Doublet Group distance statistics: 51227

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 6, 6, 16, 14, 6, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.019, 0.032, 0.046, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.032 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.027 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.018, 0.037, 0.055, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.022, 0.040, 0.059, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.040 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.020, 0.044, 0.069, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.044 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.027, 0.052, 0.077, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.052 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.022, 0.053, 0.085, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.053 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.027, 0.063, 0.099, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.063 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.107, 0.233, 0.358, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.233 std_dev=0.126
O4'	A	0, 0.034, 0.161, 0.287, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.161 std_dev=0.126
O2'	A	0, 0.195, 0.326, 0.458, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.326 std_dev=0.132
C1'	B	0, 0.344, 0.505, 0.666, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.505 std_dev=0.161
C2'	B	0, 0.331, 0.499, 0.667, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.499 std_dev=0.168
O2'	B	0, 0.228, 0.412, 0.595, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.412 std_dev=0.183
O4'	B	0, 0.403, 0.600, 0.796, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.600 std_dev=0.196
C3'	A	0, 0.147, 0.344, 0.541, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.344 std_dev=0.197
C4'	B	0, 0.424, 0.633, 0.841, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.633 std_dev=0.209
C3'	B	0, 0.407, 0.619, 0.831, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.619 std_dev=0.212
C4'	A	0, 0.020, 0.238, 0.455, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.238 std_dev=0.217
O3'	B	0, 0.414, 0.649, 0.885, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.649 std_dev=0.235
O5'	A	0, 0.338, 0.587, 0.836, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.587 std_dev=0.249
O3'	A	0, 0.313, 0.590, 0.867, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.590 std_dev=0.277
C5'	B	0, 0.528, 0.813, 1.098, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.813 std_dev=0.285
N9	B	0, 0.462, 0.756, 1.049, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.756 std_dev=0.294
OP2	A	0, 0.525, 0.840, 1.155, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.840 std_dev=0.315
P	A	0, 0.492, 0.811, 1.130, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.811 std_dev=0.319
C5'	A	0, 0.120, 0.442, 0.763, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.442 std_dev=0.321
C4	B	0, 0.672, 1.046, 1.420, 1.926 max_d=1.926 avg_d=1.046 std_dev=0.374
C8	B	0, 0.552, 0.939, 1.326, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.939 std_dev=0.387
OP1	A	0, 0.617, 1.023, 1.428, 1.868 max_d=1.868 avg_d=1.023 std_dev=0.406
N3	B	0, 0.710, 1.159, 1.608, 2.017 max_d=2.017 avg_d=1.159 std_dev=0.449
C5	B	0, 0.818, 1.303, 1.788, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.303 std_dev=0.485
N7	B	0, 0.699, 1.205, 1.711, 2.416 max_d=2.416 avg_d=1.205 std_dev=0.506
C2	B	0, 0.964, 1.560, 2.156, 2.672 max_d=2.672 avg_d=1.560 std_dev=0.596
C6	B	0, 1.105, 1.707, 2.309, 3.069 max_d=3.069 avg_d=1.707 std_dev=0.602
O5'	B	0, 0.483, 1.118, 1.753, 3.120 max_d=3.120 avg_d=1.118 std_dev=0.635
N1	B	0, 1.171, 1.809, 2.446, 3.065 max_d=3.065 avg_d=1.809 std_dev=0.638
O6	B	0, 1.280, 1.993, 2.705, 3.618 max_d=3.618 avg_d=1.993 std_dev=0.713
N2	B	0, 1.027, 1.777, 2.526, 3.380 max_d=3.380 avg_d=1.777 std_dev=0.750
P	B	0, 0.562, 1.353, 2.145, 3.668 max_d=3.668 avg_d=1.353 std_dev=0.792
