Doublet Group distance statistics: 51216

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N1	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N3	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
O6	A	0, 0.000, 0.032, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
N2	A	0, 0.000, 0.084, 0.168, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.084 std_dev=0.084
O4'	B	0, 0.000, 0.088, 0.175, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.088 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.000, 0.097, 0.194, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.097 std_dev=0.097
O4'	A	0, 0.000, 0.127, 0.254, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.127 std_dev=0.127
C4'	A	0, 0.000, 0.156, 0.313, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.156 std_dev=0.156
O2'	A	0, 0.000, 0.158, 0.316, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.158 std_dev=0.158
C1'	B	0, 0.000, 0.168, 0.336, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.168 std_dev=0.168
C3'	A	0, 0.000, 0.202, 0.404, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.202 std_dev=0.202
C4'	B	0, 0.000, 0.225, 0.449, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.225 std_dev=0.225
N9	B	0, 0.000, 0.251, 0.503, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.251 std_dev=0.251
C8	B	0, 0.000, 0.283, 0.565, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.283 std_dev=0.283
C2'	B	0, 0.000, 0.285, 0.570, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.285 std_dev=0.285
N3	B	0, 0.000, 0.307, 0.614, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.307 std_dev=0.307
C4	B	0, 0.000, 0.310, 0.620, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.310 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.000, 0.319, 0.638, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.319 std_dev=0.319
O2'	B	0, 0.000, 0.319, 0.638, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.319 std_dev=0.319
C5'	A	0, 0.000, 0.319, 0.638, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.319 std_dev=0.319
C5'	B	0, 0.000, 0.321, 0.641, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.321 std_dev=0.321
O3'	A	0, 0.000, 0.322, 0.644, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.322 std_dev=0.322
O5'	B	0, 0.000, 0.345, 0.691, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.345 std_dev=0.345
P	B	0, 0.000, 0.349, 0.697, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.349 std_dev=0.349
OP1	B	0, 0.000, 0.371, 0.742, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.371 std_dev=0.371
O3'	B	0, 0.000, 0.383, 0.766, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.383 std_dev=0.383
N7	B	0, 0.000, 0.397, 0.793, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.397 std_dev=0.397
C2	B	0, 0.000, 0.398, 0.796, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.398 std_dev=0.398
C5	B	0, 0.000, 0.403, 0.807, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.403 std_dev=0.403
OP2	B	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
O5'	A	0, 0.000, 0.425, 0.850, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.425 std_dev=0.425
N1	B	0, 0.000, 0.495, 0.990, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.495 std_dev=0.495
C6	B	0, 0.000, 0.502, 1.004, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.502 std_dev=0.502
N6	B	0, 0.000, 0.603, 1.206, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.603 std_dev=0.603
P	A	0, 0.000, 0.697, 1.394, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.697 std_dev=0.697
OP1	A	0, 0.000, 1.037, 2.075, 2.075 max_d=2.075 avg_d=1.037 std_dev=1.037
OP2	A	0, 0.000, 1.097, 2.195, 2.195 max_d=2.195 avg_d=1.097 std_dev=1.097

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.08	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.27	0.30	0.06
C2	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.07	0.04	0.01	0.26	0.37	0.05
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.25	0.28	0.05
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.08	0.12	0.05	0.03	0.03	0.12	0.07	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.15	0.30	0.01
C4	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.06	0.02	0.22	0.38	0.04
C4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.04	0.03	0.00	0.02	0.08	0.26	0.20	0.08
C5	0.03	0.00	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.09	0.04	0.11	0.01	0.16	0.43	0.00
C5'	0.00	0.06	0.01	0.03	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.07	0.06	0.05	0.11	0.06	0.03	0.06	0.00	0.00	0.10	0.07	0.26	0.03
C6	0.04	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.05	0.10	0.00	0.16	0.45	0.00
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02	0.14	0.02	0.16	0.41	0.01
N1	0.05	0.00	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.07	0.01	0.20	0.42	0.02
N2	0.08	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.10	0.03	0.02	0.31	0.33	0.09
N3	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.00	0.28	0.33	0.07
N7	0.03	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.14	0.03	0.15	0.01	0.12	0.45	0.01
N9	0.01	0.03	0.03	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.21	0.37	0.03
O2'	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.07	0.01	0.01	0.43	0.11	0.18
