Doublet Group distance statistics: 51230

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 8, 4, 1, 1, 0, 3, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.011, 0.031, 0.050, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.031 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.007, 0.029, 0.050, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.029 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.013, 0.035, 0.057, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.035 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.010, 0.040, 0.071, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.040 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.016, 0.051, 0.086, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.051 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.023, 0.149, 0.276, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.149 std_dev=0.126
O4'	A	0, -0.061, 0.102, 0.266, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.102 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.037, 0.255, 0.473, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.255 std_dev=0.218
C8	B	0, 0.149, 0.376, 0.604, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.376 std_dev=0.228
C5'	A	0, -0.021, 0.225, 0.472, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.225 std_dev=0.247
N9	B	0, 0.120, 0.379, 0.639, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.379 std_dev=0.260
C4'	A	0, -0.099, 0.164, 0.427, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.164 std_dev=0.263
C5'	B	0, 0.206, 0.471, 0.736, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.471 std_dev=0.265
O4'	B	0, 0.122, 0.389, 0.655, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.389 std_dev=0.266
C2'	B	0, 0.199, 0.468, 0.736, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.468 std_dev=0.269
C4'	B	0, 0.184, 0.460, 0.735, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.460 std_dev=0.276
C1'	B	0, 0.127, 0.406, 0.686, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.406 std_dev=0.279
N7	B	0, 0.135, 0.418, 0.700, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.418 std_dev=0.283
C3'	B	0, 0.223, 0.515, 0.807, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.515 std_dev=0.292
C3'	A	0, -0.097, 0.218, 0.534, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.218 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.085, 0.402, 0.718, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.402 std_dev=0.317
C5	B	0, 0.097, 0.419, 0.741, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.419 std_dev=0.322
O2'	B	0, 0.213, 0.558, 0.903, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.558 std_dev=0.345
O3'	B	0, 0.201, 0.584, 0.966, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.584 std_dev=0.383
N3	B	0, 0.057, 0.442, 0.827, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.442 std_dev=0.385
C6	B	0, 0.080, 0.474, 0.867, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.474 std_dev=0.394
N1	B	0, 0.062, 0.486, 0.910, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.486 std_dev=0.424
C2	B	0, 0.047, 0.473, 0.899, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.473 std_dev=0.426
O6	B	0, 0.089, 0.536, 0.983, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.536 std_dev=0.447
O5'	A	0, -0.144, 0.306, 0.757, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.306 std_dev=0.450
O5'	B	0, 0.205, 0.675, 1.144, 2.546 max_d=2.546 avg_d=0.675 std_dev=0.470
N2	B	0, 0.036, 0.528, 1.020, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.528 std_dev=0.492
OP1	A	0, -0.048, 0.451, 0.950, 2.676 max_d=2.676 avg_d=0.451 std_dev=0.499
O3'	A	0, -0.151, 0.376, 0.902, 2.734 max_d=2.734 avg_d=0.376 std_dev=0.526
P	A	0, -0.124, 0.421, 0.965, 2.919 max_d=2.919 avg_d=0.421 std_dev=0.544
OP2	A	0, -0.263, 0.541, 1.346, 4.270 max_d=4.270 avg_d=0.541 std_dev=0.805
P	B	0, 0.079, 1.467, 2.856, 3.860 max_d=3.860 avg_d=1.467 std_dev=1.389
OP2	B	0, -0.102, 1.785, 3.671, 5.136 max_d=5.136 avg_d=1.785 std_dev=1.887