OP1	B	0, 0.440, 1.545, 2.650, 4.950 max_d=4.950 avg_d=1.545 std_dev=1.105
OP2	B	0, 0.268, 1.768, 3.268, 5.822 max_d=5.822 avg_d=1.768 std_dev=1.500

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.09	0.07
C2	0.04	0.00	0.17	0.19	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.25	0.03	0.15	0.02	0.18	0.24	0.17
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.01	0.10	0.07	0.14	0.20	0.16	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.10	0.09	0.06
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.02	0.12	0.13	0.16	0.23	0.17	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.07	0.12	0.12	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.09	0.10	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.14	0.01	0.15	0.21	0.16
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.08	0.07	0.11	0.08	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.17	0.01	0.20	0.26	0.21
C5'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.14	0.11	0.11	0.08	0.15	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.14	0.06	0.01	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.12	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.18	0.01	0.22	0.29	0.23
C8	0.01	0.02	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.18	0.02	0.18	0.21	0.19
N1	0.03	0.01	0.14	0.16	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.23	0.02	0.17	0.01	0.20	0.27	0.21
N2	0.05	0.01	0.20	0.23	0.02	0.11	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.31	0.04	0.15	0.02	0.18	0.23	0.17
N3	0.04	0.01	0.16	0.17	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.22	0.03	0.14	0.01	0.15	0.20	0.15
N7	0.01	0.02	0.07	0.11	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.20	0.02	0.23	0.28	0.24
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.12	0.02	0.12	0.16	0.13
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.08	0.06	0.07	0.06	0.11	0.05	0.15	0.21	0.15	0.05	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.10	0.09	0.06	0.04
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.13	0.02	0.13	0.03	0.18	0.14	0.23	0.31	0.22	0.15	0.06	0.04	0.00	0.02	0.10	0.18	0.17	0.17	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.06	0.10	0.09
O5'	0.06	0.15	0.05	0.07	0.14	0.01	0.17	0.01	0.18	0.18	0.17	0.15	0.14	0.20	0.12	0.04	0.10	0.06	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.10	0.12	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.18	0.04	0.20	0.00	0.26	0.33	0.27
OP1	0.06	0.18	0.10	0.12	0.15	0.07	0.20	0.06	0.22	0.18	0.20	0.18	0.15	0.23	0.12	0.09	0.17	0.06	0.02	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.24	0.09	0.11	0.21	0.03	0.26	0.01	0.29	0.21	0.27	0.23	0.20	0.28	0.16	0.06	0.17	0.10	0.02	0.33	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.06	0.07	0.16	0.02	0.21	0.02	0.23	0.19	0.21	0.17	0.15	0.24	0.13	0.04	0.11	0.09	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.31	0.25	0.24	0.23	0.22	0.21	0.24	0.23	0.17	0.28	0.36	0.29	0.17	0.19	0.29	0.26	0.20	0.20	0.22	0.23	0.42	0.20
C2	0.19	0.28	0.16	0.12	0.23	0.15	0.22	0.25	0.23	0.21	0.26	0.31	0.27	0.22	0.21	0.21	0.13	0.17	0.56	0.23	0.44	1.05	0.57
C2'	0.11	0.16	0.12	0.14	0.11	0.16	0.11	0.21	0.12	0.13	0.14	0.20	0.14	0.12	0.11	0.15	0.17	0.14	0.22	0.11	0.27	0.42	0.21
C3'	0.11	0.19	0.12	0.13	0.13	0.16	0.12	0.22	0.13	0.12	0.17	0.25	0.17	0.12	0.11	0.15	0.16	0.14	0.26	0.13	0.31	0.48	0.25
C4	0.20	0.31	0.21	0.17	0.23	0.18	0.20	0.23	0.22	0.18	0.27	0.36	0.29	0.18	0.19	0.26	0.16	0.20	0.39	0.20	0.28	0.82	0.40
C4'	0.18	0.35	0.22	0.19	0.24	0.17	0.23	0.19	0.27	0.16	0.32	0.41	0.31	0.18	0.19	0.24	0.21	0.16	0.17	0.26	0.28	0.35	0.16
C5	0.19	0.32	0.20	0.16	0.23	0.17	0.20	0.24	0.23	0.18	0.28	0.39	0.30	0.18	0.19	0.26	0.15	0.18	0.47	0.21	0.33	1.02	0.50
C5'	0.20	0.44	0.24	0.19	0.30	0.16	0.28	0.19	0.33	0.18	0.41	0.52	0.38	0.21	0.22	0.26	0.20	0.17	0.19	0.32	0.28	0.41	0.19
C6	0.18	0.32	0.17	0.13	0.23	0.15	0.21	0.25	0.24	0.20	0.28	0.38	0.30	0.21	0.19	0.24	0.13	0.17	0.58	0.22	0.44	1.22	0.62
C8	0.20	0.35	0.24	0.21	0.24	0.21	0.20	0.25	0.23	0.17	0.30	0.42	0.32	0.17	0.19	0.29	0.23	0.20	0.33	0.22	0.25	0.77	0.35
