Doublet Group distance statistics: 51218

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
N1	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
O6	A	0, 0.000, 0.041, 0.082, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C4	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N9	A	0, 0.000, 0.049, 0.099, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.049 std_dev=0.049
N7	A	0, 0.000, 0.061, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.061 std_dev=0.061
O5'	A	0, 0.000, 0.076, 0.152, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.076 std_dev=0.076
C8	A	0, 0.000, 0.086, 0.173, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.086 std_dev=0.086
O4'	A	0, 0.000, 0.255, 0.510, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.255 std_dev=0.255
C2'	A	0, 0.000, 0.314, 0.629, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.314 std_dev=0.314
P	A	0, 0.000, 0.404, 0.807, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.404 std_dev=0.404
C2'	B	0, 0.000, 0.448, 0.896, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.448 std_dev=0.448
O2'	B	0, 0.000, 0.451, 0.901, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.451 std_dev=0.451
C3'	A	0, 0.000, 0.475, 0.950, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.475 std_dev=0.475
O2'	A	0, 0.000, 0.478, 0.956, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.478 std_dev=0.478
C4'	A	0, 0.000, 0.490, 0.980, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.490 std_dev=0.490
OP1	A	0, 0.000, 0.546, 1.093, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.546 std_dev=0.546
O3'	A	0, 0.000, 0.601, 1.202, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.601 std_dev=0.601
C3'	B	0, 0.000, 0.756, 1.512, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.756 std_dev=0.756
C5'	A	0, 0.000, 0.871, 1.742, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.871 std_dev=0.871
OP2	A	0, 0.000, 0.888, 1.776, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.888 std_dev=0.888
C1'	B	0, 0.000, 1.354, 2.709, 2.709 max_d=2.709 avg_d=1.354 std_dev=1.354
O3'	B	0, 0.000, 1.570, 3.140, 3.140 max_d=3.140 avg_d=1.570 std_dev=1.570
C4'	B	0, 0.000, 1.581, 3.163, 3.163 max_d=3.163 avg_d=1.581 std_dev=1.581
N9	B	0, 0.000, 1.668, 3.337, 3.337 max_d=3.337 avg_d=1.668 std_dev=1.668
O4'	B	0, 0.000, 1.728, 3.455, 3.455 max_d=3.455 avg_d=1.728 std_dev=1.728
C8	B	0, 0.000, 1.841, 3.683, 3.683 max_d=3.683 avg_d=1.841 std_dev=1.841
O5'	B	0, 0.000, 1.897, 3.794, 3.794 max_d=3.794 avg_d=1.897 std_dev=1.897
N7	B	0, 0.000, 2.109, 4.217, 4.217 max_d=4.217 avg_d=2.109 std_dev=2.109
C4	B	0, 0.000, 2.276, 4.551, 4.551 max_d=4.551 avg_d=2.276 std_dev=2.276
C5'	B	0, 0.000, 2.386, 4.771, 4.771 max_d=4.771 avg_d=2.386 std_dev=2.386
C5	B	0, 0.000, 2.503, 5.005, 5.005 max_d=5.005 avg_d=2.503 std_dev=2.503
P	B	0, 0.000, 2.651, 5.302, 5.302 max_d=5.302 avg_d=2.651 std_dev=2.651
N3	B	0, 0.000, 2.846, 5.693, 5.693 max_d=5.693 avg_d=2.846 std_dev=2.846
OP2	B	0, 0.000, 2.931, 5.863, 5.863 max_d=5.863 avg_d=2.931 std_dev=2.931
C6	B	0, 0.000, 3.331, 6.662, 6.662 max_d=6.662 avg_d=3.331 std_dev=3.331
N6	B	0, 0.000, 3.609, 7.217, 7.217 max_d=7.217 avg_d=3.609 std_dev=3.609
C2	B	0, 0.000, 3.737, 7.474, 7.474 max_d=7.474 avg_d=3.737 std_dev=3.737
OP1	B	0, 0.000, 3.931, 7.862, 7.862 max_d=7.862 avg_d=3.931 std_dev=3.931
N1	B	0, 0.000, 3.996, 7.992, 7.992 max_d=7.992 avg_d=3.996 std_dev=3.996

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.01
C2	0.01	0.00	0.08	0.18	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.19	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.10	0.03	0.11	0.10	0.10	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.05	0.02	0.48	0.23