OP1	B	0, -0.051, 2.047, 4.145, 5.372 max_d=5.372 avg_d=2.047 std_dev=2.098

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.02	0.14	0.11	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.08	0.07	0.09	0.01	0.16	0.13	0.09
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.10	0.08	0.06	0.09	0.12	0.10	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.12	0.09	0.04
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.13	0.00	0.17	0.02	0.18	0.15	0.16	0.12	0.11	0.18	0.11	0.02	0.01	0.01	0.14	0.20	0.11	0.21	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.13	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.04	0.09	0.01	0.18	0.14	0.09
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.05	0.03	0.07	0.03	0.13	0.02	0.00	0.01	0.06	0.05	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.15	0.03	0.10	0.01	0.20	0.17	0.11
C5'	0.07	0.07	0.10	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.07	0.08	0.08	0.09	0.08	0.05	0.08	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.04	0.10	0.01	0.19	0.18	0.11
C8	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.03	0.11	0.02	0.22	0.18	0.11
N1	0.03	0.00	0.09	0.16	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.06	0.09	0.01	0.18	0.15	0.10
N2	0.04	0.01	0.12	0.12	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.08	0.08	0.09	0.02	0.16	0.13	0.10
N3	0.03	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.06	0.09	0.01	0.16	0.13	0.09
N7	0.01	0.00	0.06	0.18	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.18	0.02	0.11	0.02	0.22	0.21	0.12
N9	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.09	0.01	0.18	0.13	0.09
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.10	0.13	0.11	0.05	0.12	0.08	0.12	0.12	0.11	0.10	0.07	0.00	0.03	0.08	0.07	0.13	0.07	0.10	0.06
O3'	0.07	0.08	0.02	0.01	0.08	0.02	0.15	0.08	0.16	0.14	0.12	0.08	0.06	0.18	0.06	0.03	0.00	0.06	0.21	0.20	0.29	0.28	0.21
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.08	0.06	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.10	0.04	0.10	0.15	0.10
O5'	0.08	0.09	0.03	0.14	0.09	0.01	0.10	0.01	0.10	0.11	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.07	0.21	0.10	0.00	0.11	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.20	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.13	0.20	0.04	0.11	0.00	0.20	0.21	0.13
OP1	0.14	0.16	0.12	0.11	0.18	0.05	0.20	0.05	0.19	0.22	0.18	0.16	0.16	0.22	0.18	0.07	0.29	0.10	0.02	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.13	0.09	0.21	0.14	0.05	0.17	0.02	0.18	0.18	0.15	0.13	0.13	0.21	0.13	0.10	0.28	0.15	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.09	0.04	0.12	0.09	0.03	0.11	0.01	0.11	0.11	0.10	0.10	0.09	0.12	0.09	0.06	0.21	0.10	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.15	0.22	0.08	0.26	0.11	0.30	0.18	0.08	0.21	0.22	0.10	0.10	0.08	0.19	0.24	0.21	0.47	0.22	1.56	0.42	0.74
C2	0.17	0.12	0.14	0.16	0.12	0.15	0.11	0.22	0.09	0.14	0.10	0.14	0.13	0.13	0.14	0.15	0.14	0.17	0.50	0.10	0.77	0.61	0.45
C2'	0.08	0.23	0.07	0.08	0.13	0.13	0.14	0.21	0.18	0.12	0.22	0.30	0.17	0.13	0.10	0.12	0.15	0.09	0.33	0.19	1.71	0.48	0.87
C3'	0.12	0.19	0.14	0.21	0.10	0.24	0.09	0.28	0.12	0.07	0.16	0.29	0.17	0.09	0.08	0.18	0.23	0.18	0.38	0.15	1.75	0.57	0.93
C4	0.18	0.14	0.16	0.19	0.12	0.20	0.09	0.24	0.08	0.12	0.09	0.17	0.16	0.11	0.14	0.19	0.20	0.19	0.48	0.11	1.10	0.53	0.54
C4'	0.18	0.25	0.20	0.26	0.17	0.29	0.16	0.32	0.19	0.13	0.24	0.33	0.22	0.13	0.15	0.24	0.28	0.25	0.46	0.21	1.78	0.50	0.89
C5	0.20	0.24	0.17	0.18	0.19	0.18	0.17	0.23	0.17	0.16	0.21	0.27	0.23	0.15	0.18	0.21	0.20	0.19	0.49	0.14	0.89	0.61	0.48
C5'	0.22	0.25	0.23	0.28	0.20	0.31	0.19	0.34	0.21	0.17	0.24	0.31	0.23	0.17	0.19	0.27	0.29	0.27	0.50	0.21	1.75	0.55	0.89
C6	0.21	0.28	0.16	0.16	0.23	0.16	0.23	0.22	0.27	0.19	0.29	0.29	0.26	0.20	0.20	0.20	0.17	0.19	0.50	0.25	0.62	0.72	0.44
C8	0.19	0.18	0.17	0.20	0.14	0.22	0.11	0.25	0.11	0.13	0.12	0.23	0.18	0.12	0.15	0.23	0.24	0.20	0.48	0.14	1.21	0.52	0.58