N1	0.18	0.30	0.16	0.13	0.23	0.15	0.23	0.26	0.24	0.22	0.28	0.34	0.28	0.23	0.20	0.22	0.14	0.17	0.62	0.24	0.50	1.26	0.67
N2	0.19	0.27	0.14	0.15	0.24	0.17	0.25	0.30	0.25	0.24	0.26	0.28	0.25	0.25	0.22	0.19	0.19	0.16	0.65	0.25	0.56	1.09	0.64
N3	0.20	0.28	0.18	0.14	0.23	0.16	0.21	0.23	0.22	0.20	0.26	0.32	0.27	0.20	0.20	0.23	0.12	0.20	0.40	0.21	0.31	0.79	0.41
N7	0.19	0.34	0.22	0.19	0.23	0.19	0.20	0.24	0.23	0.17	0.30	0.42	0.32	0.17	0.18	0.28	0.19	0.19	0.42	0.21	0.29	0.95	0.45
N9	0.20	0.32	0.24	0.21	0.23	0.21	0.20	0.24	0.23	0.17	0.28	0.38	0.30	0.17	0.19	0.29	0.22	0.20	0.29	0.21	0.24	0.66	0.30
O2'	0.14	0.15	0.13	0.18	0.13	0.20	0.13	0.23	0.13	0.15	0.14	0.18	0.15	0.14	0.13	0.15	0.23	0.17	0.19	0.13	0.35	0.25	0.20
O3'	0.15	0.16	0.14	0.17	0.14	0.21	0.14	0.26	0.14	0.17	0.15	0.19	0.15	0.16	0.15	0.15	0.19	0.18	0.30	0.14	0.39	0.45	0.27
O4'	0.26	0.44	0.30	0.27	0.32	0.23	0.30	0.23	0.34	0.22	0.40	0.50	0.40	0.24	0.26	0.33	0.27	0.23	0.18	0.33	0.24	0.38	0.18
O5'	0.19	0.42	0.22	0.18	0.27	0.18	0.25	0.23	0.30	0.17	0.38	0.51	0.37	0.19	0.20	0.25	0.19	0.18	0.27	0.29	0.29	0.59	0.29
O6	0.18	0.33	0.17	0.13	0.24	0.15	0.22	0.26	0.25	0.21	0.30	0.40	0.31	0.22	0.19	0.23	0.14	0.17	0.63	0.24	0.48	1.36	0.69
OP1	0.20	0.48	0.21	0.16	0.30	0.18	0.28	0.26	0.35	0.17	0.45	0.60	0.41	0.20	0.21	0.24	0.18	0.18	0.31	0.34	0.35	0.62	0.34
OP2	0.23	0.48	0.24	0.20	0.32	0.23	0.29	0.31	0.35	0.21	0.44	0.60	0.42	0.22	0.24	0.28	0.21	0.23	0.39	0.33	0.37	0.82	0.43
P	0.23	0.51	0.25	0.19	0.34	0.19	0.31	0.25	0.38	0.20	0.47	0.62	0.45	0.23	0.25	0.29	0.19	0.20	0.30	0.36	0.31	0.65	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.13	0.02	0.38	0.22	0.09
C2	0.04	0.00	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.16	0.03	0.35	0.01	0.52	0.75	0.30
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.12	0.10	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.05	0.18	0.35	0.14
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.10	0.11	0.12	0.17	0.13	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.27	0.10	0.18	0.39	0.20
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.32	0.01	0.54	0.63	0.25
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.07	0.09	0.07	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.16	0.13	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.36	0.01	0.65	0.76	0.30
C5'	0.02	0.13	0.02	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.14	0.12	0.14	0.14	0.11	0.13	0.08	0.04	0.04	0.01	0.01	0.15	0.18	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.39	0.00	0.66	0.86	0.34
C8	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.04	0.31	0.02	0.65	0.49	0.21
N1	0.04	0.00	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.14	0.02	0.38	0.01	0.60	0.85	0.34
N2	0.06	0.01	0.12	0.17	0.02	0.09	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.21	0.04	0.35	0.02	0.48	0.75	0.31
N3	0.05	0.01	0.10	0.13	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.31	0.01	0.47	0.63	0.25
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.36	0.02	0.72	0.70	0.29
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.26	0.01	0.52	0.45	0.17
O2'	0.02	0.12	0.00	0.03	0.06	0.05	0.05	0.04	0.07	0.03	0.10	0.15	0.11	0.04	0.02	0.00	0.07	0.05	0.10	0.07	0.17	0.20	0.07
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.11	0.11	0.14	0.21	0.15	0.12	0.05	0.07	0.00	0.02	0.28	0.12	0.40	0.40	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.12	0.03	0.39	0.19	0.14
O5'	0.13	0.35	0.20	0.27	0.32	0.01	0.36	0.01	0.39	0.31	0.38	0.35	0.31	0.36	0.26	0.10	0.28	0.12	0.00	0.40	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.12	0.03	0.40	0.00	0.72	0.93	0.37
OP1	0.38	0.52	0.18	0.18	0.54	0.16	0.65	0.18	0.66	0.65	0.60	0.48	0.47	0.72	0.52	0.17	0.40	0.39	0.03	0.72	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.75	0.35	0.39	0.63	0.13	0.76	0.16	0.86	0.49	0.85	0.75	0.63	0.70	0.45	0.20	0.40	0.19	0.02	0.93	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.30	0.14	0.20	0.25	0.03	0.30	0.02	0.34	0.21	0.34	0.31	0.25	0.29	0.17	0.07	0.26	0.14	0.01	0.37	0.01	0.01	0.00