Doublet Group distance statistics: 51232

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 4, 5, 5, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.015, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.009, 0.015, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.028, 0.044, 0.060, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.044 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.025, 0.043, 0.060, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.043 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.004, 0.027, 0.050, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.027 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.033, 0.083, 0.134, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.083 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.036, 0.089, 0.143, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.089 std_dev=0.053
O2'	A	0, 0.088, 0.214, 0.340, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.214 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.029, 0.166, 0.302, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.166 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.006, 0.182, 0.358, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.182 std_dev=0.176
O2'	B	0, 0.155, 0.332, 0.510, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.332 std_dev=0.177
C2'	B	0, 0.193, 0.384, 0.575, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.384 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.062, 0.258, 0.455, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.258 std_dev=0.197
O3'	B	0, 0.256, 0.458, 0.660, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.458 std_dev=0.202
C3'	B	0, 0.201, 0.432, 0.663, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.432 std_dev=0.231
C1'	B	0, 0.148, 0.396, 0.644, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.396 std_dev=0.248
C4'	B	0, 0.180, 0.436, 0.692, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.436 std_dev=0.256
O4'	B	0, 0.146, 0.419, 0.691, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.419 std_dev=0.273
O5'	A	0, 0.013, 0.341, 0.668, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.341 std_dev=0.327
C5'	A	0, -0.018, 0.310, 0.638, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.310 std_dev=0.328
N9	B	0, 0.143, 0.472, 0.800, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.472 std_dev=0.329
C5'	B	0, 0.140, 0.520, 0.901, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.520 std_dev=0.380
C4	B	0, 0.114, 0.516, 0.917, 1.903 max_d=1.903 avg_d=0.516 std_dev=0.402
C8	B	0, 0.136, 0.540, 0.943, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.540 std_dev=0.404
N3	B	0, 0.083, 0.504, 0.925, 1.990 max_d=1.990 avg_d=0.504 std_dev=0.421
O5'	B	0, 0.125, 0.580, 1.034, 2.011 max_d=2.011 avg_d=0.580 std_dev=0.454
P	A	0, -0.028, 0.430, 0.888, 2.265 max_d=2.265 avg_d=0.430 std_dev=0.458
N7	B	0, 0.110, 0.614, 1.118, 2.397 max_d=2.397 avg_d=0.614 std_dev=0.504
C5	B	0, 0.093, 0.597, 1.101, 2.440 max_d=2.440 avg_d=0.597 std_dev=0.504
OP2	A	0, -0.015, 0.496, 1.008, 2.347 max_d=2.347 avg_d=0.496 std_dev=0.511
C2	B	0, 0.032, 0.572, 1.112, 2.609 max_d=2.609 avg_d=0.572 std_dev=0.540
OP1	A	0, -0.059, 0.503, 1.064, 2.711 max_d=2.711 avg_d=0.503 std_dev=0.562
OP1	B	0, 0.136, 0.725, 1.313, 2.940 max_d=2.940 avg_d=0.725 std_dev=0.588
P	B	0, 0.067, 0.675, 1.282, 2.880 max_d=2.880 avg_d=0.675 std_dev=0.608
N2	B	0, 0.008, 0.616, 1.224, 2.911 max_d=2.911 avg_d=0.616 std_dev=0.608
C6	B	0, 0.032, 0.658, 1.285, 3.057 max_d=3.057 avg_d=0.658 std_dev=0.627
N1	B	0, 0.005, 0.638, 1.271, 3.080 max_d=3.080 avg_d=0.638 std_dev=0.633
OP2	B	0, 0.127, 0.814, 1.501, 3.306 max_d=3.306 avg_d=0.814 std_dev=0.687
O6	B	0, 0.000, 0.742, 1.485, 3.618 max_d=3.618 avg_d=0.742 std_dev=0.742

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.17	0.09	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.06	0.02	0.11	0.01	0.16	0.18	0.12