N1	0.19	0.22	0.15	0.15	0.21	0.14	0.21	0.22	0.22	0.18	0.22	0.22	0.21	0.20	0.19	0.17	0.14	0.18	0.50	0.20	0.55	0.73	0.44
N2	0.13	0.10	0.12	0.14	0.09	0.13	0.10	0.21	0.10	0.14	0.10	0.12	0.09	0.14	0.11	0.12	0.10	0.15	0.50	0.12	0.64	0.63	0.44
N3	0.16	0.10	0.14	0.18	0.07	0.19	0.07	0.24	0.09	0.11	0.10	0.13	0.10	0.10	0.11	0.16	0.18	0.18	0.48	0.12	1.09	0.50	0.54
N7	0.21	0.25	0.18	0.19	0.19	0.20	0.16	0.24	0.17	0.16	0.22	0.30	0.24	0.15	0.18	0.23	0.23	0.20	0.49	0.15	0.99	0.59	0.51
N9	0.17	0.11	0.16	0.20	0.10	0.23	0.08	0.26	0.11	0.11	0.10	0.16	0.13	0.10	0.12	0.20	0.23	0.20	0.48	0.15	1.31	0.47	0.62
O2'	0.08	0.37	0.07	0.12	0.21	0.22	0.20	0.35	0.26	0.11	0.33	0.46	0.30	0.14	0.13	0.12	0.14	0.16	0.45	0.26	1.91	0.56	0.99
O3'	0.28	0.32	0.31	0.37	0.23	0.39	0.16	0.39	0.16	0.16	0.23	0.42	0.33	0.13	0.22	0.35	0.40	0.33	0.45	0.13	1.90	0.75	1.08
O4'	0.24	0.24	0.26	0.31	0.19	0.35	0.18	0.36	0.22	0.17	0.24	0.29	0.22	0.17	0.20	0.29	0.33	0.31	0.54	0.24	1.64	0.46	0.79
O5'	0.28	0.37	0.28	0.30	0.29	0.31	0.27	0.32	0.29	0.24	0.35	0.46	0.34	0.24	0.26	0.33	0.32	0.30	0.49	0.28	1.59	0.56	0.82
O6	0.21	0.33	0.17	0.16	0.27	0.15	0.28	0.23	0.35	0.21	0.37	0.34	0.29	0.23	0.22	0.21	0.17	0.19	0.51	0.36	0.47	0.79	0.45
OP1	0.30	0.42	0.30	0.31	0.34	0.33	0.35	0.36	0.39	0.30	0.43	0.46	0.37	0.32	0.31	0.34	0.32	0.32	0.53	0.40	1.67	0.68	0.91
OP2	0.33	0.47	0.33	0.33	0.36	0.31	0.33	0.31	0.37	0.28	0.44	0.57	0.42	0.29	0.32	0.41	0.36	0.31	0.48	0.35	1.37	0.54	0.70
P	0.29	0.38	0.29	0.31	0.30	0.31	0.28	0.32	0.30	0.24	0.35	0.46	0.34	0.24	0.27	0.34	0.33	0.30	0.49	0.30	1.55	0.55	0.79

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.16	0.00	0.25	0.02	0.56	0.95	0.30
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.22	0.12	0.38	0.01	0.77	0.80	0.25
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.00	0.08	0.01	0.25	0.05	0.33	1.36	0.64
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.10	0.04	0.40	1.07	0.38
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.18	0.05	0.37	0.01	0.51	0.95	0.37
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.08	0.13	0.10	0.09	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.75	0.47	0.16
C5	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.15	0.03	0.39	0.01	0.34	1.04	0.48
C5'	0.06	0.18	0.08	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.18	0.19	0.17	0.20	0.16	0.19	0.13	0.06	0.06	0.02	0.01	0.19	0.31	0.23	0.02
C6	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.17	0.05	0.40	0.00	0.39	1.00	0.44
C8	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.10	0.09	0.35	0.02	0.32	1.18	0.66
N1	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.20	0.08	0.40	0.01	0.59	0.89	0.33
N2	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.13	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.24	0.15	0.37	0.01	0.95	0.70	0.23
N3	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.22	0.12	0.36	0.01	0.76	0.82	0.25
N7	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.11	0.07	0.37	0.02	0.31	1.16	0.64
N9	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.02	0.34	0.02	0.39	1.04	0.45
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.07	0.02	0.09	0.06	0.10	0.11	0.11	0.14	0.11	0.12	0.05	0.00	0.10	0.02	0.23	0.12	0.34	1.57	0.73
O3'	0.16	0.22	0.08	0.01	0.18	0.02	0.15	0.06	0.17	0.10	0.20	0.24	0.22	0.11	0.15	0.10	0.00	0.13	0.16	0.16	0.79	0.90	0.30
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.09	0.08	0.15	0.12	0.07	0.02	0.02	0.13	0.00	0.17	0.04	0.84	0.47	0.15
O5'	0.25	0.38	0.25	0.10	0.37	0.01	0.39	0.01	0.40	0.35	0.40	0.37	0.36	0.37	0.34	0.23	0.16	0.17	0.00	0.41	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.16	0.04	0.41	0.00	0.31	1.04	0.50
OP1	0.56	0.77	0.33	0.40	0.51	0.75	0.34	0.31	0.39	0.32	0.59	0.95	0.76	0.31	0.39	0.34	0.79	0.84	0.03	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.95	0.80	1.36	1.07	0.95	0.47	1.04	0.23	1.00	1.18	0.89	0.70	0.82	1.16	1.04	1.57	0.90	0.47	0.02	1.04	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.25	0.64	0.38	0.37	0.16	0.48	0.02	0.44	0.66	0.33	0.23	0.25	0.64	0.45	0.73	0.30	0.15	0.01	0.50	0.01	0.01	0.00