Doublet Group distance statistics: 51226

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 23, 16, 11, 1, 4, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.012, 0.028, 0.045, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.013, 0.033, 0.054, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.033 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.011, 0.033, 0.055, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.033 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.007, 0.029, 0.052, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.029 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.016, 0.042, 0.068, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.042 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.109, 0.199, 0.289, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.199 std_dev=0.090
O4'	A	0, 0.092, 0.183, 0.275, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.183 std_dev=0.091
C3'	A	0, 0.253, 0.345, 0.438, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.345 std_dev=0.093
C4'	A	0, 0.275, 0.407, 0.540, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.407 std_dev=0.133
C2'	B	0, 0.125, 0.279, 0.434, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.279 std_dev=0.154
O3'	A	0, 0.411, 0.579, 0.746, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.579 std_dev=0.167
O2'	A	0, 0.122, 0.293, 0.464, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.293 std_dev=0.171
C3'	B	0, 0.191, 0.372, 0.553, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.372 std_dev=0.181
C1'	B	0, 0.211, 0.394, 0.577, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.394 std_dev=0.183
O2'	B	0, 0.216, 0.400, 0.585, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.400 std_dev=0.185
O3'	B	0, 0.241, 0.438, 0.636, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.438 std_dev=0.197
C4'	B	0, 0.300, 0.524, 0.749, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.524 std_dev=0.224
N9	B	0, 0.302, 0.551, 0.799, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.551 std_dev=0.249
N3	B	0, 0.390, 0.646, 0.901, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.646 std_dev=0.255
O4'	B	0, 0.348, 0.605, 0.862, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.605 std_dev=0.257
C4	B	0, 0.394, 0.660, 0.926, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.660 std_dev=0.266
C5'	B	0, 0.361, 0.629, 0.896, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.629 std_dev=0.267
C5'	A	0, 0.498, 0.781, 1.065, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.781 std_dev=0.283
O5'	B	0, 0.372, 0.662, 0.953, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.662 std_dev=0.291
P	B	0, 0.420, 0.757, 1.095, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.757 std_dev=0.337
C2	B	0, 0.613, 0.955, 1.296, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.955 std_dev=0.342
O5'	A	0, 0.515, 0.865, 1.215, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.865 std_dev=0.350
C5	B	0, 0.601, 0.975, 1.350, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.975 std_dev=0.374
C8	B	0, 0.435, 0.824, 1.213, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.824 std_dev=0.389
OP1	B	0, 0.469, 0.876, 1.283, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.876 std_dev=0.407
N1	B	0, 0.797, 1.209, 1.620, 2.081 max_d=2.081 avg_d=1.209 std_dev=0.412
N2	B	0, 0.688, 1.109, 1.531, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.109 std_dev=0.421
C6	B	0, 0.806, 1.247, 1.687, 2.077 max_d=2.077 avg_d=1.247 std_dev=0.440
N7	B	0, 0.591, 1.051, 1.510, 1.846 max_d=1.846 avg_d=1.051 std_dev=0.459
O6	B	0, 0.997, 1.547, 2.097, 2.529 max_d=2.529 avg_d=1.547 std_dev=0.550
OP2	B	0, 0.327, 0.878, 1.429, 3.293 max_d=3.293 avg_d=0.878 std_dev=0.551
P	A	0, 0.657, 1.262, 1.866, 2.206 max_d=2.206 avg_d=1.262 std_dev=0.604
OP2	A	0, 0.811, 1.456, 2.101, 2.846 max_d=2.846 avg_d=1.456 std_dev=0.645
OP1	A	0, 0.527, 1.240, 1.954, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.240 std_dev=0.714