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.15	0.00	0.14	0.02	0.16	0.06	0.18	0.19	0.18	0.09	0.10	0.01	0.01	0.01	0.27	0.15	0.15	0.57	0.36
C4	0.00	0.00	0.03	0.15	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.07
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.02	0.04	0.15	0.09	0.09	0.01	0.00	0.02	0.14	0.12	0.11	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.12	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.13	0.00	0.03	0.00	0.07	0.02	0.11
C5'	0.04	0.15	0.01	0.02	0.18	0.00	0.26	0.00	0.26	0.29	0.21	0.10	0.12	0.32	0.18	0.08	0.04	0.01	0.01	0.30	0.03	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.16	0.00	0.12	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.16	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.11
C8	0.01	0.00	0.10	0.06	0.00	0.14	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.05	0.04	0.04	0.00	0.06	0.03	0.12
N1	0.01	0.00	0.03	0.18	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.19	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.09
N2	0.01	0.00	0.11	0.19	0.01	0.02	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.07	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05
N3	0.00	0.00	0.10	0.18	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.18	0.05	0.01	0.01	0.02	0.07	0.05
N7	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.15	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.03	0.05	0.00	0.10	0.00	0.14
N9	0.00	0.00	0.02	0.10	0.00	0.09	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.07
O2'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.11	0.09	0.15	0.08	0.17	0.10	0.16	0.10	0.08	0.15	0.07	0.00	0.00	0.13	0.06	0.19	0.27	0.33	0.01
O3'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.14	0.01	0.13	0.04	0.16	0.05	0.19	0.21	0.18	0.08	0.08	0.00	0.00	0.01	0.28	0.16	0.14	0.74	0.41
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.07	0.05	0.03	0.01	0.13	0.01	0.00	0.12	0.01	0.17	0.05	0.12
O5'	0.01	0.01	0.15	0.27	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.28	0.12	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.14	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.16	0.01	0.03	0.00	0.11	0.02	0.13
OP1	0.09	0.01	0.02	0.15	0.01	0.12	0.07	0.03	0.08	0.06	0.05	0.01	0.02	0.10	0.00	0.27	0.14	0.17	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.05	0.48	0.57	0.05	0.11	0.02	0.07	0.01	0.03	0.03	0.07	0.07	0.00	0.07	0.33	0.74	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.06	0.23	0.36	0.07	0.01	0.11	0.01	0.11	0.12	0.09	0.05	0.05	0.14	0.07	0.01	0.41	0.12	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	1.96	0.22	0.44	1.10	1.09	1.00	1.55	1.39	0.11	1.82	1.66	1.29	0.44	0.46	0.20	0.56	0.70	1.15	1.83	1.38	1.39
C2	0.50	0.90	0.14	0.47	0.72	0.50	0.69	0.83	0.77	0.47	0.87	0.84	0.75	0.55	0.57	0.22	0.91	0.19	0.63	0.78	1.20	0.78
C2'	0.08	1.92	0.37	0.16	1.00	0.86	0.88	1.22	1.27	0.02	1.74	1.60	1.17	0.33	0.37	0.33	0.16	0.68	0.86	1.51	1.00	1.07
C3'	0.05	1.97	0.30	0.24	0.89	0.98	0.76	1.42	1.23	0.20	1.79	1.56	1.12	0.13	0.21	0.32	0.20	0.83	1.10	1.92	1.28	1.38
C4	0.38	1.48	0.19	0.50	0.98	0.86	0.91	1.31	1.15	0.36	1.41	1.31	1.10	0.57	0.59	0.23	0.81	0.22	0.97	1.41	1.49	1.20
C4'	0.17	2.11	0.13	0.48	0.90	1.23	0.78	1.75	1.34	0.32	1.96	1.60	1.24	0.06	0.13	0.15	0.47	1.04	1.43	2.42	1.60	1.76
C5	0.41	1.48	0.18	0.51	0.98	0.79	0.95	1.25	1.19	0.41	1.43	1.28	1.16	0.62	0.61	0.21	0.85	0.14	0.95	1.41	1.57	1.20
C5'	0.13	2.13	0.13	0.51	0.91	1.24	0.79	1.83	1.37	0.34	2.02	1.60	1.28	0.04	0.14	0.18	0.52	1.00	1.55	2.70	1.84	1.97
C6	0.47	1.22	0.15	0.49	0.88	0.61	0.87	1.02	1.04	0.49	1.20	1.08	1.02	0.64	0.63	0.19	0.91	0.07	0.78	1.11	1.48	1.02