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.03	0.09	0.13	0.06
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.02	0.11	0.11	0.09	0.05	0.05	0.12	0.07	0.01	0.00	0.02	0.17	0.13	0.10	0.16	0.14
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.01	0.13	0.01	0.17	0.18	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.15	0.07	0.03	0.03	0.15	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.15	0.07	0.05
C5	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.17	0.01	0.20	0.23	0.17
C5'	0.04	0.15	0.02	0.02	0.17	0.00	0.25	0.00	0.26	0.27	0.21	0.11	0.11	0.31	0.16	0.02	0.03	0.01	0.01	0.30	0.07	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.11	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.18	0.01	0.21	0.25	0.19
C8	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.15	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.03	0.19	0.01	0.21	0.21	0.17
N1	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.01	0.14	0.01	0.18	0.22	0.15
N2	0.03	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.07	0.03	0.09	0.01	0.15	0.17	0.10
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.05	0.01	0.09	0.01	0.15	0.16	0.10
N7	0.01	0.00	0.02	0.12	0.00	0.15	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.13	0.03	0.21	0.01	0.23	0.26	0.20
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.01	0.17	0.15	0.11
O2'	0.02	0.15	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.02	0.09	0.01	0.12	0.17	0.14	0.02	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.08	0.19	0.06	0.05
O3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.01	0.10	0.03	0.11	0.12	0.08	0.07	0.05	0.13	0.05	0.03	0.00	0.01	0.20	0.13	0.15	0.16	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.09	0.03	0.22	0.08	0.11
O5'	0.05	0.11	0.08	0.17	0.13	0.01	0.17	0.01	0.18	0.19	0.14	0.09	0.09	0.21	0.12	0.03	0.20	0.09	0.00	0.20	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.13	0.01	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03	0.20	0.00	0.24	0.29	0.22
OP1	0.17	0.16	0.09	0.10	0.17	0.15	0.20	0.07	0.21	0.21	0.18	0.15	0.15	0.23	0.17	0.19	0.15	0.22	0.02	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.18	0.13	0.16	0.18	0.07	0.23	0.14	0.25	0.21	0.22	0.17	0.16	0.26	0.15	0.06	0.16	0.08	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.06	0.14	0.13	0.05	0.17	0.01	0.19	0.17	0.15	0.10	0.10	0.20	0.11	0.05	0.16	0.11	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.46	0.15	0.10	0.33	0.09	0.33	0.08	0.39	0.23	0.45	0.55	0.40	0.27	0.25	0.11	0.11	0.15	0.10	0.40	0.10	0.19	0.11
C2	0.12	0.27	0.12	0.14	0.17	0.13	0.14	0.17	0.17	0.09	0.23	0.34	0.24	0.09	0.12	0.13	0.18	0.10	0.17	0.15	0.21	0.15	0.19
C2'	0.18	0.42	0.16	0.14	0.29	0.11	0.30	0.11	0.36	0.21	0.42	0.50	0.35	0.25	0.22	0.11	0.14	0.13	0.13	0.37	0.13	0.21	0.14
C3'	0.16	0.37	0.14	0.14	0.25	0.11	0.27	0.12	0.33	0.18	0.38	0.44	0.30	0.22	0.19	0.11	0.16	0.13	0.13	0.35	0.14	0.22	0.15
C4	0.16	0.37	0.13	0.11	0.24	0.10	0.22	0.13	0.28	0.14	0.34	0.46	0.33	0.16	0.17	0.13	0.15	0.11	0.11	0.27	0.16	0.10	0.12
C4'	0.13	0.36	0.09	0.08	0.23	0.07	0.25	0.08	0.32	0.16	0.37	0.44	0.27	0.20	0.17	0.06	0.11	0.10	0.09	0.34	0.11	0.18	0.10
C5	0.14	0.37	0.12	0.13	0.23	0.12	0.20	0.17	0.26	0.11	0.33	0.46	0.32	0.13	0.15	0.13	0.17	0.09	0.15	0.25	0.22	0.13	0.18
C5'	0.15	0.32	0.10	0.10	0.22	0.09	0.23	0.08	0.29	0.17	0.34	0.39	0.25	0.20	0.18	0.09	0.12	0.13	0.11	0.31	0.12	0.20	0.12
C6	0.12	0.31	0.12	0.15	0.18	0.15	0.15	0.22	0.20	0.09	0.27	0.41	0.27	0.10	0.12	0.13	0.19	0.09	0.21	0.18	0.30	0.20	0.25
C8	0.18	0.46	0.14	0.11	0.30	0.09	0.29	0.12	0.37	0.18	0.44	0.56	0.39	0.22	0.22	0.12	0.15	0.12	0.10	0.37	0.15	0.11	0.11
N1	0.11	0.27	0.12	0.16	0.16	0.15	0.13	0.22	0.16	0.10	0.22	0.35	0.24	0.10	0.11	0.13	0.20	0.10	0.22	0.14	0.30	0.21	0.26
N2	0.12	0.21	0.13	0.17	0.15	0.15	0.13	0.19	0.14	0.10	0.18	0.27	0.20	0.11	0.11	0.12	0.20	0.11	0.19	0.13	0.21	0.17	0.20