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.18	0.01	0.16	0.21	0.21
C2	0.03	0.00	0.09	0.10	0.00	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.12	0.02	0.44	0.01	0.40	0.72	0.57
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.04	0.08	0.11	0.09	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.17	0.05	0.10	0.22	0.15
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.03	0.12	0.16	0.11	0.12	0.09	0.16	0.09	0.01	0.01	0.03	0.18	0.14	0.11	0.18	0.14
C4	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.08	0.01	0.46	0.01	0.43	0.66	0.57
C4'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.10	0.17	0.06	0.06	0.04	0.17	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.13	0.10	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.11	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.12	0.02	0.59	0.01	0.59	0.87	0.76
C5'	0.05	0.16	0.02	0.03	0.22	0.00	0.32	0.00	0.32	0.37	0.25	0.11	0.12	0.41	0.22	0.06	0.03	0.02	0.01	0.38	0.14	0.11	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.10	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.02	0.61	0.00	0.63	0.97	0.81
C8	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.17	0.01	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.17	0.03	0.59	0.02	0.58	0.69	0.70
N1	0.02	0.00	0.08	0.11	0.00	0.06	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.11	0.02	0.54	0.01	0.53	0.88	0.71
N2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.16	0.03	0.39	0.02	0.34	0.68	0.51
N3	0.03	0.00	0.09	0.09	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.11	0.02	0.38	0.01	0.33	0.59	0.48
N7	0.01	0.01	0.03	0.16	0.01	0.17	0.00	0.41	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.03	0.66	0.02	0.69	0.93	0.86
N9	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.42	0.01	0.38	0.51	0.49
O2'	0.02	0.20	0.00	0.01	0.12	0.05	0.10	0.06	0.13	0.03	0.18	0.23	0.18	0.05	0.05	0.00	0.05	0.06	0.07	0.12	0.10	0.11	0.06
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.08	0.02	0.12	0.03	0.12	0.17	0.11	0.16	0.11	0.17	0.08	0.05	0.00	0.02	0.14	0.14	0.16	0.16	0.12
O4'	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.03	0.13	0.13	0.09
O5'	0.18	0.44	0.17	0.18	0.46	0.02	0.59	0.01	0.61	0.59	0.54	0.39	0.38	0.66	0.42	0.07	0.14	0.06	0.00	0.66	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.13	0.01	0.38	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.14	0.03	0.66	0.00	0.73	1.09	0.91
OP1	0.16	0.40	0.10	0.11	0.43	0.10	0.59	0.14	0.63	0.58	0.53	0.34	0.33	0.69	0.38	0.10	0.16	0.13	0.01	0.73	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.72	0.22	0.18	0.66	0.07	0.87	0.11	0.97	0.69	0.88	0.68	0.59	0.93	0.51	0.11	0.16	0.13	0.01	1.09	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.57	0.15	0.14	0.57	0.03	0.76	0.02	0.81	0.70	0.71	0.51	0.48	0.86	0.49	0.06	0.12	0.09	0.00	0.91	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.18	0.13	0.19	0.11	0.23	0.11	0.24	0.11	0.18	0.15	0.26	0.15	0.15	0.13	0.14	0.24	0.23	0.24	0.11	0.26	0.29	0.24
C2	0.16	0.13	0.14	0.16	0.16	0.20	0.22	0.25	0.19	0.32	0.14	0.17	0.13	0.31	0.21	0.19	0.17	0.23	0.25	0.23	0.31	0.34	0.27
C2'	0.11	0.16	0.09	0.15	0.10	0.18	0.10	0.20	0.10	0.14	0.13	0.22	0.14	0.12	0.11	0.13	0.20	0.18	0.20	0.10	0.24	0.27	0.21
C3'	0.10	0.23	0.09	0.09	0.12	0.16	0.11	0.19	0.14	0.11	0.20	0.31	0.19	0.10	0.09	0.14	0.12	0.17	0.18	0.13	0.24	0.25	0.20
C4	0.15	0.16	0.13	0.18	0.12	0.23	0.15	0.26	0.13	0.26	0.13	0.24	0.14	0.24	0.17	0.17	0.21	0.25	0.25	0.14	0.30	0.32	0.27
C4'	0.12	0.36	0.16	0.10	0.22	0.11	0.21	0.13	0.27	0.12	0.34	0.45	0.31	0.14	0.15	0.18	0.12	0.12	0.12	0.26	0.19	0.19	0.13
C5	0.15	0.18	0.13	0.18	0.12	0.23	0.16	0.27	0.14	0.28	0.14	0.27	0.16	0.26	0.17	0.17	0.21	0.25	0.25	0.16	0.32	0.34	0.27
C5'	0.13	0.48	0.20	0.12	0.28	0.11	0.27	0.14	0.35	0.12	0.45	0.59	0.39	0.17	0.17	0.21	0.14	0.14	0.12	0.35	0.20	0.18	0.13
C6	0.16	0.17	0.13	0.17	0.14	0.21	0.20	0.26	0.17	0.32	0.14	0.24	0.15	0.31	0.19	0.17	0.19	0.24	0.25	0.21	0.33	0.36	0.28
C8	0.14	0.23	0.13	0.19	0.12	0.24	0.13	0.27	0.13	0.23	0.18	0.33	0.19	0.20	0.15	0.14	0.24	0.25	0.26	0.13	0.31	0.32	0.27