C8	0.28	1.89	0.20	0.50	1.12	1.00	1.06	1.52	1.44	0.27	1.83	1.57	1.39	0.57	0.56	0.21	0.74	0.45	1.16	1.87	1.68	1.47
N1	0.51	0.95	0.12	0.47	0.76	0.47	0.74	0.81	0.84	0.51	0.94	0.87	0.83	0.61	0.60	0.19	0.92	0.22	0.63	0.81	1.30	0.81
N2	0.53	0.52	0.09	0.42	0.52	0.22	0.51	0.47	0.51	0.48	0.52	0.53	0.50	0.49	0.52	0.20	0.92	0.42	0.39	0.37	0.94	0.49
N3	0.44	1.18	0.19	0.50	0.85	0.76	0.78	1.12	0.93	0.38	1.12	1.09	0.88	0.53	0.57	0.25	0.83	0.08	0.83	1.10	1.29	0.99
N7	0.35	1.72	0.19	0.51	1.07	0.90	1.03	1.40	1.36	0.36	1.68	1.45	1.33	0.62	0.60	0.20	0.82	0.28	1.07	1.69	1.69	1.38
N9	0.27	1.80	0.21	0.49	1.08	1.01	1.00	1.50	1.34	0.25	1.70	1.53	1.27	0.54	0.55	0.22	0.71	0.47	1.12	1.74	1.55	1.38
O2'	0.19	1.85	0.21	0.18	0.85	0.92	0.76	1.14	1.18	0.14	1.66	1.48	1.09	0.21	0.17	0.07	0.13	0.90	0.77	1.31	0.69	0.89
O3'	0.21	1.81	0.28	0.15	0.69	0.93	0.54	1.32	1.03	0.41	1.63	1.37	0.92	0.10	0.01	0.29	0.01	0.94	1.03	1.84	1.11	1.29
O4'	0.03	2.21	0.15	0.53	1.13	1.22	1.05	1.78	1.56	0.02	2.10	1.76	1.47	0.38	0.39	0.15	0.63	0.86	1.41	2.33	1.67	1.74
O5'	0.14	2.47	0.25	0.41	1.30	1.09	1.28	1.66	1.89	0.13	2.47	1.90	1.87	0.57	0.52	0.20	0.54	0.72	1.28	2.39	1.62	1.69
O6	0.48	1.21	0.14	0.48	0.88	0.56	0.88	0.96	1.05	0.53	1.21	1.06	1.05	0.68	0.64	0.18	0.91	0.12	0.75	1.07	1.51	0.99
OP1	0.19	2.75	0.37	0.27	1.43	1.00	1.44	1.59	2.16	0.17	2.82	2.07	2.19	0.66	0.59	0.31	0.37	0.69	1.22	2.50	1.54	1.69
OP2	0.05	2.19	0.05	0.54	1.06	1.18	1.09	1.68	1.70	0.01	2.24	1.62	1.73	0.43	0.33	0.03	0.68	0.83	1.30	2.38	1.58	1.65
P	0.16	2.57	0.26	0.38	1.36	1.05	1.39	1.61	2.05	0.21	2.63	1.95	2.09	0.69	0.57	0.18	0.54	0.68	1.22	2.37	1.54	1.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.19	0.18	0.02
C2	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.12	0.10	0.67	0.16
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00
C3'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.06	0.11	0.03	0.01	0.08	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.07	0.01
C4	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.15	0.14	0.65	0.17
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.06	0.11	0.03	0.00	0.08	0.11	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.19	0.02
C5	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.22	0.15	0.90	0.26
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.15	0.20	0.11	0.05	0.18	0.21	0.11	0.02	0.02	0.02	0.01	0.12	0.31	0.01
C6	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.21	0.13	0.97	0.27
C8	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.10	0.01	0.25	0.22	0.74	0.25
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.17	0.10	0.86	0.22
N3	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.10	0.11	0.54	0.12
N6	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.25	0.13	1.12	0.32
N7	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.28	0.19	0.99	0.32
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.18	0.51	0.14
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.07	0.01
O3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.04	0.10	0.00	0.04	0.07	0.11	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.33	0.26	0.03
O4'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.27	0.02	0.05
O5'	0.03	0.12	0.00	0.01	0.15	0.02	0.22	0.01	0.21	0.25	0.17	0.10	0.25	0.28	0.14	0.01	0.03	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.19	0.10	0.01	0.15	0.14	0.03	0.15	0.12	0.13	0.22	0.10	0.11	0.13	0.19	0.18	0.03	0.33	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.67	0.06	0.07	0.65	0.19	0.90	0.31	0.97	0.74	0.86	0.54	1.12	0.99	0.51	0.07	0.26	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.16	0.00	0.01	0.17	0.02	0.26	0.01	0.27	0.25	0.22	0.12	0.32	0.32	0.14	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00