N3	0.15	0.32	0.12	0.11	0.21	0.10	0.19	0.12	0.23	0.12	0.29	0.39	0.29	0.13	0.16	0.13	0.14	0.11	0.11	0.22	0.14	0.10	0.12
N7	0.15	0.42	0.12	0.12	0.26	0.11	0.24	0.16	0.31	0.14	0.39	0.52	0.35	0.17	0.18	0.12	0.16	0.10	0.13	0.31	0.21	0.11	0.16
N9	0.18	0.44	0.14	0.11	0.30	0.09	0.29	0.10	0.35	0.19	0.42	0.53	0.38	0.22	0.22	0.12	0.13	0.13	0.09	0.35	0.12	0.12	0.09
O2'	0.09	0.38	0.08	0.10	0.22	0.10	0.25	0.11	0.33	0.14	0.38	0.47	0.29	0.19	0.14	0.08	0.13	0.08	0.10	0.34	0.12	0.18	0.11
O3'	0.10	0.29	0.10	0.12	0.18	0.10	0.20	0.12	0.27	0.13	0.31	0.35	0.21	0.16	0.13	0.08	0.15	0.09	0.12	0.29	0.15	0.21	0.14
O4'	0.21	0.51	0.15	0.10	0.36	0.08	0.37	0.07	0.45	0.26	0.51	0.59	0.42	0.31	0.27	0.10	0.10	0.16	0.11	0.46	0.10	0.21	0.11
O5'	0.26	0.52	0.17	0.14	0.39	0.14	0.40	0.13	0.47	0.30	0.53	0.60	0.44	0.34	0.31	0.14	0.16	0.23	0.16	0.48	0.14	0.22	0.15
O6	0.11	0.30	0.12	0.16	0.17	0.17	0.13	0.25	0.18	0.10	0.26	0.40	0.26	0.09	0.11	0.13	0.20	0.10	0.25	0.16	0.36	0.25	0.31
OP1	0.44	0.74	0.32	0.25	0.60	0.26	0.63	0.24	0.71	0.51	0.77	0.82	0.65	0.58	0.52	0.27	0.18	0.39	0.30	0.74	0.23	0.40	0.30
OP2	0.24	0.56	0.18	0.18	0.39	0.18	0.41	0.20	0.50	0.28	0.57	0.66	0.46	0.34	0.30	0.15	0.25	0.19	0.17	0.52	0.23	0.18	0.18
P	0.31	0.63	0.21	0.17	0.48	0.17	0.50	0.16	0.58	0.37	0.64	0.71	0.53	0.43	0.38	0.17	0.18	0.27	0.19	0.60	0.15	0.26	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.08	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.03	0.07	0.12	0.07
C2	0.06	0.00	0.12	0.12	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.15	0.05	0.09	0.01	0.13	0.18	0.12
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.07	0.04	0.10	0.16	0.12	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.09	0.13	0.07
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.07	0.07	0.10	0.16	0.12	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.08	0.09	0.11	0.06
C4	0.03	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.09	0.02	0.12	0.17	0.11
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.06	0.11	0.08	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.11	0.01	0.14	0.19	0.14
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.10	0.08	0.10	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.09	0.04	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.11	0.01	0.15	0.20	0.15
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.11	0.01	0.13	0.16	0.13
N1	0.05	0.00	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.10	0.01	0.13	0.19	0.13
N2	0.08	0.01	0.16	0.16	0.01	0.11	0.02	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.20	0.07	0.11	0.02	0.14	0.18	0.13
N3	0.06	0.00	0.12	0.12	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.14	0.05	0.10	0.02	0.13	0.17	0.12
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.13	0.02	0.16	0.20	0.15
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.10	0.15	0.10
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.07	0.03	0.11	0.18	0.12	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.07	0.08	0.11	0.06
O3'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.08	0.02	0.07	0.03	0.10	0.07	0.13	0.20	0.14	0.08	0.03	0.04	0.00	0.02	0.05	0.10	0.10	0.11	0.06
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.07	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.02	0.06	0.09	0.07
O5'	0.06	0.09	0.04	0.03	0.09	0.01	0.11	0.01	0.11	0.11	0.10	0.11	0.10	0.13	0.08	0.05	0.05	0.07	0.00	0.13	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.06	0.08	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.10	0.02	0.13	0.00	0.17	0.22	0.17
OP1	0.07	0.13	0.09	0.09	0.12	0.05	0.14	0.04	0.15	0.13	0.13	0.14	0.13	0.16	0.10	0.08	0.10	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.18	0.13	0.11	0.17	0.05	0.19	0.02	0.20	0.16	0.19	0.18	0.17	0.20	0.15	0.11	0.11	0.09	0.02	0.22	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.07	0.06	0.11	0.02	0.14	0.01	0.15	0.13	0.13	0.13	0.12	0.15	0.10	0.06	0.06	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00