N1	0.16	0.14	0.14	0.16	0.16	0.20	0.23	0.25	0.20	0.34	0.14	0.20	0.13	0.33	0.21	0.18	0.17	0.22	0.25	0.24	0.33	0.36	0.27
N2	0.17	0.14	0.14	0.15	0.19	0.17	0.26	0.25	0.25	0.35	0.18	0.15	0.14	0.35	0.23	0.19	0.15	0.20	0.25	0.28	0.30	0.35	0.27
N3	0.16	0.13	0.14	0.17	0.13	0.22	0.18	0.26	0.15	0.27	0.12	0.18	0.12	0.26	0.18	0.18	0.19	0.25	0.25	0.17	0.29	0.32	0.26
N7	0.15	0.22	0.13	0.19	0.12	0.24	0.15	0.27	0.13	0.26	0.17	0.32	0.18	0.24	0.16	0.15	0.23	0.25	0.26	0.14	0.33	0.34	0.28
N9	0.14	0.19	0.13	0.19	0.11	0.24	0.12	0.26	0.11	0.22	0.15	0.28	0.16	0.19	0.15	0.15	0.24	0.25	0.25	0.12	0.29	0.31	0.26
O2'	0.16	0.21	0.14	0.09	0.17	0.14	0.16	0.14	0.16	0.15	0.19	0.24	0.19	0.15	0.15	0.20	0.14	0.15	0.12	0.16	0.20	0.19	0.13
O3'	0.17	0.31	0.20	0.14	0.22	0.15	0.21	0.18	0.24	0.17	0.29	0.37	0.28	0.18	0.18	0.23	0.14	0.15	0.16	0.24	0.24	0.21	0.17
O4'	0.15	0.22	0.14	0.19	0.13	0.22	0.13	0.22	0.14	0.17	0.19	0.30	0.18	0.15	0.14	0.15	0.23	0.23	0.23	0.14	0.25	0.28	0.23
O5'	0.19	0.31	0.11	0.16	0.12	0.31	0.12	0.36	0.16	0.24	0.27	0.46	0.23	0.19	0.16	0.12	0.16	0.36	0.33	0.15	0.35	0.37	0.35
O6	0.16	0.18	0.13	0.17	0.15	0.21	0.21	0.26	0.19	0.33	0.15	0.26	0.16	0.33	0.20	0.17	0.19	0.23	0.25	0.23	0.35	0.37	0.28
OP1	0.18	0.38	0.14	0.13	0.19	0.23	0.18	0.25	0.25	0.20	0.35	0.51	0.29	0.16	0.16	0.15	0.15	0.30	0.22	0.24	0.24	0.27	0.23
OP2	0.31	0.34	0.16	0.28	0.13	0.50	0.17	0.60	0.14	0.42	0.27	0.56	0.23	0.34	0.27	0.13	0.25	0.55	0.55	0.13	0.62	0.59	0.61
P	0.22	0.37	0.10	0.15	0.14	0.33	0.13	0.38	0.19	0.27	0.32	0.54	0.26	0.21	0.18	0.11	0.13	0.40	0.35	0.18	0.36	0.37	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.13	0.18	0.11
C2	0.03	0.00	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.03	0.22	0.01	0.28	0.39	0.30
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.06	0.09	0.07	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.06	0.18	0.20	0.11
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.08	0.10	0.10	0.14	0.11	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.21	0.18	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.17	0.01	0.23	0.31	0.24
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.07	0.08	0.06	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.11	0.11	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.18	0.01	0.27	0.34	0.27
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.11	0.00	0.13	0.00	0.14	0.10	0.15	0.14	0.11	0.12	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.15	0.10	0.08	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.21	0.00	0.32	0.39	0.32
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.14	0.01	0.21	0.26	0.18
N1	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.23	0.01	0.31	0.42	0.33
N2	0.04	0.00	0.09	0.14	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.18	0.04	0.23	0.01	0.28	0.41	0.31
N3	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.19	0.01	0.24	0.34	0.26
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.16	0.01	0.27	0.30	0.24
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.12	0.01	0.18	0.24	0.17
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.04	0.06	0.04	0.07	0.03	0.08	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.05	0.07	0.17	0.17	0.09
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.10	0.12	0.12	0.18	0.12	0.11	0.05	0.04	0.00	0.02	0.07	0.11	0.27	0.19	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.02	0.10	0.15	0.07
O5'	0.06	0.22	0.07	0.07	0.17	0.01	0.18	0.01	0.21	0.14	0.23	0.23	0.19	0.16	0.12	0.05	0.07	0.05	0.00	0.21	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.21	0.00	0.34	0.40	0.33
OP1	0.13	0.28	0.18	0.21	0.23	0.11	0.27	0.10	0.32	0.21	0.31	0.28	0.24	0.27	0.18	0.17	0.27	0.10	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.39	0.20	0.18	0.31	0.11	0.34	0.08	0.39	0.26	0.42	0.41	0.34	0.30	0.24	0.17	0.19	0.15	0.02	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.30	0.11	0.11	0.24	0.05	0.27	0.01	0.32	0.18	0.33	0.31	0.26	0.24	0.17	0.09	0.12	0.07	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00