O3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.03	0.09	0.06	0.09	0.13	0.05	0.01	0.02	0.14	0.07	0.03	0.00	0.02	0.08	0.11	0.13	0.20	0.00
O4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.06	0.10	0.06	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.06	0.26	0.27	0.07
O5'	0.01	0.04	0.03	0.03	0.06	0.02	0.11	0.00	0.10	0.14	0.07	0.03	0.03	0.15	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.13	0.03	0.03	0.01
O6	0.05	0.01	0.05	0.09	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.06	0.13	0.00	0.12	0.47	0.01
OP1	0.27	0.26	0.25	0.15	0.22	0.26	0.16	0.07	0.16	0.16	0.20	0.31	0.28	0.12	0.21	0.43	0.13	0.26	0.03	0.12	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.37	0.28	0.30	0.38	0.20	0.43	0.26	0.45	0.41	0.42	0.33	0.33	0.45	0.37	0.11	0.20	0.27	0.03	0.47	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.05	0.05	0.01	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.09	0.07	0.01	0.03	0.18	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.23	0.11	0.04	0.16	0.03	0.16	0.08	0.20	0.10	0.23	0.19	0.19	0.13	0.11	0.15	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.05
C2	0.03	0.21	0.06	0.13	0.13	0.10	0.16	0.13	0.20	0.09	0.22	0.15	0.20	0.13	0.08	0.10	0.21	0.02	0.09	0.02	0.07	0.06
C2'	0.01	0.12	0.02	0.02	0.05	0.07	0.05	0.10	0.08	0.01	0.11	0.09	0.06	0.01	0.01	0.06	0.03	0.05	0.07	0.00	0.05	0.05
C3'	0.03	0.10	0.02	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.04	0.05	0.08	0.07	0.03	0.03	0.03	0.06	0.02	0.08	0.09	0.01	0.07	0.08
C4	0.04	0.21	0.01	0.08	0.13	0.09	0.15	0.13	0.19	0.08	0.22	0.16	0.19	0.12	0.08	0.01	0.15	0.02	0.09	0.03	0.06	0.06
C4'	0.04	0.16	0.10	0.08	0.09	0.01	0.09	0.05	0.12	0.03	0.16	0.13	0.11	0.05	0.05	0.14	0.11	0.02	0.05	0.01	0.04	0.05
C5	0.04	0.21	0.00	0.08	0.13	0.09	0.16	0.13	0.20	0.08	0.23	0.15	0.21	0.13	0.08	0.02	0.15	0.01	0.09	0.02	0.05	0.06
C5'	0.04	0.17	0.12	0.11	0.10	0.00	0.10	0.03	0.13	0.03	0.17	0.14	0.12	0.06	0.05	0.14	0.15	0.02	0.04	0.01	0.04	0.06
C6	0.02	0.21	0.04	0.11	0.12	0.10	0.16	0.14	0.21	0.09	0.23	0.14	0.22	0.13	0.08	0.07	0.18	0.02	0.09	0.02	0.06	0.06
C8	0.06	0.21	0.06	0.01	0.14	0.05	0.16	0.09	0.20	0.09	0.23	0.17	0.20	0.13	0.10	0.06	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03
N1	0.02	0.21	0.06	0.13	0.12	0.11	0.16	0.14	0.21	0.09	0.23	0.14	0.22	0.13	0.07	0.10	0.20	0.02	0.10	0.02	0.07	0.06
N2	0.03	0.21	0.07	0.13	0.13	0.08	0.16	0.10	0.20	0.10	0.22	0.15	0.20	0.14	0.09	0.13	0.19	0.00	0.07	0.01	0.05	0.04
N3	0.04	0.20	0.02	0.11	0.13	0.10	0.15	0.13	0.19	0.08	0.21	0.16	0.19	0.12	0.08	0.04	0.19	0.02	0.09	0.02	0.07	0.06
N7	0.05	0.21	0.03	0.04	0.13	0.06	0.16	0.11	0.20	0.09	0.23	0.16	0.21	0.13	0.09	0.02	0.10	0.00	0.07	0.00	0.03	0.04
N9	0.05	0.21	0.05	0.03	0.14	0.07	0.15	0.11	0.19	0.08	0.22	0.17	0.19	0.12	0.09	0.06	0.08	0.01	0.08	0.02	0.05	0.06
O2'	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.00	0.06	0.03	0.03	0.01	0.05	0.05	0.06	0.01	0.08	0.07	0.03	0.04	0.04
O3'	0.11	0.03	0.04	0.05	0.07	0.13	0.09	0.15	0.05	0.15	0.00	0.00	0.08	0.14	0.11	0.02	0.02	0.15	0.14	0.06	0.12	0.13
O4'	0.12	0.25	0.17	0.13	0.19	0.03	0.20	0.02	0.23	0.13	0.26	0.22	0.23	0.16	0.15	0.20	0.13	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02
O5'	0.05	0.10	0.05	0.05	0.00	0.07	0.01	0.10	0.03	0.08	0.08	0.06	0.01	0.06	0.04	0.09	0.10	0.11	0.12	0.08	0.12	0.13
O6	0.02	0.19	0.04	0.12	0.11	0.10	0.15	0.14	0.20	0.08	0.23	0.12	0.22	0.13	0.07	0.08	0.18	0.02	0.10	0.02	0.06	0.06
OP1	0.47	0.46	0.55	0.65	0.46	0.59	0.47	0.65	0.47	0.47	0.46	0.46	0.46	0.47	0.47	0.52	0.70	0.49	0.64	0.73	0.68	0.65
OP2	0.10	0.14	0.05	0.05	0.12	0.02	0.10	0.10	0.10	0.07	0.12	0.14	0.10	0.07	0.10	0.09	0.09	0.06	0.13	0.28	0.28	0.19
P	0.20	0.24	0.28	0.35	0.22	0.27	0.22	0.30	0.23	0.21	0.24	0.22	0.23	0.22	0.21	0.27	0.40	0.20	0.30	0.38	0.34	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.02
C2	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.08	0.02
C2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02
C4	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.11	0.05
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.00	0.06	0.01	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.15	0.08
C5'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.15	0.07
C8	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.16	0.10
N1	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.12	0.05
N3	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.06	0.07	0.02
N6	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.02	0.18	0.10
N7	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.02	0.18	0.10
N9	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.11	0.06
O2'	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.16	0.06	0.08
O3'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.10	0.04	0.04
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.07	0.04
O5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.06	0.06	0.03	0.08	0.07	0.05	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.05	0.06	0.09	0.09	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.02	0.02	0.16	0.10	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.08	0.01	0.01	0.11	0.01	0.15	0.02	0.15	0.16	0.12	0.07	0.18	0.18	0.11	0.06	0.04	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.07	0.10	0.05	0.02	0.10	0.10	0.06	0.08	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00