28	0.19
N7	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.09	0.13	0.09
N9	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.11	0.06
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.09	0.03
O3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.09	0.02	0.07	0.03	0.12	0.04	0.16	0.16	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.12	0.11	0.17	0.13
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.12	0.05	0.09
O5'	0.01	0.17	0.05	0.08	0.11	0.01	0.10	0.00	0.14	0.04	0.17	0.14	0.13	0.05	0.05	0.04	0.12	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.19	0.03	0.06	0.11	0.05	0.14	0.06	0.19	0.02	0.21	0.14	0.21	0.09	0.04	0.02	0.11	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.31	0.12	0.12	0.21	0.03	0.22	0.01	0.28	0.06	0.32	0.26	0.28	0.13	0.11	0.09	0.17	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.19	0.06	0.09	0.13	0.01	0.15	0.00	0.19	0.03	0.21	0.15	0.19	0.09	0.06	0.03	0.13	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00